Chy5G098610 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy5G098610
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionCACTA en-spm transposon protein
LocationchrH05: 11636082 .. 11650398 (+)
RNA-Seq ExpressionChy5G098610
SyntenyChy5G098610
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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CATACATATACATTACATATTACATATACATACACCCTAAACTATACACATTAAACATACACATTAATTTATACCTACATATACATATACATTACACATTACATATACATACACCCTAAACATATACACATTAAACATACACATAACACATACACATTAAACTATACCTACATATACATATACATTACACATTACATATACATACACATTAAACATACACATTAAACTATACCTACATATACGTATACATTACACATTACATATACATACACCCTAAACATATATATACATACACTTTACACATAAATTCAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAATAACCTAAAGGACGACGGCAGTGGGCGACGACAGTAACTTTGGTAATGGCTACGACAACGACAAGGAGGCGAAACCTTCTTCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCAATTTTTCTTCTTCTTCTGTGAGATTGTGAATAGGTTCTGTGTAAACATAGGTTACACCTGTCCCGACGTCTTCAAAAACGTAGGGGAAGGGGACTTTCTGCAACGTGAACAACACAAGCACCGCAGAAAGTTAAAATATTGATGATTTTATTATTACTTTTCGCGACGTCATTCCCCACCATATTACGGAAAATTAAATATTGAATTTATTATTTCAACCTTTCACAACGTACATTGGAGAGACATCGCGGAAAGTGGAAACGTGTTGTTTAAAAATCAACTTTCTGCAACGTATGTCAGAGAGCCGTCACGGAAAGATGAATTTAAAACGACATGTTTCCACTTTTCGCGAAGTCACCTACTTCACGTCGTGGAAAGTTGAATATTGAATTTATTATTTCAACTTTCTGTGACGTACGTTAGGGAGCTGTCGCGGTAAGTCGATACATATCTTTTCAAATTCATCTTTTCGCGATGGCTCTTTGAAATACGTCGCGGAAAGTTGAATTTGAAACAACACAGTTTCACTTTTCGCGACGTCTCTTCAATGTACGTCGCGGAAAGTTGAAATAATAAATTCAATATTCAACTTTCCGCGACATCTCACTGACATACGACGCGACAAGTTAAATTATTAAACTTCGTTTTACAGTTATGGCAAAGTGATGTTCTTGAACCTCGTAGAATGACTCTTTCTACGTTGTGTTGTTGTGGATGTCGGCAGAAGGTGATCAATGTCGACGCAGCTTTCGTCGACGTCGTTTCTGGCGTCACGATTGGTCCAATTTCTTGTTGTGATAATTATGTCACCTTGAACCAGGTTCATGAATTCCTTCCTCTTCTCATCACAAAAGGAACCAGGGTAAAACTTGTCTCTAAATGCCTTCCAGAATTCTTTCCATGTGACCACACTTTCCCCGCCTGCACTTACCACATAAAAGACCCACCAATCTTTCGCACTTTCTTGTAGCAAAAACATTGCTAATTTTACCTTTCTTTCTTCGAGGCAATCCATAACCCCAAAGTACTCTTCCATCAGGCTCAACCACTTCTCTGTGTCGATTGGATTAGAGGTCGGCACGAAGGTCATCGCTCCGAACGCCTTCAACCTTTTAAAGCAAAATCTCTTATCCAAACTTTGATGAAAGCGTTTGAGCATGCTTTCCCCTGCGCTTCTCCCAATTGGTGCATGTGGGTTACCAGACATTTCGTCAGATGCTTGTGCCTCATTGGCGCTCTACGTAGCTGGAACATCTACTGCTGCTTGCTTGACACGCCATGGCCTTCCTCTTGGTGCCATAATTCCTATAGTGCATCAATACATTAGACTTTTGTACCACTATACGACTTTTATATATATGCATGACTCTATCCAAGACTTTTTTCATGAACTTACACTCTGATACCACTTGTCACGCCCCATTCCAAATTCATTTTATGTGACTAACTGGAGGCATGCTGTGTAACACCCAAAAATTAAGGTAATTTTAAATTTAATTAACTTAGTTTGGTTTAATTGTGTTAGAATTATTTGGGTGTTATTTTAAATAATTATTGATAATTATTTGTTTTTTGTGGGAATTAGGATTAATTAAATAGTTGTTGGAAAAATATTTAATTGTTGAATTTGGTAAAATTAATTTGGTGAGATTTAAGGATTTTAGTTAATTATGTATAAATATATATGTAATTAATTAAATTATGGAAGATAAGAATAATTATATTGTTGGAGATAATATAATTATTAAGGATAATATGTTGTTATATTGATTTTAGGAAGATAAAAAGAAGTTTTGATAGGTAATTTAATGAGGAGAGAGAATAAGATTTATTTGTTTTGTTAATGGAAAAGGAAAAGTAAAAAGAGAAATAATAATAATTATTATTATATTGTAAATATAATTATATAGATATCCATAACTTACAAGATGGTATCAATATTCCTATAACTCTCCCTTTAATTTATGTTGTAACATTCATCCCATTGAATTCTATATTGTAACATATACCATAGGATGTCCTATAAATAGAGGTATGTGGTGCCTTTGTAAGATACACCACAATTGAGTTTAATTGTTCTCTACTTCCTCCATTCCTTATTTCTTCTCTTTGGTTGCTTCATTCTTCTTATTTAGCTTTTTTGTTCTTGTTTTATAACACGTTATCAACACGAGTCTCTACAATTTTATCATTTGCAAAAGGTAGGCTATAAAGTATTAGTTTGTTTTCTTGTTTTGTACTTGTAAACATTGCATGAACTATTTCATATAAACTTTATGCATAGTTTAAATGTTTGAGAATGTAATATTTTGAACCTATTGCATGTTATAATTTTACGTATTATGTTTACAAAATTATTGTTTGTTAAAAATATTGTTAGTTCATAATAAGATTGTTGTTTGATTCATCTTATTTACTTATGATTTATGTGATTGTTTATGTTTGGTTCTTATTTCAATTATTTTAAGATCTATGTATAGTTTATGGGTTCTTAATGGTTTGTGTCTATAATTTAAATATCTACTTTCTATTAGTATAAGTTTTGTAATTATTTTTATGATCTAGTTTTTTTTTTATGAATTTACTTAAGCATGTTGTTTTAATATATTATGTATAAGTATGTTGAAAAATTAACATTTTTGGTGTGTGTTGTTGTCACAATTTTCCATAATATGATATTTATCTAAGTTGTTTTATAATACATGTTTAACATGTTTATTAAATTTCTAATATGAGTAAATTTATTTGTTATAGTTTTACTATGTCAAGTCTTACCAAGTTAGAATTTCTAGCTCTTGATATCAATGGTGATAATTATTTATCATGGATGCTTGATGCTGAAATTCATTTGGATGTCATGAATCTTGGAGAAACAATTAAAGAAGGAAACACGACTTCAAGTCAAGAAAAGGCGAAAGCCATGATTTTCCTTCGACATCATCTTCATGAGGGACTAAAAATTGAATATCTTACGGTAAAAGATCCCTATAAATTATGGCAAAGTTTAAAAGAAAGGTATGATCATAAAAAAAGTGTGATTCTTCCTAAAGCTCGATATGATTGGATGCACTTAAGGTTGCAAGATTTTAAATCAGTAAGTGATTATAATTCCGCATTATTTAAAATTTGTTCAAAATTATTGTTATGCGGAGAAAAAATTACTGATGAAGATATGTTAGAGAAAACATTTTCCACATTTCATGTCTCGAATATGCTCATGCAGCAGCAATATCAAGAAAGGGGGTTTAAAAAATATTCTGAACTCATATCATGCCTTCTTGTGGCTGAACAAAATAACGAGTTATTAATGAAAAATCATGACTCTCGACCAACTGGAACAACACCATTCCCTAAAGCGAATGCTGTATTTTCAAACAATAATGGTCGAGGTCGAGGTCGAGGTCGTGGTCGTGGTCGAGGTCGTGACCATGGTAAAGGAAGAAGTAATTATACCTTCCATGGTAATAATCATTTAGATTTCAAGAAAACCACAAATGATGATCATAGAGGAAAAACTCCACAAAATAACAAATTAAAAAGTGGTGAAATTCAATGCTTTCATTGTGGTATGAATGGTCATTGGACTCGTACTTGTCGTAGATCCAAGCACTTAGTCGACCTCTATCAAGCCTCATTGAAGGAAAAAGGGAAGAATGTGGAAGTAAACTTTGCCTATCAAGATGATGTATATGACCCTTCGAATATGACACATTTGGATGTTGCTGATTTTTTTGAGTCTCCTGAAGAGAAAACTGATGTTAATGAAGGAGTAGCAAATACTTCCTTTAATTATGATAATGTCCAAAACTGATATTTACATTATGTTTTGGTATTTTTTTTTATATTCAACGTTTTTCAATTTATTTAAATTATTT

mRNA sequence

ATGGAAAGAAAGATGGATTACAAAGGAAAACGCCAAAAAGGACTAGAAGTTCAAGTTGTTTTAATTGTTTTTCCGTTCGAGAAATTTGGTCAATGATGTCGGTTGGATTGGACATTAGAAAGGGGTTGACCTCGAAAAATGATAACCTCTGTGGAATCGACGAGCCACACGGTATGTGGGGGAGTAAATTTGTTAAAATCATTTGACTCTTCTATTTTCCTCGTTTATTTGGTGTATTCTTTTTGGTTTCGAAGAGTGTTGGAGCCTAGCAGACTGTTGGGATGGGGTGATCAAGGTGTTGAAAGGGTCGGACTGCGACGTTGTTGCCATCCCTTTGTGGGGTGTTTGTAATTACAGAAACCTTTTTAGCAAAGCGGAAATGTCCTGGAGCGCAATATTTTGCTGAACAAGATCTCTTTTCATGTGGAGGAGTTTTCTGGTGTTGGTGGGGATGGTCAGGCATCGTTGAGGAGGGAGAGCCCGAGAAGTCATGAGATCTGGGTGCCGCCTGATATATGTTTGTTTTTGGAAGTTTTACTCTGATGCTATGTGGAACGATGTTGAGGAGGTTCGGTGGCATTAGTTAGGCTGTCCATGACTCTGCTAGATCTCTCAATCCTTGCTGGTTGTGAGAGAGTTGGATTCAAGTGGCCCATGGAGGTTCTTGAAACTTTGGCTATGATTAGAGATTTATCTGTGTTATTTTTTTTAGCTTGGGTCACTTCCCCACGTGGTTGTGGAGTCTGATTCTGCTACTCTTATTAATGTCATTAAACATAAGTTTTTGGTTCTGTCAGAGTTCTCTGACTTTTGTTGAGGTGGAGTTGTGGGTTGTGTATGTCCATGTCGTTTCTTTTGACTGGTGTGTGTTCTGCAAATGGGGTTTTTCAATTTATTTAAATTATTT

Coding sequence (CDS)

ATGGAAAGAAAGATGGATTACAAAGGAAAACGCCAAAAAGGACTAGAAGTTCAAGTTGTTTTAATTGTTTTTCCGTTCGAGAAATTTGGTCAATGATGTCGGTTGGATTGGACATTAGAAAGGGGTTGACCTCGAAAAATGATAACCTCTGTGGAATCGACGAGCCACACGGTATGTGGGGGAGTAAATTTGTTAAAATCATTTGACTCTTCTATTTTCCTCGTTTATTTGGTGTATTCTTTTTGGTTTCGAAGAGTGTTGGAGCCTAGCAGACTGTTGGGATGGGGTGATCAAGGTGTTGAAAGGGTCGGACTGCGACGTTGTTGCCATCCCTTTGTGGGGTGTTTGTAATTACAGAAACCTTTTTAGCAAAGCGGAAATGTCCTGGAGCGCAATATTTTGCTGAACAAGATCTCTTTTCATGTGGAGGAGTTTTCTGGTGTTGGTGGGGATGGTCAGGCATCGTTGAGGAGGGAGAGCCCGAGAAGTCATGAGATCTGGGTGCCGCCTGATATATGTTTGTTTTTGGAAGTTTTACTCTGATGCTATGTGGAACGATGTTGAGGAGGTTCGGTGGCATTAGTTAGGCTGTCCATGACTCTGCTAGATCTCTCAATCCTTGCTGGTTGTGAGAGAGTTGGATTCAAGTGGCCCATGGAGGTTCTTGAAACTTTGGCTATGATTAGAGATTTATCTGTGTTATTTTTTTTAGCTTGGGTCACTTCCCCACGTGGTTGTGGAGTCTGATTCTGCTACTCTTATTAATGTCATTAAACATAAGTTTTTGGTTCTGTCAGAGTTCTCTGACTTTTGTTGAGGTGGAGTTGTGGGTTGTGTATGTCCATGTCGTTTCTTTTGACTGGTGTGTGTTCTGCAAATGGGGTTTTTCAATTTATTTAAATTATTT

Protein sequence

MERKMDYKGKRQKGLEVQVVLIVFPFEKFGQ*CRLDWTLERG*PRKMITSVESTSHTVCGGVNLLKSFDSSIFLVYLVYSFWFRRVLEPSRLLGWGDQGVERVGLRRCCHPFVGCL*LQKPF*QSGNVLERNILLNKISFHVEEFSGVGGDGQASLRRESPRSHEIWVPPDICLFLEVLL*CYVERC*GGSVALVRLSMTLLDLSILAGCERVGFKWPMEVLETLAMIRDLSVLFFLAWVTSPRGCGV*FCYSY*CH*T*VFGSVRVL*LLLRWSCGLCMSMSFLLTGVCSANGVFQFI*IIX
Homology
[Close]
BLAST of Chy5G098610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LGZ4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G070910 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 107.8 bits (268), Expect = 7.8e-20
Identity = 51/63 (80.95%), Postives = 52/63 (82.54%), Query Frame = 0 

Query: 111 PFVGCL*LQKPF*QSGNVLERNILLNKISFHVEEFSGVGGDGQASLRRESPRSHEIWVPP 170
           P  G    +  F QSGN LERNILLNKISFHVEEFSGVGGDGQASLRRES RSHEIWVPP
Sbjct: 16  PLWGVCNYRNLFKQSGNSLERNILLNKISFHVEEFSGVGGDGQASLRRESLRSHEIWVPP 75

Query: 171 DIC 174
           DIC
Sbjct: 76  DIC 78

[Close]
BLAST of Chy5G098610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CAD2 (CACTA en-spm transposon protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold648G001000 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 83.6 bits (205), Expect = 1.6e-12
Identity = 38/56 (67.86%), Postives = 44/56 (78.57%), Query Frame = 0 

Query: 86  VLEPSRLLGWGDQGVERVGLRRCCHPFVGCL*LQKPF-*QSGNVLERNILLNKISF 141
           +LEPSR L WGDQGVERVGLRRCCHPF G   + + F  ++GN  +RNILLNKISF
Sbjct: 1   MLEPSRPLEWGDQGVERVGLRRCCHPFCGVFVITETFLRKAGNARQRNILLNKISF 56

[Close]
BLAST of Chy5G098610 vs. NCBI nr
Match: KGN61225.1 (hypothetical protein Csa_006336 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 105 bits (262), Expect = 1.23e-24
Identity = 51/63 (80.95%), Postives = 52/63 (82.54%), Query Frame = 0 

Query: 111 PFVGCL*LQKPF*QSGNVLERNILLNKISFHVEEFSGVGGDGQASLRRESPRSHEIWVPP 170
           P  G    +  F QSGN LERNILLNKISFHVEEFSGVGGDGQASLRRES RSHEIWVPP
Sbjct: 16  PLWGVCNYRNLFKQSGNSLERNILLNKISFHVEEFSGVGGDGQASLRRESLRSHEIWVPP 75

Query: 171 DIC 173
           DIC
Sbjct: 76  DIC 78

[Close]
BLAST of Chy5G098610 vs. NCBI nr
Match: KAA0047652.1 (CACTA en-spm transposon protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK08310.1 CACTA en-spm transposon protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 83.2 bits (204), Expect = 2.01e-14
Identity = 38/56 (67.86%), Postives = 44/56 (78.57%), Query Frame = 0 

Query: 86  VLEPSRLLGWGDQGVERVGLRRCCHPFVGCL*LQKPF*Q-SGNVLERNILLNKISF 140
           +LEPSR L WGDQGVERVGLRRCCHPF G   + + F + +GN  +RNILLNKISF
Sbjct: 1   MLEPSRPLEWGDQGVERVGLRRCCHPFCGVFVITETFLRKAGNARQRNILLNKISF 56

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy5G098610 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy5G098610 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0LGZ47.8e-2080.95Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G070910 PE=4 SV=1[more]
A0A5D3CAD21.6e-1267.86CACTA en-spm transposon protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_... [more]
BLAST of Chy5G098610 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KGN61225.11.23e-2480.95hypothetical protein Csa_006336 [Cucumis sativus][more]
KAA0047652.12.01e-1467.86CACTA en-spm transposon protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK08310.1 CACTA en-... [more]
BLAST of Chy5G098610 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy5G098610.1Chy5G098610.1mRNA