Chy12G213400 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTACATGAAAATTGCAGTCATGGTGGAGAAGATCTTAAGAGTTCAACCAAATGTGAAGAAGCTTTATCTACTTATAAGGGCAGCGGACGAGAAAGCTGCGACACAACGCCTTAACACTGACGTGATTGGGAAGGAGTTGTTCAGGATATTGAAGGAAAAATGGGGAGAAAATTTTAGATCTATGATATCAGAGAAGCTCGTGGCGGTGGCTGGAGATATCTCCGACGAACTTTTGGTTCTCAAAGAGTACTCTAAATTGAGAGAAGAATTGTATGACCAAATCGATGTCATAGTGAACTTGGCTGCAACTACCAACTTCGATGAGAGGTACAAATTGAATGAAATACACATAATTTTGATTCAACATATATTCGTATACCTTTATACATTTGAGATACTTAAATCAAACAAATAATTATATTAAATGTTTTTTTCTAGCTCTAATTAAATACTATTTTGGCTTTCAATATTGAGCAATTTTAGTCTATTTAGTTTCATTAAAAATAGTTTTCATACAAATTTATAATAAAAATATTTACAAATATAACAAAAATATCACAATTTATCTATGATAAATCAGAAAGATTACTATCTATGTAGATCATGATACATATAGACATAAATACTAGTTTATCTTCTATCACGATTTGTAGATAGACGGTGATATTTTGTTATATTATGTAAATATTTTTGTTCGTTTTGGTATATATGAAAATAACTCTTATTATAAGGGTATTTTAACAAATCAGTATGGAAAAAAATTATAAATTAAACGAAAGCATATAAATTAAAAGTGAACAATTAAGATATTGTTTGACAACCATTTCGTTTTTTGTTTTTGAAAATTAAACTTATTTTCATCTCATTTTTTATAATAATTTGTATCTTTCTTAAGTATAATAGTAGTTGAATGCTTAACCAAATTGCAAAAATAAAAACTTGTTTCTAAAAGCTATTTTTGTAAAAAAAAAAGTTTAAAATTTGTTTGATTTTTTAAACTATTGGTAAATATAGATAATAAGGAAAGAATTTCGAAGGTGAAAATAGTATCGTAAGCTTAATTTTTAAGAAATAAAAAATGAAAATCAAATGGTTACTACATGTATAAAAACTAAAATTAAATAACCTTTCAAACTACAAAAACTAAAACCATACTTTAACTTTCTTTTCTTGTTTTTAGATATGACGTTGCTCTTCATGTCAACACTTTGGGAGCTAAGCATGTTATAAACTTTGCTAAAAATTGTGTGAAATTGAAGGCATTCGTTCATGTGTCCACAGGTTTTTCCTCTTCGAACCATCTCTTGCTAATTTACTTATTTGAAGCGAAAATAAATATCAAACTAACTGAGTTTATGTTTAGATGAATCATATTATAAAAATCTCATTAATTAAGCACGACTTTTAATAATAATGGTAAGAAATTTAATTTGATACAACAAATTTCAATGCACATAGAAAAGATGATGTTAGTTGGAAAATTCATTTAATGATTTTTGAAGCATAATATATTTATTCATAAAAGAGAAAAAATATGTTTTTTGTTTGATTGAGATGCCAATAAATGCATTCACGACTAAATATTAATTAGTTCGTTGTGATTAGATTGTTGGAAGATCCGGGTTTTGGAGTTATTTGTTATTTGTTTGAACCCATAGTTTTAATTAATGCTCAACTTAATTTGACCATTATTTGGCTTAGATTTTATAAGATAAGAATGTTTTCAATTGTACCAAAATAAGTGATCATTTCATAATAGATATGGATAGATGTTCATTTAAATCTGTTATCATCTTTTTCTTATTTGTTTTCCTTTCTCCTATCTCTCATTATTTTGGACGGTTTGCAGAAACTTGTTTTAATCCCAATTTTCAACCACTTTTTTCTTTTAAATCTGTTTTTAGCTTTTGTATTAAAAAAATTCTCGGTGTCTAAGTTGTGGTTTTTGTTAACCAAGAGAAGTTGAAATAGTAATTTAGTTAATTTAGTGAAACTATTTTTATACCATCACAATGTTGATGTTTAACTCTAAAATTTTTAGAAGTGATTTCTATGATTTTAAATTATCATGTTTGATTTCTAAAGTGATTTTAGAATTATGAACATCTCATTTAACAACCAATTGATTTTTGGTTTTTTGGTTTTTAAAATTAAGTCTATAAACATTCAATTTATTTTTAAATTTTTTTAATTGCTATCCATTTTTTATTCTTTTAGAAGTAATGACAATTTTTGAAAAAAAATAGTTTTCTTTTCTTGAAATTTGAGATAAAAAATTAAACTCTTGTATTTAAAAAATGGTATACATGTCTTCTAATCACTAAAATCAATTTAATATAGTGTAATTTTCATGTCATCAAAGTTGATTTTAAAATAGCAAGATAATAAATGCAAATGTAAAAATAAAAACATCGAAATTCAACCATGAAAACCACACCCACAATAAATGAAAGTGAGTCCTACCAAATATATATGTTTATATTTGTTTATATCATTAATATTTTGTCTACTACAAATACATTTCTTCTTCCAACTAAAATAAATGAGCATTGTAACCTCTATCCAGTAGGATAATACACCTATGTATATGGTTAATTAACCAAATATTTCTTTCTCTCATGCCTAGTTGAGTACTAGCTAGGGTATAACTCAAACCTGGATTTAATTTCTAGTCCAATGTAGATTTCGAATAATTTGTTCAATATTGACTATACTAAATGAATTTTTTACAACAATATCATGATTATTTTAAAATTTAATTGTTGATTTTGTTTGGTTAGCTTATGTTAGTGGCGTGAAGGAAGAGCTAATACTTGAATCCCCATACGTTATGGGAGACACTCTTAATGGAAAATGTGGCCTACAAATTGAAGATGAGTTAAAGCTTGTGGATCACAAACTATCTGACCTTCGGGCTGAAGGAGCTACCCAGATTTCCATCACTTTGACCATGAAAGATTTGGGTATACAAAGGTTGGTATATCACTGTGTATGGATTTTTTTGTTGTATTTTGTAAATTGTTTCAATTTTTTATGTCATATTTAAAAATGCTCAAAAAAATAATTATGTCCGTATAATCCATACTTATTATTTTTGTAAAAATAATAAAAAAGAAAAAAAAACCACACAATGTCAAAAAAATAAGTATGAATACACTTTATACAAACTTGAAACACACGATACATACTCTTTAATATACACTTAATATTCGAAAAAATGTACCACACACTCTAAAAAGACAAGAGGTAAATATGAGTTTATAAATTTGTATGGTTTAAGCTAAAAGGTTATTTGAAGGAATCATATATGATTCAATTGAACAGGTCACAAAATTATGGATGGACAAACACATACGTATTTACAAAAGCAATGGGAGAAATGTTGATATCCGAATTAAAGGAAAATATTCCTGTGGTTATTATACGTCCCACTATTGTTTCAAGTACTTACAAAGAACCATTTCCTGGCTGGGTCGAAGGTGTAAGGTATGCATTTTACCTTTCCAAAAACTTCATTACACTACAAGAATTTTCGTCTCTGTCGATGCAGAAAAACGTAGACGGTTCTTATGAAAAATATGGACAGACCTTCTGTCGTTTTTACGTGGGCACATTGCGTGGCTGAAACACTGTCGTCTTTTCCTTTGCCTACGTTTTTGACGTTGCGTCGGCAAAAATGTCCATGCAAATTAAAATCGTGAGCATAAAAATATTTCTAGCCACGAAAAAGCGTCGACAGAAAGATATTTTTGTCCACGATCATCATCACGTCGGCAAAAATAAATTTTCTGGCCACGTTTGTTTCATGGGCAAAAACTGATTCTGCCAACGAAAAGATCTTTGTCGGCAAAAATAAAATTTCATTTAGGAGAAAATGAAATTTTTGGAGAAAAATATCAATTTCATTATTATAAATTATTTTAAATCATGAAACTACTTGAAAATATTTACGAATATAACATAATATAATTAATAGGGACATCAATAGTAGTCTATCAATGGTTTATATGGCAAGCATACTGATATTTTTCTATATTTGAAAAAACAAAACCATTTAATTATATACCTTCAAAGAACAAGGGTTGTATGGATTTAAACTCTGAGCTAATGACTCTGTCATTTTAAACCCTAGAATTTTGTATTAGTAACAATTTACACCCTATTTTACATTTTTAATGTTTGAAAAAATTATTATTATGTAAGACTTACAATCAATTTAATTCAACTATTAACTTTAAGAAGGCTTCTTACATATTAATGTGAATATGATTTTCAAAGGTAACCATAACAAAGAGTCTAAATTGATTGGCTTGTTTGAAAATTTGGGAGCTTAATTAACTAAAATTATAAGTTTAACACCATATACTTGATCAATAAATATGAAAGATGGTATAAATAGATATATTCACAAAAAAAAAAATCAAAGTTTACATTATTAATCAAATTATCAATTTAATCATCATGGATTGACCTGGTAGTAAAAAGATGAGATACAGTCTCAATAGCTAATTAAGATGTTATGAGTTCAATCTGGTGGTTACTATCTAAGAATTAATTTTCTAGAAATTTTCTTAATATCATATAAATAAAATCAATATCATGTTGAATCTAGAGAAGAAACAAATAAGAGAACACAAAACACAATAGAAAAGCATAACTAATTAACCTATATATTTATACATTAATAAAAGTATAAGTTAATTTAAGAACTATTCTACCTTAAATAATTTTACAACAATATAATTGAAACGGTCAAAATACTTTGATAGTTTAAAACTTTAAAAAATAACCTTAAATTTGTAATGTGTATATATATAAACATACTCCGACTATTAGTTTTGATGAAAAATGTTATTATTTTGTGTAAAAAATATTCTTAAATTTTTTAAAATTTAAAATATACCTTTGAAATTAAGAAAGAAGTTAAAAATAGTTTAATTTTCATAAATATAACAAACAGACAATATTTTTGGCCCATGTAACAAAATGAAA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BLAST of Chy12G213400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93ZB9 (Fatty acyl-CoA reductase 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FAR3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 558.9 bits (1439), Expect = 1.0e-157 Identity = 274/465 (58.92%), Postives = 350/465 (75.27%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G213400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9XGY7 (Alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase OS=Simmondsia chinensis OX=3999 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 542.0 bits (1395), Expect = 1.3e-152 Identity = 264/462 (57.14%), Postives = 349/462 (75.54%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G213400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LXN3 (Probable fatty acyl-CoA reductase 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FAR4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 479.9 bits (1234), Expect = 6.0e-134 Identity = 239/463 (51.62%), Postives = 333/463 (71.92%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G213400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q39152 (Fatty acyl-CoA reductase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FAR1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 474.2 bits (1219), Expect = 3.3e-132 Identity = 241/463 (52.05%), Postives = 334/463 (72.14%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G213400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0WRB0 (Probable fatty acyl-CoA reductase 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FAR5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 452.2 bits (1162), Expect = 1.3e-125 Identity = 234/467 (50.11%), Postives = 331/467 (70.88%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G213400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CGS1 (Fatty acyl-CoA reductase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500564 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 869.0 bits (2244), Expect = 1.7e-248 Identity = 435/465 (93.55%), Postives = 451/465 (96.99%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G213400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CGA9 (Fatty acyl-CoA reductase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500564 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 868.6 bits (2243), Expect = 2.2e-248 Identity = 435/462 (94.16%), Postives = 450/462 (97.40%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G213400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DJ29 (Fatty acyl-CoA reductase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020507 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 745.3 bits (1923), Expect = 2.8e-211 Identity = 372/468 (79.49%), Postives = 420/468 (89.74%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G213400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2P5EFP1 (Fatty acyl-CoA reductase OS=Trema orientale OX=63057 GN=TorRG33x02_198990 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 652.1 bits (1681), Expect = 3.2e-183 Identity = 318/465 (68.39%), Postives = 388/465 (83.44%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G213400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: M5WHQ7 (Fatty acyl-CoA reductase OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_6G126900 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 649.8 bits (1675), Expect = 1.6e-182 Identity = 316/465 (67.96%), Postives = 379/465 (81.51%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G213400 vs. NCBI nr
Match: XP_004139568.1 (LOW QUALITY PROTEIN: fatty acyl-CoA reductase 3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 900 bits (2326), Expect = 0.0 Identity = 455/462 (98.48%), Postives = 457/462 (98.92%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G213400 vs. NCBI nr
Match: KGN64901.2 (hypothetical protein Csa_022764 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 870 bits (2247), Expect = 2.06e-310 Identity = 444/462 (96.10%), Postives = 446/462 (96.54%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G213400 vs. NCBI nr
Match: XP_008462145.1 (PREDICTED: fatty acyl-CoA reductase 3-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 865 bits (2236), Expect = 1.30e-308 Identity = 435/462 (94.16%), Postives = 450/462 (97.40%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G213400 vs. NCBI nr
Match: XP_008462137.1 (PREDICTED: fatty acyl-CoA reductase 3-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 865 bits (2236), Expect = 1.52e-308 Identity = 435/462 (94.16%), Postives = 450/462 (97.40%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G213400 vs. NCBI nr
Match: XP_038893773.1 (fatty acyl-CoA reductase 3-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 830 bits (2145), Expect = 9.82e-295 Identity = 414/462 (89.61%), Postives = 436/462 (94.37%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G213400 vs. TAIR 10
Match: AT4G33790.1 (Jojoba acyl CoA reductase-related male sterility protein ) HSP 1 Score: 558.9 bits (1439), Expect = 7.2e-159 Identity = 274/465 (58.92%), Postives = 350/465 (75.27%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G213400 vs. TAIR 10
Match: AT3G44540.1 (fatty acid reductase 4 ) HSP 1 Score: 479.9 bits (1234), Expect = 4.2e-135 Identity = 239/463 (51.62%), Postives = 333/463 (71.92%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G213400 vs. TAIR 10
Match: AT5G22500.1 (fatty acid reductase 1 ) HSP 1 Score: 474.2 bits (1219), Expect = 2.3e-133 Identity = 241/463 (52.05%), Postives = 334/463 (72.14%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G213400 vs. TAIR 10
Match: AT3G44550.1 (fatty acid reductase 5 ) HSP 1 Score: 452.2 bits (1162), Expect = 9.5e-127 Identity = 234/467 (50.11%), Postives = 331/467 (70.88%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G213400 vs. TAIR 10
Match: AT3G44560.1 (fatty acid reductase 8 ) HSP 1 Score: 441.4 bits (1134), Expect = 1.7e-123 Identity = 228/467 (48.82%), Postives = 327/467 (70.02%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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