Chy11G193160 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview


Name	Chy11G193160
Type	gene
Organism	Cucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Description	acetylornithine deacetylase-like
Location	chrH11: 9897155 .. 9915478 (+)
RNA-Seq Expression	Chy11G193160
Synteny	Chy11G193160

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

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mRNA sequence

ATGACCCACAAAGCAAACAGATCAGCTACACTCGAACGGCTACGGGCAAATGACTCCACATATTGGATTGATACAGCAGATTCACAACCTTGTATTGGTACCAGTGGCTCCTTAACCTGGACAATTAACACAACAGGAAAACTTTTCCATAGTGGTATGCCAGACAAGATAACTAATGGGGCTTCTCTTGATGCGCTTTATGGATCATGGCTGAGGAATGGTTCTCAAGAAGAAAGCCATGTCTTTGTTAGTTCTGATTTCAACATCTTTCCTTCGATTATTACATATGGTGGAGTTTCTCGAAAATCCAACTCTTTCGCCGCCTTCGATTCAGGTTTATGTGAATTGCAGAGCAGAAACAAGCAATGGCTTTCGAAAATCAAAGTTAGTTTGGATGAGGCTGAAGTTTTGATGCACGAAAACTTGTTCCAAAGGAAGCTTATAATAGTCAAAAGCAAGGGCACTCCTGCTGTAGATATTGCTCATGCACTTGAATACTATCCAGATACCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGACCCACAAAGCAAACAGATCAGCTACACTCGAACGGCTACGGGCAAATGACTCCACATATTGGATTGATACAGCAGATTCACAACCTTGTATTGGTACCAGTGGCTCCTTAACCTGGACAATTAACACAACAGGAAAACTTTTCCATAGTGGTATGCCAGACAAGATAACTAATGGGGCTTCTCTTGATGCGCTTTATGGATCATGGCTGAGGAATGGTTCTCAAGAAGAAAGCCATGTCTTTGTTAGTTCTGATTTCAACATCTTTCCTTCGATTATTACATATGGTGGAGTTTCTCGAAAATCCAACTCTTTCGCCGCCTTCGATTCAGGTTTATGTGAATTGCAGAGCAGAAACAAGCAATGGCTTTCGAAAATCAAAGTTAGTTTGGATGAGGCTGAAGTTTTGATGCACGAAAACTTGTTCCAAAGGAAGCTTATAATAGTCAAAAGCAAGGGCACTCCTGCTGTAGATATTGCTCATGCACTTGAATACTATCCAGATACCTAA

Protein sequence

MTHKANRSATLERLRANDSTYWIDTADSQPCIGTSGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKITNGASLDALYGSWLRNGSQEESHVFVSSDFNIFPSIITYGGVSRKSNSFAAFDSGLCELQSRNKQWLSKIKVSLDEAEVLMHENLFQRKLIIVKSKGTPAVDIAHALEYYPDT*

Homology

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BLAST of Chy11G193160 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C5C4 (Acetylornithine deacetylase OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g17830 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 62.4 bits (150), Expect = 5.8e-09
Identity = 27/53 (50.94%), Postives = 35/53 (66.04%), Query Frame = 0


Query: 11  LERLRANDSTYWIDTADSQPCIGTSGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKITNGASL 64
           L++L++    YWIDTAD QPC+GT G + W +  TGKLFHSG+  K  N   L
Sbjct: 186 LDKLKSG-PLYWIDTADKQPCVGTGGMIPWKLQFTGKLFHSGLAHKAINAMEL 237

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BLAST of Chy11G193160 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P54638 (Acetylornithine deacetylase OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=argE PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 55.5 bits (132), Expect = 7.1e-07
Identity = 23/47 (48.94%), Postives = 28/47 (59.57%), Query Frame = 0


Query: 17  NDSTYWIDTADSQPCIGTSGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKITNGASL 64
           N   YW+D+ADSQP IGT G+ TW +   GK  HS MP +  N   L
Sbjct: 193 NGPVYWVDSADSQPTIGTGGAQTWNLTAHGKNMHSAMPYRTVNSVEL 239

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BLAST of Chy11G193160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T6W0 (Acetylornithine deacetylase-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold92G001180 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 84.3 bits (207), Expect = 5.2e-13
Identity = 39/48 (81.25%), Postives = 40/48 (83.33%), Query Frame = 0


Query: 21  YWIDTADSQPCIGTSGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKITNGASL--DAL 67
           YW+DTADSQPCIGT GSLTWTINTTGKLFHSGMPDK  N   L  DAL
Sbjct: 190 YWVDTADSQPCIGTGGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKAINALELAMDAL 237

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BLAST of Chy11G193160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3E4V3 (Acetylornithine deacetylase-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold455G004330 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 84.3 bits (207), Expect = 5.2e-13
Identity = 39/48 (81.25%), Postives = 40/48 (83.33%), Query Frame = 0


Query: 21  YWIDTADSQPCIGTSGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKITNGASL--DAL 67
           YW+DTADSQPCIGT GSLTWTINTTGKLFHSGMPDK  N   L  DAL
Sbjct: 190 YWVDTADSQPCIGTGGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKAINALELAMDAL 237

[Close]

BLAST of Chy11G193160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CQ32 (acetylornithine deacetylase-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503530 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 84.3 bits (207), Expect = 5.2e-13
Identity = 39/48 (81.25%), Postives = 40/48 (83.33%), Query Frame = 0


Query: 21  YWIDTADSQPCIGTSGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKITNGASL--DAL 67
           YW+DTADSQPCIGT GSLTWTINTTGKLFHSGMPDK  N   L  DAL
Sbjct: 190 YWVDTADSQPCIGTGGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKAINALELAMDAL 237

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BLAST of Chy11G193160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LK66 (M20_dimer domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G902920 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 82.0 bits (201), Expect = 2.6e-12
Identity = 38/48 (79.17%), Postives = 39/48 (81.25%), Query Frame = 0


Query: 21  YWIDTADSQPCIGTSGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKITNGASL--DAL 67
           YW+DTADSQPCIGT GSLTWTINT GKLFHSGMPDK  N   L  DAL
Sbjct: 189 YWVDTADSQPCIGTGGSLTWTINTKGKLFHSGMPDKAINALELAMDAL 236

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BLAST of Chy11G193160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3E5D0 (Acetylornithine deacetylase-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold455G004340 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 76.6 bits (187), Expect = 1.1e-10
Identity = 39/66 (59.09%), Postives = 44/66 (66.67%), Query Frame = 0


Query: 11  LERLRAN--------DSTYWIDTADSQPCIGTSGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKITNGAS 67
           +ERL AN           YW+DTADSQPCIGT GS+ WTINTTGKLFHSG+P+   N   
Sbjct: 180 VERLYANGYFDNLKGGPLYWVDTADSQPCIGTGGSIPWTINTTGKLFHSGLPNNAINALE 239

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BLAST of Chy11G193160 vs. NCBI nr
Match: TYK31153.1 (acetylornithine deacetylase-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 82.8 bits (203), Expect = 2.35e-15
Identity = 39/48 (81.25%), Postives = 40/48 (83.33%), Query Frame = 0


Query: 21  YWIDTADSQPCIGTSGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKITNGASL--DAL 66
           YW+DTADSQPCIGT GSLTWTINTTGKLFHSGMPDK  N   L  DAL
Sbjct: 190 YWVDTADSQPCIGTGGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKAINALELAMDAL 237

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BLAST of Chy11G193160 vs. NCBI nr
Match: KAA0038588.1 (acetylornithine deacetylase-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 82.8 bits (203), Expect = 4.99e-15
Identity = 39/48 (81.25%), Postives = 40/48 (83.33%), Query Frame = 0


Query: 21  YWIDTADSQPCIGTSGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKITNGASL--DAL 66
           YW+DTADSQPCIGT GSLTWTINTTGKLFHSGMPDK  N   L  DAL
Sbjct: 190 YWVDTADSQPCIGTGGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKAINALELAMDAL 237

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BLAST of Chy11G193160 vs. NCBI nr
Match: XP_008465960.1 (PREDICTED: acetylornithine deacetylase-like [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 82.8 bits (203), Expect = 6.26e-15
Identity = 39/48 (81.25%), Postives = 40/48 (83.33%), Query Frame = 0


Query: 21  YWIDTADSQPCIGTSGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKITNGASL--DAL 66
           YW+DTADSQPCIGT GSLTWTINTTGKLFHSGMPDK  N   L  DAL
Sbjct: 190 YWVDTADSQPCIGTGGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKAINALELAMDAL 237

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BLAST of Chy11G193160 vs. NCBI nr
Match: XP_004148485.1 (acetylornithine deacetylase [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 80.5 bits (197), Expect = 4.08e-14
Identity = 38/48 (79.17%), Postives = 39/48 (81.25%), Query Frame = 0


Query: 21  YWIDTADSQPCIGTSGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKITNGASL--DAL 66
           YW+DTADSQPCIGT GSLTWTINT GKLFHSGMPDK  N   L  DAL
Sbjct: 189 YWVDTADSQPCIGTGGSLTWTINTKGKLFHSGMPDKAINALELAMDAL 236

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BLAST of Chy11G193160 vs. NCBI nr
Match: XP_038888364.1 (acetylornithine deacetylase-like [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 77.4 bits (189), Expect = 5.01e-13
Identity = 38/54 (70.37%), Postives = 41/54 (75.93%), Query Frame = 0


Query: 21  YWIDTADSQPCIGTSGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKITNGASL--DALYGSWLR 72
           YWIDT+DSQPCIGT GSLTW++ TTGKLFHSGMPDK  N   L  DAL    LR
Sbjct: 193 YWIDTSDSQPCIGTGGSLTWSMKTTGKLFHSGMPDKAINALELAMDALKPIQLR 246

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BLAST of Chy11G193160 vs. TAIR 10
Match: AT4G17830.1 (Peptidase M20/M25/M40 family protein )

HSP 1 Score: 62.4 bits (150), Expect = 4.1e-10
Identity = 27/53 (50.94%), Postives = 35/53 (66.04%), Query Frame = 0


Query: 11  LERLRANDSTYWIDTADSQPCIGTSGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKITNGASL 64
           L++L++    YWIDTAD QPC+GT G + W +  TGKLFHSG+  K  N   L
Sbjct: 186 LDKLKSG-PLYWIDTADKQPCVGTGGMIPWKLQFTGKLFHSGLAHKAINAMEL 237

[Close]

BLAST of Chy11G193160 vs. TAIR 10
Match: AT4G17830.2 (Peptidase M20/M25/M40 family protein )

HSP 1 Score: 62.4 bits (150), Expect = 4.1e-10
Identity = 25/43 (58.14%), Postives = 29/43 (67.44%), Query Frame = 0


Query: 21  YWIDTADSQPCIGTSGSLTWTINTTGKLFHSGMPDKITNGASL 64
           YWIDTAD QPC+GT G + W +  TGKLFHSG+  K  N   L
Sbjct: 200 YWIDTADKQPCVGTGGMIPWKLQFTGKLFHSGLAHKAINAMEL 242

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Chy11G193160 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
Q9C5C4	5.8e-09	50.94	Acetylornithine deacetylase OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g17830 PE=2 SV...	[more]
P54638	7.1e-07	48.94	Acetylornithine deacetylase OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=argE PE=1 SV...	[more]

BLAST of Chy11G193160 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A5A7T6W0	5.2e-13	81.25	Acetylornithine deacetylase-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27...	[more]
A0A5D3E4V3	5.2e-13	81.25	Acetylornithine deacetylase-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676...	[more]
A0A1S3CQ32	5.2e-13	81.25	acetylornithine deacetylase-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503530 PE=4 SV...	[more]
A0A0A0LK66	2.6e-12	79.17	M20_dimer domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G902920 P...	[more]
A0A5D3E5D0	1.1e-10	59.09	Acetylornithine deacetylase-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676...	[more]

BLAST of Chy11G193160 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
TYK31153.1	2.35e-15	81.25	acetylornithine deacetylase-like [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
KAA0038588.1	4.99e-15	81.25	acetylornithine deacetylase-like [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
XP_008465960.1	6.26e-15	81.25	PREDICTED: acetylornithine deacetylase-like [Cucumis melo]	[more]
XP_004148485.1	4.08e-14	79.17	acetylornithine deacetylase [Cucumis sativus]	[more]
XP_038888364.1	5.01e-13	70.37	acetylornithine deacetylase-like [Benincasa hispida]	[more]

BLAST of Chy11G193160 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT4G17830.1	4.1e-10	50.94	Peptidase M20/M25/M40 family protein	[more]
AT4G17830.2	4.1e-10	58.14	Peptidase M20/M25/M40 family protein	[more]

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Chy11G193160.1	Chy11G193160.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
molecular_function	GO:0016787	hydrolase activity