Chy5G096970 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy5G096970
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH05: 8069643 .. 8098317 (+)
RNA-Seq ExpressionChy5G096970
SyntenyChy5G096970
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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mRNA sequence

TCCAAAAAAGCCAAAAGATCAAGAATTAGCATGTGTTGAAGCAGATTTTGTGTTCTTCAAAAAATGAGTTATTGACTTTGAAGAGTGCTAAAAGTGGTGAGTTCAAGGTGTGCTACATTAATCTTATGGAAGTGGGAGTATAGTGAGAAAGATTTTGCTAAGATTATTTTATATGGGATTGATAGGTGTGTAAATTTTGGAATTGTTCATATGGGAGAAGGGGCGTTGGTTTTACTTTTGGAAATGTATTTATATGGGGGTTGATAGTTAGACATACTTTTGAAATGTTAGCATTGTTCATTATATTTTTTGTTCATATGGGGATGCCCGTATTATTCACAAGCTTGTAAGTTGTATATTGCAATGTTGAAGAAGTTAACTCTTTTGAAAAATATTGGTAAAATTTTAGTTGAAAATGTGGTTGAAA

Coding sequence (CDS)

TCCAAAAAAGCCAAAAGATCAAGAATTAGCATGTGTTGAAGCAGATTTTGTGTTCTTCAAAAAATGAGTTATTGACTTTGAAGAGTGCTAAAAGTGGTGAGTTCAAGGTGTGCTACATTAATCTTATGGAAGTGGGAGTATAGTGAGAAAGATTTTGCTAAGATTATTTTATATGGGATTGATAGGTGTGTAAATTTTGGAATTGTTCATATGGGAGAAGGGGCGTTGGTTTTACTTTTGGAAATGTATTTATATGGGGGTTGATAGTTAGACATACTTTTGAAATGTTAGCATTGTTCATTATATTTTTTGTTCATATGGGGATGCCCGTATTATTCACAAGCTTGTAAGTTGTATATTGCAATGTTGAAGAAGTTAACTCTTTTGAAAAATATTGGTAAAATTTTAGTTGAAAATGTGGTTGAAA

Protein sequence

SKKAKRSRISMC*SRFCVLQKMSY*L*RVLKVVSSRCATLILWKWEYSEKDFAKIILYGIDRCVNFGIVHMGEGALVLLLEMYLYGG**LDILLKC*HCSLYFLFIWGCPYYSQACKLYIAMLKKLTLLKNIGKILVENVVEX
Homology
[Close]
BLAST of Chy5G096970 vs. NCBI nr
Match: XP_038879646.1 (shaggy-related protein kinase GSK4-like [Benincasa hispida] >XP_038879654.1 shaggy-related protein kinase GSK4-like [Benincasa hispida] >XP_038879664.1 shaggy-related protein kinase GSK4-like [Benincasa hispida] >XP_038879671.1 shaggy-related protein kinase GSK4-like [Benincasa hispida] >XP_038879678.1 shaggy-related protein kinase GSK4-like [Benincasa hispida] >XP_038879687.1 shaggy-related protein kinase GSK4-like [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 47.4 bits (111), Expect = 8.72e-04
Identity = 20/35 (57.14%), Postives = 25/35 (71.43%), Query Frame = 0 

Query: 29 VLKVVSSRCATLILWKWEYSEKDFAKIILYGIDRC 63
          +LK  SSR ATL LW+ E+SE+D  +I  YGI RC
Sbjct: 57 LLKAASSRWATLFLWRQEHSERDLVRIASYGICRC 91

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy5G096970 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy5G096970 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy5G096970 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_038879646.18.72e-0457.14shaggy-related protein kinase GSK4-like [Benincasa hispida] >XP_038879654.1 shag... [more]
BLAST of Chy5G096970 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy5G096970.1Chy5G096970.1mRNA