
CcUC10G205060 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTGGTCTCTGATGTGGTGATCCAGATTCTATTGAAGCTTCCTCCAGAGTCTCTACTTCGATTCAAGTCTGTTTGCAAATCATGGTATGCTCTAATCAACGATCCTAAATTTGTGACGAAACATCTCTCAAATTCTCTTCCATATAAACATGTTCTCCTTAAGCGTATTGTCGCAACCAACTCTGAAAAATATGAATATGCGTTGTCCATCCTCAAATTTTCTCTTGATCGATCTGTGTCTGTTCTCGACGTACATTTGCCACTGTATGAGGATCATCCAGCTTTAGCTATTTGTGGTCAATCTCACAGCTTAGTTTGTCTAAGTGATCTTTGCGATATTTTCCTTTGCAATCCGATGACTAGACAATTCCGTAAACTTCCACCCTCTTTTCTTATAGTGAGAGGTCATGATCCCGATGATTATTATGCACATGGGATTGCTGTCGGATTCGGGTATGATGCAAAATCTAGGAATTTCAAAGTGGTTAGAGTTGTGAATCCTTAGGTAGGAGTGGTGTCTCATCCTTCTAGAGTGGAAATTTATGATTTGAGCAAAGATAGATGGAGAGAAATTGAAACCCCTGTTTATGGCAATATATCTATCACACCTTCGTTTGAGATGTATCATGAAGGAACATTTTACTGGTGGGAAAAAATTCAATCATTTACTCAAAATACTGAACATATATTAACATTCGACATGAGCGAAGAAGTTTTTGGCAAAATTTCAGTCCCAGAGAGTTTCGATAGGCAAGGGAATTTTAGAAGTTTAATGGTTTTCAATGGATCCATCGTTCTTTTTTCTTATCCATATGCTGGAGAAATTTTTGACATTTGGGAGATGGAGAAGGATGAATTTGCAGTTGTTTCGTGGTCAAAGCTATTGACCATTGGCCCTCTTTGTGGAATTGAATTTCCATTGTTGTTTGTAAACTCCGATGAACTTTTAATGGAGTCCAAAGAAGGACAGGTGGTTTTGTACAGTATTAAAGCTCAACAGGTCAAAGAGCTCCCAATAAAAGGGGAAAACCCGCATGGATGGAGAACCAATCGGTTTGAAGCTACTTTTTTCATTAAGAGTTTGCTACCCGTGGAAGGAAGAAATAATATCAGTTATGAGTTTTAGTATTTTTCAACTAGTTTAAGTAAAAGTTTAGATGTAACAAATGTCGCTTATGTTTTTTAGAGATGATTTAACGTAATTTTCGTACTTTGTTCCTCCATCTCTATGGAAAGGGAAATGGTTATTTTCCATTTTTCCATTTAAGATGACTTCCCGATTAATTATGGCGATATTTGTTTCATGGAAATGATATGATAGAATATTATATTGTTTGTGCAAACTAGGTAAGTGAATTTGAATTTGATTTTTTTTTTTCTTTTCGTCATTTTGTAATCACATAAGGTTTAACCATATATATCTCCTTGTACCAATTTCACCACTTATTTTTATCATCTTATTCCTTCAATCCAAACAACCTTAAACCTTTAAATTGAATTTTGAAAATGGAAGAATTTGATGTGAAAAAATAAATTATATTTGTAATTATTTTCAACCGTTTTTCTATTTCTAAAAACATAACTAATTTTTATAATAATGTAAATGGATATAATATTAATGCTTACAAAAAAAAAAAAAACATATAAACATATAATATTAATGCATATATGGCACTTGTTGGGCTTAAACCCAAAACTTTTAGGCTACCCAAAAATATGATATCCATAGTAGGAGTCAAATCATTGTTGCCAGAATTGGTGACCACTAATAATCATCCTAAAAAGATGATGTCTCTAGCAAGAGTCAGATCTCTATTGCAAATTATAGTTGATGATAAAGTCAGAGCACAAGTTACTCGTAGTTCAACTCTAGAAAAAAAAATAGAAGCAAGTTATTAAAGAAAAAGTATGAAAAAAAAAGTGATGCAACAAAGAAGGAAATAAATAGGGAGAGAGAAATTCTTTATTAAAAAAAAAAAAAGAAATTCTAAAAAATTGCCAAAAAAAAGTTAAAGGATAAGAAGAAAATATAGCGAATTAAAATAAAATAAAATAAACTAATCTCAAGATCAAGTTTTGTTCTTGGGAGATTTTTTTATTAAAAAAAACCAGAAAGAAAAAATAGAAGAAAACAAAGTATGGAAAAAGAAGAAAGGTAAAAATGGAGGCAATTAAAGTTTTTAGAGAAGAAAGTACGAAAAACATCTTAAATTATAATTCTAAAAAGAAAAAAAACTTAAATTGTGAAATAGAGAAAAAGAAAAAAAAGAAAAAAGAAAGTTGAAATTGTTATAGTGTTATTTTGGAAAAATAAATAAACAAAATATCAAAACTAAAGATTTTGCTATATATGCAAAATTTGAAATGTTGAAGACTTTCAAAATCATATTCTTAAATTGCTACCTATTGCAAATTTTTTAAAAAAAGACCCCGAGCACGACGTTAAGGCGAACGACAAGGAAGCACGGGTGGGGACACGTGGCAACCATCGGAGGCACCGGATCAACGGTCAAATTTGAGGGTGAAATAAAAGGGGGAGAGAGAGAGGGAGACTTATTCCCATGACATGGCCTACTTTCCTATTAATTAGGGAAGTGGCCCAGTCATGGAAGGAGTGGCTGATTTTCAAGGAAGGTGGGCATTTGCTTACTCATCAAGGCCACTCCCATTTGCTAAATATAGCCTTCACGATCTCCTCTCCCCTCCTATATAAGGTGAACCTTGGGAGTTGTTCAAGGGCACCGAAAAGTAGCCAACTCATCTCACGTTGCCAAGGATTTGGAGTGAGATCTTCTCTTTGTGTAAAGTGTTTGGTTGAGTGTCTCTTGTCAAAACGAGCTTAAAGCTCCACCCTTAGTATTTAGTGGTTTTGACATAATGAAGAGTTACATTTCCACTTAAGTACTTGTGTGTCCTCCCTTACCCATTGTAAGCACTGACTTGCAATGCCAAGCATTGAATACTACATCTGTAACTATGCGTTGCAAGAAGGAAGAGTAGTCGAGAAGCAGCTAAGTAAGGGGTGAAATTTCGTCTAAGTAGTGGCCAATACCATGCGTTGATGAACGAAGTGGAAGTCGAATTACATTGAGAAACCATGCGTTGTTGAGTGAATCGCAAAGGGGTTGTAAGTGAAGTGTCGTCACCTCGAGAGATAAGAGTTCATTGGCGGGGAGGAAGTTCGCTTGAACTATGCGTTGAAGTTATTCTGCGTCCAAAACAGTGATCTTGACGTGATGAAATTAGTGGCAGGAGATTATGTTGTATGTGTTGGCAGCCGAAGGCGTCGAGAGCACCATGCGCTGAGAATGGTGAATTGCTGAAGGCGCTGAAGGAGAACTCAGACATAAGCGCTATGCATCGAAGAGATGGTCAGCGCTAGCATACGGATAAGTAAGTCGGCATTATCATCTCGGTACTTGTGATGGATAAGTCGGCAGTATATATATAGGTAAGTTTAATCATTTTCAAACATTTCGAGAGCCTAAGTCGGTTCCATCTTTCAGAGGAAACACAAGAGAAGAGAGAGGAAGGAGTTCTTATGGTTTTCGGGCGAAAATCCACTCGTTTTGGTGTAGAAATCAGAGCTGGAATAGAAGACTGATTTCAGACGCACAGATTGAGCAGTGGATGATGTTTTGAGAAGAACGACTCGAGGAAACCGAGATTTGAGCTGAAATTTGGAGGTTAGTAAGTTAACCCAATTTCTAACAAGTCTTGTGAAGGATGGTTAAGCTAAAAGTGAAGTTAATTACGTGAATATTTAGGTAAAAGCAGCAGCTGCAGAACTGCTGTGCAATCTAGGGCAACGCGGAGTGATTTTGACATAACCAGAGAACGATAAAGAGTTAGGCCTTGAAATTTTGAGGTAAGCTGTGGAACTCAATTCCTTACAAGTTTGTCGAAGGGAAGAAGTCTTAATATGGACTTGAAATGCGTTTTTAGCAGGGAAGAAGCAGAGGTATCAAGCTGTAACAATCAGCTTTGTTAAAAAAGAGATTAAGCTCAAACATCGGATTATCAGCAAGAATGAGCTACACCCAAAGTATTCTCTGAATTGGAGTTTAACAGAAGGGTAAGGAGTGATTAGTAGTAATAGCCTTAGTGCTTAAAGCTTGAGAATGAGCTAATGAAGTTGAATCACATGTTGAGCTCTAAATATTAAGTATATGATAAGTTGTTTATGTTCATGAATGGAAAGGAAATATAACAAAGGAAAAATTGTTATTTCAGGCCAAGAGGAGATAGGGAAAACGTATAATCCCCTTAGAGCCTAAGAAAAGTTGTGAGTGACACTTCCTTTATTTTAAAATGATTTTATTGAACATGAAAGTTCGGTTTTCCAATGAAATGTGAACTTGTGATTAAATGATTTATGAAGCATCTTTATGTTCTTAAAGTTATTGAAAAGCATGTTTATGAAATGCTATTGATATAATAATTGTCCTGTATTCTTATGAACGTTTTGTATACGAACAATTTGTATAAATGCTATTTTCTTATAAAGGAAATGTTTAAGAGGAGGCTCAATGCTAGTAAAGCATGTGAGTTTCCCCGGGACCCAACATGCGGGCAACCCGTCTATAAAATGTTTTAGAGGCGACTCAGTGCTGATGGACTCGAGAAGGCACGTGAGTTTCCCCGGGACTCGGTACTGAGGGACACGGAGAAGGTACTTGGGCAACCCGTCCTGTTCCTATGTGCACATAGAGGTGTATATGCTGATGTGTTGAGTCTTGCTCCGCATCGAGCCTTATATGTTTTCGACGTTGAGGTGTTGAGTTTTGCTCCACTTCAACTAAAGGAAAAGTATTGCAACTAAAATGTTCTCTGATGATTTACTGAAAACCATGTATGAAATAATAAGGGCAATTATAATTGTTTAACTAAGGTATTTGCAATGATTTCGTGTTTATACTTGATGCTGAAATTAGTTTTATTCTTAATGTTTCCGAACTAAAATGATTTGTTAAAACTCGTCACTCACCGGGC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Match: TYK25090.1 (S-RNase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 180.6 bits (457), Expect = 2.7e-41 Identity = 97/196 (49.49%), Postives = 112/196 (57.14%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G205060 vs. NCBI nr
Match: KAE8651058.1 (hypothetical protein Csa_002465 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 170.6 bits (431), Expect = 2.8e-38 Identity = 91/196 (46.43%), Postives = 114/196 (58.16%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G205060 vs. NCBI nr
Match: KAE8651058.1 (hypothetical protein Csa_002465 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 117.5 bits (293), Expect = 2.8e-22 Identity = 61/100 (61.00%), Postives = 78/100 (78.00%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 170.6 bits (431), Expect = 2.8e-38 Identity = 91/196 (46.43%), Postives = 114/196 (58.16%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G205060 vs. NCBI nr
Match: XP_031738547.1 (ribonuclease MC-like [Cucumis sativus] >XP_031739193.1 ribonuclease MC-like [Cucumis sativus] >KAE8651059.1 hypothetical protein Csa_001394 [Cucumis sativus] >KAE8651065.1 hypothetical protein Csa_001488 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 162.9 bits (411), Expect = 5.8e-36 Identity = 88/196 (44.90%), Postives = 113/196 (57.65%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G205060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P23540 (Ribonuclease MC OS=Momordica charantia OX=3673 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 87.8 bits (216), Expect = 3.1e-16 Identity = 51/181 (28.18%), Postives = 75/181 (41.44%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G205060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P80196 (Intracellular ribonuclease LX OS=Solanum lycopersicum OX=4081 GN=RNALX PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 87.0 bits (214), Expect = 5.3e-16 Identity = 60/197 (30.46%), Postives = 84/197 (42.64%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G205060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P80022 (Extracellular ribonuclease LE OS=Solanum lycopersicum OX=4081 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 84.0 bits (206), Expect = 4.5e-15 Identity = 57/192 (29.69%), Postives = 90/192 (46.88%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G205060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P42813 (Ribonuclease 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RNS1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 83.2 bits (204), Expect = 7.6e-15 Identity = 55/194 (28.35%), Postives = 87/194 (44.85%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G205060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O80324 (Ribonuclease S-6 OS=Pyrus pyrifolia OX=3767 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 75.1 bits (183), Expect = 2.1e-12 Identity = 52/189 (27.51%), Postives = 81/189 (42.86%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G205060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LAB0 (Ribonuclease T(2) OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G736680 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 182.6 bits (462), Expect = 3.4e-42 Identity = 95/195 (48.72%), Postives = 115/195 (58.97%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G205060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DP91 (Ribonuclease T(2) OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold352G002140 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 180.6 bits (457), Expect = 1.3e-41 Identity = 97/196 (49.49%), Postives = 112/196 (57.14%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G205060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LAN6 (Ribonuclease T(2) OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G745530 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 170.6 bits (431), Expect = 1.3e-38 Identity = 91/196 (46.43%), Postives = 114/196 (58.16%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G205060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EXD5 (Ribonuclease T(2) OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439251 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 157.5 bits (397), Expect = 1.2e-34 Identity = 81/187 (43.32%), Postives = 101/187 (54.01%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G205060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IAR7 (Ribonuclease T(2) OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472844 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 152.5 bits (384), Expect = 3.8e-33 Identity = 79/187 (42.25%), Postives = 100/187 (53.48%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G205060 vs. TAIR 10
Match: AT2G02990.1 (ribonuclease 1 ) HSP 1 Score: 83.2 bits (204), Expect = 5.4e-16 Identity = 55/194 (28.35%), Postives = 87/194 (44.85%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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