Chy10G176890 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy10G176890
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH10: 11291359 .. 11297312 (-)
RNA-Seq ExpressionChy10G176890
SyntenyChy10G176890
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TGATGCATCAAAATCGTCTCTAGTGTATAGCTACCACCGGAGCTTCAGCGGCTTTGCAGCGAGGCTCAACGAAGACGAGGCTCGAAAACTCGCGGGTGAGTTCATCTTCTTCTTCTAAAGAAAAAGTTGTATTTAATTAAGTTAATGAAGAGGTTTTTTGTTTCTGGATTTATCAGAGATGGATGGAGTTGTTTCTGTGTTTCTAAGTGAAAAAAAACAACTTCACACAACAAGATCATGGGATTTCATGGGTTTCTTCCAAGATGCTCCAAGAACAAGATTGGAGAGTGATTTAATCATCGGAATGTTGGATACCGGAATTTGGCCGGAATCTAAAAGCTTTTCCGATGAAGGCTTTGGCCCGCCGCCATCTAAATGGAAAGGGGAATGCAAACCCTCTCTTAATTTCACATGCAACAAGTAATATATAATCCTCTTTTTTACATCTTTAATTAATATATTAGGCTAAACAAGTGTTTTCATTTTTTTAAAAAAAATTTATACCCTAAATATAGGGTATAATGATTAGGGTTTAAGAAGGCTTAATCAAATTACAAAAAATACAAAATACAAAAATGAATTTTGGACTTTGTTTCAAAAATACAAACATCAAAGTTAACCTTTTTTTTAATATTGAAAGTTATTTTGAGTATGAAAAAAACAATTAATTTTATGGCTAATACTTAATTTTGACATTTTGTTACTTCATCTAATTAAATGAGAATTTTTAAAAATAGTAGATTTTACGAAATATTTACAACCTATAACAAATTTTATTATTGATAATCGTTGATATACTATAGTGATAGAAGACTATCAATAATAGAATCCAAAATTTTGTTATAGCTTGTAAATATTTTAATTTATTTTGTTATTTTTAAAAATGTCCCCTAATTAAATCTATTTTCTATTTTTTATAGGTTAATTACATTAATTTTTTAGAAATGTATACATTATGCTTTAAAAAAATAAATTACTTTCCTTAACTAAAACTAAGGATTTTTTTTCTTTTTTAAAAAGGGCAAACTATTTACCCTTTATAGAACAAAACACCTGAAAAAAGGATAGTTCCAAATTTAGCGATTAAATTCAAAATAATTAAGTAATAACAATATTTTAAAAAAATTGTAAATATAGCAAAATTTGTCAAATTCTATCTCTATCACCGATAGATCATGTTGCAAATATTTGTCTATCACTGATAGATCATACGAGTTTATTAACGATACGAGTCTATCGACGATAATTTTGCTATATTTGCAATTTTTTTAAAATGTTACTATATCCTTAATTATTATTCCTAAAGTGGTCATCAATTACAATTATCCCAAAAAATTCATTACACTTGATTTTTGACAACTTGTGTAAACAAATTTAATTTAGACTAACAAATTTTATCACACTAAACAACAATTTTAAATTACAAAAGAAATAAGATGTCTATTTCAATTTAAAAAGGAAGCTCGATCTTCTTATTTTTTTTATTTGTAACAACACGGATAAAACTTCAATCAACTCATAAAGATAGTCTAGAAAGTCTTGAAAACAAATTATTAGCCTAAAATGTTAGTAAAACGATGAATTTATAAAATACAAAAGGGACAACAAAGGAACGTCATAAATTAAAACAAAAACAATGATACAAATAGTAGTTTATCGCAAATAGATGATAAAATTTTACTATATTTATAAATATTTTTGTGTTTAATTTGATATATTATTGAAGACACATGGAAATAAAGTATAAAAGTTTGAAAGGATAGATTTGAAATATTGAATCGAAAGAAAAGTTATTTAAGAAAATTGAAATATTTGGTAAAAAATTTAGAATGTAATTTAAACAATTTTGGAGAAAAAATATAAATAAAAATGTGGTTTAAGCCAATCCAAGGAGCAAAGTATTTTTCATAATTTGATAATCCTTAAAACTGTCGACTGTTGACTATGCTTAGATATAATCGTAAAAGAGACGTAAATAAAACTGCCCTTAAAAACGACGACGTTGAGTGTGTTTTTTTCTATCTATTTTTTCCCCTAAACATATATTTGTTGAAATTTATGAAAGTAAAATAATTGGAGCTCGATTCTTTCGGAGCGAGCCTTTCGTCGGAGGCGATCTTCCTTCTCCAAGAGATGTAGAAGGCCATGGAACTCACACCTCATCCACCGCCGGCGGTAATTTTGTCTCCAACGCCAACCTTTTCGGCCTCGCCGCCGGTACCTCTCGGGGCGGCGCTCCCTCCGCCCGCATTGCTGTCTACAAGATTTGCTGGTCCGATGGTTGCCCTGACGCCGACATCCTTGCAGCTTTTGACCATGCAATCGCTGATGGTGTCGACATCATCTCCCTTTCTGTCGGAGGTTTTGGCGCCAGCGATTACTTAGACGATCCCATTGCTATTGGGGCTTTTCATGCAATGAAGAATGGGATTCTGACGTCAAATTCCGGTGGCAATGATGGCCCTAACCTCGGTAGTATCTCTAATGTTTCTCCATGGTCGTTATCGGTGGCTGCTAGCACAATCGATAGGAAGTTTGTGACTAACGTGGCGTTGGGTAATGGACAATCCATTCAGGTGAGCCCTGGAATGCTTTATTCTTTCATGAATGTTTCATAAACTATAGAATCCCTTACCTACCAGCCTATGATTTTGGGTCAATCCGTGATTTAAGATGCTATATTTGAGTCATTGATTAATTTACACACCACCTGTTTGTTAGGGGATCTCTGTGAACACCTTCGATCTTGGAGATAAATTGTTTCCACTTATTCATGCTGGTGATGCTCCTAATACAACTGCAGGTTTCAATGGATCAACATCAAGGTAGTTGAAGCTCAAAGATTTCTTATTGTGCAATTGTTAGTCGTTGACTGATGTTACTCTGCGACGATTTTATTATAAATCAAAATGTGATGTGTTTTTCCCTAGTTGAAGAACAAGTTTTGGGTTTAGAGGAATTGAACTTTGGTGTTAAAATGCAGGTTATGCTTCCCAGGTTCTTTGGACGTGGATAAAGTTCAGGGAAAGATTGTTATATGCGATTTGATCAGTGACGGAGAAGTAACCCAGAGTAGTGGTGCGGTTGGTACAATAATGCAAAATTCTGACTCCCTAGACGTTGCCTTTCTTTTCCCCCAACCTGTTTCCTTAATAAGCTTCAACACTGGAGAAAAACTTTTTCAGTATCTGAGATCAAACAGGTATATTGGCACATCGCTGAAAGGATGGATAGTATTTAAATTATATTTTAGTTTCTTAACTCTAGTGTTTGTTTAGTCTCTACAATTTTTAAGATTCTGTTTTAGTTTTTAACTAATTCATTAACTTTCTATTAATAGATACTTTCAAAAGTTATATATAGGTAGGCACACACTATATTCATTTATCTTATCATTAGATATGTCTACATTAAGGCAATTCGATTGTTTCTCAATGTTTTCTTAGAAGAAACAGTTCATTGATTAATGGAGCAGAGGAAACCCTAAAAGCCAATAGACAATTATAAGAAACATTTCTAGTTGGAGACGATAGAAGAAAGACTGAAACGATTAAAAGGTTGTTTGTCCTTGCTCCAATAAAAAGCTGTAGATAAAACCAAATCCATAAACCTATCAAAAGAGGAGAAAGAATAATCCTTGAAAAAATGACTATTGCCCTCGCACCAGGTGTCCAAAAGAAAGCACTCATAAGGGCCAACCAATTCATACTAAGTACTCATAATTGCCAACCAATTCATACTTGTAGTAGCACCAAAAGGATGACCCACTATAAGAGTCACCAAAATATTAAGATAGAGTTAGAGGCCAACCAAACTCGATCATATTTCAATGTTTAAGACTTCTATTACCTTCTTTGAGGTTGAAGGTACATTCCTCCCCCTCACCTCTTGTGGAGAATTTTAAAACATGTCTATACGAAAAGGTGTTTGTGTCTGAAGTAGTATTTAGTTTCTAAATGTATATAAACTATTTTTAATGATTAACAAAAGTTAATGCTAAAAACTAAAATCATATTTTATGTAAAGCATAGTGTGTCTAACGCAGGATATTTCAATATTGGTAAACTAAAACCTAATATTTGAAAGTTGAGTCTGAAACATTGATTGACTAAAATAGAATTTAAACCTTGCAAATTCAATTGTCAATATTGACCATTTTAGCATAAAATGCTTTGAAATTGTCCTTTATCATCTTGTGTTTTTACTTTGATAGCAACCCAGAAGCTGTCATAGAAAAGAGTACTACCATTGAGGATCTGTCTGCTCCATCTGTAGTTTCCTTCTCATCAAGGGGTCCTAACTTAATTACACTGGACATTCTCAAGGTAACACATCTGAGTAATTTAACTCAAGATCTGTAAGCTAAATCCTCATTGATTTTGACTTCTAGAAATCTCTTGTAGCCTGATTTGGCAGCACCAGGAGTGGATATAATAGCATCTTGGTCTGAAGGCACATCAATCACAGGTTTAGTAGGGGATAAACGAATATCTCCATTTAACATAATCTCTGGCACATCCATGGCTTGCCCACATGCAACAGGAGCGGCTGCCTATGTCAAATCCTTCCACCCAAATTGGTCTCCTGCTGCTATTAAGTCGGCACTTATGACAAGTGGTAATAGTTTGAGCTTAATTTTTTTAGTACAACTTAAATCGTGTTTCATATCTGATTTTTCTTGTTTATTTCATTTTAGTCTTAAAATGCCCGGTTTTAACCGATTTCCTTTGAGATCTTAGGCTGTAGTCTCTAAACTGTTATTAAAAATTATTTTAGCTTTACCATTAACATTTTATGCAGTAGACCTTAAATTATTCTGTAGGTTATATTTTACATAAATTGGAGCCCTCTCTTTTAGACAACTTGTCTTTTTGTATGCCCTTGTATTCTTTCCTTCATTCTCAATTAAAGTTGTTATAATGTTAAAGAAAAAAAAGGTTGTACATAATTTGTTTTTTACTGGGAACACTATTTTAGACTTCACAATTAATCGTTGAACA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mRNA sequence

TGATGCATCAAAATCGTCTCTAGTGTATAGCTACCACCGGAGCTTCAGCGGCTTTGCAGCGAGGCTCAACGAAGACGAGGCTCGAAAACTCGCGGAGATGGATGGAGTTGTTTCTGTGTTTCTAAGTGAAAAAAAACAACTTCACACAACAAGATCATGGGATTTCATGGGTTTCTTCCAAGATGCTCCAAGAACAAGATTGGAGAGTGATTTAATCATCGGAATGTTGGATACCGGAATTTGGCCGGAATCTAAAAGCTTTTCCGATGAAGGCTTTGGCCCGCCGCCATCTAAATGGAAAGGGGAATGCAAACCCTCTCTTAATTTCACATGCAACAATAAAATAATTGGAGCTCGATTCTTTCGGAGCGAGCCTTTCGTCGGAGGCGATCTTCCTTCTCCAAGAGATGTAGAAGGCCATGGAACTCACACCTCATCCACCGCCGGCGGTAATTTTGTCTCCAACGCCAACCTTTTCGGCCTCGCCGCCGGTACCTCTCGGGGCGGCGCTCCCTCCGCCCGCATTGCTGTCTACAAGATTTGCTGGTCCGATGGTTGCCCTGACGCCGACATCCTTGCAGCTTTTGACCATGCAATCGCTGATGGTGTCGACATCATCTCCCTTTCTGTCGGAGGTTTTGGCGCCAGCGATTACTTAGACGATCCCATTGCTATTGGGGCTTTTCATGCAATGAAGAATGGGATTCTGACGTCAAATTCCGGTGGCAATGATGGCCCTAACCTCGGTAGTATCTCTAATGTTTCTCCATGGTCGTTATCGGTGGCTGCTAGCACAATCGATAGGAAGTTTGTGACTAACGTGGCGTTGGGTAATGGACAATCCATTCAGGGGATCTCTGTGAACACCTTCGATCTTGGAGATAAATTGTTTCCACTTATTCATGCTGGTGATGCTCCTAATACAACTGCAGGTTTCAATGGATCAACATCAAGGTTATGCTTCCCAGGTTCTTTGGACGTGGATAAAGTTCAGGGAAAGATTGTTATATGCGATTTGATCAGTGACGGAGAAGTAACCCAGAGTAGTGGTGCGGTTGGTACAATAATGCAAAATTCTGACTCCCTAGACGTTGCCTTTCTTTTCCCCCAACCTGTTTCCTTAATAAGCTTCAACACTGGAGAAAAACTTTTTCAGTATCTGAGATCAAACAGCAACCCAGAAGCTGTCATAGAAAAGAGTACTACCATTGAGGATCTGTCTGCTCCATCTGTAGTTTCCTTCTCATCAAGGGGTCCTAACTTAATTACACTGGACATTCTCAAGCCTGATTTGGCAGCACCAGGAGTGGATATAATAGCATCTTGGTCTGAAGGCACATCAATCACAGGTTTAGTAGGGGATAAACGAATATCTCCATTTAACATAATCTCTGGCACATCCATGGCTTGCCCACATGCAACAGGAGCGGCTGCCTATGTCAAATCCTTCCACCCAAATTGGTCTCCTGCTGCTATTAAGTCGGCACTTATGACAAGTGCTTTTCCCATGAGTCCAAAGTTGAACACAGATGCTGAGCTTGGATATGGAGCAGGTCACTTAAATCCAGTAAATGCCATTAACCCCGGTTTAGTCTATGATGCTGAAGAGCTTGACTACATAAAGTTCTTATGTGGACAAGGATATAGTACAAAAGATCTTCGTCTTGTTTCGGGTGACCATAGCAACTGTTCGGATGTTACAAAAACAGCTGCATCAGATCTAAACTATCCATCTTTTGGTCTAATAATCAATTCTACAAGTCAAAGATTGATTAGTCGTGTCTACCACAGGACCGTCACAAATGTTGGGCTGCCAGTCTCAACTTATAAGGCAGTTATTAAAGCTCAGCCCGGGCTCAAAGTTACAGTACGTCCTGCTACTCTTTCTTTCCGTTCTCTTGGACAAAAGATATCCTTCACTGTGACTGTGAGGGCTAAAGCAGATGTTAGTGGAAAGGTAGTCTCTGGTAGCTTAACCTGGGATGATGGAGTGCATCTGGTGAGGAGCCCCATTGCTTCATTTGTTATTCCATAA

Coding sequence (CDS)

TGATGCATCAAAATCGTCTCTAGTGTATAGCTACCACCGGAGCTTCAGCGGCTTTGCAGCGAGGCTCAACGAAGACGAGGCTCGAAAACTCGCGGAGATGGATGGAGTTGTTTCTGTGTTTCTAAGTGAAAAAAAACAACTTCACACAACAAGATCATGGGATTTCATGGGTTTCTTCCAAGATGCTCCAAGAACAAGATTGGAGAGTGATTTAATCATCGGAATGTTGGATACCGGAATTTGGCCGGAATCTAAAAGCTTTTCCGATGAAGGCTTTGGCCCGCCGCCATCTAAATGGAAAGGGGAATGCAAACCCTCTCTTAATTTCACATGCAACAATAAAATAATTGGAGCTCGATTCTTTCGGAGCGAGCCTTTCGTCGGAGGCGATCTTCCTTCTCCAAGAGATGTAGAAGGCCATGGAACTCACACCTCATCCACCGCCGGCGGTAATTTTGTCTCCAACGCCAACCTTTTCGGCCTCGCCGCCGGTACCTCTCGGGGCGGCGCTCCCTCCGCCCGCATTGCTGTCTACAAGATTTGCTGGTCCGATGGTTGCCCTGACGCCGACATCCTTGCAGCTTTTGACCATGCAATCGCTGATGGTGTCGACATCATCTCCCTTTCTGTCGGAGGTTTTGGCGCCAGCGATTACTTAGACGATCCCATTGCTATTGGGGCTTTTCATGCAATGAAGAATGGGATTCTGACGTCAAATTCCGGTGGCAATGATGGCCCTAACCTCGGTAGTATCTCTAATGTTTCTCCATGGTCGTTATCGGTGGCTGCTAGCACAATCGATAGGAAGTTTGTGACTAACGTGGCGTTGGGTAATGGACAATCCATTCAGGGGATCTCTGTGAACACCTTCGATCTTGGAGATAAATTGTTTCCACTTATTCATGCTGGTGATGCTCCTAATACAACTGCAGGTTTCAATGGATCAACATCAAGGTTATGCTTCCCAGGTTCTTTGGACGTGGATAAAGTTCAGGGAAAGATTGTTATATGCGATTTGATCAGTGACGGAGAAGTAACCCAGAGTAGTGGTGCGGTTGGTACAATAATGCAAAATTCTGACTCCCTAGACGTTGCCTTTCTTTTCCCCCAACCTGTTTCCTTAATAAGCTTCAACACTGGAGAAAAACTTTTTCAGTATCTGAGATCAAACAGCAACCCAGAAGCTGTCATAGAAAAGAGTACTACCATTGAGGATCTGTCTGCTCCATCTGTAGTTTCCTTCTCATCAAGGGGTCCTAACTTAATTACACTGGACATTCTCAAGCCTGATTTGGCAGCACCAGGAGTGGATATAATAGCATCTTGGTCTGAAGGCACATCAATCACAGGTTTAGTAGGGGATAAACGAATATCTCCATTTAACATAATCTCTGGCACATCCATGGCTTGCCCACATGCAACAGGAGCGGCTGCCTATGTCAAATCCTTCCACCCAAATTGGTCTCCTGCTGCTATTAAGTCGGCACTTATGACAAGTGCTTTTCCCATGAGTCCAAAGTTGAACACAGATGCTGAGCTTGGATATGGAGCAGGTCACTTAAATCCAGTAAATGCCATTAACCCCGGTTTAGTCTATGATGCTGAAGAGCTTGACTACATAAAGTTCTTATGTGGACAAGGATATAGTACAAAAGATCTTCGTCTTGTTTCGGGTGACCATAGCAACTGTTCGGATGTTACAAAAACAGCTGCATCAGATCTAAACTATCCATCTTTTGGTCTAATAATCAATTCTACAAGTCAAAGATTGATTAGTCGTGTCTACCACAGGACCGTCACAAATGTTGGGCTGCCAGTCTCAACTTATAAGGCAGTTATTAAAGCTCAGCCCGGGCTCAAAGTTACAGTACGTCCTGCTACTCTTTCTTTCCGTTCTCTTGGACAAAAGATATCCTTCACTGTGACTGTGAGGGCTAAAGCAGATGTTAGTGGAAAGGTAGTCTCTGGTAGCTTAACCTGGGATGATGGAGTGCATCTGGTGAGGAGCCCCATTGCTTCATTTGTTATTCCATAA

Protein sequence

*CIKIVSSV*LPPELQRLCSEAQRRRGSKTRGDGWSCFCVSK*KKTTSHNKIMGFHGFLPRCSKNKIGE*FNHRNVGYRNLAGI*KLFR*RLWPAAI*MERGMQTLS*FHMQQ*NNWSSILSERAFRRRRSSFSKRCRRPWNSHLIHRRR*FCLQRQPFRPRRRYLSGRRSLRPHCCLQDLLVRWLP*RRHPCSF*PCNR*WCRHHLPFCRRFWRQRLLRRSHCYWGFSCNEEWDSDVKFRWQ*WP*PR*YL*CFSMVVIGGC*HNR*EVCD*RGVG*WTIHSGDLCEHLRSWR*IVSTYSCW*CS*YNCRFQWINIKVMLPRFFGRG*SSGKDCYMRFDQ*RRSNPE*WCGWYNNAKF*LPRRCLSFPPTCFLNKLQHWRKTFSVSEIKQQPRSCHRKEYYH*GSVCSICSFLLIKGS*LNYTGHSQA*FGSTRSGYNSILV*RHINHRFSRG*TNISI*HNLWHIHGLPTCNRSGCLCQILPPKLVSCCY*VGTYDKCFSHESKVEHRC*AWIWSRSLKSSKCH*PRFSL*C*RA*LHKVLMWTRI*YKRSSSCFG*P*QLFGCYKNSCIRSKLSIFWSNNQFYKSKID*SCLPQDRHKCWAASLNL*GSY*SSARAQSYSTSCYSFFPFSWTKDILHCDCEG*SRC*WKGSLW*LNLG*WSASGEEPHCFICYSIX
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy10G176890 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy10G176890 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy10G176890 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy10G176890 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy10G176890.1Chy10G176890.1mRNA