Chy10G173030 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy10G173030
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionNAC domain-containing protein 83-like
LocationchrH10: 2716344 .. 2725371 (-)
RNA-Seq ExpressionChy10G173030
SyntenyChy10G173030
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGATGGATATGAGGTATAATTATTAGATTTATTTTAAACATAATATTATTATTAATGTGTCTTATATGCATTATATGTTATTTTATCTCTTTCAAATTTATTGTTTTATTAGGTGCATTAGATCAAAAGATAATGTCCTAATTAAACATCATGATGATGATGTCTATAAATAGAATCTTGGCATTGGTTCTCACAGCCTCATTCAATGAGTAGTTCACTTTTCCTCATCAAAAAAATTAATTAAGGTAAAAGAGATCAAGTGAGAGAAACGCAATCTCTTAAAAGACCATTCATAGATCAAGGTATGTGATTCTCTAACTAAATTTAATTTGTGAAAATCATGTAGTTCAAAGATCTTGACATTTATTGTTGTATGCAATGTTATGTTTTTGTTGTATAATCATGAAAATAAAACTTACATGTGGTATCAGTGGTATCATAGCCAAGTTGAGAACTTACGAATTTTTTATTGATGTGTAAGATATAAATTATGTTTCTTGCAAAAAATAAATTTGTTTGACTTTTCTTTAATAGATGAAGAACTCCGTTCCATGAGAAAGATTAACAAAATAATAATTGTAAATAAATAAATAAACTTAAAGGTATTTTAGAAATCACAATAAACTCGAGTTTAATTTGATTAAGTTTTCTTTGTTTGATTTTTCATGGATTAAGTTTTCTGGTGTGATTGTTTTTATTTATTAATTTATTATTGCTTTTTATATTGAAGAATCTAGTGGATTTCAAAATTGATCTAGTTTGTTTAAATCTATTATTATTAAATTTTTAAAATCTATGCAACTACTTATAAAGTCATATCATAGAAACGTCATAATTAATGATGATCACATAAATTATATATCATTTGTATTTTATGTATGATGGATATATAATGATAATGATATAAAGGGTGATTTATATTATTCACTTATCCTAGTGATTTAAATTATGTCGTTTAGATTGAATGAGAGTTTTGATAAAATTATTTGCAATATCAATATTTTGCAAAATTATGTTATTTTATATCTATATATTAGAAATAATTTGTTAGTCACCAAAATGACCAAATTAGTAAGTTATATAGATATCAAATGAAACGTAATTGGTGAAAACAAATAAGTTTTAGAAATTACAGAAAAATCTTTTCTCTTCTTATCATGAAAAGAAAATTTTTGTATCTTCTTATCATGAAAAATCTTTAATTTTCTTATTATGAAAAGGACAATAAAAATAAAGAAGAAGAAGATAAAGATCATCGAGAGATAATCATATATTTTTATTTTTGGATTAAAGTTATTGGAGATTAATTAGATTTTTAATTATTCCATTAATGTTACTATTTTTCTCAGGATTGAATTGAGTTGCTTAAATTTAAAATATAATAAATTATGCATGTTTAAATTTCATAAAATTTGGTACATTAAATTATGTTTTATTGTTCTTTTGTGTTATGTTTAAATCACAAATAATTTAAAACATATATTTGTTTGTGATTATTTGATATCTATAGTATAAATAATTTGTTAGTCATCAAAGTGGTCAAATTATTAAGTGTTTTATCACTATCAAATTAAAGTTACGTTACTTCAATTATCAATGTTTGTGATTGTTTTGTTGCAATATATTTATGTTATGAATAATTTGTTAGTCACCAAAGTGGCCAAATTAGCAAATCTTATAGATATATTACATTGATATTGTTTTGCAAATTAAGAAAATAATTATTTGTAATTATTTTAATATGATATCTATATTATGAATAATTTGTTAGTCACTAAAGTGCTCAAGTTACTTCAATAGATATCAAATTAAAGTTGATTCAATTACTCATGTTCATTTGATGCTAATGAATGAAATGATATTATGAAACATTAATGATTTGTCATGAGTATATTGATTTTAATTATTATAAAAAATTTAATTTGTTCAAAGGTAATTAGTAGTTTTATAATTTTGAATCTTATTATGGTTAATTCAGGTGTTTGGTTAGATATTATTAGTATATCCAAAGATAACTAATGTATATAATTTGAGTATTTAAATTACCAATTATATGAAACTAAATCTAGAAATATTGTACATTGTTGTGCCTTCCAAAGAAGAGCTTCAATGTATAAGTATGATTGAATATGTGTTGTATCTTTATGTTTATTTCTCAAACCAATAATGTATAAGCATACTTATTTTGTAATTGCATCATCTGTTTTCGTTTCTCTTCATTTGCATGCTATGTCTATTATCAAGTTTAATGGACTCAATTTATCTAATTGGTGTAAAAAAATTTGATTCTATTTTGGAGTTTTGGATCTTGATTTGACACTTTTAGTAAGAAACTTGTTGCACTTACTTCTACTAGCAATGATGAGGATAAATCTTTCTATAAAGCTTGGGAAAGATCAAATAGATTGAGCCTAATGTTTATGCGAATGACTGTAGTAAACAGTATCAAGTCCACAATTACAATATTGAAAATGTCAAGGAATTTACAAAATTTATAGAAAATATGATGAGAAAGCACATTGTTTTGACCAATTTGCTAAATTCCTAGAAAATCGTGGTATATGTGCTCAATACACAAGATCAAAACACCACAACAAAATGGTGTTGTAGAAAGGCATAATTGTACATTAATGAATATGGTTAGAAAAATATGTTAATTAATTTGTCTTTACCAGTGTCCTTGTGGATGTATGCACTAAGAACCGCTCAATATTTATTAAACAGAGTTCTTAGTAAGTCAGTTCTAAAGACACATTTTGAATTATGAACAGTAAAGAAACCTAGTTTAAGGCACCTACATGTTTAGGGCTGTCAAGCGAAAGTAAGAATTTATAATCTATATGATAGGAAACTGGATTCAAGAACAATCAATGGTTTCTTGGTTATCTAGAAAAATCAAAAGGGACCAAAATATGAGAGTACTTGAAATTGGAAATGTAAGGTTCATTGAAAATGACATAATTAGTGGAAGTTTGGAACCACATAAAGTGGAAATTCAAGAAGTTAGGGTGGAAATTCCTTCATCTATAACTTCTTCTCAGGTTGTTGTTCATGTAGTTGTTGACTTTGTTAACAATTCACAAGAAGAACAAATTAATGATCAAACACCACATAATGATGTTATAACAAATGAACCTGTAATTGAGGGACAACAAGAAATAAAGTTAAGAAGATTTGTAAGACAAAGAAGATCAGCTATTCTTGATGACTATGTGGTTTATTTGCATGAGTCAGAATTAGACTTAAATATTAATAATGATCCATTTTCGTTTTCACAAGCCATTAAAGACGATAATTCTGCCAAATGGTTAGATGTCATAAAAGAAAAGTTAAAATCAAGAATAATAGTGAAGACTAGGACCTTGTAGAATTGCCTAAAGGAAGTAAAAGACTTGGGTCTAAATAGGTCTTTTATGACAATGCGTGACACAAATGGCTATATCAAATGACACAATGATAGACTTGTTGCCAAATGTTATACTCAGATAGGTGACAGTGACTACAAAGAGACCTTTTCTCCTGTCTTCAAAAAGGACTCATTAAGAATTATTATGACTTTAGTAGCTCATTATGATTAGAGCTTCACGAAATGGATGTAAAAACTGCCTTTCTAAATGGGAATTTAGGTGAAGAATTATTCATCGATCAACCAGAAGGTTTTATGGTTGAAGAAAATGAACATATGGTGTGTAAATTAAAGAGGTTAATATATGGATTTAAACAAGCTTCCAGACAATGGTATCATATGGTATCTTAAGTGCAATGATACCATCACATCTTTTGGTTTTAAAGAAAACATCATTGATCGATGTATATACCTAAGGATTAGTGGAGCAAGTTTAATTATAATCTTTGTTCTATATGCTTACTTACAAGAGATCTGATCATCTCGAGGTGATTGGATATTCATATTCAGATTTTACTGGGTGTGTGGATACACGAAAATTCAGTAATTTTGGCTATTTGTTTCCATTAGCTGAAGGAGCAATTTCATGGAAAAGTGCAAAATTGGTTATTATCGCTGCATCCACTGTAGAGGTTGAATTTGTAGCATGCTTTAAGGCTACAGTTCATGGTTTATGGTTGCAGACTTGGAATTGTCGACAACATTGTCAAGCTATTGATAATTTATTGAGATAATTCTACAATAGTTTTCTTCTAAAAAAAATGACTAATATTCTAAAGGTGCTAAACTTATGGAATTAAAATACTTTGTTGTTAAAGAAGAAGTTCAAAAACAAAAAGTGTCAATCAAACACTAATGCACTAAACTTATGATTGCGGATCTACTAACTAAAGGATTGCCACCAAAGATATTCAATGATCATGTTAAACGTATGGACATTAGTAGATATCATTATCGAAATCAAGATTATGTTATTTGACACTTTGAGCTCATTTATTTATTTTTTCTGATTTTATCTCATGGTTCTGTTCTTATGATTAGTATATACATAGATGATTTATGTTAAATAGGACATCGTTTTTGATAAAGACACTTATTGTTGGATCGTTATTAATTATCTTTATTATAGATCATGTTAATAGAAGAAATATTTTAGTGATATATGGAAGGGAGTATGTAATCCAATGATGTATGACCGCCATGATCCTTTAGTAGTTTCTTTGACTTGACATGATATGTTATGAAGTTTAATTGTGTGCATTATATCTATGAATGTATATGATAAATAATGTCAATAGGCCAAGTGAAAAAATGTTAGATTTAATTTAAATATAATCTTATTATTAATGTGCCCCACATGCATTATATGTTATTTTATCTCTTTCAAGCCTATTATTTTATTAGGCTTAGGTAAAAAGATAATGCCCTAATTAAACACCATGATGGATGATGTCTATAAATCGAACCTTAGCATTGGTTCTCTTACTGGCTCATTCAAGTAATTCACTCTTCTCCATCAATAAAATTAATTAAGTTAAATGAGATCAAGTGAGAGAAACACAATCTCTTAGAAGACCATTCATGTATGTGATTCTCTAATTAAGTTTGATGTGTGAAGATCATGTAATTCAAAGATATTGACATTTATTGTTTCATTGTGTAATCATAAAAATAAAATTTATAATAATATGAGGAAAATATTATTGATGAAAGTGTTGAAATGGATAGACTGGGTACAAAATTGTGGGACAAAACATTAGTGATGGAAGTTTTGCGGAATGAAAGAAGCTAAGATGGGTATGAAATTATTCACAAATATGGAGAAAGAAGTAACAAATCTTATGCTTTGCTTAAATTTGGTCTACAAATGGATGTAAAGAAGGAAAAAGAAAATGTTAGAAATGGGAATGAATGAGGAAAGGACCATCTCCCAAATAATAATAATAATGAAAATACTGAAAAATGGATTGAAATTTGAAAAAAAGAGAAAAGAAATTGGACACTTGCACCACTTTTACTTGGAAATCTATAAGTGGATATTTGTGGCGTGGATTATTATAATACGTAATTATTATAGTTTAAGTTTGAATTATTATAATTTATGTTTGGAAAAGTGACAAATAGTGAAATGAGAGAGAAGAATAGTAACATGTAGGAGAGATAGTAAAAAGGGGGTGAGGAATAAGGAAAAAAAAAGTAGAACAATCCTAATTTTAGATTGTGATAATCCTGGACAAACATGGAATAGCCCACTCCACTCCTCCGTATTCTGAGAGCTAAACGGTCCCTAAATAAGTTAAACTTGGAATCATTAATTAAATTCATAAAGAAAAAGAAATAAAAAATTTCCCATCATCAAACACACGCTCTCTCTTCCAAATACCTTCCTCTCCTTCACATTGTTCCTACGACCAACCACCGCTTACCACCACCACCTCAGCGGCTTGAGGTCTCACCAGCTCTATCTCATCAAGAAACAGTGGTATAATAATCTAATCTTTGGTAATGGACTGCTATAATTTGTGAATATAATTACTATGTTGTATCTATTTTAAATTCATTTACTTTACCATAACTCATGTCTGATTTCTAAGAATAAATAAAAAAAATTATTTTTATGGAAAGATTGATTATAACTATAAAAATAATTGTTTTGATAGATTGGTTATCATAGTCCCAAGATCTCAAATAGGGGTGTTGTATTATCAAACTAAAATTGTAAGGGTTGGTTTAGGTTGCAGAATTTTAAAAAAAATATATTTCAAGTTGGGTAAGGTTATAGGATTAAGTAACTCCATCAATATGATCCAACTTGGTTTATTTATTTATTATTATTATATATTGAATGAATTTGAATGTAAACTTAAATATTTTGCATAGAGTGCTTTTGATTGTTTTTTATTCATGTTTTGAATGAATTTAAATGTAGACTTGAATTTTACATCAACTTAAATTTTATTTATTTGAGGGTAAACACTTGAACTTTTATTGGAAAAAAGAAAGAAAGAAAAAAAACTAGGTTGGGTTGGGTTTACCCTTGTGTATTGCAATTTTTGCCAACCCGAGGAATTCAGGTTGATCCATAATTTACCATCAACCCTGTCCAACCAGATTTAAGTACACCCATAATCGATCTCATTAGTGGTATATCTATTTATACATTCGTTCGATTATAGTTTTTATTAATTAAATTTTAATCAATTTAGGAGCGAACCCACACATATATAGTCAATACTTAATTATAAATTTAGAACCTTAATTAAATAGAACATATAATAGGGCTCAATCTAATAAAATAACCAAAGTAATAAGATATTACTAATCCATCTATACTTTAACTATCCATATTATTAATTAAAAATATGACTAACAATTTTGTCCCGTTTTCTTGATTTTCATTAGTTTATTTGGCTAGGGTTTTTGATTATTCACTGTACTATTATTATCATTACTTTATTTTATATTTTGACCTTAGATTCTCAACTTCAAAGAAATTTCTTGACATACAGTCCACCGCGTAATAAGGCCTTTTAGTTAATAATTGGTGAGTTTTAAAGCATTAGCTCTTTTTCATCCATTATCGTTTATAGATTTTGAATCCTAAACTTTGAAATTTTGTTATGTTTAGGTTCGTTTGTATCCTCTATAGAAGAGATTTGAAGTAGTTTTGGATCAAGTCACATCTACGGTAAACTCTTTAATGGAAAGACTATCTAGGACTTGGTTTAAATTAACATAAATATCACATCATAATAATTTTACAGAAATTTCAATGAAAATAGGATCAAATGTCAATATGGATGGACATTTCTTAGAAAATTCACATTTAAAATTAAATTTAAATTAGTAAATAATCATTTTATTATGATTCTTAATCATTTTGTTCTTTATTTTGTATGTTTAGTGATTTTTTTATTGTGATATAATGAAAATGTCGATTCACAAACTCGTCTTGTGATATAATTATATCACAAACCTATGGAAACGTGAAAATATGTAATTATATCACAAACATAATTAAACTTACATATTAATTATATCACAAACCTATGAAAACGTGAAAATAACAATGAAAATATTAATATGTAAGTTTAATTATGTATTACAAAAAATAATATATCCATTGTAAATTCAAAGAACGGTCAGGGATGCTAAAAAGAAAAAAAAAACTTTTATGAAACACGTTGATCGCAGGCTCTTAATTAGAAAAAAAAAAAAAACCATTCTTTCCTAAATTTTTAGTTACAAATTAAAATCAACTCACAAATTTAAATAACCAAACCTTTTCTTCTTCTTTGCTTTTTGTGTAGCAATGGATTCATCAAGCGGTTATTTATCATTACCATTGAACCAATAGGTTGGTGTCAAGTTTAGGCCAACTTATCAACAATTTCTTCATTATCTTTATTGTGTCAGCCGTATTTTCAAGGAGCTGTTTTCAATCATTAGAGTGGAACCGAGCCATGAAAAATCTGGCAAAGTTTCAAAGGCATTGATGACGAAGATCTCTACTTCATTACTAAACTCTGCACAATTGTCAACACACATCAAATGCAAGATTGGCTTCACTCGACTTGGAGTGGCGAGAATTTAGTCACTCCAATTTTCAATGAATGATGAAAAAATAATTGGTTATCGCAAGCACTTTAGGTATGTTCTTTGGTTTCAGTTTTTGTTAAACTTGTTTTCAATATATGTTGTCATTGTTGCGCTTGTTTTACTTTATTAGGAAATTGTCATGGTGTTGCTTTATTTGGTATTTTGTGATAAATGATATGATTTTGTAATGTATAGGTATGAGAATGACCAGTTTGGAAGAACACCACTGTGAATGGATAATGCATGAATATAGCTTGCATCAAGGTTATTTGGCGTACCAAGATGTCGACCCTAATTATGTTTTATGTTGAATAAGGAAGAATGAAAGAGCTAAAAGAAAATTAGAAATACAACGTAAGTTGCAACAACCGAATAAGAAAAGAATAACGGCACCAAAAATCTCTAGTAATGAAAGACCAAAGACAAAAGCAAAAGAAAAGATGTTTTGTTCATTTGTTGCAATCAATAGAGCCAAGATTAATGACATGTGAGACGATCTCCAACTCGAATATCATGCATGACATATGAGTGTGCATGATATATCCACTCATCAAGATACTAGTGTTGTGGACCATATGTCCAATATACTGCTAAACAAGATAATGTTGATACACTTGATACGCCTGTAATGATCATAAATGAAAGCAGTTTGAGTATTGAATACGTACTTTGCATGCTCATTGACAACGAACGAAAAGTTCATAGTCTAAATTTAGGAGGCTTGAATGACTGTGAGCAAAGATTAATGGCATATAAGACGATCTGCACCTTAGATATCATGTCTGATACGCCCACTAATTTGGATAGTGGTGTTATGGCTCACACGATCAATATTGTGGCCACTAATCAAGATAATGTTGATATGTTCAACAAGCCTTCAATGTTCACAAATGAAAGCGCTAGTTTTGGTACTCAAGACACACCTTATGTGAGCACTGACGATGAATGGATAAATAGGATAAATTTATGTGAATTCAACGACGATGACTTTCCATTTTATATTCCTAGCACCTTGGATTAG

mRNA sequence

ATGGATGGATATGAGAATCTAGTGGATTTCAAAATTGATCTACAATGGATTCATCAAGCGTGTTGTGGACCATATGTCCAATATACTGCTAAACAAGATAATGTTGATACACTTGATACGCCTGTAATGATCATAAATGAAAGCAGTTTGAGTATTGAATACGTACTTTGCATGCTCATTGACAACGAACGAAAAGTTCATAGTCTAAATTTAGGAGGCTTGAATGACTGTGAGCAAAGATTAATGGCATATAAGACGATCTGCACCTTAGATATCATGTCTGATACGCCCACTAATTTGGATAGTGGTGTTATGGCTCACACGATCAATATTGTGGCCACTAATCAAGATAATGTTGATATGTTCAACAAGCCTTCAATGTTCACAAATGAAAGCGCTAGTTTTGGTACTCAAGACACACCTTATGTGAGCACTGACGATGAATGGATAAATAGGATAAATTTATGTGAATTCAACGACGATGACTTTCCATTTTATATTCCTAGCACCTTGGATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGATGGATATGAGAATCTAGTGGATTTCAAAATTGATCTACAATGGATTCATCAAGCGTGTTGTGGACCATATGTCCAATATACTGCTAAACAAGATAATGTTGATACACTTGATACGCCTGTAATGATCATAAATGAAAGCAGTTTGAGTATTGAATACGTACTTTGCATGCTCATTGACAACGAACGAAAAGTTCATAGTCTAAATTTAGGAGGCTTGAATGACTGTGAGCAAAGATTAATGGCATATAAGACGATCTGCACCTTAGATATCATGTCTGATACGCCCACTAATTTGGATAGTGGTGTTATGGCTCACACGATCAATATTGTGGCCACTAATCAAGATAATGTTGATATGTTCAACAAGCCTTCAATGTTCACAAATGAAAGCGCTAGTTTTGGTACTCAAGACACACCTTATGTGAGCACTGACGATGAATGGATAAATAGGATAAATTTATGTGAATTCAACGACGATGACTTTCCATTTTATATTCCTAGCACCTTGGATTAG

Protein sequence

MDGYENLVDFKIDLQWIHQACCGPYVQYTAKQDNVDTLDTPVMIINESSLSIEYVLCMLIDNERKVHSLNLGGLNDCEQRLMAYKTICTLDIMSDTPTNLDSGVMAHTINIVATNQDNVDMFNKPSMFTNESASFGTQDTPYVSTDDEWINRINLCEFNDDDFPFYIPSTLD*
Homology
[Close]
BLAST of Chy10G173030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TC54 (NAC domain-containing protein 83-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold477G00130 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 2.8e-06
Identity = 44/100 (44.00%), Postives = 52/100 (52.00%), Query Frame = 0 

Query: 74  LNDCEQRLMAYKTICTLDIMSDTPTNLDSGVMAHTINIVATNQDNVDMFNKPSMFTN-ES 133
           L   E RLM  +TI   +I+ D  T  D  V+ H  N++A NQDNV     P M TN ES
Sbjct: 214 LQPIEPRLMIRETIYNSNIIPDKTTCEDISVVDHVPNMIA-NQDNV---YTPLMATNIES 273

Query: 134 ASFGTQDTPYVSTDDEWINRINLCEFNDDDFPFYIPSTLD 173
            + GT        DDEW+N INL E ND  FPFY     D
Sbjct: 274 NNLGTGLNLGDLNDDEWMNCINLDELNDVHFPFYTEGNFD 309

[Close]
BLAST of Chy10G173030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CL63 (NAC domain-containing protein 83-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold1017G00650 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 2.8e-06
Identity = 44/100 (44.00%), Postives = 52/100 (52.00%), Query Frame = 0 

Query: 74  LNDCEQRLMAYKTICTLDIMSDTPTNLDSGVMAHTINIVATNQDNVDMFNKPSMFTN-ES 133
           L   E RLM  +TI   +I+ D  T  D  V+ H  N++A NQDNV     P M TN ES
Sbjct: 214 LQPIEPRLMIRETIYNSNIIPDKTTCEDISVVDHVPNMIA-NQDNV---YTPLMATNIES 273

Query: 134 ASFGTQDTPYVSTDDEWINRINLCEFNDDDFPFYIPSTLD 173
            + GT        DDEW+N INL E ND  FPFY     D
Sbjct: 274 NNLGTGLNLGNLNDDEWMNCINLDELNDVHFPFYTEGNFD 309

[Close]
BLAST of Chy10G173030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CPA2 (NAC domain-containing protein 83-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503286 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 2.8e-06
Identity = 44/100 (44.00%), Postives = 52/100 (52.00%), Query Frame = 0 

Query: 74  LNDCEQRLMAYKTICTLDIMSDTPTNLDSGVMAHTINIVATNQDNVDMFNKPSMFTN-ES 133
           L   E RLM  +TI   +I+ D  T  D  V+ H  N++A NQDNV     P M TN ES
Sbjct: 214 LQPIEPRLMIRETIYNSNIIPDKTTCEDISVVDHVPNMIA-NQDNV---YTPLMATNIES 273

Query: 134 ASFGTQDTPYVSTDDEWINRINLCEFNDDDFPFYIPSTLD 173
            + GT        DDEW+N INL E ND  FPFY     D
Sbjct: 274 NNLGTGLNLGDLNDDEWMNCINLDELNDVHFPFYTEGNFD 309

[Close]
BLAST of Chy10G173030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B941 (protein SOMBRERO-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487114 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 2.4e-05
Identity = 43/134 (32.09%), Postives = 58/134 (43.28%), Query Frame = 0 

Query: 54  YVLCMLIDNERKVHSLNL---------------GGLNDCEQRLMAYKTICTLDIMSDTPT 113
           YVLC +  NER    L +                 L      ++  +TI   +IM D  T
Sbjct: 163 YVLCRIRKNERAKRKLKVQRELKQPNKKRIMAPDQLQPINHGVITRETIYNSNIMHDMTT 222

Query: 114 NLDSGVMAHTINIVATNQDNVDMFNKPSMFTNESASFGTQDTPYVSTDDEWINRINLCEF 173
           + D+ V+ H  N + TNQDN          TN S S G        T+DEW + INL E 
Sbjct: 223 HQDTSVVDHVTN-MTTNQDN----------TNASTSLGALCLTCTPTNDEWKDIINLDEL 282

[Close]
BLAST of Chy10G173030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BNU6 (Protein SOMBRERO-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold1545G00160 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 55.5 bits (132), Expect = 2.6e-04
Identity = 41/134 (30.60%), Postives = 59/134 (44.03%), Query Frame = 0 

Query: 54  YVLCMLIDNERKVHSLNL---------------GGLNDCEQRLMAYKTICTLDIMSDTPT 113
           YVLC +  NER    L +                 L      ++  +TI   +IM D  T
Sbjct: 163 YVLCRIRKNERAKRKLKVQRELKQPNKKRIMAPDQLQPINHGVITRETIYNSNIMHDMTT 222

Query: 114 NLDSGVMAHTINIVATNQDNVDMFNKPSMFTNESASFGTQDTPYVSTDDEWINRINLCEF 173
           + D+ V+ H  N + TNQ+N          TN S S G      + T+DEW + INL E 
Sbjct: 223 HQDTSVVDHVTN-MTTNQNN----------TNASTSLGALCLTCMPTNDEWKDIINLDEL 282

[Close]
BLAST of Chy10G173030 vs. NCBI nr
Match: XP_008465646.1 (PREDICTED: NAC domain-containing protein 83-like [Cucumis melo] >KAA0041044.1 NAC domain-containing protein 83-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 1.81e-07
Identity = 44/100 (44.00%), Postives = 52/100 (52.00%), Query Frame = 0 

Query: 74  LNDCEQRLMAYKTICTLDIMSDTPTNLDSGVMAHTINIVATNQDNVDMFNKPSMFTN-ES 133
           L   E RLM  +TI   +I+ D  T  D  V+ H  N++A NQDNV     P M TN ES
Sbjct: 214 LQPIEPRLMIRETIYNSNIIPDKTTCEDISVVDHVPNMIA-NQDNV---YTPLMATNIES 273

Query: 134 ASFGTQDTPYVSTDDEWINRINLCEFNDDDFPFYIPSTLD 172
            + GT        DDEW+N INL E ND  FPFY     D
Sbjct: 274 NNLGTGLNLGDLNDDEWMNCINLDELNDVHFPFYTEGNFD 309

[Close]
BLAST of Chy10G173030 vs. NCBI nr
Match: TYK12052.1 (NAC domain-containing protein 83-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 1.81e-07
Identity = 44/100 (44.00%), Postives = 52/100 (52.00%), Query Frame = 0 

Query: 74  LNDCEQRLMAYKTICTLDIMSDTPTNLDSGVMAHTINIVATNQDNVDMFNKPSMFTN-ES 133
           L   E RLM  +TI   +I+ D  T  D  V+ H  N++A NQDNV     P M TN ES
Sbjct: 214 LQPIEPRLMIRETIYNSNIIPDKTTCEDISVVDHVPNMIA-NQDNV---YTPLMATNIES 273

Query: 134 ASFGTQDTPYVSTDDEWINRINLCEFNDDDFPFYIPSTLD 172
            + GT        DDEW+N INL E ND  FPFY     D
Sbjct: 274 NNLGTGLNLGNLNDDEWMNCINLDELNDVHFPFYTEGNFD 309

[Close]
BLAST of Chy10G173030 vs. NCBI nr
Match: XP_008443554.1 (PREDICTED: protein SOMBRERO-like [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 58.5 bits (140), Expect = 1.39e-06
Identity = 43/134 (32.09%), Postives = 58/134 (43.28%), Query Frame = 0 

Query: 54  YVLCMLIDNERKVHSLNL---------------GGLNDCEQRLMAYKTICTLDIMSDTPT 113
           YVLC +  NER    L +                 L      ++  +TI   +IM D  T
Sbjct: 163 YVLCRIRKNERAKRKLKVQRELKQPNKKRIMAPDQLQPINHGVITRETIYNSNIMHDMTT 222

Query: 114 NLDSGVMAHTINIVATNQDNVDMFNKPSMFTNESASFGTQDTPYVSTDDEWINRINLCEF 172
           + D+ V+ H  N+  TNQDN          TN S S G        T+DEW + INL E 
Sbjct: 223 HQDTSVVDHVTNMT-TNQDN----------TNASTSLGALCLTCTPTNDEWKDIINLDEL 282

[Close]
BLAST of Chy10G173030 vs. NCBI nr
Match: KAA0053644.1 (protein SOMBRERO-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYK00815.1 protein SOMBRERO-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 55.1 bits (131), Expect = 2.30e-05
Identity = 41/134 (30.60%), Postives = 59/134 (44.03%), Query Frame = 0 

Query: 54  YVLCMLIDNERKVHSLNL---------------GGLNDCEQRLMAYKTICTLDIMSDTPT 113
           YVLC +  NER    L +                 L      ++  +TI   +IM D  T
Sbjct: 163 YVLCRIRKNERAKRKLKVQRELKQPNKKRIMAPDQLQPINHGVITRETIYNSNIMHDMTT 222

Query: 114 NLDSGVMAHTINIVATNQDNVDMFNKPSMFTNESASFGTQDTPYVSTDDEWINRINLCEF 172
           + D+ V+ H  N+  TNQ+N          TN S S G      + T+DEW + INL E 
Sbjct: 223 HQDTSVVDHVTNMT-TNQNN----------TNASTSLGALCLTCMPTNDEWKDIINLDEL 282

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy10G173030 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy10G173030 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5A7TC542.8e-0644.00NAC domain-containing protein 83-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=... [more]
A0A5D3CL632.8e-0644.00NAC domain-containing protein 83-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=... [more]
A0A1S3CPA22.8e-0644.00NAC domain-containing protein 83-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503286 PE... [more]
A0A1S3B9412.4e-0532.09protein SOMBRERO-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487114 PE=4 SV=1[more]
A0A5D3BNU62.6e-0430.60Protein SOMBRERO-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold15... [more]
BLAST of Chy10G173030 vs. NCBI nr
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XP_008465646.11.81e-0744.00PREDICTED: NAC domain-containing protein 83-like [Cucumis melo] >KAA0041044.1 NA... [more]
TYK12052.11.81e-0744.00NAC domain-containing protein 83-like [Cucumis melo var. makuwa][more]
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KAA0053644.12.30e-0530.60protein SOMBRERO-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYK00815.1 protein SOMBRERO-li... [more]
BLAST of Chy10G173030 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy10G173030.1Chy10G173030.1mRNA