Chy11G203860 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATGTCATCAATGCAGAGAAGCTTTTTGCCATAAAATATTGTTACAAGAAAAGCCAACTCTTCCTCTGCAATCTCAATCTTTTTCACTCTCTCATCATCTTCTTCTTTACCTATTGGCTTTCTTCTCAATCTCATTACTTTCCTCCCGACACGATTTCCTCGATAATCAAAATGGTTGTTACCCCGCCCTCGTTCTTCAGCCCGAGTTGCTTGTTTGTTATCGTTAATTTCATTGTTGTCTACATCGTTGGAGAACAAAAGCTCACCGGTGCAAAATCGGCTTCCATGAACACAATGTATGATGAATACTATATTGAGAGGACTTTGGAGATGAAGTACTTGAATCCTTGTGAAAATATGAAACAATTGGTTGTTGAGAAAGTTGCGGAAGAAAAGGAAGAGGAAGGGATCAGCCCCATCGAGGATGACAACAGTGTCCATTTTAGTGAAAAAGAAAACGAAGGCGACTACAACTTGGCCAACCAAGAGTTGAACATAAGAGCTGAAGCCTTCATTGCAAGAGTTAACAAGCAAAGGAAGCTTGAAGCTGTCGATTGTTTCTCATGGTAGCATAGTTTTTTTGTCTTCCTTTTTATTTTATTTAATGTAATAATTAATCGTTTGATCTCACAATATTTGAGATAAAAAAAATGTAATGGTCAATTTTTGCGACCTTTACTTTGGTTAATGTTGAAGCTTTATGCAAGATAGTGAATTTTGGAATGAGCTATTATATATGTATATATCATGATAAATTTATTTAAGTTTATTTGATGAAATCATATCGATATAGTGTTTCCTACTTTGTCAACATTACTCGTATATATAAAAAGAATGATATTTCGTTGATTCTTATCGGATAGAAATACAAGAATTGTACTTGACATAAACATAACTAATAACTAATTAACATGAGCACAATATTCAACTAACACAAAACTTGTCCAATCAATCTTGAGATTAGAAATTTAAAATTTTCTCACCTCGCATATCAATTCTCTCATCTCACATAATTAGCGGTTAATTGATATAATTGTACTCCATTCTTTCGTGGGAGAAACATTCAAATTCCTTGCAATATTATTTATTTAATTTACTAAAAAAACCTCAATCTACCATATGTACCAAATGGCCTTCACATGATGTTTGAGAAATAAATATTTCTTTTGCTTTTTTTTGTGGAGCACTTCTACATGAGATAGCAATTTTAAGAGGACCCATTGAAGGGTTTGAAATTCCTTTCTTAACATAGAAGGACACATGCATATGCAAAATTTTGCATTATAAACTTTACTTTATAAATCCAAAGGGAAAGTTGTTTTCTTAAACCAATTTCCAAAGGCTTCAAAATAAGGTTTATTTTAGAACCAAATTAAAATAATTCTCTATTTAATTCATCTATATAATTAATCTTTCCAGAATCAAAACTTACTAAACCTATACCAACTTGCAAATCCAATACACATTACTTATATATATAACACATGTGAGTTTGGATAATAATATCTATGTTATCAAGACCTATAAGTTAAGTAAATAGCAAAATATTAAAACTTGATTTTGTAATGTTTTACATAAAATGAAAAAAAAAGGTTAATGTAAAATTGAAGACAATATTCCATATATGCACATGCTATGGGAAATAAATACATAAAGTGAGGGCACTAGGCCAAGTATGATCCACCTCATCAAAGCCATTGTTTTTCATTAATAGATATGGAAATCTTTTCGGACGGGATGGGACGGGGCGAGACTCTAACTCGACTCGATCGATATATGAACGAGATTGATTATTTCGATTTAGTTAAGAAATGTGTAATTTTGGAAGCCGGCAAAAAACTTATTGTAAAAATAGTTAGTAGCAATTGTATGGGTTAAGTTTTAATGTGAATGGTGATAAAAGAGAGTAGTTTTTTAATATTGGAGTAGAAATCTTCTAATTAATTAAGTCATGTAATTAATTAAGCTAAATATATTTAGATAAATCAAATCTAAAGAAAGAAGAGTCCAAGGCCTTCTAGACATTTGATTTGACCGAGTTGATTTATAAGATATTATTCCAATTAATTATCAATTATTTTCCCATACTATTTAATTTGTAGACAATAATTATAATTTAAATAATTTATCTTCTACCATAGAAATAGGTTATAAAACTTATTATATTTCTAAAAAGAAAATTAATTTATTGTCAATTTTTTTTAGCAAAGTAGTGAGTGTAATCTGTAAAACTAAAAATTCGTTATTTGTACGACATTCTTCCATGGTAACTGATCGAACCAAAATTTTGAAGAAAAAAAAATAATTTGTTGAGTTTAACTTGATCTTTATGTTTAATGTGAATTTAGTACGATTGCTAATAATTGATTATGCACTACTACGAAAGGGAGATTAGGTATTGTGGGCTTTTGGTGGTTTAGTACAAAATCAATGAGAATTGGGCCACTATTTAATGGGCCACTTTTGGGCTCATATGAACTTATTCTTGCGTTTTGTTGTTATTTTTGCCTTCCAATTTAATTTTGGAACATACATAGTGTCTTAGATACATGATCTTATGATCTTCTATTCTAAAGGTAAAAATGTAAGTCCATCTCTAAGGAATTTTTTTAAAAAAAAGTGAGACAATTTGTAATTAAACAAAATCTCTTGTGGAACCTAGATCTTATTTTCGAGAATCATACAAATAGTGTATAGGGTTATAAAATAAAAAAGAAATTTAGAAATAAAATAACAGTAAAATTTTACTTCTAACATAAATTGATTTTTTTTTTTTTGTAGCATTGAATTCAAAAAAAATTAATTGACATATTTTTACAATATTCTTTTTAATTTGAATTACTAATATACTCAAAAGCTTAAATGAGAAGATTTTAAAAATAATAATTATATCATCCAACACATAAAAGACTTTCATGATTTTTCTATTAGATCTCAAGTAGTCATTTTTCTTTAACTTTTAATAATTGGGGTCACAATTCTAATACTTGGAACTCCAAACCATTATTAATTTTGACAAAAAATTTATTTAAAGAATGAAGAATATTCTGAATTAGTATTTTAGTTTTATAAATATATTAAGAAATGAGTTGTCTCATATGGTTGTTGTCATCTTTATCTATTTTAATATTTAATCCCAATTATGAATTCTTCTTATAGAGATAAATTGTCAAAATCGCTTTCCCTTTCCCTTTTGTGAAAAAGATTGCTTCCTCCTCCTTATCTCTAACTAATTAAAATAAAATAAATATATATATATATCAAACTAGATATCAAATTTCTTTTATAAATTAAAAATCTAGATTTTAATCCCTATTTAACTTTGAAGTACAATATATTGGATATGATTTTTAAAATTGGAAGGTTGAAATCGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTAAAACTTTCTTTTTGAAAGCTTAGATAAGTTTTGAAGGCGAATCCATCATAAATTAAATAAATTTAAAGAGGATCAATTTCTAAAACATTTCTTAACATGGTTTATTTCAACTAAAATTCAACTTACATTTTCTTAGTATGAACAACAACATTCAAATCAATCAAGGGTAATCTTGAAATTTCCTTTATTGGAGTAGGGTTTGTTCAAGAATTTTCAATATCTCATATCCATAATCTTTGCACTAATATATTCTATATATTATCTATAACTAGTGGGTCCATTTATATCAAATTAAGATATATAAACTAATGTTATTTTCGTATATTACAACTTCAATTAATATAAAATATACATTATCAATTTAAATCAAGAGATTAGAGCCCTTACATATTGTTTTGAACTAAGAAAAAAAAAATTAGGTTTTTTTTCTTAGTTTGTTCCTATATGCATACGTCCACCTATATTTAGGGAGAACTCACATATGCCTCACATTTATTTTAACTAAGCTTTAACTTTTTAATATCCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATCTTGGGTCATGGTTGAGCAACTTTGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTCGTTTTAAGAGACTTAAATATGATGGAGAATAAGAAATTAGAAATCACATTAAATTATAATTTGTTTACATGGATATATTTAATCTAAAATGATGCATGTGGGGGACAACTTCTTCTCTTCTTTCCTTCTTTACTTCTCTTTGTATTTGTTAAGTCCTAGGTTCAATTCCAAAGCAAAGAAAACCAAAAGCTAATTTAAAAAATGTTGTTATGATTAAAAATGTTGTTATGATTTTTTTTTCTTTTTTTCTTTTTGTTAAATGGGACTTTAAAAGTGATTGTTTAATTTAATTATGTGTGTTTTTTTAATGTGTGTGAAAAATATGTTTCATTTAATAATTATTTTGTATTTTCTACTCCATAGAGAAGTACACACACTTTATTTTATTTGTAAACTTTTCAACTATTTTGTTGTTATGTGAGATTTTAAACATTGTGTCAATATATGAACAAGTATTTATTTAAGAGTAGAAGTTGTACTAAAAATGAGTAGAAAAAGTAATGTCAATTAACTTTTAGTGTCCAAACAAAATACAAAAAAATATCTTTAAAAACTTACTTAAACTAAGTTTTTAAATCAAAATATTATTTAAGGGTTGTTTTAAATTATAACAAAATAAACTAAATGTATACCAAAAATAGTAAAATATCACAATTGGTCTACGATAATACATTAAGGTAGATTACTATCTTGTGTTTATTTATGTCATGATACAGATGATAGTCTATATTAGTGTATTACAGATAAATTGTGATATTTTGTTATATTTATAAATATTTTCATAAGTGATGTCATTTAAAATAATTTCTACAAAATTTTATCTTAAATTTTTTTAGTAATAAATGTTAATTTTTTAGTAGTGATTTAACAATATCAATTGTTCGAAAATGTTATTAAAATGAATAAAATCACTTTTGTCCTTTTCAAAATACTTTAATCATTCAAAATATTTTCCTTTTGATAATACGAACAAAAATCTGTGGTAAAAAGTG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ATGGATGTCATCAATGCAGAGAAGCTTTTTGCCATAAAATATTGTTACAAGAAAAGCCAACTCTTCCTCTGCAATCTCAATCTTTTTCACTCTCTCATCATCTTCTTCTTTACCTATTGGCTTTCTTCTCAATCTCATTACTTTCCTCCCGACACGATTTCCTCGATAATCAAAATGGTTGTTACCCCGCCCTCGTTCTTCAGCCCGAGTTGCTTGTTTGTTATCGTTAATTTCATTGTTGTCTACATCGTTGGAGAACAAAAGCTCACCGGTGCAAAATCGGCTTCCATGAACACAATGTATGATGAATACTATATTGAGAGGACTTTGGAGATGAAGTACTTGAATCCTTGTGAAAATATGAAACAATTGGTTGTTGAGAAAGTTGCGGAAGAAAAGGAAGAGGAAGGGATCAGCCCCATCGAGGATGACAACAGTGTCCATTTTAGTGAAAAAGAAAACGAAGGCGACTACAACTTGGCCAACCAAGAGTTGAACATAAGAGCTGAAGCCTTCATTGCAAGAGTTAACAAGCAAAGGAAGCTTGAAGCTGTCGATTGTTTCTCATGGTATGTTTTACTCCATTCTTTCGAGTCGTTTATCTCTTCATCTTAA ATGGATGTCATCAATGCAGAGAAGCTTTTTGCCATAAAATATTGTTACAAGAAAAGCCAACTCTTCCTCTGCAATCTCAATCTTTTTCACTCTCTCATCATCTTCTTCTTTACCTATTGGCTTTCTTCTCAATCTCATTACTTTCCTCCCGACACGATTTCCTCGATAATCAAAATGGTTGTTACCCCGCCCTCGTTCTTCAGCCCGAGTTGCTTGTTTGTTATCGTTAATTTCATTGTTGTCTACATCGTTGGAGAACAAAAGCTCACCGGTGCAAAATCGGCTTCCATGAACACAATGTATGATGAATACTATATTGAGAGGACTTTGGAGATGAAGTACTTGAATCCTTGTGAAAATATGAAACAATTGGTTGTTGAGAAAGTTGCGGAAGAAAAGGAAGAGGAAGGGATCAGCCCCATCGAGGATGACAACAGTGTCCATTTTAGTGAAAAAGAAAACGAAGGCGACTACAACTTGGCCAACCAAGAGTTGAACATAAGAGCTGAAGCCTTCATTGCAAGAGTTAACAAGCAAAGGAAGCTTGAAGCTGTCGATTGTTTCTCATGGTATGTTTTACTCCATTCTTTCGAGTCGTTTATCTCTTCATCTTAA MDVINAEKLFAIKYCYKKSQLFLCNLNLFHSLIIFFFTYWLSSQSHYFPPDTISSIIKMVVTPPSFFSPSCLFVIVNFIVVYIVGEQKLTGAKSASMNTMYDEYYIERTLEMKYLNPCENMKQLVVEKVAEEKEEEGISPIEDDNSVHFSEKENEGDYNLANQELNIRAEAFIARVNKQRKLEAVDCFSWYVLLHSFESFISSS* Homology
BLAST of Chy11G203860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K9L0 (DUF4408 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G094140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 337.4 bits (864), Expect = 4.1e-89 Identity = 173/189 (91.53%), Postives = 177/189 (93.65%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G203860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DN17 (DUF4408 domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold266G002200 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 307.0 bits (785), Expect = 6.0e-80 Identity = 167/192 (86.98%), Postives = 173/192 (90.10%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G203860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5E4EWE0 (PREDICTED: L484_010133 OS=Prunus dulcis OX=3755 GN=ALMOND_2B009142 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 91.7 bits (226), Expect = 3.9e-15 Identity = 83/235 (35.32%), Postives = 113/235 (48.09%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G203860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: M5XMS0 (DUF4408 domain-containing protein OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_1G222200 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 91.3 bits (225), Expect = 5.1e-15 Identity = 78/229 (34.06%), Postives = 114/229 (49.78%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G203860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A314YTX2 (Zinc finger E-box-binding homeobox 1 OS=Prunus yedoensis var. nudiflora OX=2094558 GN=Pyn_32330 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 88.2 bits (217), Expect = 4.4e-14 Identity = 82/238 (34.45%), Postives = 116/238 (48.74%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G203860 vs. NCBI nr
Match: KAE8646757.1 (hypothetical protein Csa_004884 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 328 bits (842), Expect = 3.68e-112 Identity = 170/186 (91.40%), Postives = 174/186 (93.55%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G203860 vs. NCBI nr
Match: KAA0039829.1 (DUF4408 domain-containing protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK24670.1 DUF4408 domain-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 305 bits (782), Expect = 3.71e-103 Identity = 167/192 (86.98%), Postives = 173/192 (90.10%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G203860 vs. NCBI nr
Match: XP_038875115.1 (uncharacterized protein LOC120067646 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 259 bits (662), Expect = 7.35e-85 Identity = 147/192 (76.56%), Postives = 161/192 (83.85%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G203860 vs. NCBI nr
Match: XP_034200059.1 (cilia- and flagella-associated protein 251-like [Prunus dulcis] >VVA19973.1 PREDICTED: L484_010133 [Prunus dulcis]) HSP 1 Score: 90.1 bits (222), Expect = 4.23e-18 Identity = 83/235 (35.32%), Postives = 113/235 (48.09%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G203860 vs. NCBI nr
Match: XP_007221609.1 (zinc finger E-box-binding homeobox 1 [Prunus persica] >ONI29918.1 hypothetical protein PRUPE_1G222200 [Prunus persica]) HSP 1 Score: 89.7 bits (221), Expect = 5.27e-18 Identity = 78/229 (34.06%), Postives = 114/229 (49.78%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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