Chy10G180500 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy10G180500
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH10: 14438068 .. 14456656 (+)
RNA-Seq ExpressionChy10G180500
SyntenyChy10G180500
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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mRNA sequence

CAGTTGTGATTTCGGTTGTGAAACTGGCGTTAATGTCATTCAGCAATTCTCTCGATTTTGCCATGAGGTTTCCGTCGTTCACCAAACGTTGGCTTGCAATTTGATCACAATATGAAGCTAAATATGATTTGCTCTGGTTATCCATGGCAGAAGGCTTGGGATTCTACTCTCTTCAGGGACAAAGCATAATATTTTTCAAATTAGTGCAAAGTGGACTGATCACCTTTGTTTGGACACGCCTCGACAAGATATCAGAGCAAAACATGGGTAAACCTTTGCGGAAAAAACAAGGTACGGTATCGTTTTCCATTTCTTCAAACTACCGAATAATTATTTTTACCCATTTATGTTTATCAAATTTACAATAATTTTCTAACTGTGAACTTACCATAATATATATATATATATATATAATAGATAGATTCATAAAATCATAGAGAAAATAAGTTAGGTGGACAAATAGCAAAGTTGTTAGCAAAAATATAAGTTGGGATAACTTGTAGCGTGGGTTGAGAAAAAGTGAAATAATAGGGAGATTATTGGGACCTACATTCAAGAAGGTAAAAGATATATGCTAGAGAAATACTTTTAAGAGAAAAATAGAATCTAGCAACCAAATCAAATAATTAACATAAAAGAGTTACAAACAGTCAATTTTATCACATTATATGAAAATATGGTGATAATTATTACTAAAGTACCATTTGATAATGGTTTTGAAAATTCAAACATTATACATATTTTCCATTAAATATTTGGATTAGAAGCAAATTAAACAATATAATATGGTAAAGTTGAAATAACACATGAATTTTAGATTACATGATCTGATATATTAAATTATCTATACAAATATACTAATGGAAATGGAAGCTTATTAAATTGAAGATTAAACTTCCAAGATTTTTAATTATACCACAAAATTTCAAGATTATTTGTTTGTTTTTGAAAGGAAAGCTGATAAAAATTTTTCCTTAATCCCCCACA

Coding sequence (CDS)

CAGTTGTGATTTCGGTTGTGAAACTGGCGTTAATGTCATTCAGCAATTCTCTCGATTTTGCCATGAGGTTTCCGTCGTTCACCAAACGTTGGCTTGCAATTTGATCACAATATGAAGCTAAATATGATTTGCTCTGGTTATCCATGGCAGAAGGCTTGGGATTCTACTCTCTTCAGGGACAAAGCATAATATTTTTCAAATTAGTGCAAAGTGGACTGATCACCTTTGTTTGGACACGCCTCGACAAGATATCAGAGCAAAACATGGGTAAACCTTTGCGGAAAAAACAAGGTACGGTATCGTTTTCCATTTCTTCAAACTACCGAATAATTATTTTTACCCATTTATGTTTATCAAATTTACAATAATTTTCTAACTGTGAACTTACCATAATATATATATATATATATATAATAGATAGATTCATAAAATCATAGAGAAAATAAGTTAGGTGGACAAATAGCAAAGTTGTTAGCAAAAATATAAGTTGGGATAACTTGTAGCGTGGGTTGAGAAAAAGTGAAATAATAGGGAGATTATTGGGACCTACATTCAAGAAGGTAAAAGATATATGCTAGAGAAATACTTTTAAGAGAAAAATAGAATCTAGCAACCAAATCAAATAATTAACATAAAAGAGTTACAAACAGTCAATTTTATCACATTATATGAAAATATGGTGATAATTATTACTAAAGTACCATTTGATAATGGTTTTGAAAATTCAAACATTATACATATTTTCCATTAAATATTTGGATTAGAAGCAAATTAAACAATATAATATGGTAAAGTTGAAATAACACATGAATTTTAGATTACATGATCTGATATATTAAATTATCTATACAAATATACTAATGGAAATGGAAGCTTATTAAATTGAAGATTAAACTTCCAAGATTTTTAATTATACCACAAAATTTCAAGATTATTTGTTTGTTTTTGAAAGGAAAGCTGATAAAAATTTTTCCTTAATCCCCCACA

Protein sequence

QL*FRL*NWR*CHSAILSILP*GFRRSPNVGLQFDHNMKLNMICSGYPWQKAWDSTLFRDKA*YFSN*CKVD*SPLFGHASTRYQSKTWVNLCGKNKVRYRFPFLQTTE*LFLPIYVYQIYNNFLTVNLP*YIYIYI**IDS*NHRENKLGGQIAKLLAKI*VGITCSVG*EKVK**GDYWDLHSRR*KIYAREILLREK*NLATKSNN*HKRVTNSQFYHII*KYGDNYY*STI**WF*KFKHYTYFPLNIWIRSKLNNIIW*S*NNT*ILDYMI*YIKLSIQIY*WKWKLIKLKIKLPRFLIIPQNFKIICLFLKGKLIKIFP*SPT
Homology
[Close]
BLAST of Chy10G180500 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DW32 (uncharacterized protein LOC103488967 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488967 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 57.8 bits (138), Expect = 1.0e-04
Identity = 24/30 (80.00%), Postives = 26/30 (86.67%), Query Frame = 0 

Query: 76  LFGHASTRYQSKTWVNLCGKNKVRYRFPFL 106
           L GHAST Y+SKTW+NLCGKNKVRYRF  L
Sbjct: 71  LVGHASTGYRSKTWLNLCGKNKVRYRFQLL 100

[Close]
BLAST of Chy10G180500 vs. NCBI nr
Match: XP_016900173.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103488967 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 4.85e-07
Identity = 35/80 (43.75%), Postives = 45/80 (56.25%), Query Frame = 0 

Query: 27  SPNVGLQFDHNMKLNMICSGYPWQKAWDSTLFRD-KA*YFSN*CKVD*SPLFGHASTRYQ 86
           +P + L+   +++L+M        + WDS L    K   F    K     L GHAST Y+
Sbjct: 29  TPQLLLRASTHIRLSMA-------EGWDSILSSGTKPNVFQISAKWT-GDLVGHASTGYR 88

Query: 87  SKTWVNLCGKNKVRYRFPFL 105
           SKTW+NLCGKNKVRYRF  L
Sbjct: 89  SKTWLNLCGKNKVRYRFQLL 100

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy10G180500 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy10G180500 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A1S4DW321.0e-0480.00uncharacterized protein LOC103488967 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488967 PE=... [more]
BLAST of Chy10G180500 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_016900173.14.85e-0743.75PREDICTED: uncharacterized protein LOC103488967 [Cucumis melo][more]
BLAST of Chy10G180500 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy10G180500.1Chy10G180500.1mRNA