Chy2G037160 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy2G037160
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH02: 11570789 .. 11576226 (-)
RNA-Seq ExpressionChy2G037160
SyntenyChy2G037160
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAGTTCTTTATTGGGTCAGAGTTGACCCTTTTGTTGGGAGGTCAAAGTTATTGCCACATCAAGATCTTCAAACTAAAAAACAACTAATCCTTCATGAAATTGGCTCTTTCAGTTTTAGTCCCCTTCACAAGATTCTGGCAGGTGATATTTAGGGACTGAGGAACAAATCTATTTATCAACCTAATGTAAATGCATAAGAGTGGAATATTATATTGAATTTCATTTATAATTGTCATTTGCTATATTTCCTAATGAAGCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTATAATCCTCTCCATTCCAAATGGTTTACTTAATTGAGTGTTAGGTTTTAATAATGACCTTTTTTTTTTTTTACTTCATACATAGTTCACCAAACTCCATAACTATATAATCTTTTTGTTTCCTTTTTTATGCACATTTCATAAAAAAAGACTTTACAGCTAAAAGCTACTATATACTTTATAAAACTAATATTAAAACTCCATTCAACAACGTTTTGATTTTCTAAAGAACAACAATTGGTCGGTCGAGGCATTATTTTGCATTTGGGTAGAGGAAGCTAAGAGTCAACACGATAGAAGAAAGATAAAAGCTTCATGAAATATGCACACAATTTGAGTGTTTAAAACTTCATATATTTCTATATTTGAACAAAGGGTATTTACACCAAATAACAAATATGATACACCCAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAAAGGCCTTAGAAAAAAGTGGAAAGAATAGTTTAATAAATTAAAGACGTAGCTTGATAATCATTTAATTTTTTTTGTCTTTGATTTTTGAAAAATAGAAGAGTTGCATTCTTAATCAAATTCTAAACATACAAAAACGATTTTAGAAACTATTTTTTTAGTTTTCAAAATTGAACTTGAGTTTTCAAAAATATGGTATAAAGTAGAAGAAACATTTGTTTATAGACTTAATTTTCAAAAAAACAAAAAACAAAATTTGAAATCAAACCCAAAATTTTAAAAGTGAATATTTTTTTTAAACCTAACAATCAAATTAAACTTAGGCTTGAAATCATACAAAGAATGATGTTTATAGATTGCTTTTCAAAAACTAAAGAAAAAAAAAACAAACAAAAGGGAAAAGTAAATCAATGGACCAAAATTATTACCCTATCTCTCATTTAAAATTCAATAGTATGTGTGAAATTCCTAGTTCGTCTTAAGAATGTCACGTAAGGATTCTTGCTCCTTCTATCCTTTCATCTCACTTTTCCATAGTGAAGAAATGGTTAGAGACATGAAGTAGACAAATCGAAGTTTTCACTTTAAAAAATTAGCATCATTTTCAAAAATTCGTTCAAATAGTTTTTCTTAAAAGATATAGAGCAGGTTTGGTTTGTGATTCATTTTTATTTTTATGTTTTAAAAAACAAAAATATATGGAAAATAATTAGACTTCTTTGTTTTTAAATTCTGATTTAAAAAATTATGAACATAAGTATTGCATTTTAAAATTCGCAAACACAAATTTTGAATTTTGCATTAAAATATCAAAATTTTAAAATTGATCCAAACATGTTTTGGAATACAATAAAAAATGTTTGTTTTTGTTTTCGGTTGAATTTTTTGTATTGTAAAACAATTTTGGATCATAATCCAAAGAGACCAAAATTTTTCCAAGTTATCGATTATTTTTGCCCTTTTCGGTATATCTAGTGAGATTACACATACATATTTGCTAATTTTTTCAAATGTCATGTAATCTTCCAAATCTTTCCAAAATTAAAAAAGAAAAATTCACACAATATTATAAAATTTTAGAAAAAAAGATTGATGAATTATTTAGATAATTGGTAAATTCATTTAGGAATTTGGGTAAGTATATATTTTGCAATGAGATTTTGCAAAATTTTATATATAAGATTTGTGAAAGATTGCAACAGTAAATTTGATATATTTGAGCTTCGTCCCATTAGCAGGCAAATTAACAACAAAATTCTACATATAAATCTGGATAAAACTTGAACCAATTTTAGAAAATTTACTTTTAAAATCAATTTAGAAAGTATGTTAGACATGTAAAAAAAGAATCATTTTAAAAAATATAACTGCTCCAAAATATTTAATAATTTTGAAAACGAAAAAACCCACCGCACTCAATAGAAAACACACAAAAATATTCATAATTAATTGTCATCCAACGCATAATATATTTGAGAAAGAATGGTTGAAAATACACAAAAATATTCATAATTAATTGTCATCCTAACGCATAATATATTTGAGAAAGGATGGTTGAGATAGTATCGTTTAGATTTGGCTATTAGGATAGTTTAAAATAGACTATTCTTGCCTATTTAAATTTGGGCAGCCAATTTTATCGTTTAAATTAGGTAACCAAATCTCAACAATTTTGGGGCAATTTTATAGTTTAAATTAGGTAGTCAAATCTCAACAATAATTTTTTAAGATTTTTTTTTGTAAACGATTGCTTAGATTTGGTACACAAAAATCGATGAAAAGGAAAAGAATATGAAAATAGGGACAAATGAAAATATTTCAAAAAATTGCGAGAAAAATACAAAAAAAAAAGGCGATAGAAAGAAAAAATATTGCATAAGAGGAAAGAAAAAAAAAAAGATAAAAGAGAGACGATGATAAGGAAGGGCCCGAATTTTTTTTTAAATGGATAGTTTACTTTTTCATTTTGTTACACATTTCGTTAGCTTTTAATATTTATGGAAATTAACCCTTAAAATAATTATTCAATAATTTGATGTAATGTTCGGTAAAATAAGTCACTAAACTAAAAGTTAATTTTCATAAATATAACAAAACTAGTAAAATAAAAAAGTCCATGAAGCAGTTAATTTTTTTTCATAAATTTCATATTTGCTTTTTATATTGCGAACAATTTGTCACTTCTCTTACTCTTCTTCTTTGAGATTTATTCATCTCCTATTTTTTTTATTTATTTGACTTCTCTTCAAAAATTTATTTCGTCTATTTTTATTCATATTCTCTTTCTTTCTTCGCAATAAATTGTTGAAGTTAATAATAAGAACAATGAATCGTAGGCAATGATAGTTATTTATTTTCTTAGATAGACAACGATGGTAGAATATCACAATATTTTATGTTTTTATTTGGCTCTTGACTATTTTTTGTTTTGTTTTCACTCATCCTATTTTCTTCTTTATCCTTTTCCGATGTTTCGTTATCTTGTTCTTCATCTTCTCCTTGTCTAGCTTTATCTTCATGTAACAAAAAAAAATGTTGTCAAAATAATTGTGCAAGAAAATGTAAACGATTGTGCAAGACAAGTAAATGACAAAATTATTTAGATTCGAAGCCATTTTTAAAAAAAACTAAATCATCGGTTAGGTTTGAAGCATTTTTTCAATTGTTAAAAAACTTCATGATTGTCTATCATGATGGTTTAGAAGAAGAAAATAATTATACATAAATGGTTTATGAGTAAATATGTTGGCGGTTTGTTATATTTTTGAAAAAATACAAATAAAATTTAGGAGGATTGCATAAAAAATGAGTAAATGTGGATTTGATCATGTCTATAGTTATATTTCTTAATTATTCTTAAATTTAAATTTAGATTAGGCTTAAGAAAAAGAAAGAATAGAGATCTGCACTCCCCATTCATCATTTCTTCCTCTTCCTATTAGAGCCGTCGACCACCGCATTTGCCGTCTGTCTTTTTCCCCGGCGACGAGCAGTAGTGTCGATAACAGACTCAGACGACCAGTTTTCGCGTCTCAGACGATTCATACTGACACGCTCTTCATCCACGTTCGACACCGGAGCTAGCCTACCACGTAAGCACCCATTTCCAACAAGTTTTGAAGCATTTTTTCTTCTCCGTTTGAGACTCCAGCGTGATGCGTCACGTTTTCGATGGCTGGTTTGTCTTGCAGAAACTTTTCGACTTGGACCTAAGCTTTTGATTGCTATTCCATTGGCTTCAAATCAGTTTACACTAAGCTTCATATCTGTAAGTTCAGAGTTTTTCGGTCACCAACCAGCAAGGATCCGAGCCTTTTCGGTAAGAGTCGGTAAGGATTATTGCTTTAATTTCTTTTTCGAATTGGATTTGAGTATTTGAAGATTAATATGAGCTTTTGGAATTCGTTTGTTGTTATGTTTGGGTATATTTCTAAGTGTCTGATTAAGATTCAGCAAGGTTGAACACATTTTGGACTAGTTCGGACTTGATTAAGATGTCTTAGATCAGTTTTTGAACCGTGAAAGTTTGTTGGTCGTAGTTCTGGATTAATTTGGAGTGATTAATTAAGGTTTATGGTGGATTTTGTATAAGTACATTACTTTTGAAAATCTCTCGGTGTTGATCAAGGTTGAGATTTGTCATTTAGGCTTTCTAAAAGTTGATATTTGTTCAAGGAAGTGGTTCTTTGGATTGAGAGTTATAGGATTGTTGATCGGGCTAAATAGTTTCCACATCCCTTACACAATGTAAATTTTGATAAAGATATGTTTTGGCTGTTGTGATTAGTTAAATGGGTGAATGTGGGTGTTGGATGTTTGAGAGTATGTTTTGCACCATTTGGAATTGAATGAATTTGTTTTTGGATGTTTTAAATGTTATCCTATTAGAAATCACGTTTTATGTGATTGAGAATCAACTGAAAGTATTTGTTATATTTTTAGTTGATTTGTCAAGTAAAAGTATATGATTGTTTTGAATGATAGTTGAGAGTGTCTTGACCGATTTTAAATTGAAAGTGTTCATGTTTTGGATTTGATGAGTTCAACTGCTGAAATTTTTATTTGAAACTTTAATGAATGATTCAATTAGGGCTATCTAGATATGCCCATTTTTGTGTTTTGGGGATTCTATGGTATTTTGTTGTAGCCAAAATTGGAATTGGCGGTATACACTCATGTGTGAGAAGATACATCTTTGGGGTTTTACATTATTTGGAAGCAAGATCGTGTTTGTGTTGTACTCACATGACCTCACACTTAAGTCATTTCTGTTGTTCTGGTCGGTTGTTAATCAACGTTTTTGTTGTTCTGGTCGATTGTATAAAGTATTTCTTGATTGAAAGTATTGAAATGCTAGCATTTGAAAAAAAGTATGAAAGTTCCATTTATTAAAGGTTCTAAAAGTTTATTTGAACATTTTGATATATATATTTTTTTTTTTGAAAGACTATCTGGAAGTTTCAGCTTGAAACATTTGGTGTTGAAGTTTTATTTGCGTGGAAGATCTTGAATTTTAAACTATTGTTTCTAGCAAGTTTTAATTGAGAGTTCTACAATGTTTTGTATTTTTATTTTCAACAGTTTTGAAAGACAATGAATTTCAATGGCCGATATGGGAATTTCTTATTGAATATTTTTGTACTCATCTTTGTTTTTTTCTAAAATGCTTTCAGATAAAGGATAAGGTGAGGTGA

mRNA sequence

ATGGAGTTCTTTATTGGGTCAGAGTTGACCCTTTTGTTGGGAGGTCAAAAGCCGTCGACCACCGCATTTGCCGTCTGTCTTTTTCCCCGGCGACGAGCAGTAGTGTCGATAACAGACTCAGACGACCAGTTTTCGCGTCTCAGACGATTCATACTGACACGCTCTTCATCCACGTTCGACACCGGAGCTAGCCTACCACGTAAGCACCCATTTCCAACAAGTTTTGAAGCATTTTTTCTTCTCCGTTTGAGACTCCAGCGTGATGCGTCACGTTTTCGATGGCTGGTTTGTCTTGCAGAAACTTTTCGACTTGGACCTAAGCTTTTGATTGCTATTCCATTGGCTTCAAATCAGTTTACACTAAGCTTCATATCTGTAAGTTCAGAGTTTTTCGGTCACCAACCAGCAAGGATCCGAGCCTTTTCGATAAAGGATAAGGTGAGGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGAGTTCTTTATTGGGTCAGAGTTGACCCTTTTGTTGGGAGGTCAAAAGCCGTCGACCACCGCATTTGCCGTCTGTCTTTTTCCCCGGCGACGAGCAGTAGTGTCGATAACAGACTCAGACGACCAGTTTTCGCGTCTCAGACGATTCATACTGACACGCTCTTCATCCACGTTCGACACCGGAGCTAGCCTACCACGTAAGCACCCATTTCCAACAAGTTTTGAAGCATTTTTTCTTCTCCGTTTGAGACTCCAGCGTGATGCGTCACGTTTTCGATGGCTGGTTTGTCTTGCAGAAACTTTTCGACTTGGACCTAAGCTTTTGATTGCTATTCCATTGGCTTCAAATCAGTTTACACTAAGCTTCATATCTGTAAGTTCAGAGTTTTTCGGTCACCAACCAGCAAGGATCCGAGCCTTTTCGATAAAGGATAAGGTGAGGTGA

Protein sequence

MEFFIGSELTLLLGGQKPSTTAFAVCLFPRRRAVVSITDSDDQFSRLRRFILTRSSSTFDTGASLPRKHPFPTSFEAFFLLRLRLQRDASRFRWLVCLAETFRLGPKLLIAIPLASNQFTLSFISVSSEFFGHQPARIRAFSIKDKVR*
Homology
[Close]
BLAST of Chy2G037160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LZP5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G613560 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 107.8 bits (268), Expect = 3.9e-20
Identity = 65/104 (62.50%), Postives = 66/104 (63.46%), Query Frame = 0 

Query: 44  FSRLRRFILTRSSSTFDTGASLPRKHPFPTSFEAFFLLRLRLQRDASRFRWLVCLAETFR 103
           FSRL RFI TRSSSTFDTGAS P                                  TFR
Sbjct: 2   FSRLTRFIPTRSSSTFDTGASQP---------------------------------PTFR 61

Query: 104 LGPKLLIAIPLASNQFTLSFISVSSEFFGHQPARIRAFSIKDKV 148
           LG KLLIAIPLASNQFTLSFISVSS+FFGHQPARIRAFSIKDKV
Sbjct: 62  LGRKLLIAIPLASNQFTLSFISVSSQFFGHQPARIRAFSIKDKV 72

[Close]
BLAST of Chy2G037160 vs. NCBI nr
Match: KAE8653510.1 (hypothetical protein Csa_023634, partial [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 109 bits (272), Expect = 3.81e-28
Identity = 65/104 (62.50%), Postives = 66/104 (63.46%), Query Frame = 0 

Query: 44  FSRLRRFILTRSSSTFDTGASLPRKHPFPTSFEAFFLLRLRLQRDASRFRWLVCLAETFR 103
           FSRL RFI TRSSSTFDTGAS P                                  TFR
Sbjct: 1   FSRLTRFIPTRSSSTFDTGASQP---------------------------------PTFR 60

Query: 104 LGPKLLIAIPLASNQFTLSFISVSSEFFGHQPARIRAFSIKDKV 147
           LG KLLIAIPLASNQFTLSFISVSS+FFGHQPARIRAFSIKDKV
Sbjct: 61  LGRKLLIAIPLASNQFTLSFISVSSQFFGHQPARIRAFSIKDKV 71

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy2G037160 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy2G037160 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0LZP53.9e-2062.50Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G613560 PE=4 SV=1[more]
BLAST of Chy2G037160 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAE8653510.13.81e-2862.50hypothetical protein Csa_023634, partial [Cucumis sativus][more]
BLAST of Chy2G037160 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy2G037160.1Chy2G037160.1mRNA