Chy12G210670 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCCAAGCCCGAAAGGGCTGTTCTTGAACCACTCGGTGAGGAGTTCGATATATCCACTCATTTTCGCACTTCAATTAGATCTCTCGCCGTTTCCCCCGTCTCTGATTCCGAGACCTTAATATACGCCGGAACTAAATCTGGGGCACTTGTCTTGTTCTCTGTAACTCCGAAATATTCAAGTTCTACCGCTCTAGTTTCCGAAACTGCCAGCTTGGATACTCCCAGAATTACCTCTTCATCGGAGGGACTTTCACTTCTGAGGACTGTTGCGGTTAGCGTTTCCTCAATTGTCTGTTTGCATGTACTCCGTGGAATTGGAAAGGTTTTAGTACTTTGTTCCGATGGGTTTTTGTATATTGTTGATTCGCTTCTTTCACTGCCAGTAAAGAGGTTGGCGGGTTTGAAAGGAGTTTCTTTGATTGCGAAACGAATTAGGAGCAGCGAGTCTGAGTTTTCTAGTCTGTATGGGAGTGTGGATAATAATTCTGGATTTGTTAGCCCTAGTCAAAGGCTTCTGCAGAGACTGGGAAGTGGTATGCGAACAAATGGCTTGAAAATTAAGGAATCAGAATCGCCGCGTGAAGAAAGTGATTTCGTTTTTGCAGCTCTAGTTGGTAAAAGGTTGATTTTATTTGAAGTTGTTTTGGGTCATCGAACTGGCAGAAGTGATCGAAATACAAATGATCCAACTGAGTCCCTTCTAATTTTGAAGGAGTTACAGTGTAAAGAAGGATTTTCAACAATGGTGTGGCTCAATGATTCAATAATTGTTGGTACAGCTAGTGGCTATTATCTTTTTTCATGTGTTACAGGAGAGAGTAGTTTAATATTCAAATTACCAGAGTTATCCAGTCCTCCATGCCTTAAGTTGTTGCGGAAAGAGTGTAAAGTGCTACTATTGGTAGATAGGGTAGGGATTACTGTTAACGCTTATGGTCAACCTATGGGTGGGAGTCTCGTGTTTCATGATATTCCAAAATCTGTTGCTGAGATATCTACGTATGTGGTTGTTGGAAGTAGTGGACAGCTGAAGTTATATCATAGGAATACTGGTAGCTGTATTCAAACTATTACTTTTAATGGAAACAGAACTGAGCCTTGCATTGTTTCAGATGAGGAAGATGGTAGTGGAGATGTTATTGCCGTTTCTGTGACTAACAAGGTATATGACCATTTATTAATTCTAACAAATTTTATTTTTGTCTTGCAATGCGAAGACCTGTGATACAACAAAAGTAAGAAATTCACTAGGTCAATATATGTTGTAACTGTTTTACACAAAACAGATCAATGTGTGGAAAAATACTGAGTAACATGTTGGATTTTGTGGAACTAGAGAAAGAATATGTATATTTTAGGTGAGAACTCATTGATGAGATGAAATTAGAAAAGGAGGGAGAAAACCTTTCCTATTCAAAAGGAAATTGAAGCACACACACAAGATAGGCTATAAATAGTTGCAAAAGCAGGCAGGAATTTTACAAATTTACACCAAGGAGAGCCAAAGAAGATAAATAATCAAGGAAGCTGTTCAAACATTTCTCTCTGTCCTTGAAGATACACGAGTTTCTGTTGTTCCATCTTTTTAACTAAGAAAGTTTTTTTTTTTTAAAGTTTTTATATAGCACGTTGGGCTGTGCACTTTGTTGTGACTTGTGAGATATTTGAAGGAGACAAATAGTTGAATCTTCGAAGGAGTTCATAGGGAGTCTTTTGAAAATGGTCCTTTGTGAGCAGTGGTGGATTCAAAAATTTTGTTGACGGGGCTTTATAGTTTAGTAAAAATGAAAGTGATTGTTTTACCACTGGTCTAGCTTCTGGTACTAGTATTTTTTCAGTTGTATATATATATGTATGTGTGTGTGTGTGCATGCATGTGTGTGTAAATAAAAGTGAAAAACATCTTCAAGGTAATGTAGAAATAACAGCCCCTGAAGCCTTTTAAATACCAATCAGAACTACACATTGCAGGACAATTTTTAAAGATTTGTGAAACAAAATTAGATCTTAACTTGCGGTGATTGAGGCGTACTTTCCTTCATATGTCTACAAATCTCAATTAATGAATGAAATTTGTGAAATTGAAGAATTAAATGTGCCCATCTCCTTCATGTTGATGCCACAAGAATTTCAAATCTTTGTTTCATGAAAAGCTTAGCCCCTCCACTTTGTATTTTAAGCAAGGACATGAAATAAGTTGGTGTGCTTGAAAGGCTTGGTGTGCCGAACCTCTCTTACACTTTTTCAATTAGTGGATATTGGAAATCCTCAAAAGCTTAAAAGCTTGAATGCCCCTAGCACTACCTTCAAGTAGCCCATAAGCTACTATGTAGCTAATTTTTGAGTTTCCCCTTCGCGCGTTTGGGTGTACCGCTTATGTTCATAATTTCGGCCCTAATCAGACCAAATTTACCCCTCGGGCTCAAGCATGTATGTTTGTTGGGTATCCCCTTGATCAACGTGGTTATAAATGTTTTCACTTGTTGTTCAATAAATATTTCATCACTATGGATGTTACCTTTTGTGAGAACTGACCCTACTTTTCCGTTAGCCATCTTTAGGGGGAGAGTGTGAGTGAAGAGTCTAATAGCACCTTAGAGTTTATCGAACCTACTTCTAGTACCGTGTCTAACTTCGATCCTCATCCCATAGTCCTACCCACAAACCAAGTTTTTTGGAAAATGTATTACAAGAGGAATCTCAAAAAGGAAGTTGGGTCCCCTACTAGTCAGTCGTTGGCTCCGGTCCAAGACTTCGAACCTCCTCGAGATCAAGGTATGGAAAATCCTACTCAACCTTGTACTAGTAATAAAGATCAGTGAGAATGACATGTCTGTTGTTGCTGGTCTTGAAAATGTGGAAGAAAAGAACAGTAGTGATGAGATTGAGGGAGGTCAGAGCAGGAACCAGTAATAATGAAGTTGAACAGGGTCATACAGGGCAACTTGATGAGTATGATCCCTCTCTTGATATTCCCATTGCTCTGAGAAAAGGTACTAGGTTCTGTACTAAACATTCCATTTGCAATTATGTTTCTTATGATAATATCTCTTCATAGTTCAGAGCTTTTACAGCAAGCCTAGACTCTACCATAAAACAAAAAAATATTTACACTGGTTTAAAGCCTGAATGGAAGAATGCTGTCATGGAAGAGATAAAGGCTTTTGAAAAGAATAAAGGTTGGGAGATTTATGCTATACCCAAGGGACACAAAACTATGGGATGCAAATGGATGTTCTCTCTCAAATACAAAGCAGATGGAACTCTTGACAGAGACAAGACAAGGTTAGTTGCAAAGGAATTTACTCAAACCTATGGTGTTGATTATTTAGAAACTTTTCTCCAGTTGCTAAGTTGAACACTATTGAGTCCTCCTATATGTTGATGTGAACAAAGATTGGCCTTTATACCAGTTGGATGTTAAGAATGCTTTTCTGAATGGAGACCTAGTGGAGAAAGTCTACATGAGCCGCTTGCCTGGATTTGAAGCTCAGTTTGGTCAACAGGTGTGTAAACTCCAGAAAATTCCTATATGGTCTTAAACAGTCATGGTTTGACAAATTCATTACCTTTGTCAAGTCCCAAGGGTACAGACAGGGGCACTCTGATCATACTTTATTTACAAAGGTTTTCAAGACAGGGAAAATGACAGTTTTGATAATTTATGTGGATGACATTGTTTAGTTTGGAAATGATCAGGCAGAAATCAATTAACTAAAGCAGAGAATGGGTGATGAATTTGAAAACAAGGATTTGGAAAATCTGAAATGTTTCCTTGGAATGAATGTGGCCAAATCTAAAGAAGGTATATCCATGTCTCAAAGAAAATACACCCTTGATTTGTTGATCGAGATCGGTATGTTGGGTTGTCGTCCTGCTGACGCTCCTATTGAATTCAACTGTAAGCTAGGAAACTCTGATGATCAAGTTCCAGTTGATAAAGAACAATATCAGCGCCTTGTGGGTAACAAACCGAAACCAAGGTACTATTTTTCGTCGTCCTGATGTTTCCTTGTTTGTGAATGTCGTTAGCCAGATTATGCAGACCCCCTATGAGGAATACATGGAAGCTGTCAACAGAATTCTGAGGTACTTGAAAATGACACCTGGTAAAGGGTTGATGTTTAGAAAGACAGATAGAAAGACCATTGAGACACATGTTGACTCGGACTGGGCAGGATCTGTCATTGATAGAAAGTGTATCTTCGTTTATTATACCTTTGTTTGGAGCAATCTAGTTACTTGGAGGAGTAAGAAGCAAACTGTTGTGGCCAGGAGCAACGCTGAGGCCGAATACTGAGCTATGAGTTTGGGAATACGTGAGGAAATTTGACTCTAGGAAATTCTGTCTGATCTTCATAAGGAATGTGAGACACATTGAAGCTTTTTTGTGATAATAAAGCCACTATTAGTATTGCTAACAACCCAATTCAACATGATAGAACTAAACATGTTGAGATTGATCTGCATTTCATCAATGAAATATTTGATAGCTGGAGCATATGCATTCCGTACATCCCTTCGAGCCAACAGGTTGATGATGTTCTCACCAGGGGGACTTCTCATACCAAGCTTCGATTTTTGTGTTAGCAAGTCGGACCTCATTGATATTTATGTCCCAACTTGAGGGGAGTGTTAGAATTTGTGGGGTTGGCCCTGAGGGTGTTTATCGAAAAAGTTATTTATGGAAAGTTTTACCATAAACATTTTTTTGTCTTTCTTTAATCTGTGTATTCTATTTAATCTCCTTCATTGTACCTTTGTAATTCATCATAAAACAGTAAAAGTAACGATATCGTGGTTTTTCTCCTGGTACTCGGGTTTCCATGTAAGCCTAGTTTTTCATGTTTATTGCTTTTAATACAATTAAGCTGACAACACCTTAAGTTCTTTAATCTGGCATGAGTGAAATAAATACTAGAGTTAGATGTTTCTCATAGTCTTTCCTTGAAAATCACCACTTCTAGTTCCTTGCATTAATATTCTTATTGA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ATGGCCAAGCCCGAAAGGGCTGTTCTTGAACCACTCGGTGAGGAGTTCGATATATCCACTCATTTTCGCACTTCAATTAGATCTCTCGCCGTTTCCCCCGTCTCTGATTCCGAGACCTTAATATACGCCGGAACTAAATCTGGGGCACTTGTCTTGTTCTCTGTAACTCCGAAATATTCAAGTTCTACCGCTCTAGTTTCCGAAACTGCCAGCTTGGATACTCCCAGAATTACCTCTTCATCGGAGGGACTTTCACTTCTGAGGACTGTTGCGGTTAGCGTTTCCTCAATTGTCTGTTTGCATGTACTCCGTGGAATTGGAAAGGTTTTAGTACTTTGTTCCGATGGGTTTTTGTATATTGTTGATTCGCTTCTTTCACTGCCAGTAAAGAGGTTGGCGGGTTTGAAAGGAGTTTCTTTGATTGCGAAACGAATTAGGAGCAGCGAGTCTGAGTTTTCTAGTCTGTATGGGAGTGTGGATAATAATTCTGGATTTGTTAGCCCTAGTCAAAGGCTTCTGCAGAGACTGGGAAGTGGTATGCGAACAAATGGCTTGAAAATTAAGGAATCAGAATCGCCGCGTGAAGAAAGTGATTTCGTTTTTGCAGCTCTAGTTGGTAAAAGGTTGATTTTATTTGAAGTTGTTTTGGGTCATCGAACTGGCAGAAGTGATCGAAATACAAATGATCCAACTGAGTCCCTTCTAATTTTGAAGGAGTTACAGTGTAAAGAAGGATTTTCAACAATGGTGTGGCTCAATGATTCAATAATTGTTGGTACAGCTAGTGGCTATTATCTTTTTTCATGTGTTACAGGAGAGAGTAGTTTAATATTCAAATTACCAGAGTTATCCAGTCCTCCATGCCTTAAGTTGTTGCGGAAAGAGTGTAAAGTGCTACTATTGGTAGATAGGGTAGGGATTACTGTTAACGCTTATGGTCAACCTATGGGTGGGAGTCTCGTGTTTCATGATATTCCAAAATCTGTTGCTGAGATATCTACGTATGTGGTTGTTGGAAGTAGTGGACAGCTGAAGTTATATCATAGGAATACTGGTAGCTGTATTCAAACTATTACTTTTAATGGAAACAGAACTGAGCCTTGCATTGTTTCAGATGAGGAAGATGGTAGTGGAGATGTTATTGCCGTTTCTGTGACTAACAAGGTTATGTGCTATCAAAAATTGCCTTGTGATGAACAAATTAAAGATTTGCTGAGAAGGAAGAACTTTAAGGAAGCCATCTCTTTGGCTGAGGACCTAGAGTGTGCAGGTGAAATGTCCAAGGAGATGCTATACTTTGTTCATGCTCAAATTGGTTTTCTGTTGCTCTTTGACTTGCAATTTGAGGAAGCGGTAAATCACTTTTTGCAATCTGAGACAATGCAGCCTTCTGAAATATTCCCATTTGTGATGAAGGATCCAAATCGTTGGTCCCTACTGATTCCCAGAAATCGGTACTGGGCAATGCATCCTCCCCCTGCTCCCTTTGAAGATGTTATAGACGATGGTTTGCTTGCCATCCAGAGAGCCACGTTTCTTAAAAAAGTAGGAGTAGAAACTGCTGTAAACGATGATTTTCTCTTGAATCCACCGAGTAGGTCAGATTTGTTGGAGTCGGCTGTAAAGCATATTATCAGGTACTTGGAGGCTTCCCGCCATAAAGAATTGATATCAGCTGTTAGAGAGGGAATTGACACTCTTTTACTGTGCCTGTATAGAACTTTAAATTCTGTTGACAAGATGGAAAAACTGGCATCTTCAGAAAACAGTTGCGTTGTGGAGGAGTTGGAAACTTTATTAGAGGACTCTGGACATTTGCGTACACTTGCTTTCCTTTATGCTAGTAAAGGGATGAGCCCAAAGGCTCTTGCAATTTGGCGTATCTTGGGGAGAAATTATCCATCCCGCCTTTTGATGGACTCTTCTATGGATGAGAGTACTATGGATAGCAATGTTCGGGATATATCTGGTAAGGAAGCGGCTGCAGCAGAGGCATCAAAGATTCTTGAGGAGTCATCTGATCAAGCATTAGTTCTTCAGCACCTCGGATGGATTGCGGACATCAACCAGCATTTTGCCATTCAGATTTTGACATCAGAAAAGAGACAATCTCAATTATCACCAGATGAAATAATAAGGGCTATTGATTCCAAGAAGGTAGAAATGCTTCAAAGGTATATACAGTGGTTGATTGAAGAGCAAGAGTCTTGCGATCCTCACTTCCACTCACTATATGCTCTCTCATTAGCCAAATCAGCAGTCGAACTTGATAGTACTCAAAGCCTTGATTCGTCATCAGACCCAAAAATTTCTGATCAGAGACTTAACTCAATATTTGAACAGCCAATCCGAGAAAGGTTACAGATCTTTTTACAGTCTTCGGATTTGTATGATCCAGAAGAGGTTTTACACTTGATTGAAGGATCAGAATTATGGTTGGAAAAGGCTATTCTATACCGGAAACTAGGGCAAGAGGCATTGGTGCTCCGGATTTTAGCCTTGAAACTAGAAGACAGTGAAGCTGCTGAGCAGTACTGTGCTGAAATTGGCAGATCGGATGCCTATGTCCAGTTACTCGATATGTATTTGGATCCTCAAAATGGTAAGGAGCCTATGTTTAAAGCTGCTGTTCGCCTTCTCCACAACCATGGAGAATCATTGGATCCATTCCGAGTCTTAGAGACTTTGTCCCCAAATATGCCGCTTCATATTGCGTCAGAAACAATATTGAAACTGTTGAGAGCACGATTTCATCATAAATGTCAAGGACAG MAKPERAVLEPLGEEFDISTHFRTSIRSLAVSPVSDSETLIYAGTKSGALVLFSVTPKYSSSTALVSETASLDTPRITSSSEGLSLLRTVAVSVSSIVCLHVLRGIGKVLVLCSDGFLYIVDSLLSLPVKRLAGLKGVSLIAKRIRSSESEFSSLYGSVDNNSGFVSPSQRLLQRLGSGMRTNGLKIKESESPREESDFVFAALVGKRLILFEVVLGHRTGRSDRNTNDPTESLLILKELQCKEGFSTMVWLNDSIIVGTASGYYLFSCVTGESSLIFKLPELSSPPCLKLLRKECKVLLLVDRVGITVNAYGQPMGGSLVFHDIPKSVAEISTYVVVGSSGQLKLYHRNTGSCIQTITFNGNRTEPCIVSDEEDGSGDVIAVSVTNKVMCYQKLPCDEQIKDLLRRKNFKEAISLAEDLECAGEMSKEMLYFVHAQIGFLLLFDLQFEEAVNHFLQSETMQPSEIFPFVMKDPNRWSLLIPRNRYWAMHPPPAPFEDVIDDGLLAIQRATFLKKVGVETAVNDDFLLNPPSRSDLLESAVKHIIRYLEASRHKELISAVREGIDTLLLCLYRTLNSVDKMEKLASSENSCVVEELETLLEDSGHLRTLAFLYASKGMSPKALAIWRILGRNYPSRLLMDSSMDESTMDSNVRDISGKEAAAAEASKILEESSDQALVLQHLGWIADINQHFAIQILTSEKRQSQLSPDEIIRAIDSKKVEMLQRYIQWLIEEQESCDPHFHSLYALSLAKSAVELDSTQSLDSSSDPKISDQRLNSIFEQPIRERLQIFLQSSDLYDPEEVLHLIEGSELWLEKAILYRKLGQEALVLRILALKLEDSEAAEQYCAEIGRSDAYVQLLDMYLDPQNGKEPMFKAAVRLLHNHGESLDPFRVLETLSPNMPLHIASETILKLLRARFHHKCQGQ Homology
BLAST of Chy12G210670 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4I312 (Vacuolar sorting protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VPS3 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 954.1 bits (2465), Expect = 1.1e-276 Identity = 511/929 (55.01%), Postives = 680/929 (73.20%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210670 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A4IG72 (Transforming growth factor-beta receptor-associated protein 1 homolog OS=Danio rerio OX=7955 GN=tgfbrap1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 164.1 bits (414), Expect = 7.6e-39 Identity = 179/709 (25.25%), Postives = 299/709 (42.17%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210670 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L5Y0 (Vacuolar sorting protein 39 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VPS39 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 82.0 bits (201), Expect = 3.8e-14 Identity = 140/695 (20.14%), Postives = 288/695 (41.44%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210670 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C9C4 (transforming growth factor-beta receptor-associated protein 1 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498291 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1725.3 bits (4467), Expect = 0.0e+00 Identity = 889/924 (96.21%), Postives = 904/924 (97.84%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210670 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EKN6 (transforming growth factor-beta receptor-associated protein 1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434183 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1585.9 bits (4105), Expect = 0.0e+00 Identity = 819/925 (88.54%), Postives = 867/925 (93.73%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210670 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KP09 (transforming growth factor-beta receptor-associated protein 1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111495214 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1569.7 bits (4063), Expect = 0.0e+00 Identity = 810/925 (87.57%), Postives = 863/925 (93.30%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210670 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E2A7 (uncharacterized protein LOC103498291 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498291 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1548.1 bits (4007), Expect = 0.0e+00 Identity = 802/834 (96.16%), Postives = 815/834 (97.72%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210670 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CM87 (transforming growth factor-beta receptor-associated protein 1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012580 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1538.5 bits (3982), Expect = 0.0e+00 Identity = 797/929 (85.79%), Postives = 846/929 (91.07%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210670 vs. NCBI nr
Match: XP_011660326.1 (vacuolar sorting protein 3 [Cucumis sativus] >KAE8653678.1 hypothetical protein Csa_007372 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1759 bits (4556), Expect = 0.0 Identity = 913/924 (98.81%), Postives = 916/924 (99.13%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210670 vs. NCBI nr
Match: XP_008459073.1 (PREDICTED: transforming growth factor-beta receptor-associated protein 1 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1717 bits (4448), Expect = 0.0 Identity = 889/924 (96.21%), Postives = 904/924 (97.84%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210670 vs. NCBI nr
Match: XP_038894017.1 (vacuolar sorting protein 3 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1624 bits (4205), Expect = 0.0 Identity = 844/924 (91.34%), Postives = 878/924 (95.02%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210670 vs. NCBI nr
Match: XP_022927318.1 (transforming growth factor-beta receptor-associated protein 1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1578 bits (4086), Expect = 0.0 Identity = 819/925 (88.54%), Postives = 867/925 (93.73%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210670 vs. NCBI nr
Match: KAG6583814.1 (Vacuolar sorting protein 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1573 bits (4072), Expect = 0.0 Identity = 816/925 (88.22%), Postives = 867/925 (93.73%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210670 vs. TAIR 10
Match: AT1G22860.1 (Vacuolar sorting protein 39 ) HSP 1 Score: 906.4 bits (2341), Expect = 1.9e-263 Identity = 494/929 (53.18%), Postives = 661/929 (71.15%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210670 vs. TAIR 10
Match: AT4G36630.1 (Vacuolar sorting protein 39 ) HSP 1 Score: 82.0 bits (201), Expect = 2.7e-15 Identity = 140/695 (20.14%), Postives = 288/695 (41.44%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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