Chy12G207150 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ACCCAACATATCCAAAGAAGGAGACTTGGGTGTCTTTCTTTTCAACATTGAGTTCTGTAAATGTCATATGGAAGGCTCAATGGATGCCTTTGAAGGCAGTAATTTACAGATGTGGAGATTTTCATAGTGTGCCTTTGTTGGGACCATGGGGAGGTGTTAATTATACACCATTGTTAGTTTTGCGTCAGGTGGGGCTCAAACAGTTTATACCACACCAACTCATAATCTACAAGAGTCTGACTTTTCATATGATCTTGAAGACTGTCAAGGAAAAAAACATCGAGCAGTATGTGCATGGAAGTCTGTGAAGAAGATAAAAGACAAAGAACACTATGAAGGGTTACCAGTGGATATGAGGCATGGCAGACAAACAGAAGGAAGAATGTAATATATACCTTAAGGGAGGTAGTTGAAAAGGTAGAAGAGACGAGCTCTGAACAACCAGACCAGTGGGTTGAGTAGACCATTAAATTAGAAGAGAAAAATCGACTCTTAGAGCAAGAGAATGAGAAACTTCAAAAGGAGACGAGCCAATGGATGGATCATGTGACTTTTTTGCAGAAAGAGCTTGAAAAGACCAAGAGTTTCTTAAAAAGTCAAGATAAGTTAGAAAAGAATCTTGAGGTGTTAGATAAAGAGATGAGGCTAATGAATAAAGCGAATAGAAGCTTAAAAAATGAAAAGACAATATTACAGCCAACAGTAGAATCGCAAGATGAATGTATTAAAGATTTAGAAAGCAGGAAGGAATATTCTCTCAAGCTTGTAAATGATTTGAATACATCAATTGGTAAACAGGAAGCACAAATAGTAGATTTGGAAGTACACAATCAGTCTCTACGCCAAACTGTTGATAGCCTACATGTGAAGATGGTCTAGCACTCTGAAGAGTATAAGATACTGAAAATTTTTGCTGATTCCTTACACCATCAATTTACTGCATTTCAAAATTCAAGTGAGAGGATAGTGCAAGAATACGAATTATTGAAGACAGATTAAACGTAAATGAAGGTTGATTATGATTTGCAAAGGAGAGATTTTCAAGCGTTAGTTGAACGTGTAGATCAAACAATTGGATTTCTCAGAATAGTGTCTAAAAGAGCAAATGGTTTTGTAGAATGAGCAGCTTATTTAAGGATTAATTTTTTCTCAATACAACCTCATGCAGATGATCTGAATAGATTTTTAAAGATGATATGCAGAGAACTTGGGCATTTTGGTCATTTTCATTAAGCTGTTTATTTTGATATAATGAACAATGAGAGTTGTTGTTATTGCATTTCGTTTATTATTATTATTATTATTATTATTTATTTTAGTTTGATTTTTATTCTGTTAAGTTTATATTTCGTGTGGATTTATTGTATTTGAATTTATTATTTAATAAATTTTTCTCTCTCTCTTTTTTCCTTTACTCTTTGGTCTTCAAAGTTTTCCAAATAATCAAAGGAAAACATAGCTCGTCCTACTCCAATTCGCCATCCTTACAATACGCAGCATAAAATTCGAATCATGGAAGAACAGGATAAAGACATGGATAAAATGAGACAAGATATTAATAATCTTGGGGAACAAGTTTCAAAAATACTGGAATTGCTTTCAGCAGGAAAAGGGAAAGTTGTCATAGAAACAGCACAATCAAGCAATCCAGTTCAAGACACTGATGATCCCATTTATCCCCCAAAATTTACGCCACGCCACATGAATGTTCCACAGTCTCAAACCACTCAACATATGTTGCTATGAATCTGCTTTTTGTTGTTCCACCTCCTGTCCAAGATATAGAACAATTGGAAGCTCAAGCTAAAATTCAAGACATGGGACAAAATGAAAACACTCATGCTAAGCAAAAACTAGATGTTTTGGAAGAAAGGTTACGAGCAATTGAAGGGACTGACGTTTATGGAAATATAGATGCAACACAGTTGTGCTTAGTGTCAGGCTTGATCATTCCAGCAAAGTTTAAAGTTCTCAAATTTGACAAATATGATGGATCATCGTGTCCAAGGAGTCATCTTATAATGTATTGTAGAAAGATGGCAGCGCATATTGGTAATGATAAATTGTTGATCCATTGCTTTCAGTACAGTTTGACTGGTCCAGCTACTCAATGGTATATTCAATTAGATAATGCACACATTCATATTTGGAAGGATTTGGCTGATGCATTTCTAAAGTAATACAAACATAATATTGATATGGCTTCAGATCGTTTAGAGCTGCAACGGATGGAAAAGAAGAGTTCAGAAAGCTTTAAAGAATATGCTCAACAATGGAGAGATATGGCTGCAGAGGTTCAACCACCATTAAAAGACAAAGAAATGATATCTATGTTTATAAATACTTTGCGGGTGTCGTTCTATCATCAAATGATTGGTAATGCTACAACCAATTTTTTTGACATTATTGTTATTGGTGAAAGAATTGAATATGGGATAAAGCACGAGAGGTTAACAGAGATTTCAGCTGAGTATGATAGATTAAAGAAAGGAACAACATCTAAGAAGAAAGAAGTTGAGGTTCATGCAATTGGTTTTCCTAATTCAGGAAACCACAAATCGACTTTTGGCCAAAGAAAACATGACCAAAATTTTCCTTCATATATAAGCAATGTTACTCATATTCCTTATAACAACTATGTACCAGCTCACTCTCTCTCTGGAGCCCCAAAACCTGTTAATTCAAACTTTTTTCGACCGTTTGTATAAGGTCAGAGTAGTAAGACCAACTCAGATACATAACGGTTTAATCCAATTCCCATGACATATACAAAGCTTTTACCTCAGCTAATTCAGAATTGACAGTTAGCTCCTATCCCAATAAATCCTATACAATCTCTTTATCCAAAATGATATGGTTCAAATGCTCGATGTGATTATCATGCCGGAGGAGGGGGACACTCAACTGAAAATTGTTTAGCTATGAAAAGGAAGGTGCAATTTTTAATTAATGTTCGATGATTAAGCTTCAAAAAAGCTAGTGAGCCCCCTGATGTCAATAACAATCCATTTCCTAATCATGAAAATTCAAAAGTGAACGATGTAGATTGCTTTGTTGAAAAGTGTAAAAATGAAGTTCATGAGATAGTGATGCCTATGTAAACACTTTTTGAAGCAGGATATGTTAGTTTGGAATATTTGGATCCCAACATAAGATGCGAAGGATATGATGAAAGCAAACATTGTATATTCCATCAAGGAGTTGCAAGCCACGTTATCCAACAGTGTTGTAAATTTAGATCTAAAGTACAACAATTTATGGATTCAAAGATACTCATGGTATACGGAGGACAAGGAAAAGATGAGATGAAAGACAATAAAATATGTGCATTAATGGATGAAGTTGCAAAAAAGGAAATTCCTTTTTACCAAGCCCTTTGATAGTCTTTTATCAAGAAAGTTGTAATAAGTTAACTTCCTGTAATCCTAAACAACTCACTATCCAAGTACCGAGTCCCTTCAAATTCAAGGATATGAAAACAGTGCCATGGCGGTATGACTGCCAAGTCATTACAGTCCTTCAGTTGATAATATTACAGGAATTAGCAGGATAACTCGAAGTAGAAGATGTTATAAACCAGATAATTTAACAGCTCCTTCACTTAGTTTGACATTGAGGCAAGGGAGGAAAAATGAGAAAAGAAATGTGAATAAACATGACAGAGAGCAGGATGTAGAGATGCCTATCACAGCAAAAGATATAGAATGCAAAAAACCTGTTACGGATGAGGAAGCAAACGAATTCTTGAAAATAATAAAACAAAGTGAGTATAAGATCATAGAGAAAACGCATCATACTCCAGCTCGAATTTCTTTATTATTTTTGTTTTTGAATTCAGAGCCTTATCGAAAAGTGCTATTAGATATTTTGAACAAGACACATGTTGGACATGACATTTCAGTGGAAAAGTTCAACGAAATTATTGGAAACATTACGTCTTCAAATTCCATAGTCTTCATGGATGATGAAATTCCTTTTGAAGGTTTAGGTCATATAAAAGCACTGCATATTCAAGTGAAGTGCAAGGATTATGTCATAGCGAGAGTTTTAGTGGATAACGGTTCAACTCTTAATATAATGCCTAAATCTACACTATTGAAGCTTCAAGTGGACATGTCATACATAAAATCAAGCACAATGGTTGTAAGAGCTTTCGATGGATCACGAAGAGAAGTAATTGGTGACATTGAATTACCAATCAAAATTGGCCCATGTACTTTCAATATAGTCTTTCAAGTCAAGGAAATAACACCTACTTACAGTTTTTTGTTAGGACGTCCTTGGATTTACTCTGCAGGAGTGATGCCATCTACGTTGCATCAAAAATTGAAATTTATTGTTGAGAATACGATGATTTGTTTGATGGGAGAGGAAGATTTCCTGATAACAAAACTGATATCAACCCCATATGTTGAGGCAGCAGAGGAATCATTAGAATGTTCTTTTCGTTCTTTTGAAATTGCTCATGCAACTATGTTGGAAGCAGCTACAGATGAAATAATAAAGTCACACATGCCTAAAATGGAAGTTATGATCACTAGGGTGATGAGAGGTGGAGGATTTTCTTTGAATCAAACCTTATAAACACTTCTAAACACACCAAGCAATGACCGGAGATTTGGTTTGGGCTATATGCCATTTGTATATGATAAGATTAGGCTTCAAGAAGAAAAGAAGAAAAAGCGTTTGGCAAAGCAAGAGATGAGGGAGTTTGATCCAAGTCTAAAATTTATACCAACATTATATGATACTTTCAAGAGTGTTGGTATAAGTTACTCATCACATTACTCTGATTCAAAGGATTGTTTGTTAACAAAGATGAAGAGTTTATTAATTGCAGCAGTGACACTAGAAGCATCATTTGAAGGCGAAACATTTTATGCATGTCCACCTGATTTCAAGCTTAACAATTGGGATGTTGTAGATCTACCTACATTTTCAGAAGATTTTTAAGGGTAATGATTAAACTTTTATTTGTCAAATTTCTTTAATTT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Match: A0A5D3DJ95 (Girdin-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold4336G00010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 421.8 bits (1083), Expect = 3.4e-114 Identity = 221/287 (77.00%), Postives = 245/287 (85.37%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G207150 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3D533 (Girdin-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold390G00200 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 415.2 bits (1066), Expect = 3.2e-112 Identity = 221/297 (74.41%), Postives = 247/297 (83.16%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G207150 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T6E2 (Girdin-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold86G00290 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 409.1 bits (1050), Expect = 2.3e-110 Identity = 212/274 (77.37%), Postives = 238/274 (86.86%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G207150 vs. NCBI nr
Match: XP_031738551.1 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC101203611 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 486 bits (1251), Expect = 1.83e-151 Identity = 256/294 (87.07%), Postives = 272/294 (92.52%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G207150 vs. NCBI nr
Match: XP_016900531.1 (PREDICTED: girdin-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 424 bits (1090), Expect = 1.33e-143 Identity = 224/297 (75.42%), Postives = 251/297 (84.51%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G207150 vs. NCBI nr
Match: TYK23955.1 (girdin-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 424 bits (1090), Expect = 1.64e-142 Identity = 224/297 (75.42%), Postives = 251/297 (84.51%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G207150 vs. NCBI nr
Match: TYK23632.1 (girdin-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 417 bits (1073), Expect = 6.94e-142 Identity = 221/287 (77.00%), Postives = 245/287 (85.37%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G207150 vs. NCBI nr
Match: TYK18656.1 (girdin-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 411 bits (1056), Expect = 1.39e-138 Identity = 221/297 (74.41%), Postives = 247/297 (83.16%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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