Chy12G213920 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy12G213920
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH12: 12432134 .. 12436716 (-)
RNA-Seq ExpressionChy12G213920
SyntenyChy12G213920
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATAATGAGAGTGGGTTTAATTATGACGAAGATGGAAACAAAGGGCCATCTCATTGGGGAGAACTTAAAGAAGAATGGCATGAATGCAAAACTGGAAAAATGCAATCTCCTATTGATCTATCCCACGATAGAGTTCAAATTGTACACAAGTTTGTGGACTTCAAAATTGCTTATAATCCTACCAATGCAACTCTTATGAATAGAGGTCATGATATAATGGTATGTACAAACTGTTTGCTAGATTCTAAATTTTATCTTCATAATTTGAAAAAAGAAAAGTTAGAGAATTTAGTCTATGTGATTTATAATCATAATATAATTCTTATATAGTTTGATAAAACTCTATCTCTAAATTAAATATTTACTATACAACGTGCACTAATTGTTAGAATTTATCAAATCATATAGACTTAATTCTAATTATTAAAACCATAAGGAGTAAGTGTGTGCGATTAGAAATGATAGTTAAAAATCACTTAAAATCATTTTGATACACTTTTATACTTTTAGATGCATTTTTATTACTATTAAACTTGATTTTGATTTGAGACCACAATTTTAAAAATAACCAAAGTGATTTTAATCATATTAGAAAGATAATAATTAGGTGCAACGTAAGCTCCACCAAGCATCATCTTATTCTTTTTACATACTTAAAAATAAAATTAACTTTAAAATTCCAAACAAATTGTCACTTGGTACATCATCAATCATTAAAAGCTGATTATGCTGCATGAAGTTGCACGTAATTTTTATTAATCACTCTTAAACATGACATAAATTCTGGTTTTATTTGAATTTGTAATATCAATCCAATGTTCTTATTGTTTCAAATGATGAATAGTTTTAGGCTGATACTGAAATATATATTTAACCTAAATTTAAGAATATTTTGTTATGGTTAAATTTGTAGCTAAAATGGAGTGATGATGCTGGATATATTGAAATAAATGGAACACGATATTTTCTCAAACAATATCATTGGCACTCTCCTTCCGAGCATACTATTAATGGTGAAAAATTCGCTTTAGAAGCTCATTTAGTGCATCAAAGCCACAATGGAAATATTGCTGTCATTGGAATTCTTTATCATCTTGGACATTGTGACTATTTCTTATCCACAGTATGTATCATCTAACTCTTAACCATTGTTTTAATATAATAAAACTTATCGTTGATAGGATTTATCGTCAGTACACTTCTTTTAATGATGCATACTTTATCATAATAGTTCATTCTAAATTTTGTGCTATATTTGTCAATTCTTTTACATTGGATTGTACCCTACTAAATATATACACTTTATATTTTGTAACTATATTGAAAATATCTAGCTACGAAAGTATATAGTCCGGGTCAATTCTTAGATTAACTTAAGATTAATATTGAAAAGTTAAACTTAATCTTAAGCTAATCTAATATAACTTATTTTTCGAAGCTATAAAAGTTCAAATAAATAAAATTATTTTGACAGATCAAAGAGCATTTGGAAGAAATTTCAGAGACAAACGAATATATTGAACTGGATGATATCAATCCATCACTTCTAGAAATGAAAAGTAGTATGTATTATCAATACTATGGCTCTCTAACGATTCCTCCATGCACTCAAAATGTACTTTGGATTATCGTTAAAAGGGTAAGATTTTAAAATTTCAATTTACATATTAATCTTATATGGCTCTCATGTTTTCTCAAAATAAATAGTATTTACTTTTGTGCTTAATATTTTCTTTTTGGATGATATAGGTTAGGAGTGTTGCACCCTACCAACTAGAGTTACTTCGAGTGGCAGTTCATGATGTAAGTCAAATAGTTTTGTGTTAATTTTTTTTTTGTTTTATTTTTATAATATAAACTTAAAATTTAACTACTTATATAATGAGTATTCGTAATCTAGATTGTCCTAGGTGTTTTAGAGAAATAATACATTATGAAAACATTTTTTTTTTTTTAGTTTACTTAAGAATTAACGTGTTTGTTTAGAAAGGATAAAATCATTTTAAAGGTTTGATGTTAAGCAAGAATGCATTTTTTAGAAAAAAAAAAATACTTAGAAGCTGAATGATTATTCAACTTAATTTAGAGGAACTTCTAAAAAGTAGGGCCATTAAGGTTATATTGCAAATTTGATCTCTCTTTTAAGTTTCATTTCTATTCTAAAAATGTGTTTATCTAGCAAAATCTAAATTGAAATGAAAACTGATAATGGGTTTAGGTATTTTAATTTTTTTTTTTTAATTTCTTTTGGCGATATGTTTTAGGAAAGATTGAATCTAAGATCTCGAGAATAATATTAAAAAATTATGCTTACTGAGTGATATTCATAATGGATATACATATACTTAGACGAATGGTGATTATCAATAATTACTAAACAAGTATTGGTTATTATAGTGGGTATATTTTGAAAATCTTCTTAACTAAATGATTGATTGTGGTCAAAAGTATTCAATGGTTTTTTTTTTTTTAAGGAAATCAACTTCTTCCTTGAAAGGCAATTAGTGAATATTCATATCAAAAGTAATTGTCAAAGAAAACTTTTATTAAATGTTGTATTGTTATTGTCAATGGTATTTAGTGTTCAATAACTTCTTTTAGGAAACTACTTTGAAGTAGCTTAGTTTTCAAATTAGTCTTAATAATAGGAAGGGTTGTGGCTGAATAGTGAGAGGAAATAACAATATATAGTTGGATTTATATATAAGTTTTGAAGGTCTACAAAGAGGTCAACATGGGAAGAAAAAATAACTTCTATATGCGATAAAACCAAATTACAAGAACACTCACTCAAAGCTTTTGATTGTTCATACTTTTTCAGTCTTTCCAACTAGAGAATATAAGAATATAATAATATAAAAGAAAATTAATTAAAAGCACATTAAAGTTTAAAGTGTTTCTAATTGATACAATTGAAAACAAAAAAACATAGGCACCTTTTATAGCTCATGAACTTTCCAAAACCTTTTCAATATAGAACAAAACTTACGACTTTCCTAAACCCTTTCAATGTAGGACAAGTCTATGACTTTCCTATACCTTTTTTATGTGAGATAATAACACTTCTAATATTTTGCCAAAAACTCAACAAATTTCACCTTGGTAAGATATTTAAAGATTCCATAGCTTTTGCAAGATCCATTGTCTTCATCGACAATCATAATTCTCATTTCATAGAATTATGACCTATTTCACAATAAAAATAGACCACTTAGAATTACCACCCCTCAAGATTTTCATTTCCCATCACATGTCGATAAAACCTTTATTGAGATTTATGGTGCAACCTTCTAACTACTTGGCTCACTTGAAAGTCTTTTAGCCATCGACATACCTTCTAACACACACCTTGAAAACTTGTGGACTCACTAACATCACATCCTCTATTATGATAAAGTGGACTTACCACGAGGATGAATTGTGTCTAATTGAGAGGAAGTCACCGTCTCACATGACATGAAAGTCGGCATCTGATCCAGAGACTTTTGACAAACTTGCTCTACTTTCCATGTGCTCAAACTATTCACATCCCAACAATCTATCAACAGCTCAAAAAGACTATCCTTTTTTAATCTCCTACCAAAACCACTCTTAGACTGCACTAGAACACCATCACCGCTTAATTTGCACTCAGGTAATCAGACTTGCATTAGTACATCCTTGATTTCCACTTGCCGCAAATCGAAGTACAACTCTTCTATCAAATTTATCCACATCAAACTTTACTGGACTCATAAAGCTTGACAGACATCTACTTCAATTCTAGCAACTAAGGTAATAGTGAGCAACTCACACTATTCAAAAAAACCGCAACTAACATTGAGAATTCTTTTCTGATGTGGAAGGTCAGATAATGTTGCAACCAGAAAGCATACTAAAAAATTCAAGAAATTACAAACTCAGTTTTGATCCCACTTGTTGGAAAAATACCCTCCAACTTCTATCACAGACAAATAAAGAAAAAGCAATAAAAACTTAAAACACAAGAATTTACTATAAAACTCTCAACTTGAAAGAAAACCGCGACAAGAAATGAATCCACTATGTAAAAAATTGTTAAAATCACACTTAGAATAGTTTTCTCTCTCCCAATCCAATTACAATAACACTCTCTCAAACCTCTTTTACTGTACACTCACACCTTTTTATCACTCTTCAACGCTAGAGAATATAAAAAACAATTTAATTAAAGTTAGCATATTAAAACTTAAAATATTTTTAACTAAGACAATTGAAAATCAAAAATATATATAGGTTATTTCAATAGCCCTTTTTTTAATGTTGACAAACTCATATCTTTCTAAACCCTTTCAATGTACACCAATTCCATGACTTTTCTATACCTTTTTTGTGTGTTACAACTACACTTCTAATATTTTACCAAAATCCAAAAAATTTATACCCATTATTAGTTGGGTTTTCTTTATTTACCTTCTTCTAAACTTTTGTTAGAAATAAATAGTATATGATATAGTAAAATTTAAACTGCAGGATTCAAACACTAATGCAAGGCCTCTGCAGCCTCTCAACAACAGAATAATTCAACTTCGATTTAGATCCCAACATAATGAGAAGGAGCATTAA

mRNA sequence

ATAATGAGAGTGGGTTTAATTATGACGAAGATGGAAACAAAGGGCCATCTCATTGGGGAGAACTTAAAGAAGAATGGCATGAATGCAAAACTGGAAAAATGCAATCTCCTATTGATCTATCCCACGATAGAGTTCAAATTCTAAAATGGAGTGATGATGCTGGATATATTGAAATAAATGGAACACGATATTTTCTCAAACAATATCATTGGCACTCTCCTTCCGAGCATACTATTAATGGTGAAAAATTCGCTTTAGAAGCTCATTTAGTGCATCAAAGCCACAATGGAAATATTGCTGTCATTGGAATTCTTTATCATCTTGGACATTGTGACTATTTCTTATCCACAATCAAAGAGCATTTGGAAGAAATTTCAGAGACAAACGAATATATTGAACTGGATGATATCAATCCATCACTTCTAGAAATGAAAAGTAGTATGTATTATCAATACTATGGCTCTCTAACGATTCCTCCATGCACTCAAAATGTACTTTGGATTATCGTTAAAAGGGTTAGGAGTGTTGCACCCTACCAACTAGAGTTACTTCGAGTGGCAGTTCATGATGATTCAAACACTAATGCAAGGCCTCTGCAGCCTCTCAACAACAGAATAATTCAACTTCGATTTAGATCCCAACATAATGAGAAGGAGCATTAA

Coding sequence (CDS)

ATAATGAGAGTGGGTTTAATTATGACGAAGATGGAAACAAAGGGCCATCTCATTGGGGAGAACTTAAAGAAGAATGGCATGAATGCAAAACTGGAAAAATGCAATCTCCTATTGATCTATCCCACGATAGAGTTCAAATTCTAAAATGGAGTGATGATGCTGGATATATTGAAATAAATGGAACACGATATTTTCTCAAACAATATCATTGGCACTCTCCTTCCGAGCATACTATTAATGGTGAAAAATTCGCTTTAGAAGCTCATTTAGTGCATCAAAGCCACAATGGAAATATTGCTGTCATTGGAATTCTTTATCATCTTGGACATTGTGACTATTTCTTATCCACAATCAAAGAGCATTTGGAAGAAATTTCAGAGACAAACGAATATATTGAACTGGATGATATCAATCCATCACTTCTAGAAATGAAAAGTAGTATGTATTATCAATACTATGGCTCTCTAACGATTCCTCCATGCACTCAAAATGTACTTTGGATTATCGTTAAAAGGGTTAGGAGTGTTGCACCCTACCAACTAGAGTTACTTCGAGTGGCAGTTCATGATGATTCAAACACTAATGCAAGGCCTCTGCAGCCTCTCAACAACAGAATAATTCAACTTCGATTTAGATCCCAACATAATGAGAAGGAGCATTAA

Protein sequence

IMRVGLIMTKMETKGHLIGENLKKNGMNAKLEKCNLLLIYPTIEFKF*NGVMMLDILK*MEHDIFSNNIIGTLLPSILLMVKNSL*KLI*CIKATMEILLSLEFFIILDIVTISYPQSKSIWKKFQRQTNILNWMISIHHF*K*KVVCIINTMAL*RFLHALKMYFGLSLKGLGVLHPTN*SYFEWQFMMIQTLMQGLCSLSTTE*FNFDLDPNIMRRSIX
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy12G213920.1Chy12G213920.1mRNA