Chy5G102890 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGGTAGCAACTTTCTTTCCTTCTCAAACTTCATATAACAACCGCCATTATCTTTCTCGCGACATCCAATTTCGGTCTCCTCTTCGTTTGTCCACTCCTCGTTCCTTCCTTTCCACCATTCGAGCAAGCTCGGCTCTCGTTCTTGAGTCGGTAAGCTCCACGTTATCATTCTTGTTTCAATCATCGTTTATAATCCCACCCTTTTGATGTTGAATTGTACCGTTATTTCTCAATTTCCATCACGCGTTTGGTTGTTAGGGAATTTTTTGTTTAATTTGTAATTGTAACTCAATTTCGAACTGTTTCATCAGGGTGTATTTGAAATTAGTATTACTTTATGTTGCTATCAGGATTCAGGTATTCAACAGGATCAGAATTCGAAAATTGACGTGTTTTCATGTCCGGTTTGTTTTGAGCCATTGTTGAGAAAAGGTCCGCCAGGTTTTAACTTGTAAGTTGACTAATTGAGATGTCTATCATCTTTTGAAATTTAACTTGTTACATGACATTATAATTTGATCTGGGTGAAGTGGAAAATTTGCAGGCCAGCTATTTATAGGTCTGGTTTCAAGTGTAGAAGATGCAACAAGTCATATACCAGCAAAAACATCTTTTTAGATCTCACAGTTACTTCTGGAATGAAGGAATATGTTGAAGTCAAACCTGGGGGAACTGAGCTGTTTCGGTATCTGTTTGATATTTCCTCTTCATTTTCTCTTCTCTGTATTCCTTTTTGTGCTTTGTTTCCTACTTTGTTTCATCTCCTTAGTGTTAGATGATGTAGTATTAAATTTATCTTTAACCATCCGCTTAAGCTTTTAGGTTAATCAATGATTTGATATAGCACTAGATTTGGTGGCTGTGGTCTAGAAAGTCCTGTGTTCAAACCCGACAATGTTATTTCCTTCTCAATTAATCACTTGCTGTGTTTTTTCTACTCATTTCGAGGCCACAAGTCAGGGGAGTGTTAGAATAATATAACACTAAATTTAATTTCACCCATGAGATTAAGCTTTTGGGTCAATGTTAAATTTATGTCATTCATTAGTCTAGTTAAAGGAAGGCGTATAGTAATATTGCAATTTCCCTCCGGACAATTCTGAACTGCTTCTGATTTTTGAACTTTATAGGAGTCCCCTTGTTTCATATCTATACGAAAGAGGATGGCGTCAAAACTTCAACCAAAGTGGTTTCCCAGGCCTTGACGAAGAAGTATGCTCTGTCTCAATAATAACACTATCATTCAAATGGACGTAGATTTTAGATTTGATATTTTGATGCCATTCAAAAGATTATTCGTGGAGAAAAACAAGTCTAATTGCAATGTTACATAATTTTCCCTGGTATTTTTCATTGGACAAAGTGACTATAAGTTGATACCTTGTCTGTAACTATACAACATTGCAGTTTAAAATGGCCATGGAGTATTTTAAATCTGTTGAAGGTGGTCTTTTAGTGGATGCAAGCTGTGGTAGTGGTTTGTTTTCCAGAAAATTTGCAAAATCTGGGTCCTTCGCAGGTGTAATTGCTCTTGATTTCTCTGAGAATATGCTTCTTCAATGTTATGACTTCATTAAGAAAGATGCTACTCTCTTGAACAGGTAATTTTAGTGACTTTTATTCTCTATTAGTTTAGTTCCTTAGAACTGCAATCACTATTATATTCTGCTGGCTTGTGTATTAAGTGAAGTCCAATTCACTTGCAAGAAAGGAAGGTTATATTAATTAGCTCATCTTCTTTTGGAAAATATGCAGTAATCTTGCTCTTGTGAGGGCAGATATCTCTAGGCTTCCCTTTTCATCAGGATCAGTAGATGCTGTTCATGCTGGAGCAGCGTTGCATTGTTGGCCATCTCCTTCCAATGCTGTAAGCATTGTCTTGTAGAACATATTCTATTATTTGATTTCCTACCAGTAGTCATAATCCGCTGAGTTCAACCATGTTTTTTTTTTTTTCTGAAAAGGAGACAGAATTTTCATTGATAAACTGAAAATGAAAGGACGATTACAAAGAGACAGCAATGAGACAACAACAATCTAAAATAAAGACCCGAATATGAAAACAAAAAACAGCTACCCCGAAAAGAACAAAAACAAAACTCAAGCTAAACTAGCTGACCAACAACCAACGAATTCAGCAATAGTACAACAAAAACAACCCATAACCAATGCAAAAACAAAAGTTTCAACTTCAAAAAACTGTGGATCGAAAAAATCTTGATTTTCAAGAGGAACAGAACAGGGCTTGAGCAGATTCATGAGCTAATCTTCTAGGAGACAGATGTCTTGCAAAATCCTGAACAACTTCAAACCAAGATTAGATCACAATCTTTAACAATGGACCATAGGTGAGCTGGAATTTTGGAAAGGGGCAATGGAAAGATCTTCCAACTTTTGAGACAAAACACTTCCTCAAAAAACATAGTATTCTATTTAGAACTCCTCCCAAATTGTTTAATGGCTCCGGCAAATCTTGAGCTAATCCTTTCTTGGTGCCAACTGATTCTTCGCTACTCACACTAAAAGGTGAACCAAACTCGGGATCTAACGTCTTCTCAACCAGCATGCGTGATTGAAATCATCTAAAATTTCTCTCTTCATGTCAAAGCCTTACTCTTCACAATAGTTAACATGGGACTCGATTCATATGGAACAGTGCACGTCAGTGTGTCTGAATTAACGGCAGGTTCATTGGCCAATTGGTATTTTGATACATCTTCTTGACTAATTCATTCCTTTTAGGAAGTTTTAGTTGAAACATGTAGGAATTAGCTCCTGGTTATTTATATATATTCTAAGGTTAATATTTTTCCACTTTTTTTAGTTTTAGTAATGTGTTTCTTTGACTATTCTCATCAGATTGCTGAGATCACTCGTATAATGCGGAGTGGAGGAGTATTTGTGGGAACCACTTTCTTGCGGTACACTTCATCTACTCCCTGGTACCTAAGATTTTTAAGAGAGGTATACTCTTAATCTATCCTTGCCCTATCCTTACTTTTTTGGATAAAGTTTAGTTTCACTAGTTATCAGGAAGCAGCTATGATTGAAAATTTTGTGTTATCTGATCAATATTCTTGGGTCATAAACTTGGTAATCATGCATTTGCATATATGAAGTCCGTCCTTGCATAATTTCTAATAGCTCGCAAGTTAAGGTGGTATAAACAAGCTAGCTTTCTAAATGGTATATTGGACTTCTTGCTGGCTTATATTTTTTCAGTTTTATTGGACATAATATCGATATTTTTCAGTTTTATAGAATTTTTAACTATTTGATCTTATGGTAAATAAAGAGCATTGAATTTAATAAAGGAGTTTAATCCATGGTAATCACCTACTTAGAATTAATGCTTTACGAGTTTTATTGACACCCAAATATCTTAGGGTCGTGTAGGTTGCCCCTCAAGTAGCTGACCCATATGGGGTGGGGCAAAGTAAGAGGAACATATATTGTAAAACATAACCTTTTTCTTAGATAAAAGGATTCGAGACTACATCCTCCTCCATCATTTCATAGATACCAACCTCTACGCTATGAATAATCCTGAATCCTGTCATAATCGGTCAATTATTCAAAATACCAACTGGTCCCAAACCAAGCATATGTGAAATTGTTTTTGACCATCTTATGATAAACAATTACATTTTAACGACGCATAAGATTCTAGGTTTCTCTAACTCTGAACGATGCCATGATTTTCAAACTTTCTTGATTATGAAGATGGATTTGTGAGCGTTATAAGTGTGTGTGTGTTCAGCAGCGTGGTTTTCAGCCCTATGGCTACTTAACAGAGGAAGAAATAGAGGAACTGTGCAAATCCTGCGGTCTGATTAACTATTCAAGTAAAGTTCAACGATCTTTCATTATGTTCTCTGCCCAGAAGCCTTGAAAGTAAGTTCTGATGTGATCAATCTCATCCTCATTATGTTGTCTATGTTCAGAATCAAAGTTTAAAGAATTATATTGATAAGTTAATACAATAGCTTGTAAATTGTTGGAACTGAAGAATAATTGATTGAATTGAATATAATTAAAAATTGAGAAGAGATGTGTAATGATGTCCTCTTTATTTGGTTGATTTTCCTTAAATCTTATTTTGTAGGCATAATCTCATAAGCTTGGTCTGGTTGTCTCTCTCTGTCTTTGTTAAATTTATTTGATTTTCAATATGAACTTAACTATCTCAATATCCGTCCAAAATTTTGAAAAATGAAACTAAAAGAATAGGAAAAGAAGGGGATGGGTGAGGTGGGTTTGATTAAGCAAATAATTTAAAATGGAAGGGGCAAATGGGAAGGAGAAGTGGGGATTCAGAAATTCAGACTGACAAAAAGACTGTCCAATCCCCCACGTACTCACCTCCTCTTTCTTTGACCAACTTTCTTTTTTATTTTTTTTTGTAAGAAAACCTTTTCTTATTTCTTTATATATATTGTTTAAATTTTATAATTTTCACAGTGTAGGTGAACTAAGCTTTTTGTTGGCAATTTTAATAATTTAGCCTATGTCATTAATATTATAAATCAAGTCATTGATGACATTTCAATTAATCTATTTGCTTCTGTTGATATACTCCAAATTTATCTAATATCATAAGAGTAATTATACAATGATTAAAATTACTTTTGTTATTGGTTTTTTTTTAAGAATAATAAGAAAAAAAAAACAAATTATTTACATTTCCATAATAAAAAACCACTAGGACAAAAATCAATTACAATTTTGATTTTGACATGAGGTTTAAATATTTTCAAGATCACTGAAAATGTGATTAGAAGCGTAAAATTATACATTAAATCAAATTTGAATAGATAAATGGGTAATTTGAAAAATCACTATCAATTTATTAGAGTGCCATGTCAATTGATGACCTTTATCGTCATTACAATACATATCCAAATCAATAACACATTATATATAAATTTCCATTATTGATCTAAATCAACCAAATATTGAAAGAGTTCACACCATATTTGAATGTAGTTTAT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ATGGCGGTAGCAACTTTCTTTCCTTCTCAAACTTCATATAACAACCGCCATTATCTTTCTCGCGACATCCAATTTCGGTCTCCTCTTCGTTTGTCCACTCCTCGTTCCTTCCTTTCCACCATTCGAGCAAGCTCGGCTCTCGTTCTTGAGTCGGATTCAGGTATTCAACAGGATCAGAATTCGAAAATTGACGTGTTTTCATGTCCGGTTTGTTTTGAGCCATTGTTGAGAAAAGGTCCGCCAGGTTTTAACTTGCCAGCTATTTATAGGTCTGGTTTCAAGTGTAGAAGATGCAACAAGTCATATACCAGCAAAAACATCTTTTTAGATCTCACAGTTACTTCTGGAATGAAGGAATATGTTGAAGTCAAACCTGGGGGAACTGAGCTGTTTCGGAGTCCCCTTGTTTCATATCTATACGAAAGAGGATGGCGTCAAAACTTCAACCAAAGTGGTTTCCCAGGCCTTGACGAAGAATTTAAAATGGCCATGGAGTATTTTAAATCTGTTGAAGGTGGTCTTTTAGTGGATGCAAGCTGTGGTAGTGGTTTGTTTTCCAGAAAATTTGCAAAATCTGGGTCCTTCGCAGGTGTAATTGCTCTTGATTTCTCTGAGAATATGCTTCTTCAATGTTATGACTTCATTAAGAAAGATGCTACTCTCTTGAACAGTAATCTTGCTCTTGTGAGGGCAGATATCTCTAGGCTTCCCTTTTCATCAGGATCAGTAGATGCTGTTCATGCTGGAGCAGCGTTGCATTGTTGGCCATCTCCTTCCAATGCTATTGCTGAGATCACTCGTATAATGCGGAGTGGAGGAGTATTTGTGGGAACCACTTTCTTGCGGTACACTTCATCTACTCCCTGGTACCTAAGATTTTTAAGAGAGGGAATTCAAAAGCCTGCATGGTTAGAAGCACTTTACAACCAAAAGTTCTTTGTGGGATGTTCGTTTCACGAGACTTCAAAGAAGAATGAGAAGAACATTTGTTGTTTGGATTGTTGCATTAGTATTTGCCCTCATTGTTTGTCGTCTCACCGATTCCATCGCCTTCTTCAAGTTCGTCGATATGTTTATCACGATGTTGTTCGACTCGAAGATCTTCAAAAGCTTATAGATTGCTCAAATGTTCAGCCTTATACCATAAATAGTGCCAAAGTGGTGTTCATCAAGAAGAGACCTCAAAATAGACAATTTAAAGGGTCGGGCAATTTTTGCACTTCTTGTGATAGAAGTCTTCAAGAACCGTATGTTCATTGCTCTCTCGGATGCAAGGTGGATTTTGTGTTGAAGCATAAGAGAGATTTAACTTCTTATCTTAAACCATGCAATTCTCTCCCCCTTAGTATGGATTTTTTAGTTCCACAAGATGTAGGCGACGACGAGATGACAAACGAGACACCTCGTTCGACAATCGTGGACTACGATGAGCCGATGAGCTCGTCTTCCGGTTCCGAGAACATGAGCATTGCTCAACCACCAATTGTTCGTAAGAAAAGAAGTGGACTTTGCTTGTGTGGAAGATCATCTAGAAAGATAATATCTAGTGAAGACATAGCAACAAAAAACTCTGCTGGGGTTGAGGAATTTCAGGTGTCGGAGCCATGGAGGACTGGAAGAAGCCTTGCCGAGCTGGACCCTGCTGTGAACTCGTCTCTGGTTTTGGCTGAAGACAGGACTCGGAGGAAAGACCCCCTTGATGACTTTAAACCTTATACGGGTGGATGGAATATAAGCAACGAACATTACTGGGCTTCTGTTGCTCTTACTTCTATTCCATTCACTGTCATTGGCATTGCTTGGTTTGTGCTCTTCGGGATATGCTTGTTCATCACCTGTCTTTGCTGTTGCTGTTGTCGGAGGGAGCCTTATGGCTATTCTCGAACGGCCTACGCTCTTTCTCTTGCTTTCCTCATATTCTTCACCATCTCAGCAATTGTAGGATGTGTCGTGTTATATGTTGGTCAAGGGAAGTTTCATAGCCGTACATCGAGCACATTGGAATATATAGTAAATCAGGCAGATGGAACTGCTGAAAACCTCAAAAATTTGTCGGTGTATCTGTCTTCAGCCAAGTCAATCAAAGTTGATTCGATATTTCTGACTCCAGATATCCAGAAAGGAATTGACGATATTGGCACAAAGATAAGTTCTGTTTCTTCCACTCTTACCGATGCAGCTTCTAACAACTCAGACACGATACAAAAAGGCCTAGATGAAAACCGACTCATCCTCATTATTATTGCTGCTGTTATGCTCTTGTTGGCATTTATTGGATTCTTATGTTCCATCTTCGGATTGCAGTGTGTTGTATACACCTTCGTAATACTTGGTTGGATTCTTGTTACGGTCACGTTCTTTCTGTGTGGCGTGTTTCTTCTTCTCCATAATGTGGTCGGAGATACATGTGTTGCAATGGAAGATTGGCTGCAGAATCCCACTGCCAACACGGCGTTAGACGATATCCTTCCTTGCGTCGATAATGCCACTGCCAAACAAATTCAGTCGGTAACCAAAAATGTGAGTTTCCAACTTGTTAGTTTGGTCAATGGAGTGATCAACACAGCCTCAAATGTCAACCCTCCTCCAAATATCGGTCCCCCTGTTAATTACAATCAATCTGGCCCATTGGTGCCACCTCTATGTAGTCGGTTTAATTCCGATCTCACCAGTCGAACCTGCTTGGCGAATGAAGTACAACTGAACGAAGCTCCTGCGGTTTGGAAGGATTTCACTTGTCAAGTATCAGCTTCTGGCATTTGCACCACCACTGGCCGGTTGACTCCAGCTCTCTACAACCAAATGACAGCAGCAGCAAACGTGAGCTATGGTTTGTATCGCTATGGACCGTTCTTGGTCGAACTCGTGGACTGTACGTTCGTTCGACAAGTATTTACTGATATCAGTAACAACCATTGCCCTGGTCTTCGACTATACACGAAATGGATATATGTCGGGTTGGTTCTGATGTCTGGTGCTGTCATGTTCTCCCTGATCTTCTGGATTATATACGCAAGAGAACGACGACATCGGGTTTACACAAAGCAGTTTATTTCCAGAGCTCCAGGAGGAGAAGACAAGGGAAACTAG MAVATFFPSQTSYNNRHYLSRDIQFRSPLRLSTPRSFLSTIRASSALVLESDSGIQQDQNSKIDVFSCPVCFEPLLRKGPPGFNLPAIYRSGFKCRRCNKSYTSKNIFLDLTVTSGMKEYVEVKPGGTELFRSPLVSYLYERGWRQNFNQSGFPGLDEEFKMAMEYFKSVEGGLLVDASCGSGLFSRKFAKSGSFAGVIALDFSENMLLQCYDFIKKDATLLNSNLALVRADISRLPFSSGSVDAVHAGAALHCWPSPSNAIAEITRIMRSGGVFVGTTFLRYTSSTPWYLRFLREGIQKPAWLEALYNQKFFVGCSFHETSKKNEKNICCLDCCISICPHCLSSHRFHRLLQVRRYVYHDVVRLEDLQKLIDCSNVQPYTINSAKVVFIKKRPQNRQFKGSGNFCTSCDRSLQEPYVHCSLGCKVDFVLKHKRDLTSYLKPCNSLPLSMDFLVPQDVGDDEMTNETPRSTIVDYDEPMSSSSGSENMSIAQPPIVRKKRSGLCLCGRSSRKIISSEDIATKNSAGVEEFQVSEPWRTGRSLAELDPAVNSSLVLAEDRTRRKDPLDDFKPYTGGWNISNEHYWASVALTSIPFTVIGIAWFVLFGICLFITCLCCCCCRREPYGYSRTAYALSLAFLIFFTISAIVGCVVLYVGQGKFHSRTSSTLEYIVNQADGTAENLKNLSVYLSSAKSIKVDSIFLTPDIQKGIDDIGTKISSVSSTLTDAASNNSDTIQKGLDENRLILIIIAAVMLLLAFIGFLCSIFGLQCVVYTFVILGWILVTVTFFLCGVFLLLHNVVGDTCVAMEDWLQNPTANTALDDILPCVDNATAKQIQSVTKNVSFQLVSLVNGVINTASNVNPPPNIGPPVNYNQSGPLVPPLCSRFNSDLTSRTCLANEVQLNEAPAVWKDFTCQVSASGICTTTGRLTPALYNQMTAAANVSYGLYRYGPFLVELVDCTFVRQVFTDISNNHCPGLRLYTKWIYVGLVLMSGAVMFSLIFWIIYARERRHRVYTKQFISRAPGGEDKGN* Homology
BLAST of Chy5G102890 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0WPT7 (Uncharacterized methyltransferase At2g41040, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g41040 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 371.7 bits (953), Expect = 2.7e-101 Identity = 191/304 (62.83%), Postives = 230/304 (75.66%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G102890 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q1G3Q4 (Protein RGF1 INDUCIBLE TRANSCRIPTION FACTOR 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RITF1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 338.6 bits (867), Expect = 2.5e-91 Identity = 160/225 (71.11%), Postives = 188/225 (83.56%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G102890 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8LBV4 (Uncharacterized methyltransferase At1g78140, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g78140 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 255.8 bits (652), Expect = 2.1e-66 Identity = 138/279 (49.46%), Postives = 182/279 (65.23%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G102890 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6GGU0 (Demethylmenaquinone methyltransferase OS=Staphylococcus aureus (strain MRSA252) OX=282458 GN=menG PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 3.3e-06 Identity = 37/107 (34.58%), Postives = 54/107 (50.47%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G102890 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5HP74 (Demethylmenaquinone methyltransferase OS=Staphylococcus epidermidis (strain ATCC 35984 / RP62A) OX=176279 GN=menG PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 7.3e-06 Identity = 38/117 (32.48%), Postives = 55/117 (47.01%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G102890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LFD9 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G009430 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 985.7 bits (2547), Expect = 1.4e-283 Identity = 496/508 (97.64%), Postives = 502/508 (98.82%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G102890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C3P8 (uncharacterized protein LOC103496501 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496501 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 964.5 bits (2492), Expect = 3.5e-277 Identity = 491/528 (92.99%), Postives = 503/528 (95.27%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G102890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V9A8 (Transmembrane protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold329G00650 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 948.7 bits (2451), Expect = 2.0e-272 Identity = 477/497 (95.98%), Postives = 486/497 (97.79%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G102890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G4G7 (uncharacterized protein LOC111450661 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111450661 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 852.4 bits (2201), Expect = 1.9e-243 Identity = 423/508 (83.27%), Postives = 468/508 (92.13%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G102890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KF77 (uncharacterized protein LOC111493765 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111493765 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 851.7 bits (2199), Expect = 3.3e-243 Identity = 423/508 (83.27%), Postives = 468/508 (92.13%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G102890 vs. NCBI nr
Match: XP_004139261.1 (uncharacterized protein LOC101209187 [Cucumis sativus] >KGN60755.1 hypothetical protein Csa_019264 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 983 bits (2541), Expect = 0.0 Identity = 496/508 (97.64%), Postives = 502/508 (98.82%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G102890 vs. NCBI nr
Match: XP_008456594.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103496501 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 962 bits (2487), Expect = 0.0 Identity = 491/528 (92.99%), Postives = 503/528 (95.27%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G102890 vs. NCBI nr
Match: KAA0063557.1 (transmembrane protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 946 bits (2444), Expect = 0.0 Identity = 477/497 (95.98%), Postives = 486/497 (97.79%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G102890 vs. NCBI nr
Match: XP_038890635.1 (uncharacterized protein LOC120080138 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 902 bits (2331), Expect = 0.0 Identity = 453/508 (89.17%), Postives = 480/508 (94.49%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G102890 vs. NCBI nr
Match: XP_023521650.1 (uncharacterized protein LOC111785485 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 853 bits (2203), Expect = 1.49e-300 Identity = 429/528 (81.25%), Postives = 476/528 (90.15%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G102890 vs. TAIR 10
Match: AT2G12400.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT2G25270.1); Has 177 Blast hits to 172 proteins in 23 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 3; Fungi - 0; Plants - 164; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 8 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 601.3 bits (1549), Expect = 1.5e-171 Identity = 311/516 (60.27%), Postives = 381/516 (73.84%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G102890 vs. TAIR 10
Match: AT2G25270.1 (unknown protein; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 18 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT2G12400.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 501.1 bits (1289), Expect = 2.1e-141 Identity = 246/461 (53.36%), Postives = 334/461 (72.45%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G102890 vs. TAIR 10
Match: AT1G80540.1 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT2G12400.1); Has 175 Blast hits to 171 proteins in 20 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 2; Fungi - 0; Plants - 171; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 416.4 bits (1069), Expect = 6.7e-116 Identity = 226/477 (47.38%), Postives = 300/477 (62.89%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G102890 vs. TAIR 10
Match: AT2G41040.1 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 371.7 bits (953), Expect = 1.9e-102 Identity = 191/304 (62.83%), Postives = 230/304 (75.66%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G102890 vs. TAIR 10
Match: AT1G71110.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT2G12400.1); Has 173 Blast hits to 169 proteins in 21 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 3; Fungi - 0; Plants - 165; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 5 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 370.9 bits (951), Expect = 3.2e-102 Identity = 210/483 (43.48%), Postives = 293/483 (60.66%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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