Chy1G006480 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGACTTTGCTCCCCAAGAATTCATACCAAAGAAGGAAGAAGAAGAAGCACGTGTTGAAATATGGAAATACATATTTGGTTTTGTGGAAATGGCAATTGTAAAATGTGCAATAGAACTCAGAATAGGTGATACAATAGAAAGCCATGGAAGCCCCATGACACTCTCCCAATTATCCGCATCTTTAAATTGTTCTTCCTCACTTCTATACCGCATCTTGAGATTCTTAGTCCGACGTGGAATATTCAAACAAGAAATCAATGAAGAAAATGTCATAAGCTATGACCAAACACCTTTGTCAAGGCTGCTTGCAAGTAGCAACTACAACAGCATGGCTCCACTTCTTTTAATGGAGAGCAGCCCTGTGATGTTGGCACCATGGCATAGGCTCAGTGCTCGAATTAAAGGCAATGGAGAAACCCCATTTGAGGCTGCTCATGGAAAAGATGTATGGAGCTTTGCAGCAGCTGATCCAATACACAACATAGTAATCAATGATGCTATGTCATGTACTGCTAGGGTTCTTACTGTGCCAGCAATACTTGAAGAATGTCCACAGATTTTTGAAGGAATTGGAAGTTTAGTTGATGTGGGAGGAGGAAATGGAACTTGCTTGAGCATGATTGTTAAGGCTTTCCCTTGGATTAAAGGCATTAACTTTGATCTTCCACATGTCATTTCTTCTTCTCAACAGTACATTGGTGTTGAACATGTTGGTGGAAATATGCTTGATTCCATTCCGAAGGCTGATGCTGCATTCTTTATGGTTAGTACATACATATAAATGGCATAATTTAATTTAGTAGTTCTACAATTTCTAAATTGTGTTTGTTTGGTCATCTAATAATATTTAGAGGTGTATCTCTAAATTTTTAATTTTGTGTTTAATAATTGTTAATTTTAGAGACTTTGAGGTTTGATATAGTTTGTATATATCAAGTATATGAATTTTAATTAAAAAATGATTTTTAAACTTTTAAGTTTTTCTCTAATTGATTCTTGAAATTTCAATTTTTGAGTCTATTTGATTAATTAGTTAACTAGTATTTGGTGTTTATTAACATTCATAGACTTAAATAAGCACTAAATGGAGATTAAAATCTAGAGACCTTTTCAGAACGAAATTCAAAACTTTGGAGACCTAGTGGACACTTTTAAAAGTTAAAAGCATATAGGAAAAAAAAACCTAAATTCATGAACTTAAATTCTAATTTACTTTAAAATATAGGTAACAAATCACCAACAATTCTTGAACTTTTGCATAAAAGTATTAATTTAGTTCTCAGATACTTTACAACTTATAATGATTTAGTCCTTGTCATGAATTGTCATAAAATTTCTTACATTGGTAGATCAATAAATAAATCATTTAACAAAGTTGACAACTCATTTTGAAGAGGTTTTTCATATAATAGATTAAATAGGTACTAAATTTTTTCAAACCTCAAAATATAGAGACCAAATGTTTTATTCCAATTTAAAAATTACATTGTTACAACTCTTTGAGACTACAAATATTAAATCGTTACTAATGAAAGTATAAGAAATAAATGGTTGGTTTTATAAAAGTTTAAGGATAAATTGTATTTTTTTAACTTTAAAAAACATACATTAGGTATAGCGGTATGACGTTTTAGCTTATGAATCTCTTCATGTATGTGCTGAAATCTTTTGTATAAAAAAAAGGTATATTAACTTTTGTGAGATTAATTATTTTATATTAGTGGGTGCTACATGACTGGGATGATGAGACATGCATCAAAATATTGAAGAATTGTAAAGAAGCAATTTCAGAACAGAGAGGAAAAGTAATCATTGTAGAAGCAATTATTGAAGAAAGATCAGAAGAAAACAATAATAAACTTGGGGATGTTGGATTAATGCTTGACATGGTGATGATGGCTCATACCAAAAATGGCAAAGAAAGAACCTCTAAAGAATGGGGTCTTGTACTTCGTCAAGCTGGTTTTACTCAATACACCATCACATCCATTCGAGCTGTCCACTCTGTAATTCAGGGTTTTCTTTGATCTAAAAATGTCCACAAACAAAAAAGGTTTATATTTACATTTCGTTATGGTATGAAATTCGCCTTTTAACTTCAACGGTAAGGTGTGAGAAGAGATCTAAATCTTTGACCTTTTGGTTAAAGAGACGATATCTTACCTCATTTAAACTATGTTTGGTTTGTGACTTGTATTGAAGGTTTGGTTAACTATAATAATAAATAATAAGGGTTTTGTTGTAAATACTAGTAGGTGGACACATTTTTAACCTCTTTCATCCATTGAATTTATTTAGCATGAATAAACTAGGTTTAAATTGACGTTTGAAATGGTTAACTATGTGAGGTTGAAACTATTGTGTATTGTTTTTACTATTTACAACATCTCTTTTCATTTTCATCAATGTCGTGAAAAATAATATTTTTGCATATTATAGATGGAACTAAATAAAGGTAAGTGTATGATTAACTGGTGGTCTTTTAATTATTATTATCATCACCATAACTTTTCATATTAAAAATATATTTAACCTATATCCTTAATTATCTATAACTATTTGTACTTATTTTATTTTATTGGGTTGTTTGAAAACATCCATAAACATGAGAGGTTTAATATAAAAAAAATTATTATTATTATTTTGTTTCTTTTCTTTCTTTTCCAAAATTAGGTTAAGAATTAAAGTTTTTTAAGTTAGAATGATAAAAACTATAACATAGAAAATGCACCACATCAGTTTAGCAATGTGTTTACTCTGACTTAAAATAAATAAATTTATATATACGTGTGTGTGGATGAGAAAATCAAACTTATAAGTTATGTTAATAATATTTTATTAGGTTAGTTCAACTATATTCTTTTTAAAATTTATCTAAGTTTTTAAAAAGGATATTTACAAAAATAGCAAAAAAACAAGTTATAATAATAAGGTTTATGCCACTACATTTTTTAAATTGCAAAAATAGAAAATTTAAAAGGAAAATTGCATCAAATGACAAAAAACGTTTAGAAAAAAACAGCTAATGGCACCAATTTTTTGCAAATTGCAAATATGAAAAAATTAGTGAGATCAGACGACTATCAGAGGGATATCATATGGTAATCAAAGGGCTATCAGAGAGTCATCACTTTTGAATTTGCTACTTTTATAAATTTAGAAAATGTCGTGACATGGATTCTATTATCTTTAATTTTTTTTGCTATTTTTACAAAAGTCTCAATTTAAAAGCTGATAACCTTCCGATATTACTGGTCATATTTACTATATTCACAATATGAAAAAAAAGAGGTATATAAACGGTTTTTTTCTAAATGTTTTTGTCATGATGCAATATCCCTTTTATAAAACTCCTAAATAATCAAACCAATTTGATATGAAAATTCAACCCTACTCGTTACCACTACAATTTAAAATTAAGCACACACAAATCATCGATCCTAATGGCAAATTGTAAGAAATAGCATTTTAAGTCTTTTCAAAACTAACATCCCTTTTTAAAACTCATTAGAATAGTTTTTCTGAATATATCTCACTCGAGATCGGCCAACAAAATTTACTTAAAAATCTAACCTCTTTGATGTTAACGATTGCTTTTTGCTTTTTCAGTCAAATCTTGGGTGTTAGTATTAACATCCGGATTCTCCGAATTAATTTTCTCAAATAGCATATAATATTTTCCAAAATTTATATCAAATCTTAACTAATTTTTTAAATATTCTCCAAAAATTTGACTATTTCTATCAATTCTTATATTAAATTTTTTACATAATTTTTAAAATCTTTTAGCCTAATCTATGCCATCCACAATTATATGAATTTCTAAATTTCCAAATGTGAGTTGATTGGTGATGATTTTTCTAGGTGGATCTTAGGTTAAATTTCAGAAAATATCGAATTTTGAATGTCAGTATTAATTTGCCATAGATAACATCTAGAAAACCCAAATACACAGGATTTCAATGTTAATCTAACATGACTTCAAGATTTTCAATGACTTTCCGTACTACTTTTTTTTTTATTTTTTTTTTATGGCAAAAATTGACTTTTCTTGAAAGATTTGATAAATTAGTTAAGTTTTGATAAAAACTTTGAAAATTTTGGCTCAGGAAAATTATAAAAATTGGTAAAATAAACAAACTATTTACCTGACAAAATAAGTGTAATTAGTTTTTTTTAATCCTTTAATGGTTTTTTATCATAGAATATAAATAGCGATTGTATTTTTTATTATTCTTAAAAAACCCTCGTACTTAAAAAGTTAGGTAGAGTCTCAATGTTAATATTGTTCTAGATTTCACGGAGAAAGCAAAAACAACTATTAACATAAAAAAATTAGATTTAAGTAAATCTCGGTTTGTTCTCGAGTGAGAGATCGATCAATTAACTAGAGCAGCAAATTTTCAAAAAAAGGTGCTAATTTTCAAAAGCGAAAACTCAGGAAGAAGAAGAGTTAGGACAATTTCTCGATTATGATAGATGTTGCACTTATTTTTGTTTAAATTAATAATACATTTTTTTAACTTATAACTTTTCTTTCTGCTCTAAAAATGAGGTACACAACTAAAACAAATTTCGAAAAACTATAATATTAAAATAAAATATTAGAAATTTCTCTTCAATTCTCACCTTCATTTATGTGGAAAGTTCACCAATGTTTATCAATTTTCCAAAACTCGCTATTTATAGGTAATTTGGCAAGTAAGAGATGGAATACATAGCAACTAAGAGAGTGTTTGATGTGCAGGATCGAAATTAAATGTTTAGGAATTAAATGACAGTGAACTTATTTGATGGGATTTTAATGTCTAGGAATTGCAGATGTTTGTGTTTGGAGTGCAGGAATTGGAAATCTGAATTGCTGATACCTGTGTTTAGGGTTGCAGGTTTTGAATTCCTAGACTTAGCTAATCTGTTTAGTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTGTGAATTGTACTTCATAAAGTTATCATGTATAAAAAATTTAATTGATTT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BLAST of Chy1G006480 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T003 (Acetylserotonin O-methyltransferase OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ASMT PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 350.9 bits (899), Expect = 3.3e-95 Identity = 183/354 (51.69%), Postives = 246/354 (69.49%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G006480 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6WUC2 ((R,S)-reticuline 7-O-methyltransferase OS=Papaver somniferum OX=3469 GN=7OMT PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 281.6 bits (719), Expect = 2.5e-74 Identity = 148/352 (42.05%), Postives = 222/352 (63.07%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G006480 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B0ZB56 (Xanthohumol 4-O-methyltransferase OS=Humulus lupulus OX=3486 GN=OMT2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 277.7 bits (709), Expect = 3.6e-73 Identity = 162/347 (46.69%), Postives = 220/347 (63.40%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G006480 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B0ZB57 (Probable O-methyltransferase 3 OS=Humulus lupulus OX=3486 GN=OMT3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 256.5 bits (654), Expect = 8.6e-67 Identity = 143/349 (40.97%), Postives = 199/349 (57.02%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G006480 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XB10 (3'-hydroxy-N-methyl-(S)-coclaurine 4'-O-methyltransferase 2 OS=Papaver somniferum OX=3469 GN=4'OMT2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 255.4 bits (651), Expect = 1.9e-66 Identity = 132/340 (38.82%), Postives = 204/340 (60.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G006480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7J6GIU2 (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Cannabis sativa OX=3483 GN=G4B88_021628 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 705.3 bits (1819), Expect = 2.6e-199 Identity = 382/731 (52.26%), Postives = 499/731 (68.26%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G006480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K2N4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G017720 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 674.1 bits (1738), Expect = 6.4e-190 Identity = 338/358 (94.41%), Postives = 344/358 (96.09%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G006480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BII4 ((R,S)-reticuline 7-O-methyltransferase-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490252 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 662.1 bits (1707), Expect = 2.5e-186 Identity = 333/358 (93.02%), Postives = 341/358 (95.25%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G006480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K1F0 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G017710 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 661.8 bits (1706), Expect = 3.3e-186 Identity = 329/346 (95.09%), Postives = 332/346 (95.95%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G006480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7J6DY54 (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Cannabis sativa OX=3483 GN=G4B88_030093 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 660.2 bits (1702), Expect = 9.5e-186 Identity = 384/854 (44.96%), Postives = 505/854 (59.13%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G006480 vs. NCBI nr
Match: KAF7143553.1 (hypothetical protein RHSIM_Rhsim05G0050400 [Rhododendron simsii]) HSP 1 Score: 690 bits (1780), Expect = 8.98e-240 Identity = 361/674 (53.56%), Postives = 487/674 (72.26%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G006480 vs. NCBI nr
Match: XP_004144927.1 (acetylserotonin O-methyltransferase [Cucumis sativus] >KGN43289.1 hypothetical protein Csa_020398 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 676 bits (1744), Expect = 8.53e-239 Identity = 338/358 (94.41%), Postives = 344/358 (96.09%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G006480 vs. NCBI nr
Match: KAF4382845.1 (hypothetical protein G4B88_021628, partial [Cannabis sativa]) HSP 1 Score: 703 bits (1814), Expect = 4.30e-238 Identity = 382/731 (52.26%), Postives = 499/731 (68.26%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G006480 vs. NCBI nr
Match: XP_008447906.1 (PREDICTED: (R,S)-reticuline 7-O-methyltransferase-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 664 bits (1713), Expect = 4.34e-234 Identity = 333/358 (93.02%), Postives = 341/358 (95.25%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G006480 vs. NCBI nr
Match: KAF9676201.1 (hypothetical protein SADUNF_Sadunf09G0113700 [Salix dunnii]) HSP 1 Score: 673 bits (1737), Expect = 6.93e-233 Identity = 353/686 (51.46%), Postives = 480/686 (69.97%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G006480 vs. TAIR 10
Match: AT4G35160.1 (O-methyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 350.9 bits (899), Expect = 2.4e-96 Identity = 183/354 (51.69%), Postives = 246/354 (69.49%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G006480 vs. TAIR 10
Match: AT4G35150.1 (O-methyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 296.2 bits (757), Expect = 6.9e-80 Identity = 157/348 (45.11%), Postives = 216/348 (62.07%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G006480 vs. TAIR 10
Match: AT5G54160.1 (O-methyltransferase 1 ) HSP 1 Score: 200.3 bits (508), Expect = 5.2e-51 Identity = 120/313 (38.34%), Postives = 179/313 (57.19%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G006480 vs. TAIR 10
Match: AT1G77530.1 (O-methyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 176.0 bits (445), Expect = 1.0e-43 Identity = 121/339 (35.69%), Postives = 187/339 (55.16%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G006480 vs. TAIR 10
Match: AT1G77520.1 (O-methyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 172.2 bits (435), Expect = 1.5e-42 Identity = 111/339 (32.74%), Postives = 175/339 (51.62%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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