Chy5G098280 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy5G098280
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH05: 11155637 .. 11161104 (-)
RNA-Seq ExpressionChy5G098280
SyntenyChy5G098280
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TGTTGGGGATTTTGTGGCCATGATCGGTTGGGAAGATGTTTACAAGGTGGTTGCCGCCATGGCTCCATTGTACTTTGCTTTGATCTTAGGCTATGGCTCTGTGAAATGGTGGAAAATCTTTAGCACTCAACAGTGCGACGCCATTAACAAATTAGTTTGCTATTTCACTCTCCCTCTCTTCACCTTCGACTTCACTTCCCATATCGACCCTTTTCATCTCAACTTTCCTTTCATCGCCGCCGACGCCATCGGAAAACTTGTCATTGTTCTCTTCTTGGCTTTTTGGGCCAAGTGTACTACCAAAGGTAGTTATTGTTGGTCCATCACTAGCTTCTCACTCTCTACGCTCACCAACGCCCTCGTCATTGGTGTTCCTCTCGCTAAGGTCATGTACGGCCAAATGGCTGTCGATCTCGTTGTACAGGCAAGGTTTTAAACATTGATGTTGAAATGTTTTTATTATTAGGTTTGTATAAACTGATCGTAATGTAAACATGTCAATGAAAATTCTGAATTTTGAGTATGTAGGGTTCGGTGGTTCAAGCAATTATTTGGTTGACTATACTATTGTTTGTGTTGGAACTTCGACGAACGGGGTTGGATTTGGCAGCTGCTGAAGCTTCTTCAGGGGTTGTCAGTGACGAAAAAACTGTTCAAGTGGGTGGAGAGGGAGAAAAGGATTTAGAGGGAGAGGGCATGGAGGTTGAGGAAATGAGAAGATCAAGTAAGAGTCATAGGCCTTCTTTGAAGCCTTTGATGAAGAAAGTTTGGGTGAAGATGGCTGGGAATCCCAACTCATATGCTTGTACCATTGGCTTTGCTTGGGCATTTGTTGCAAAAAGGTATTTCTATATCATATGAAAAGAAAAAAAGAAACCATAGACCAAAAGAATAAAAAAGATTAATGAATTAAATAAAATCCATATAGTCTTTGAGCTTAAAAAAATGCATTTGATAGTTGCTTCTTTTTATTTTCTTTGAAATTTTAAGGTAAAATATTCTTATCAATTGTTTATTTTAACGTAGTTTTTATGCTTTTGAAATGTTTAAATTTCTTCTCCTACTTTTCGATGAATCTTAAAATAAATATTGATTATTAGTTTAAAATTAATTCTCAGTTGAAAAGCACTCTTAACTAGTCTCTTATTTATTACCATTGTTATTACAATTTATAAAACACAATAACTGAATTGTTACTTTTTCAAAGATAAAATTGTTAGATATTCATACTATTAAGTATCTTTTAATCTTATTTTTGTTTCGAGGTTCAGACTTTAATGACAAATAATACAATATATAAATATGGTTACCTTCATGGAGAGAAGCTAGTTATTGGATAAAGACTAATTATTTTATTTTTCTAAAAAAATAACCATATACTAACTTTAAGTAGTGAAATTTCACAGCTAAATTTCAACCTTTTGGACTAAATTAAGTATAACATGTTTGAAAGCGGATGTAAATAATATTTAAAAGAGTTATTTTTAAATATATTAAAATAAAACAAAATATTTATAAAATATAAAAAGATATCACAATCTATTTGAGTTCCGATATACTATTATATATGACTATCTATATTATAATAGATACATACAGTGATTTGTCTTCCTTTATTGTGATTTATCACATATAGATTTAATTATAATTTGCTATATTTGTAAATGTTTTTAAAAAAATTTCATGTAAAACAATTTCTTGGATGTTCTTTGTGTAGTAACACTTTCTTTAGTTATCAAACACATCAAATGTAATTTTAAGTTGAAACTTCTCACTATCTTGTATAAATGATTTCAAATGCATATTCTTCGGTGAACATCTGTTTGCAAAGTAAATGAAAAAGAAAAAACATTATATGATCGGAGTTTATGTTAAATAATTTATTAAATAGATGTCAATTATTAAAATAATATTTTATGCAATATTTACAAATTAAATTATACAGTACCAAAATAAAATTTAAATTCAAAGTGTGGAAATGAAACAAAACATATAATTATATATGTGTGTGTGTTACAAGGTAATAATGTATGTATATATATATATATATTAATGTTTTGAAAATTTGATGAAGGTGGCATGTTGAAATGCCAAGCATTATGGAGGGGTCTATTTTAATAATGTCAAAAGCTGGGATTGGCACTGCCATGTTCAACATGGGTAAGATTACAAACTTACTTCCTTTGTTAATTTAATTTTATTTTGCATCTTCTTTTATTAGGAAAGATATATGAAAAAACTAAGGGTCAGGTTTGGATTTATTAGAGTGAAAATTTTTCAAACAAATTATTTTTAGAAAAAAACAGCTCATAACACCAATTTTTTTTACATATTACGAATATGGTAAAATTAGTGATATCATACAATTATCAAGATAGTAATCATAGGCCTATCAGAAGACTATCAGACGGTAATTATATCAAAAGATAATTACTTTTAAATTTGCTACTTTTACAAATTTAGAAAATGTTGTAACATAGATTCTATTATCATAATTTTTTTTTCAATGTACAAAAATTTCTTATTTTTATTAAAAAAAATTACAGCTATTTTATTTTAAGTAATTTTCTATATTTTTTTTATTTTTAAAATTAAAGTACTTCAAAAGTAAATAAAAAAATTTCAACTAGTTGTCAGCTCTTTCAAAAATTTTCTCGATCACTTATTTCCAAAATTAAACCACCTGACCTAATTCTATATATTTAATAATCATGTTATTTAAGGATGATTTGAATGGTTATATTTAGTTTATAAACTTTTTTTAACTAGATTATATTATAATTTAAATTTTCTATAGTGTCCAGCAATTCCCATTAAAAAAATTTAATTCTCATTCTTTTTTGAAGAAAAAAATTAGTGGCTATAATTGAAGATTTGAGTGGAAATCTATTCAAAAAAGATATATGACATAAGCTAATAAAAATTATATTAATGGGATCTTAGGTTAGTATATTTGTTTACAATTAATAAAAGTTACAATCAAGTCATAATACATTAAAACATTTTATATTGTATACTATGTTTGTTTTACCACATACACCAAATGAGTAACTATTATTTAATTAACTACCAAATGACGTCTATCCTCCTTTTTTATTATTAAACAGATATTCTAACTCTTTTTACTATGACAATTTTAGGATGGAGGATCTAACATTTCCAACTTTTTATTGGAGTACACATATATCAATAAAATAATTGTTGAGTTATATTTAATTTAACAAAAATCATAAGACTTGGAGTTTAACAAACTTTTAGTTTAGGATTATACTCTTGAATTACATGAAAGGAAACAAACGCATTAAAGAAACGGGGTGTTTCTTATATATTTCCAATCCAAGTAGTCAATAAAAAAATTAAAGACGACAAAAATACTAAAATGGATATAGTTAAGAGGTAATTGAACATACATTACTAATTTCCTTAAGGTCAGAGGTTTTAAATTCTAATACTCAACCTGTTGGACTATAGAAATAAATGCAATCCAAAGTTGGTCTATAAAGAACATTTTAGAGAGTTTAGAAACTAAGTTGAAGACAATAGTATATGAAAGTAAGTATTTTTGTTCTTTGGTATGATGGGTTATGATCATGAAGGGAATAATTTTCTCACCAATAATTCAAAGAACATAATTTTCTTGGTATATGCTTTCAATTATTATTTTATTTTATACATTTTTGTTCGTGGTAGATAAGTTCTAAAACTTCAATTGGCTTCTTGATCAAAAAAACATATATTTTAAACCGTTGAATTAGGACAATAATATTTTTTATTTAGCTTATGCATAGCTTTCAATTAAGTGCAGGAATTTTCATGGCATTGCAAGAAAAATTGATAGCTTGTGGACCAGCACTCACTATAGTAGGAATGGTGTTGAAGTTTATTGCTGGACCAGCTGCCATGGCCATTGGCTCCATTGCTATGGGTTTGCATGGTGACGTTCTTCGTGTTGCTATAATCCAGGTTTAATTTTCTAACCACTCCTATTTATATTTATATATGTGTGTGAGAGAGAATAAACTGAGGTTTAGCTTTTTAATTTTTAGTATTGTGTGACTAATGAAAATCTACAAAACTTTAGATAAGACTCAAATTGAACCTTCAAAGGTGATGAACCTAAAGAGTCAATTTGAATATATAGGTTGTGAACTTTGGATAAAACTCAAATTGAGCCTTCAAAAGTTACGAACATAAAGAGTCATAATGAACATAAAGGTTATAAACTTTTTGGAGAAGACTCAAGTTAAAAGGTCAAATATTTTTGGAGAAGACTCTAGTTAGAAGGTCAATTTGAGTACATAAATACTATTTTTAAATTTTAAATAAAAATCAATAGTATAATATATTTGAAGGGTCAACTTAAGTCTTATCCAAAGCACTGGTCTAATCTAAATATAATTTTGGTTCATCGAGCAAGGCCAATGGTAGGGCTATAGGGTTGTGTTTAAGAAGTTGGGTTCATCCATGCCTAACCTAATTAGTGTTGAGGCTTCTAGTACTCGGGCTTACGTCAGGTTTGGGCCTTTGATTTTTGGGCTAGGCCAAGCTTCGCTCGACCCAATGGACGACTCAACTATGACAAAATACTTTCGCACGCCTAACTTCAACGACCAACTACGGCTCTAACAACACCACCTCCAACGACCATCTCGTGAGGCCAACTATGTCTAACCACCTCAGACGACACTTCATGAAACCACGTTCGATGATCAACTCCAACGACAACCACGCCTCTAATGATCAATACTACTACATTCACCCCGAACGCATCTCTTTGTTTTCATTTTGAATATTTTTAGTAAAAGTGTAAGAAAATGACTTTAAAAAACTCCAAGCATACTTTATTTAATAGTATTGATTGTAGGGACTAAATTTAAGTACACTAGAAGTATAAATTAGCTAAAACAAATTTTTAATTATTTCAAAAATTTTATGACAATTCATTTTAATGCAGTTTTTAATATCTTTTTGCAGGCAGCAGTACCACAATCCATTACATCATTTATTTATGCAAAAGAGTATGGGTTACACGCAGATGTTCTTAGCACAGCGTAAGTATCTGCTTTTAATTTTTGCTGATACCATCATTTAACGATAACGATTTTTAAAAAAAAATATTTATAAATTATATTTTTTCTTCTATTGATCAAAGTAGATAATAAAATAAATGAAATTATTATATGTAAGCTACAGTTTCTATAAATAAATTAAAATATTTTAAAATGAAGTTTCGATCTTTATAAAAGAAAGTCAAAGATGAATATGTTTTTGGATAAGTTATAAATCTTTATAACATTTATGACATTTAATTTTCTTGTATACTTGAATTAATATGAGTTGATTACATGATTAATTAATTTGTTAAATTGTGGCCTTTTTGTTTGAAATGCAGGGTGATTTTTGGGGCAATAGTTTCTCTTCCTGTGTTGGTTGCTTATTATGCAGCTTTGGAGTTTATTGTACATTGA

mRNA sequence

TGTTGGGGATTTTGTGGCCATGATCGGTTGGGAAGATGTTTACAAGGTGGTTGCCGCCATGGCTCCATTGTACTTTGCTTTGATCTTAGGCTATGGCTCTGTGAAATGGTGGAAAATCTTTAGCACTCAACAGTGCGACGCCATTAACAAATTAGTTTGCTATTTCACTCTCCCTCTCTTCACCTTCGACTTCACTTCCCATATCGACCCTTTTCATCTCAACTTTCCTTTCATCGCCGCCGACGCCATCGGAAAACTTGTCATTGTTCTCTTCTTGGCTTTTTGGGCCAAGTGTACTACCAAAGGTAGTTATTGTTGGTCCATCACTAGCTTCTCACTCTCTACGCTCACCAACGCCCTCGTCATTGGTGTTCCTCTCGCTAAGGTCATGTACGGCCAAATGGCTGTCGATCTCGTTGGTTCGGTGGTTCAAGCAATTATTTGGTTGACTATACTATTGTTTGTGTTGGAACTTCGACGAACGGGGTTGGATTTGGCAGCTGCTGAAGCTTCTTCAGGGGTTGTCAGTGACGAAAAAACTGTTCAAGTGGGTGGAGAGGGAGAAAAGGATTTAGAGGGAGAGGGCATGGAGGTTGAGGAAATGAGAAGATCAAGTAAGAGTCATAGGCCTTCTTTGAAGCCTTTGATGAAGAAAGTTTGGGTGAAGATGGCTGGGAATCCCAACTCATATGCTTGTACCATTGGCTTTGCTTGGGCATTTGTTGCAAAAAGGTGGCATGTTGAAATGCCAAGCATTATGGAGGGGTCTATTTTAATAATGTCAAAAGCTGGGATTGGCACTGCCATGTTCAACATGGGAATTTTCATGGCATTGCAAGAAAAATTGATAGCTTGTGGACCAGCACTCACTATAGTAGGAATGGTGTTGAAGTTTATTGCTGGACCAGCTGCCATGGCCATTGGCTCCATTGCTATGGGTTTGCATGGTGACGTTCTTCGTGTTGCTATAATCCAGGCAGCAGTACCACAATCCATTACATCATTTATTTATGCAAAAGAGTATGGGTTACACGCAGATGTTCTTAGCACAGCGGTGATTTTTGGGGCAATAGTTTCTCTTCCTGTGTTGGTTGCTTATTATGCAGCTTTGGAGTTTATTGTACATTGA

Coding sequence (CDS)

TGTTGGGGATTTTGTGGCCATGATCGGTTGGGAAGATGTTTACAAGGTGGTTGCCGCCATGGCTCCATTGTACTTTGCTTTGATCTTAGGCTATGGCTCTGTGAAATGGTGGAAAATCTTTAGCACTCAACAGTGCGACGCCATTAACAAATTAGTTTGCTATTTCACTCTCCCTCTCTTCACCTTCGACTTCACTTCCCATATCGACCCTTTTCATCTCAACTTTCCTTTCATCGCCGCCGACGCCATCGGAAAACTTGTCATTGTTCTCTTCTTGGCTTTTTGGGCCAAGTGTACTACCAAAGGTAGTTATTGTTGGTCCATCACTAGCTTCTCACTCTCTACGCTCACCAACGCCCTCGTCATTGGTGTTCCTCTCGCTAAGGTCATGTACGGCCAAATGGCTGTCGATCTCGTTGGTTCGGTGGTTCAAGCAATTATTTGGTTGACTATACTATTGTTTGTGTTGGAACTTCGACGAACGGGGTTGGATTTGGCAGCTGCTGAAGCTTCTTCAGGGGTTGTCAGTGACGAAAAAACTGTTCAAGTGGGTGGAGAGGGAGAAAAGGATTTAGAGGGAGAGGGCATGGAGGTTGAGGAAATGAGAAGATCAAGTAAGAGTCATAGGCCTTCTTTGAAGCCTTTGATGAAGAAAGTTTGGGTGAAGATGGCTGGGAATCCCAACTCATATGCTTGTACCATTGGCTTTGCTTGGGCATTTGTTGCAAAAAGGTGGCATGTTGAAATGCCAAGCATTATGGAGGGGTCTATTTTAATAATGTCAAAAGCTGGGATTGGCACTGCCATGTTCAACATGGGAATTTTCATGGCATTGCAAGAAAAATTGATAGCTTGTGGACCAGCACTCACTATAGTAGGAATGGTGTTGAAGTTTATTGCTGGACCAGCTGCCATGGCCATTGGCTCCATTGCTATGGGTTTGCATGGTGACGTTCTTCGTGTTGCTATAATCCAGGCAGCAGTACCACAATCCATTACATCATTTATTTATGCAAAAGAGTATGGGTTACACGCAGATGTTCTTAGCACAGCGGTGATTTTTGGGGCAATAGTTTCTCTTCCTGTGTTGGTTGCTTATTATGCAGCTTTGGAGTTTATTGTACATTGA

Protein sequence

CWGFCGHDRLGRCLQGGCRHGSIVLCFDLRLWLCEMVENL*HSTVRRH*QISLLFHSPSLHLRLHFPYRPFSSQLSFHRRRRHRKTCHCSLLGFLGQVYYQR*LLLVHH*LLTLYAHQRPRHWCSSR*GHVRPNGCRSRWFGGSSNYLVDYTIVCVGTSTNGVGFGSC*SFFRGCQ*RKNCSSGWRGRKGFRGRGHGG*GNEKIK*ES*AFFEAFDEESLGEDGWESQLICLYHWLCLGICCKKVAC*NAKHYGGVYFNNVKSWDWHCHVQHGNFHGIARKIDSLWTSTHYSRNGVEVYCWTSCHGHWLHCYGFAW*RSSCCYNPGSSTTIHYIIYLCKRVWVTRRCS*HSGDFWGNSFSSCVGCLLCSFGVYCTLX
Homology
[Close]
BLAST of Chy5G098280 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A287RUT0 (Uncharacterized protein OS=Hordeum vulgare subsp. vulgare OX=112509 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 62.4 bits (150), Expect = 4.7e-06
Identity = 82/272 (30.15%), Postives = 116/272 (42.65%), Query Frame = 0 

Query: 10  LGRCLQGGCRHGSIVLCFDLRLWLCEMVENL*HSTVRRH*QISLLFHSPSLHLRLHFPYR 69
           +GR +QGG RHG+ +L    RL L  +VE L    VRR      L   P L LRL   + 
Sbjct: 1   MGRRVQGGGRHGAALLRPGPRLRLGAVVEALHAGAVRRREPPRGLLRGPLLRLRLRRAHG 60

Query: 70  PFSSQLSFHRRRR---HRKTCHCSLLGFLGQVYYQR---*LLLVHH*LLTLYAHQRPRHW 129
           P  ++L   RRRR    R+      LG       +R    LL+VHH LL+  A Q  R  
Sbjct: 61  PLRAELPRPRRRRALQARRRAGARRLGRRVHALPRRRGAGLLVVHHRLLSGDAEQHARGG 120

Query: 130 CSSR*GHVRPNGCRSRW--FGGSSNYLVDYTIVCVGTSTNGVGFGSC*SFFRGCQ*RKNC 189
            ++   HVR  G R R    GG+ + L+         +  GV   +C             
Sbjct: 121 RAAAGRHVRRVGARPRRADIGGADHRLLP-------AAAAGVRGQAC------------- 180

Query: 190 SSGWRGRKGFRGRGHGG*GNEKIK*ES*AFFEAFDEESLGEDGWESQLICLYHWLCLGIC 249
               R R+  RG G  G G      E+     A  E  L + G ESQ +       + + 
Sbjct: 181 -VRRRRREAGRGGGRRGGGRRCGGEEAARAGLAIGESGLAQGGAESQRVRGRPRGRMVVR 240

Query: 250 CKKVAC*NAKHYGGVYFNNVKSWDWHCHVQHG 274
            K+VA  +++H+ G+  ++V+      HVQHG
Sbjct: 241 HKQVAHCDSQHHRGIGADHVEDGGRTRHVQHG 251

[Close]
BLAST of Chy5G098280 vs. NCBI nr
Match: BAT08851.1 (Os09g0505400, partial [Oryza sativa Japonica Group])

HSP 1 Score: 58.5 bits (140), Expect = 2.62e-05
Identity = 75/266 (28.20%), Postives = 105/266 (39.47%), Query Frame = 0 

Query: 8   DRLGRCLQGGCRHGSIVLCFDLRLWLCEMVENL*HSTVRRH*QISLLFHSPSLHLRLHFP 67
           DR+GR +QG   HG+ +L    RL L  +V  L    VRR      L   P L LRL  P
Sbjct: 5   DRVGRRVQGSGGHGAALLRAGPRLRLRAVVAPLHRRPVRRREPPRRLLRRPLLRLRLRRP 64

Query: 68  YRPFSSQLSFHRRRR-------------HRKTCHCSLLGFLGQVYYQR*LLLVHH*LLTL 127
           +RP   QL   RRRR              R+  H  L     Q   +R +L+VHH +L  
Sbjct: 65  HRPLRPQLPRPRRRRALQARRRARPRRLRRRRLHPLLRLRRRQARRRRRVLVVHHWVLAG 124

Query: 128 YAHQRPRHWCSSR*GHVRPNGCRSRW--FGGSSNYLVDYTIVCVGTSTNGVGFGSC*SFF 187
            A Q  R   ++   HVR  G R       G+ + L+      V       G G   +  
Sbjct: 125 DAEQHARRRRAAAGRHVREVGARPHRADLRGADHRLLPAAAARVRGEARHHGGGGAAAAA 184

Query: 188 RGCQ*RKNCSSGWRGRKGFRGRGHGG*GNEKIK*ES*AFFEAFDEESLGEDGWESQLICL 247
            G + R+        R G R RG  G G E +         A  E  + + G + + +  
Sbjct: 185 DGDRRRR--------RGGRRRRGGDGGGGEAVA-------VAAGESGVAQGGAQPERLRG 244

Query: 248 YHWLCLGICCKKV-------AC*NAK 251
             W  +G+  K+V       AC N++
Sbjct: 245 RSWRRVGVRHKQVCLRKRLHACRNSR 255

[Close]
BLAST of Chy5G098280 vs. NCBI nr
Match: XP_020405299.1 (uncharacterized protein LOC100281763 isoform X1 [Zea mays])

HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 6.95e-04
Identity = 34/111 (30.63%), Postives = 52/111 (46.85%), Query Frame = 0 

Query: 235 WLCLGICCKKVAC*NAKHYGGVYFNNVKSWDWHCHVQHGNFHGIARKIDSLWTSTHYSRN 294
           W C+       A   A+   GV  ++V+    + HVQHG  HG A +   +      +  
Sbjct: 246 WACVANRYAYAAHRAAQRLRGVGAHHVQVGHGNGHVQHGAVHGAAGEGAGVRAQLRGAGP 305

Query: 295 GVEVYCWTSCHGHWLHCYGFAW*RSSCCYNPGSSTTIHYIIYLCKRVWVTR 345
           G +V      HGH LH       R    ++ G +T IH+I+++CKR+WV R
Sbjct: 306 GAQVRARPGRHGHRLHRRRPPRRRPPRRHHTGRTTPIHHIVHICKRIWVAR 356

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy5G098280 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy5G098280 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A287RUT04.7e-0630.15Uncharacterized protein OS=Hordeum vulgare subsp. vulgare OX=112509 PE=4 SV=1[more]
BLAST of Chy5G098280 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BAT08851.12.62e-0528.20Os09g0505400, partial [Oryza sativa Japonica Group][more]
XP_020405299.16.95e-0430.63uncharacterized protein LOC100281763 isoform X1 [Zea mays][more]
BLAST of Chy5G098280 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy5G098280.1Chy5G098280.1mRNA