Chy12G212650 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGTATCCAATTGCTTCCCGCCATTGCAAGAAGGTTTACTCATTATTTTACTCTTTTAACTTCTCCAAAACACACATATTATTGTGTGATTATGATTTCTACAACCAATAAAACTTTATTTATTTCTTTACTTCTATATATATTAGACTTGAAGGTAAGGTAGCCGTAATCACTGGTGGGGCTAGAGGAATTGGGGAACAAACAGCGAAGCTCTTCTTCAAGCATGGAGCCAAAGTGGTTATTGCAGACATTCAAGACCATTTAGGTCAAACAATATGTAACGATCTCGGTCAGTCATCTTCTGTATTCGTTCATTGCGACGTAACGAAAGAGAAAGACGTTGAAACTGCGATTGACACGGCAGTCTCCAAGTACGGAAAGTTAGACATCATGTTGAACAATGCAGGAGTTTTCGAAGAATCTCCAAACTTCAACATTCTGAAAGATGATCTATTAACCTTTCAGAGAGTGGTGAACGTCAACCTCGTTGGGGCCTTTCTCGGAACGAAACACGCAGCACGAGTAATGAAACCGGCGGGTCGAGGGAGCATCGTGACGACAGCGAGTATATGCTCGGTGATTGGGGGAATTGGGACGCATGCTTATACGAGCTCGAAGCATGGGGTGTTGGGATTGATGAGGAATGCAGCTGTGGATTTGGGAAGATATGGGATTAGGGTAAATTGTGTTTCACCAAGTGTAGTGCCAACTGAAATGGGAAGGAAGTTGTTAAAGGTTAAAGATGGTGGGGAATTTCCAAGTTTCTACTGGAATTTAAAAAATGGAGATACTTTAAGGGAAGAAGATGTGGGTGAAGCTGTTGTGTATTTGGGGAGTGACGAGTCCAAGTGTGTGAGTGGACTCAACTTGATTGTTGATGGAGGCTTTACTGTTGTCAACCAAGCTCTTTGTTCCTATCGATCATCTCATTGATCGATCATAAGTTTGAGTCAAGAATAAATGGAATCCCACCCCATGTAGTAAAATAGAGAAGGCACCTTATACGTCTCATTCTCTAATTGTTGTACTATATATTTTTTTTTATAGCACTAGGATTTCTCACGTTTGAAGTAATATTATTAATAGAAAAACTACTGTAAACGATATATAAAATTGTTGAAAGTATTACTAATAAACTGTCACACTCCCTCCCAAGCCCTCCTCATACAATCAAGTGAAGTTTGTCTGCCTAGACACTTAACATCTATCTCACCATAAGATAATACGTTGGACACTTAGTAAGCGAATTTTACTACTCATTTACTCTTTCAGGCGTGTCATAGACTAAGCTAACTCAACGGAAGACTTCATTCAAAGGAACTCTTATTCTAACCGAAGGCTATATTGCCTAATGGTTATACTGCATACAACAACTCCAACATTAGTCATGTGACGTAGTTGAATGACTAATTCAAAATGCATTAAACGTTTAAACCAGAAAACATAAGAAAGAAAGTACTTCATGAATATGTATTAAGAGTTTACAAAATGTCAATGTCTAGGTAAAATGCAAGTACCAAAGGCTTAAGTACAAATAATTGAATTACAAAATATCCCTCCCCTTCTCTTAACAAATTTAGATGCTATGCGACCAAACTAGTGGTTACTAACAAAAAAATGTTGTGTAACAAGGCACAACAGGCGATCAAGACGGCAAGTCAAGCTGAATGTCCTTCGCTACCTAGAAGGAAAGGAAACAAAACATTTCAAGAATTAGACAAAATGTCCCGTGAGTGAGGATTTCTTCAATACATTTCATTTTAATAAATGGTTTTCAATACTTAGCTTAGAGTTCAAATTAAGCTCTAAAACTTGCCCCGAACTCCTTACTTATATACTTCTCCCGTGAGAATTTTTATGCTGGAATGATTACTTCTACATGACGGTGAGTTTTCAACAAATCGCGTTCGGTGTTGATATTTTATTAGTTTTCAACAAAAAAAATTTCTTCAAATGTTTCATAATTCAAAATAATAATAATAGTAATAAATTAAACTCAAAGTAAAATTGTAATATTTTATAACCGATGTAAATGAAGTACAAACTAGAAAAAAAAGTTCTCTTTTTCAGTGTTTTACCTTCATTATGTATATAAATAGTATATCTAATATACTGTAAATATGACAATAAGTAAACCAACTTAGATAAAAATTATAACTATATAGCTAGGTAATTGATAAACCAAATTCACATTTTATATACCAAAATTTTTAGTCTCAATAATGGCCGGTGTGCATTTGATATTATTTGTGGACATAAAGTTGACACTTATTGCATAAGTTATTTTGTTACGACTTCAAACCTATGAAAAATGTGAATAATAAGGTAACAAAGATAACTGCAAATTATTGAAAGGAATCTTTTAATCAAGAGTTGATTGAATTTTGAGGATATTGAAAATTCTAAGAAAGTAGGAATGTTTACACCACACTCAACCTTGGATTCCTAATCTATTGGATATGCAATTTTGAGATAGAATTTTATTTATTATGAAATGTTTTCATTATTTACAAGATTATAATATAGTGTTCAATTTTAGTCCAAGTCGGTACTCTCAAATATTTAATTTTAATTCTTTTATTTTTAATAAATTTTATATTTAATTTTTTTTGGAAGTTAATATTTATTAAATAATCACAATAATTTTCATCCAAAGAAACATGAATATACTTAATGAAAAAATCTATAATAAACTAATAGATTATTCTAAATTTAAAATTATGTAAATTTAAAGTTAAAAAAGAGAGAAACTAAAATTGAACAAAGAGGAAAGGAAAACAAGGAGTGAGAAGGGAAGAGTTTTTAAGGTGGGAATTTTGGGTGTTAGTGAAGAAAAGATATTTGCTTGTGGGAATTAAGGTGAACCACACAAAATGATTGAAACCCCTTCTCTCCCTACATTTTCTTTCTTATCCACATGTACTTTTTCATTTTTCCAAAAACTTAATCAATCTAAAATTGAGACACTATCACTACTTAAGGTTTGTTTGGTTTAAATTTTTAATGATGCTTGAAAATATAAATCTCAGTTTTTTTGTTTGCATGGAAAATGATAACATAATATTATACACAAATTTTGTTTTTAAACTTAATTTATGAAATTAACCATGAAAATTTTATATAATTTTGGATCTCTTAAAGAATATAACAAAATGGAAAAATATTTGAACAATTTCGAAAATAGAAAAAGCTCACAAACCCATAATGAGAAATACCAAAAATGATATGTGATTAATTGGCATTGAGCGCACGTAATATATTTGGTAAACTATCGTTTTGATTTGACTATTCTTTCGTACACAATCGTTTAAATTTGAGTAGTCAAATCTAAACGATTATTTTTCAAGATCATTTATACTTGGTTATTTTGGTAAATGATCATTTAAATTTGGACAATCAAATCTAAACAATTTTTTTCAAGATTTTTTTGTACACGATGGTTTAGATTTGGCTATTTAATATCCAATGATTTTTTTCACCATCTTTTATATTTGACGTTTGAAAAAAAGTAAAAAAAATATATATCTTTTATATTTTGTACACAATCTTAAACCAAATAACAATTTGAAAAAAAAATAAAAGAAAAATTGCATAAAAAGAGAAAAAGACGATGAAAAATGAATGACAAACTTGAAATTTTTTTAAAAAGATGACCAACCTAATGAATTTTTTCATTTTGTTGTACTTGCCTTAAATATTTTGTCGTTTTATTATATTGATGAAAATTAACATATAATTTTTATAGATTAATTAATTAAACAATTTATCTTATTTAATACAAATTTTTATTCTAAAACTAAGTTAAGTAAATATTGTAATAGATGATTATCTTTTATTTATTAAAATAATATTTATATTAATTTTGTTAAATTAATATTGATTAATTAACTATATTCCATATGAATCGATATATAAATTGAAAAACAAATGGAGTGGGGAAAAGATAAACCCCTAGTTTTGAAAATAAATAAATAAATTTTGGTCTATGAAAAATAAACATGTCTGGAAATAACTTATTCACAACAAAGATTGAAAACTTTGAAACAAAATCTGAGATTTGGATGTCTATATTAATTTCTACGTAGAAAATCCTCCAATCAAAAAATGAGCTATAGAGAGAAAAAAAAACATCATTTTAGAGAATGAATCAAAGACATGAGATTGAATCCATGACAATTGACAAACCAAGGTTGATTAACTAATTAATGCTATGAAAATTGCACCAAATAGCACAATATAGAAAATACATATAATCTATGGTACAAGAGAACAATATTTGCAAAAATAGAAATTTTCTACTGTTATATGATAAATAATTCTTAAAATGTCAATTCTATACTTTAGTTTACTTTCTCTCATGCTATCAATGACAACATGCATAATATGTCAATGTGTTTTCATGAATTTATCAATCATAACTTGAACTTCGATATTCTATATGATATAAATGTTGATAGCATAACCTAAAATTAATAATTTATTTCAACAAAATTTGCAACTATATCAATTTTTATTTATACTATTAACGATAAAAGCTATCAATGACAACTATATCATTATATAGTATGTTATTAGTGATTTAAAGCTATTACCGATAGCATACTAATCTGATCTCTTTTCTTTGTCCATTTGTGCTTAAAAAAAAACAATCACAATATCACTTTATAGTTGCATTACCTTGATATCATTGATATATAATAGCTTATTAGGGATATTACTTATAAATGCTATCAATGATATCACTCATTTGCTATAAGTTGTAAATATTTTGTAAAATCTACTATTTTTAAAAATTACCCTTGGTTAAATTAAGGGAGATTTTTAAAAATAAAAGAATTGATAAACAATTTACGGGCCATAGCAAAATTTTAATCCTAACCCAAAATGGATAACCAAAATTTTAACCCAAGCCCAAAGTATTCATTTTTTTTTTTGCTATAGAATGTAAATATTTTCTATTTTCTTCTATTTATGTAAATTCCCCTTAAATTA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BLAST of Chy12G212650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZUT9 (40S ribosomal protein S5-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RPS5A PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 358.2 bits (918), Expect = 2.4e-97 Identity = 181/207 (87.44%), Postives = 194/207 (93.72%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G212650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O65731 (40S ribosomal protein S5 (Fragment) OS=Cicer arietinum OX=3827 GN=RPS5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 357.1 bits (915), Expect = 5.4e-97 Identity = 180/190 (94.74%), Postives = 188/190 (98.95%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G212650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P51427 (40S ribosomal protein S5-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RPS5B PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 354.8 bits (909), Expect = 2.7e-96 Identity = 181/207 (87.44%), Postives = 192/207 (92.75%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G212650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5E988 (40S ribosomal protein S5 OS=Bos taurus OX=9913 GN=RPS5 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 310.5 bits (794), Expect = 5.8e-83 Identity = 154/190 (81.05%), Postives = 174/190 (91.58%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G212650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P46782 (40S ribosomal protein S5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPS5 PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 310.5 bits (794), Expect = 5.8e-83 Identity = 154/190 (81.05%), Postives = 174/190 (91.58%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G212650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6N2LW37 (Uncharacterized protein OS=Salix viminalis OX=40686 GN=SVIM_LOCUS244872 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 602.1 bits (1551), Expect = 3.6e-168 Identity = 323/578 (55.88%), Postives = 397/578 (68.69%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G212650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A3S3P3S7 (Glucose/ribitol dehydrogenase OS=Cinnamomum micranthum f. kanehirae OX=337451 GN=CKAN_01101500 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 522.3 bits (1344), Expect = 3.6e-144 Identity = 281/569 (49.38%), Postives = 378/569 (66.43%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G212650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A4D6LHH5 (Momilactone-A synthase OS=Vigna unguiculata OX=3917 GN=DEO72_LG3g2553 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 516.5 bits (1329), Expect = 2.0e-142 Identity = 305/590 (51.69%), Postives = 385/590 (65.25%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G212650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LT69 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G168890 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 513.5 bits (1321), Expect = 1.7e-141 Identity = 257/265 (96.98%), Postives = 260/265 (98.11%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G212650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A118JYF1 (Glucose/ribitol dehydrogenase OS=Cynara cardunculus var. scolymus OX=59895 GN=Ccrd_000197 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 511.5 bits (1316), Expect = 6.4e-141 Identity = 274/566 (48.41%), Postives = 362/566 (63.96%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G212650 vs. NCBI nr
Match: KAE8652818.1 (hypothetical protein Csa_022860 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 873 bits (2255), Expect = 1.39e-312 Identity = 457/505 (90.50%), Postives = 464/505 (91.88%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G212650 vs. NCBI nr
Match: KAG6583702.1 (hypothetical protein SDJN03_19634, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 589 bits (1518), Expect = 3.66e-201 Identity = 316/497 (63.58%), Postives = 372/497 (74.85%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G212650 vs. NCBI nr
Match: CBI28275.3 (unnamed protein product, partial [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 582 bits (1499), Expect = 1.54e-192 Identity = 323/577 (55.98%), Postives = 398/577 (68.98%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G212650 vs. NCBI nr
Match: KAG4980001.1 (hypothetical protein JHK85_033959 [Glycine max] >KAG4985635.1 hypothetical protein JHK86_033326 [Glycine max] >KAG5118817.1 hypothetical protein JHK82_033237 [Glycine max] >KAG5139808.1 hypothetical protein JHK84_033576 [Glycine max]) HSP 1 Score: 532 bits (1371), Expect = 6.23e-177 Identity = 311/601 (51.75%), Postives = 405/601 (67.39%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G212650 vs. NCBI nr
Match: KAG8387456.1 (hypothetical protein BUALT_Bualt02G0023200 [Buddleja alternifolia]) HSP 1 Score: 522 bits (1344), Expect = 2.33e-174 Identity = 292/579 (50.43%), Postives = 369/579 (63.73%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G212650 vs. TAIR 10
Match: AT2G37270.1 (ribosomal protein 5B ) HSP 1 Score: 358.2 bits (918), Expect = 1.7e-98 Identity = 181/207 (87.44%), Postives = 194/207 (93.72%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G212650 vs. TAIR 10
Match: AT2G37270.2 (ribosomal protein 5B ) HSP 1 Score: 358.2 bits (918), Expect = 1.7e-98 Identity = 181/207 (87.44%), Postives = 194/207 (93.72%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G212650 vs. TAIR 10
Match: AT3G11940.1 (ribosomal protein 5A ) HSP 1 Score: 354.8 bits (909), Expect = 1.9e-97 Identity = 181/207 (87.44%), Postives = 192/207 (92.75%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G212650 vs. TAIR 10
Match: AT3G11940.2 (ribosomal protein 5A ) HSP 1 Score: 354.8 bits (909), Expect = 1.9e-97 Identity = 181/207 (87.44%), Postives = 192/207 (92.75%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G212650 vs. TAIR 10
Match: AT3G51680.1 (NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein ) HSP 1 Score: 236.1 bits (601), Expect = 9.9e-62 Identity = 131/266 (49.25%), Postives = 177/266 (66.54%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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