Chy4G067840 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy4G067840
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Descriptionprotein ABCI7, chloroplastic-like
LocationchrH04: 726183 .. 730547 (-)
RNA-Seq ExpressionChy4G067840
SyntenyChy4G067840
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GTGTTCGATTAAAGGAGAGATGGTTGGCATCTCCCCTGACAGGGTCGGGAACAGCTTTCGGGCTTCCCTGTTAACACATACGGTTAAGGCTACCCACCTCTTGTAGGTGGATCTAACCCAATTTTTTTCATTTTTGTTTCTTTACCTTCCGAGAGTATTGCGAAGAGGGTGCCTGCGTTTGTTGATGGGAACTGGGAAGTTCGTGAGAGATTTGTATTGGTCTAAAGCTCCAGCCTTTTATGTTCCTGCTGGGTGTAAGGTAGGTAATTCCTATTGGGCAAATCCAAACCCTGTTTTGGAGTGGAGGTTAGGTTAAACATCCTCATATTCCTAATCAGTCTTTATGCTGCACATATCAAATGGACTTCTGTTCTGCAGGTTCTCTACTTTTCCGTTATTTAATTTTGTTGGTAGTTTTGGTAACCTGTTTCTGGCTGCTCTTACATTATGCTCATGTGTTTATCTCAGGTTGGGAATGTGACCAAACATGACAAAGAGAGTACCTGCCAGATAAGATTGGACAACTATGTCCGTTTTTATGAATAGTTTTAGGTAAAACCAATAGCAGCATCACGTGGATTTATTTCCAAAATGGATAGGATCGTTGCCCGTAACATCTCATCCATCCTAGATTTTAAGTTAAGCCTAGTTTGGTACCGTTTTAGTCTTTGGTTCTTAGAAGTAAAGCTTATAAGCTCTCTTTTGCCTATGAGGTTCTTTGTTTTGTTATTGTTGTTTAGGGGAAGATGAAAACATATGAAAGAAAATAAACACAATTTTAAAAAACCAAGTAATGTTGATATTAGATCTTGAAATCAGGAGTGTAAGGTCTGTATTTCTCATTTTTTACAACCTGTCTTGAGAACCTTCCCAATGTAGGATTCACTTTGATGGTTAATGTGAATTTTTCTTTTGAAAGCATCTTTTTGAAGTAACTATGGAAATCAAGTGCAAACCAGTTCTCATAGTACAATTTTGTTGAAGATATAGGTCTTTCAATTGTTTTAGTTGTTTTTCCTCCCCACATGTAAAAAGTTCTAGTACTTTTTTCAAGCTAGCAACTTATGGGTCTAAGATAGTTTGAAAGAAGTCCCAGAGCTTATGGGTCTAAGCTGCAAGCTAGCAGCTTATGAGACTAGCAATTATGTCACGCACGATCTCGGACTAGGAGCTTATGAGTCATAGGCCTCTTCCTTCTTTCAGGCTAAGACTGATGTTGCCTGTTTCCTGTTGGACTCTCCCATTGGAAAATTCTCAATTAAATTTGGAGATTTAGAGTCCCTGGATAATTATAGTCCTCTGTCATTAAGAACACTCTTTGTTGGTAGATACCGGCGAATTTAATATAGGTCCAGGGGCTCGACTCCACCCTCAACTTTATTGTTTTTATATAATATGTATAAACAAAACCAATTAATGTTTAATATTTGTAGGCAATTTAGTGGTAATTATGCTTGTTAGCCCCCCTCCAACCAGAGTTTAAGTCTTACTTGTGTAATCTATTTTTCAGATTTTTATTTTTTCTTTAAGTTACAACTTGAAGCTCCTTATCAATAAATTTTCTGGATCCGCCACTGTTGGTAGATGATTTTGCAAATTCTATTGATACAAGTAGAATTGAGGAAGTTTTATCAGAAGAAGGTCTGAAGGAGGAGGCTGCTGTTTTGGAAACCAAATCCTTCAATTTCAAATGAAGTTTTGGTCCAAAGAAAGCAGCTTTCTTTGAGATCCCAAGGGTCACTCCAGTTGCATGAGAAAGATAGATACAACTTCATCATTCTTCTTCACTCCAGTTGCACAAGCAGAAGCAGAAGCACAAGTACTAGCCTTGATCTCACAATGTCAGTTTACAAAGGAGGTGCCAATTCATTCGTCCTCTGAAGATGCAGTTTATTAAGGAAGATTCAGATGATGACTGATCTTCAGTGAGTGAGTATTATTTGGTGTTAAACACTATTCCTGAAGTATTTGATGAAGATCTTGGTGAATATATTGCATATTTGTCAATAGTCTCAATATACAAGTTAATGTGTAATTCAAGTTGAAGATTAAGATGGAAAATTATAATTTGTTTAGTTTTAATTTCACATTTTCAAAAGGGTTCAAAATTAATTAGCTAATTAATAGTTGTCTAAACAAGGCTTCATGCAACTTGCCCAAGTTTAAAAAGCCACCCTAAGTATGAAAGTTAATAAGAGAGTTTGGTTTCATAAGTTATGAGAAAATATTTATAAATAATAAATTTTCTTTCTAAATAACTCAGGAAACAAATATTTATATAATGTATTTTAAAAAGGGAAATTTTAAAAAATAAAAAAATAAATTAAAATATTTATTAAGCTATAGAAAAATTTTGAATTCTATCATCATTGATACTGATAGACTTCTATCATTGTAGCATATGAGTGACTATCAGTGATGGAATTTAAAATTTTGCTATAGGTTATAAATATTTTGTAAAATTTGCTATTTTTGAAAATTTTCCTTTCAAAAATATATTTTTATTTTCTTTAGAATTAGATATAACCAACTTGAAAAATAGGACCTTACTTGAGCATCATTTGTTCTATAGGTTGTATAGACGTATCCTTAGTTTTACGTAATGAGATTTAAAAAAAAAACAATATGTTAATATAATGCCCGATATATTTGGTACACGATAAACGATTTAACTATATGATCGTTTAGATTTGTTTACATTTACATTTTGGCTACCCAAATCTAAACGATTATGTATAAATACCCATTTTCAAGATTCTTTAGATTTAGATTTGTCTACGTTTACATTTTGCTACCCAAATGTAAAAGGAGTTTTCAAGATTCTTTGACTTTAGATTTGTCTACGTTTACATTTTGCTACCAAAATCTAAATGATTTTTTAAAAGATTTTTTTGCTACATGATCGTTTAAATTTAGCTAGGCGATTATTTGTTCGTGTTTGCTACATGATTGTTTAGATTTGGGTACACAATCGTTGTACCAATATCAAAAAAAAATTCAAGATATTTTATATTGACCTTGAAAAAAACAATACAACATTTATGGTGGATTGAAAACAAAGATCATGATTTCAAAAATATATAAAAGAAAATTTAAGAAAATTTAAGAAAGAAGATGGAAAGGAAAAACAAATTTGAAATATTTATATAAGAAAAAAGGGTGGCTTCATAACTTTTTTATTTTGTTAAATAGTACTCCGTAAATATTCTTGTGTTTTGATATATGTATAAAAATTAATTTTTTTTTTTTAAATTTTCGTTCTTATCATTAAGCTTAAATTAGAAATAGATAATGATTTCGTTTTCAATTCTTTCTTTCTTTTTTTCATTTTCCATGATTCGAAGTAGATGAAATGATTTTTTTAAAATCTTTTTTGTGAATTTTTGTATTTAAAGTGAATTACATTATATAATCCTATAATCATCAACTAAATTGGAGAAAGGGAAAGAAACCAAAAGTTTTCTCTAGAGATGGGATATATTGATTGATAGAAAGATTAGATAATTTTTTTTACACAAATTGTAAATAGTTTTGGTGATAAGTTATTTTAGTTTTGCTTTTTAGAGTAAAAAATGACACACACAATTTTTAGTTGTTTTGATCATAGTTAAATGATGCCTTGTGCACTTTTTTCCAAACTTTAACAGTTTGATGTATTCATAGAGTATAGTTTACAAATTAAATTTAAATTTAAAGTGAGTTTATGTGTTTGTAAAGGTGGTAAGTTTATGTTTAAGTTTAATAATAGACTTTAGAAGTTGTGATGTTTGAATTGTTGACGGGATGGAAGTCTTATGCTACTAATTAGTTGTTGTTGATGGGGTACAGAGTTCGAGGAGGATATTTGGCATTTGATTAGATTTAATAATTCTTGATGAGGACACGTTAATAGAGTGTTTTGTAATTATAAACTTAATAGTAACCTTTTTTTATATTGGGATTCCCTTTAAGTGGTGTGGTGATAGTTTGAGAAATAATATGTTATCACGTGCATGTTGCTTCGATGTTGTTAATTGTTATATGCACGTTAAACTGACTTGTTTATGTGCACGGTAAAGTTCATTTGTGTGCTTATTAAGTAGGTGAAATATTTGCTTGATTCATTTTTTATAATATGTTAATTAACATTCATTTCTAACAAATTTGTAGGTTTTCGAAGAATCCGTGGACCATGAGATCAAGTCAATTTATGCGTTAGTTTGATTAGATTAGGTGACTCATATATGTATTTAATTGTTTTATAGTTTATGTATTGAATTCTTGTTAAATCTTTACTGACGACAATGTAATTAAATTTTTTATTATCAACTTAAAGATTTATCTAAACATACGTGGGTAATGTTGAATCTTAAATTTTAATTTTCT

mRNA sequence

GTGTTCGATTAAAGGAGAGATGGTTGGCATCTCCCCTGACAGGGTCGGGAACAGCTTTCGGGCTTCCCTGTTAACACATACGGTTAAGGCTACCCACCTCTTGTAGGTGGATCTAACCCAATTTTTTTCATTTTTGTTTCTTTACCTTCCGAGAGTATTGCGAAGAGGGTGCCTGCGTTTGTTGATGGGAACTGGGAAGTTCGTGAGAGATTTGTATTGGTCTAAAGCTCCAGCCTTTTATGTTCCTGCTGGGTGTAAGGTAGGTAATTCCTATTGGGCAAATCCAAACCCTGTTTTGGAGTGGAGGTTAGGTTAAACATCCTCATATTCCTAATCAGTCTTTATGCTGCACATATCAAATGGACTTCTGTTCTGCAGGTTTTCGAAGAATCCGTGGACCATGAGATCAAGTCAATTTATGCGTTAGTTTGATTAGATTAGGTGACTCATATATGTATTTAATTGTTTTATAGTTTATGTATTGAATTCTTGTTAAATCTTTACTGACGACAATGTAATTAAATTTTTTATTATCAACTTAAAGATTTATCTAAACATACGTGGGTAATGTTGAATCTTAAATTTTAATTTTCT

Coding sequence (CDS)

GTGTTCGATTAAAGGAGAGATGGTTGGCATCTCCCCTGACAGGGTCGGGAACAGCTTTCGGGCTTCCCTGTTAACACATACGGTTAAGGCTACCCACCTCTTGTAGGTGGATCTAACCCAATTTTTTTCATTTTTGTTTCTTTACCTTCCGAGAGTATTGCGAAGAGGGTGCCTGCGTTTGTTGATGGGAACTGGGAAGTTCGTGAGAGATTTGTATTGGTCTAAAGCTCCAGCCTTTTATGTTCCTGCTGGGTGTAAGGTAGGTAATTCCTATTGGGCAAATCCAAACCCTGTTTTGGAGTGGAGGTTAGGTTAAACATCCTCATATTCCTAATCAGTCTTTATGCTGCACATATCAAATGGACTTCTGTTCTGCAGGTTTTCGAAGAATCCGTGGACCATGAGATCAAGTCAATTTATGCGTTAGTTTGATTAGATTAGGTGACTCATATATGTATTTAATTGTTTTATAGTTTATGTATTGAATTCTTGTTAAATCTTTACTGACGACAATGTAATTAAATTTTTTATTATCAACTTAAAGATTTATCTAAACATACGTGGGTAATGTTGAATCTTAAATTTTAATTTTCT

Protein sequence

VFD*RRDGWHLP*QGREQLSGFPVNTYG*GYPPLVGGSNPIFFIFVSLPSESIAKRVPAFVDGNWEVRERFVLV*SSSLLCSCWV*GR*FLLGKSKPCFGVEVRLNILIFLISLYAAHIKWTSVLQVFEESVDHEIKSIYALV*LD*VTHICI*LFYSLCIEFLLNLY*RQCN*IFYYQLKDLSKHTWVMLNLKF*FS
Homology
[Close]
BLAST of Chy4G067840 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CRH6 (protein ABCI7, chloroplastic-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503518 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 2.7e-05
Identity = 27/31 (87.10%), Postives = 30/31 (96.77%), Query Frame = 0 

Query: 113 SLYAAHIKWTSVLQVFEESVDHEIKSIYALV 144
           SL A+HIKWTSVLQVFEES+DHEIKSIYAL+
Sbjct: 92  SLNASHIKWTSVLQVFEESIDHEIKSIYALL 122

[Close]
BLAST of Chy4G067840 vs. NCBI nr
Match: XP_008465947.1 (PREDICTED: protein ABCI7, chloroplastic-like [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 58.5 bits (140), Expect = 2.80e-07
Identity = 27/30 (90.00%), Postives = 29/30 (96.67%), Query Frame = 0 

Query: 113 SLYAAHIKWTSVLQVFEESVDHEIKSIYAL 142
           SL A+HIKWTSVLQVFEES+DHEIKSIYAL
Sbjct: 92  SLNASHIKWTSVLQVFEESIDHEIKSIYAL 121

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy4G067840 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy4G067840 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A1S3CRH62.7e-0587.10protein ABCI7, chloroplastic-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503518 PE=4 S... [more]
BLAST of Chy4G067840 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_008465947.12.80e-0790.00PREDICTED: protein ABCI7, chloroplastic-like [Cucumis melo][more]
BLAST of Chy4G067840 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy4G067840.1Chy4G067840.1mRNA