Chy1G012630 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy1G012630
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH01: 15676778 .. 15698489 (-)
RNA-Seq ExpressionChy1G012630
SyntenyChy1G012630
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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mRNA sequence

CTGCAGTGGCATGGGAAGCTGGAAAGCCACTGGTGATTGAAGAAGTGGAAGTGGCACCACCACAAGCTAATGAAGTTCGTGTTAAGATCCTTTTCACTGCTCTTTGCCATACTGATGTTTACTTCTGGGAGGCCAAGGGCCAAACACCTATGTTCCCTCGAATATTTGGACATGAAGCTGGAGGAGTTGTGGAGAGCGTAGGAGGAGTGACCGATTTGAAAGAAGGCGACCATGTGCTGCCAGTGTTCACAGGGGAATGTGGAGAATGTCGTCATTGTAAGTCCGAAGAGAGCAACATGTGTGATCTTCTTCGAATCAACACAGACCGTGGAGTGATGATTAGTGATGGGAATACAAGATTCTCCAAAAATGGGCAACCAATTTACCACTTTGTTGGAACCTCAACATTTAGTGAATACACAGTTGTTCATGTTGGGTGCTTGGCCAAAATCAACCCTTGTGCCCCTCTTGACATTGTGTGTGTTCTTAGTTGTGGGATTTCAACCGGCCTTGGCGCCACTTTGAATGTGGCTAAGCCAACTAAGGGTTCCTCTGTAGCTATCTTTGGGTTGGGCGCTGTTGGTCTTGCTGGGTAA

Coding sequence (CDS)

CTGCAGTGGCATGGGAAGCTGGAAAGCCACTGGTGATTGAAGAAGTGGAAGTGGCACCACCACAAGCTAATGAAGTTCGTGTTAAGATCCTTTTCACTGCTCTTTGCCATACTGATGTTTACTTCTGGGAGGCCAAGGGCCAAACACCTATGTTCCCTCGAATATTTGGACATGAAGCTGGAGGAGTTGTGGAGAGCGTAGGAGGAGTGACCGATTTGAAAGAAGGCGACCATGTGCTGCCAGTGTTCACAGGGGAATGTGGAGAATGTCGTCATTGTAAGTCCGAAGAGAGCAACATGTGTGATCTTCTTCGAATCAACACAGACCGTGGAGTGATGATTAGTGATGGGAATACAAGATTCTCCAAAAATGGGCAACCAATTTACCACTTTGTTGGAACCTCAACATTTAGTGAATACACAGTTGTTCATGTTGGGTGCTTGGCCAAAATCAACCCTTGTGCCCCTCTTGACATTGTGTGTGTTCTTAGTTGTGGGATTTCAACCGGCCTTGGCGCCACTTTGAATGTGGCTAAGCCAACTAAGGGTTCCTCTGTAGCTATCTTTGGGTTGGGCGCTGTTGGTCTTGCTGGGTAA

Protein sequence

LQWHGKLESHW*LKKWKWHHHKLMKFVLRSFSLLFAILMFTSGRPRAKHLCSLEYLDMKLEELWRA*EE*PI*KKATMCCQCSQGNVENVVIVSPKRATCVIFFESTQTVE**LVMGIQDSPKMGNQFTTLLEPQHLVNTQLFMLGAWPKSTLVPLLTLCVFLVVGFQPALAPL*MWLSQLRVPL*LSLGWALLVLLGX
Homology
[Close]
BLAST of Chy1G012630 vs. NCBI nr
Match: KAG6674040.1 (hypothetical protein I3842_15G022300 [Carya illinoinensis])

HSP 1 Score: 52.0 bits (123), Expect = 2.22e-04
Identity = 24/38 (63.16%), Postives = 28/38 (73.68%), Query Frame = 0 

Query: 28  LRSFSLLFAILMFTSGRPRAKHLCSLEYLDMKLEELWR 65
           ++SFS  F  LMFTSG+ R +H C L YL MKLEELWR
Sbjct: 152 VKSFSPPFVTLMFTSGKRRGRHRCFLAYLGMKLEELWR 189

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy1G012630 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy1G012630 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy1G012630 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6674040.12.22e-0463.16hypothetical protein I3842_15G022300 [Carya illinoinensis][more]
BLAST of Chy1G012630 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy1G012630.1Chy1G012630.1mRNA