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Chy2G040700 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGGTGGTACCGGCCAGGGGCATTGTCCTTCACTGTCCTAAAACCCTACTTTCTCTATAACTCTTTAACCACTCCCAAACTCACCAATAGATCTTCTTCGATCGCGGTCATGCCGACGAAATCCATAGGCGAATCAGATGTTGGCATACTCAGTTACATTTCTTCTCTCCCTGGCTTTCGCGGCATTCTCAAGCAAAGGTCTCAGCTTCTTACCCCCATGCATGCCCTTCATTTCTCAGGGATGCTACAACTCTCAATCCAATTTCGTACTATCTGCTTGATTGTATTGAAGATAAGGGTCGACTCTTAGAATGTGAAATGAAATGTTGAGAGTAAATTTAACTTATGAAACCGTTTTTCTGAATTGATAACAAAATCAGAATGAATGAGACCAAAAGGGTAACTTCAACTGCCAATTGTTGTTATGAATTAGTTGACATAACTGGCACCATGGGAATGTTCTTATGGTGTCATTGCCAGAGATTTTTTGTGGCCGTAATCTGTTCGGAGGAGGGTTTTTTTTCCTATCCCACTTTTGTTGTTTTATCATTTATTAATGAAGTTTCTGATTCCTCAGATAAAAAGGTTCGGTAGTGATGTGTCCATCGTATAGCATCTGTTGTTTGTTCTCGTTCTATTATTGGAGTGGGAAATAGAGCAATGAGCTTTTAGGTTGTTGTAGGAATGCTAATAGCAAATAGTATCATTCAACTATATTCTCATAAGGTTTGGATAAAGCCTAAAGGGACGATTTTTACTTTATTTTTAATTTTTGAAAAAACTTTTACTCAACGATCCAGTTGTATGACATTTTTTTAAAGCTTTTAGAACCCTATCATTGTATGCTCATCCTTTTTTGGTTTCGATACAGGTATTCTGATTTCATTGTGAATGAAGTTGACACTGATGGAAATGTTGTTCATTTGACGTCATTGGATGCTCCTCCAGAGGTGGTGAAGTTGAATTTCTGTGTTTATATTGGATGCCTTAGATGTTGATTTCCTCCTTTTGCCTGAACATTTATGGTAATTTTAATTCTTTTGAGGCTTCAGATTGTTTCGGAAAGTGGACCAACGATAGTCCACAGTACAAGCCAGAGTTATGCTTCTGAAATTGAATTGTTTAGATCTCTTGCTGGTGATTCTGATGCTAAGGTTTTGGAAGCTTTTCTTAAGCAAATCAATTCTGGCGTGAATGATGACATTTCGCCTATTGTATTCTCCCCAGATACAGACAAAACTCATCGAACGGTTAGCTCTATGACCTTGTTTGTTAATGTATTTGCACATTCATTTTTGAGTATCGTGCATTTTTTGATTCCGACTAACAACCAGTGCAGGCCATCATCTCTTTCTTCTTTTAGCTGATCTTGAGATTATTCCTTTAGTTTTTAACTAAAACTGTCCATTGTGGTACAGATATCTATATCTATTTTCAATGCTAAATATTTTAATTTTCTCAAAGTGTAACTTCTCTTACCATTCAGTCAGATTGAACAAATAAATAAAGACATATCTTTGTTTACTTTTCATCACCATATAATTTACTCTTTGAATTTGCGGTTTTCAGGCTGTCCACAATTTCTTTAAGAAATTTAAGTTCCTTGTGACCGATACTATTGATGGACCAGATTCTGCATCAAAATGTGTCCGTGTGAGGGTGGATTCAGGGGTAAAGAATAACCGAGGTCGTTTCTCTAAGAAACGGAAAGAAAGGGGCGATAAACCCTTTGATAGTAGAGGTTCGGACAACTGGCCTGAACATGTTGGCAAGTTTCTCAGGTAAGGTATTTTCTACTTTTTAGTAGTTCTGCTTGCTTTGGACTCGCTTCTGCCTTCTTGCCTTCTTGCCTTCTTGCCTTCTTGCCCTCTTATTCATAATTTTACATTTCGAATAAGAAAATATTTATACTTTGGTCTTAACGTCTACATCTGAATTGAATTGAAGTACTAAATATGAACCGTCTTCCAAAAGTTTTGCATCTTTCTCGATGAAATTTTTTGTTACGAGCAAAACAGCCAGTTTGTGCTCTTGCTTTATCTTGATATAAATGCTTAATGACTTTTTCTAACAAGAGGTTAAATGGTCTTTTTGCTATTGGGAAGTTCTTTTGTAATCCTCTAGCTTTAGTTGATATTTCTCTCTTTCTGTGCGTGTACGTGTTTTATTATTCGGTTTTCGTTTTTGTATATTTTATCAGATCATTGAAATACTTTTATATCATTTCTTATCCCCATAACAAAAATGTTGTACCATCAAATTGCGTCAATCTAAAAAGGAGATTTTTATTGTTGTGTTATTTGATTGGAAAGTTTTCCAAACTATTTTGTTTTCTAGAACTGGCGTCTTTCTTTTTTTCCCATGTAATTATGCACATAGCTTAACAATTTTTCTAATTTATGGTTATCTGTCTGGATGTTGAATTCTGAATCAATTTTAACATGTCAATTTGAAAATATTTTAGGTTTCATCTTTACAAGGAGAACAAGGACACACAAGAGGCATTAGGACTTATAGGAAAGATGCTTGGCATCCAGGTTCATATAATCTTTGGGCTTATTTCTCTCTCTAATAGTTGTTTTCCTGATTCTCTACATTGTATTTTTTGTTTCTTTTCTTTCATTTCCCTATCGACAAATTGGATAAACTGTTTGTGTGCTCCTTGTTCATCACGTTTTGGAGTGGAAACTTAATCCTGTGCAGTGTTTTAAATAGCCTATTGGAAGTGTGCCTAGGCTCAAGGCACAGGTCTAGCGCTAAGTCTGCCCACAAAATAAGGTGCGTCTCAAGCATGCGCCTTTTGTGAAGCCACAAGGCTCAAAGCCTTGAGCTTTAGGACCTTTTCATTTTTTTTTTAAAATTGTACTAATTAAGGGTTTCCCTTCTTTATTAACTAAAAGAATCAAGTTTACTAAGCCTAAATGCAAAAATTCTTGTGTTTAGGGTCTTTTTCTTTTTCTTCCATATTTCCACTTCAACTATGCTTCTCTTTTTGATGTAATATTTTTATATGTAGTGCGTCTCACAAAAAAGCCTGCTCCTTTTTGTGCGCCTTACGCCTAGGCTTAAGAGGGCCATTCTTCCTTAGTGCGCCGCCCTAGGCATTTAAAAGCACCGATCCTGTGTAAATTTTGTTCATTCACGCCTTTGTAATTTGTTGTCTCCTTGTTCATTTATAACTGCCCTTGTGATTTGTAATCTTGTTCATTTGTACCAGCTCTTTTTTTTTTTCTTTGTACGCCCTTGTATTCTTTCATTTATTTCTCAATGAAAGCTTTTGAATTTTTGTACCAGCTATTGACTAGTGCTTGTCCTGTCGAAACTAGGGGTAGTTTGCAATTTGTTTGAATAGATTTGGTCACACATACATGTATTACAGTTAATTATGGAGACATTGCTGTCCCCCTTACTAAACTACTGCAGAAAAATGGTTTAAATGGAGTGAGGAAACCGAAGCCTTTGAACAGTTGAAACAGGCCATGATTTCTGTCCCCGTGTTAGCTCTTCCAAATTTCTCAATACCGTTCACTATTGAAACCGATGCTTCAGGGGTTGGGTTAGGTGCTGTATTATCACAGAATGCTTGACCAATTGCTTATTTTAGTCCGAAATTGTCCCCTCGTGTGCAGGCCAAGTCCATATATGAGAGAGAACTGATGGCAGTCCAGAAATGGAGGCATTATTTGTTGGGTATAAAATTCACGGTACTTTCAGACCAAAAAGCCTTAAAATTCTTGATAGAACAACGGGAAGTCCAGCCCCAATTTTGGAGGTAGTTGACCGAACTCCTTGGGTACGACTTTGAAATCTTGTATCAACCCGGGTTGCAAAACAAGGCCGCAGATGCTTCCCGAATGAACCACAAAGTGGAACTTAATATAGTGACTGCTCAAGGGCTGGTTGTGGTTGATGTTGAGATGGTTATGAGGGAGGTGGAAAACGATGAGGAACTCCAAAACATAATCAACATTTTGAGAGAGGATTTGGAAGGGAAAGTTAATTATAAATTAGTGGCTGGCTGCTTGTTGTATAAAGGAAGGTTAGTCCTCTCTAAAACATCCACTTTAATTCCAGCAGTACTTCATGCTTTTCATGACTTTGTTTTAGGAGGCCATTTGGGATTCCTTCGAACTTACAAGAGAATTAATGGAGAAATCCATTGGGTTGGTATGAAAAATGATGTAAAAAGGTGTGTAGAACAATGTGAAGTATGCCAAGGGAACAAGACGGATGCGCTTTCTCCGGCTGGTCTTTTACAGCCCTTACCCCTACCCAACTTAATCCTTGAAGATTGGACGATGGACTTTATAGAGGGACTTCCAAAGGCAGGGGGATTTGATACAATCATGGTGGTAGTAGGTCGTTTGAGTCAAATGGCCTATTTTATCAACCTTAAGCATCCATTTATAGCAAAGCAAGTTGCTGAAAAATTAATTGAAGAAGTGATCTGTAAGCATGGGATCCCAAACTCATTCGTCATAGATCGTGCTAAGATTTTTCTATGCCATTTTTGGAAGTAATTATTTTTGGCCATGGGTACATCTCTAAAAAGAAGCTTCGCATTTCATCCTCAAACGGATGGCCAAACTGAGCGAGTAAATCGTTGTCTCGAGACTTACCTACGCTGTTTTTGCAATGAGCAGCCCAATAAATGGCACAAGTGTATACCATGGGCTGAGTTGTGGTATAATACCACTTTTCACTCATCAACTAGAATGACCCCGTTCCAAGCGGTTTATGGAAGGCTCCTACCCCCACTAGTTTTATATGGAGACCGACAAACAGCCAATAACAATGCTGAACAATTACTCAAGGAGAAGGATTTGGTGATTAGTGCCTTGAAAGAAAATTTAGTAGTAGCTCAAAATTGAATGAAGAAGCAAAGTGATCTCCATCGAAGAGAGTTGAAGTTTAAAACTGGGGACGAGGTATACCTCAAATTGAGACTGTATAGACAAAATTCTATGGTCCTTGCCGCATAACAGAAGAAAT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MGWYRPGALSFTVLKPYFLYNSLTTPKLTNRSSSIAVMPTKSIGESDVGILSYISSLPGFRGILKQRYSDFIVNEVDTDGNVVHLTSLDAPPEIVSESGPTIVHSTSQSYASEIELFRSLAGDSDAKVLEAFLKQINSGVNDDISPIVFSPDTDKTHRTAVHNFFKKFKFLVTDTIDGPDSASKCVRVRVDSGVKNNRGRFSKKRKERGDKPFDSRGSDNWPEHVGKFLRFHLYKENKDTQEALGLIGKMLGIQTRSFGFAGTKDKRSISTQRVTVFKQHASRIAALNDRLIGIKLGNFSYIQEGLLLGQLLGNRFTITLRGVVANSEDVIKASAEALGRHGFINYFGLQRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGDILLLMRVQGRIVTLLICLLTNARNYYKESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTGTTAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEMCKLGLPTERHKLVKAVTAEDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATKDSISLTNSVHNVKEFSITSMTGSYRRVFQRPKDYEWELISYVDRNLPLAQSDLHNLLKSQSVEISKEEKIADKSEDSLDSTDQSVCCKKNIQLEAGGKENENGQGTQDPQMALKLSFTLPASSYATMAIRELLKTSTSRLALPYMETDGNSEKFSRSVKREPGDKGTSENTKIFLVSRSAVSVWTNSV* Homology
BLAST of Chy2G040700 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q08647 (Multisubstrate pseudouridine synthase 7 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PUS7 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 323.2 bits (827), Expect = 8.2e-87 Identity = 233/709 (32.86%), Postives = 360/709 (50.78%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G040700 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96PZ0 (Pseudouridylate synthase 7 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PUS7 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 321.2 bits (822), Expect = 3.1e-86 Identity = 226/696 (32.47%), Postives = 335/696 (48.13%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G040700 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O74343 (Multisubstrate pseudouridine synthase 7 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=pus7 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 319.3 bits (817), Expect = 1.2e-85 Identity = 234/727 (32.19%), Postives = 359/727 (49.38%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G040700 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q08DI8 (Pseudouridylate synthase 7 homolog OS=Bos taurus OX=9913 GN=PUS7 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 318.9 bits (816), Expect = 1.5e-85 Identity = 225/696 (32.33%), Postives = 336/696 (48.28%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G040700 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q91VU7 (Pseudouridylate synthase 7 homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Pus7 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 315.5 bits (807), Expect = 1.7e-84 Identity = 223/696 (32.04%), Postives = 329/696 (47.27%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G040700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CHJ1 (pseudouridylate synthase 7 homolog isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501017 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1317.8 bits (3409), Expect = 0.0e+00 Identity = 675/725 (93.10%), Postives = 685/725 (94.48%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G040700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V3D9 (Pseudouridylate synthase 7-like protein isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold79G00610 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1261.9 bits (3264), Expect = 0.0e+00 Identity = 647/688 (94.04%), Postives = 654/688 (95.06%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G040700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CI40 (pseudouridylate synthase 7 homolog isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501017 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1253.0 bits (3241), Expect = 0.0e+00 Identity = 642/689 (93.18%), Postives = 652/689 (94.63%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G040700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F560 (multisubstrate pseudouridine synthase 7 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111440943 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1204.1 bits (3114), Expect = 0.0e+00 Identity = 617/725 (85.10%), Postives = 654/725 (90.21%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G040700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KMR0 (multisubstrate pseudouridine synthase 7 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111496015 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1193.3 bits (3086), Expect = 0.0e+00 Identity = 613/725 (84.55%), Postives = 650/725 (89.66%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G040700 vs. NCBI nr
Match: XP_011660284.1 (LOW QUALITY PROTEIN: pseudouridylate synthase 7 homolog [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1346 bits (3484), Expect = 0.0 Identity = 687/725 (94.76%), Postives = 695/725 (95.86%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G040700 vs. NCBI nr
Match: XP_008462716.1 (PREDICTED: pseudouridylate synthase 7 homolog isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1319 bits (3413), Expect = 0.0 Identity = 676/725 (93.24%), Postives = 684/725 (94.34%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G040700 vs. NCBI nr
Match: KAA0062573.1 (pseudouridylate synthase 7-like protein isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1262 bits (3266), Expect = 0.0 Identity = 647/688 (94.04%), Postives = 654/688 (95.06%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G040700 vs. NCBI nr
Match: XP_038878530.1 (pseudouridylate synthase 7 homolog isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1257 bits (3252), Expect = 0.0 Identity = 649/729 (89.03%), Postives = 674/729 (92.46%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G040700 vs. NCBI nr
Match: XP_038878531.1 (pseudouridylate synthase 7 homolog isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1257 bits (3252), Expect = 0.0 Identity = 649/729 (89.03%), Postives = 674/729 (92.46%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G040700 vs. TAIR 10
Match: AT3G04820.1 (Pseudouridine synthase family protein ) HSP 1 Score: 827.8 bits (2137), Expect = 7.3e-240 Identity = 437/720 (60.69%), Postives = 543/720 (75.42%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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