
CcUC10G196440 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAATTCCCAAATCGGTTTCTGGGCAGCAGATCGAAGGCCTTAAGCATTCAGATTGCTGAATCGGCGACATAGATCCCCTCCGATCTGCTTTCAATCCGCTCCTCCAATGTTCCTCATTGACTGGTTCTATGGCGTCTTGGCTTCCCTCGGTCTCTGGCAGAAGGAGGCCAAGATCCTCTTTCTCGGCCTCGATAATGCCGGGAAAACAACCCTCCTCCATATGTTGAAAGACGAGGTTTTATTCATTTCTTCCCTTTCCCTTCTTCTATTTTTCTCTTTTCTCGATCTATGTCTTTTCTTTTCTTAAATATGTCCCTGCCTTTGTTATTCTTCTTTCTCTCTTTTAGAGGTTAGTTCAGCACCAGCCTACCCAGTACCCCACCTCCGAGGAGTTGAGTATTGGAAAAATCAAATTCAAGGCCTTTGATTTGGGTGGACATCAAATTGCTCGTAGAGTCTGGAAGGATTATTATGCCAAGGTAACCAACAACACTGTTCTTCTCAAACTCAAGCATTTTGTATTTCTGTCTTTTTTTTGGGTATTAGGCTAAGAACGACCTAGTACTTGTACTCTTTACCAATTGTCTTATGTTTTTAGAATACTAGTATGTGTGATTCCCAACCGATAGCTAGAAATCCTTGTGTATAGTTTCATGAACTTAGTATTTGATATCTTTTGTACAACAGTATTTCTTTATTTTTGTCCAAATCTACAAGCTGATATAGTATGAGGTTATTTTGTAAAGTATCGTGGACTTGGGTTTCCATCTAACATACATACTTACATAATGTTAATTTATATGTATCTCCCTCTGCTCTTCCTCTGGGTTCCTTCTTTATTTTATTTATGTTGTAAAAAACCCAGATTCCTTCTTCAGCTGCTCATTACTCACTCAGTTTTGGATCTCTTGCACCTGTTGTTCATCTTAATTCTTACTTATTGTTGTGTGATACTCACCTAATCAGTTATTTGTATCAGTCTCTTTTTATCATAATTTGCTCATCTGCCATTGACTTGTGAAGAATACACATCTCATAGTAACTGCTTTGGAGGGGAGTGATATTTCCTGTAGTTTAGTGTAAGCATTTAAAAGAAATTTCCTGAACTCTGGTGCTGAATCAATTTTAACAATGTATCTTAGCCCCGAACCTTAGAAAAAAAGTTAGCTAAGTTCTTCAAGCTATAGTCAGCCTTGTTGACTGTCCTTCAAGCTATAGTCAGCCTTGTTGATTATCTGTTTTCTTTATCTTTTAAGCAAGAAAACATTTTTTCAGTGTCGGTTTTATAGCCTGGTGTAGTGTTTGATTTTCTCCAGCTTGTGCCATAATGGATTTCCATGGATCTTGGTCATTCCTATGAATTTGGGTAATTACATTGTGTTTGCAGTGTGATATGCTATATCTGGTGGATGGTTTTGCCTATATTTTCAGCTTTCTCCAAATACTATGGTCCTTAGACATGGCTTCCAATTTGAAATGAAAATTGATATTACAGGTAGATGCTGTGGTGTACTTGGTCGATGCCTTTGACAAAGAGAGGTTTGCAGAATCGAAAAAGGAGCTCGATGCTCTTCTCTCTGATGAAGCTCTTGCTAATGTGCCTTTCCTTATTTTGGGCAATAAGATTGACATTCCATATGCTGCCTCAGAGGACGAGTTGCGCTACCACCTTGGTTTGACCAACTTCACCACCGGCAAGGGAAAAGTTAATCTGGCTGATTCGAACGTACGTCCATTAGAGGTATTCATGTGCAGTATTGTTCGCAAAATGGGCTACGGTGATGGTTTCAAGTGGATGTCTCAATATATCAAGTAGGTGAGATCGATAGATATGTCATATGGTTTCATGAATTGATGAAATCCCACCGTCTGAAGCCCCTCCAAGTTCTCAACGTACTGATTGCAGTTTGATATTCATTGTGTTAGAAAGAGAGGAGCTTTGAGTTGAACTTTTTTTGCTTTCAGATGATGTGTGGAAGGAGGTACTAATGCTTACTATGTAAAATTCACTTCCTTACCTCAAGTTTATTATTTTTGACATTCTTATCTCTTGTTATTCATCTGACTGGTTAGGATGTGATTTTCTAATTGTTGTTTATAAACACCAGTTGTAGGTGGAAGGTCTTAGAAAGTAAAAACTTGGACTTGAGGGCATAGATGAAAATTAGATTAAAAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGTACTGAATAAGAAATCATAGCCGATTGGAAGACTGTTTCTAAAACCTTTTTTTTTTGTTTGTTTACTTTTCCATAATGTTTTCAATTTAACATTGAAGATATCAGTTTGCTTGGATATGGAGATTTGTTTGAATATTAAAAAGTTGTTTGATTGGGATGGTAGATTTAAAGTTAAGAAATCAATAAAGATTTACTTACTCTAGAATCTTGACTGTAAGTATCAAATCTATGTCTTATATACCCTTTTTTTTTTTTTTTTCAATCTATGTTTTATATACTTGTGCTTATAAAAACCTGCTTGTTATATCCACCAATCAAATATAAGCTATGATTTATCTACAAGCTTGTGTACAATCCGAATGCATGTTAGACAAATTGAAGCATTCCAATTCCAAATCTTATAAATTGAGATTTTCTTAAGAAAAAGAAATGAGATTTCTAACGTTCAAAATTAATATTTGAAAGTAAATTTATTCAAAGACATGTTTAGAAAAAGCAATGTGAAAAATTAAAACGTGTGAAGAATAAAGAGTGGTTTGACCAAATTAATTTAATAGTAGTACAATTATTTTAATATTTGTTTTGGGAATGTAAAAGCTATGTATTTATATTTTACCTAGTAAATCGAAGAAAATAAGAAAGCTTTTGAATTTTTTTTTTCTCTAATGAGAAAAAAAGTCAACAGTGTGAAATTGTGAATATATTTTGGAAAAATACATTGGTGAACATCTTACTTCCGTCTATGTCTCATCATAATTTGTTTTAAAATATAATTGTTTTAATATTTCCTTTGTAATTGAAGATGATCTCTCAACTCAAGTATTACTCTATATTTTGTATATAGGTTAAAATATCATCTAGGTTCTTATATTTTGAAGTTTGTTCAATTTTAGTCTATATACTTTTAAATGTCTTAGTTCTGGCACTATCAATCAATCTAAAATTTAGGCCCTCAAGTTAATTTTGATCTTAATTAGTTTTAAAAAAAATAATTTTAATGCAAGAAAACACCATATGTGAATATGTTTCTAAAAATTGTAATAAAAATGCTAATAGATATTAAAAGGTTTTTGAAAAGATCTACAATAAACTAAGGAAAATTGCACAACCCAAAAACCAAAAACTTTTCTATGGATGACCCACTCCCAAAAACTTTATCATGAGTGGCCTTTTGATCACGTGAAATACCAATTTTACTCCCAAAAATTAAAACAGCCGAAAACGCGCGCCTCTTCATTTTTCTTTAAAAGTCGTCGCCCCTATCATTGAAAACTTTTTCAGACTTTTGCCTTATCTCTCAACCTTTCGCTTTCTCTCAATGTTTCGCTTTCTGCGAATCCTTCGTCTTTGTCTTCTTCTTCCTCTTCCTCCTCGTCCTCTACTTCATCTGAAAGGTATGTGACGCCCATTACGTTCAATATAGGTTATTGCTCAACCCAAGTTAAACGATTGTCCATACTAGGTTTAACGATTGCCCATACTAGGTTTAACGATCATGCATACCAGGTTTAACGATCACATAACATAGCTTAAGCGATCGCTCAACCTAGGTGAAATGATCGCCCAACCTAGGTTAAACGATTAAGCGATCGTTTAGGTTACTACGTGATTGTTTAGTGACGTAAGGGATCGCTTATTTCACTAAGTGATCGTTTATTATGCACTAAGCGATCGCGTAGTGAACTAAACGATCGCTTAGTAACCTAAACGATCGCTTAGTTGTTTTAAGCGATTACTTAACATATTTTAAGCGATAGTTTAGTATTTACTAAGCAATCGTTTAAGAGTTTTTAACTAGTTGATAATGGTTGTATATGAGGATAAGTATTTTCCTGCCACCATCTCCTACATGGTCCACAAAACCAGTTCTTTGATCAAGAGCAAGCTGACAACTGATCAGATGGACATGTTTAGGAAAGCCTCATTTGGTCCACTGTTGGAGGTGGAACTGGTGTTCAATGGGCAGCTATTCCACCATTTCTTGCTACGAGAGGTGAGGGAGGAGAGGGCGACTCAATCAACTTCAATATACTGAGGAAGAAGGTTACCTTCATCCAAGAAGACTTTAATCTCATAACTGGATTGTGGTCGATTGAAGAAATGGTCAAAAGAGATACATGCGGCGAGAGGCTGCGGTGTCTTATCCTTGAACCTAAGGATCCGAACGATAAGAAGGAAAAGCTGGTTAAGGATGTTGAGGCTGTCTTCAAGAAGATTCGATTTACGAATGATCAAGACTCCGTGAAGGTAGCCTTCGCGTTGTATATCGAAATGGTTATGATGGGCAAAGACAAGAAAACCCAATTCGACATGAAGACACTTGGGATTGTCGATGACCTTGAAGTCTTCGCAAACTACGACTGGTCATCTGTCTTCTTCAACCGACTATTGAATAGCATGAAGACTATCATGTGTGGGAAGAAAGAGGCGCATGATATCAAGAAGATAGACAACCCCAAGCACACCACATACTACTGCATTAAAAGATATGTGCTTGCATTCCAAGTACGATTTAGCCTAATTTATACTTTGATAACTTGTAGAAATACAAGTTATTATAGTCATTATTTGATTTAATTAGAGTAACTTTGGAGTTAAACGCATGATTTTGGTAGTTAAATGATGAAAAATGTATCAACATGAGTTGGCACTACTTGCAAAAGAAAAATGCCTGAAAAACGATAAGCTTCTGTTCCTAACGCAGGGTTAAGAAGAAAAGAAGTGGGAACAACCAAGTACGAAGAGATGAAGCTGCTGCGAGAACATGCGTCGAGCCTATGC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MFLIDWFYGVLASLGLWQKEAKILFLGLDNAGKTTLLHMLKDERLVQHQPTQYPTSEELSIGKIKFKAFDLGGHQIARRVWKDYYAKVDAVVYLVDAFDKERFAESKKELDALLSDEALANVPFLILGNKIDIPYAASEDELRYHLGLTNFTTGKGKVNLADSNVRPLEVFMCSIVRKMGYGDGFKWMSQYIKAPFACDPKNAAASDYPFCRRSLAVAERVKDLIGRLTLEEKVKLLVSNAGAVPRLGIKAYQWWSEALHGVSNVGPGTTFGGEFPAATSFPQVITTAAAFNASLWEAMGQVVSEEARAMYNGGVAGLTYWSPNVNIFRDPRWGRGQETPGEDPVLAGMYAVNYVRGLQGSDGNRLKVAACCKHFTAYDLDNWNGVDRFHFNAQVSKQDIEDTFDVPFRMCVKEGKVSSVMCSYNQLNGVPTCADPNLLANTLRSQWRLDGYIVSDCDSVGVFYDTQHYTSTPEEAAAMAIKAGLDLDCGRFLETHTENAVKRGLLSEAHINGALSNTLSVQMRLGMFDGDFKTQPYGHLGSKHVCSAGNRQLAVDAARQGIVLLENRRRSLPLSTRRHRTVAVIGPNSNVTLTMIGNYAGIACEYISPLQGIGRYTKAIHQQGCEGVSCRTDKFFSGAIEAAREADAVVLLMGLDQSIEAEFRDRAGLLLPGLQQDLVSKVASAAKGPIVLVLMSGGPIDVSFAKDHPKISGIIWAGYPGQAGGLAIADVLFGQTNPDYVSKLPMTTMGLRPSPSYPGRTYRFYKGPVVYPFGHGLSYTTFTHKILNAPSALIVPVSGHRRRHNATDFSGKAVRVTHTKCNRLSLVIHVAVRNTGRRDGPHTLLVYSSPPMGLWAPQKQLVAFEKVHLEAQAQKEIQINIHVCKFLSVVDKFGIRRVPMGKHGIHVGDVRHSVSLQPETLGIIK Homology
BLAST of CcUC10G196440 vs. NCBI nr
Match: XP_038903591.1 (probable beta-D-xylosidase 2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1397.5 bits (3616), Expect = 0.0e+00 Identity = 681/744 (91.53%), Postives = 707/744 (95.03%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G196440 vs. NCBI nr
Match: XP_008454298.1 (PREDICTED: probable beta-D-xylosidase 2 isoform X1 [Cucumis melo] >KAA0044410.1 putative beta-D-xylosidase 2 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK29537.1 putative beta-D-xylosidase 2 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1342.0 bits (3472), Expect = 0.0e+00 Identity = 645/744 (86.69%), Postives = 688/744 (92.47%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G196440 vs. NCBI nr
Match: XP_004152230.1 (probable beta-D-xylosidase 2 [Cucumis sativus] >KGN52846.1 hypothetical protein Csa_014971 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1327.0 bits (3433), Expect = 0.0e+00 Identity = 639/745 (85.77%), Postives = 682/745 (91.54%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G196440 vs. NCBI nr
Match: XP_008454299.1 (PREDICTED: probable beta-D-xylosidase 2 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1265.0 bits (3272), Expect = 0.0e+00 Identity = 618/744 (83.06%), Postives = 661/744 (88.84%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G196440 vs. NCBI nr
Match: XP_042988362.1 (probable beta-D-xylosidase 2 [Carya illinoinensis] >KAG6647986.1 hypothetical protein CIPAW_07G116200 [Carya illinoinensis] >KAG6704094.1 hypothetical protein I3842_07G119100 [Carya illinoinensis]) HSP 1 Score: 1166.4 bits (3016), Expect = 0.0e+00 Identity = 554/752 (73.67%), Postives = 639/752 (84.97%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G196440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94KD8 (Probable beta-D-xylosidase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BXL2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1086.6 bits (2809), Expect = 0.0e+00 Identity = 520/743 (69.99%), Postives = 606/743 (81.56%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G196440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FGY1 (Beta-D-xylosidase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BXL1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1007.7 bits (2604), Expect = 8.7e-293 Identity = 484/749 (64.62%), Postives = 597/749 (79.71%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G196440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FLG1 (Beta-D-xylosidase 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BXL4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 835.5 bits (2157), Expect = 5.9e-241 Identity = 413/745 (55.44%), Postives = 529/745 (71.01%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G196440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A5JTQ3 (Beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase 2 OS=Medicago sativa subsp. varia OX=36902 GN=Xyl2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 832.4 bits (2149), Expect = 5.0e-240 Identity = 409/746 (54.83%), Postives = 529/746 (70.91%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G196440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A5JTQ2 (Beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase 1 (Fragment) OS=Medicago sativa subsp. varia OX=36902 GN=Xyl1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 825.9 bits (2132), Expect = 4.7e-238 Identity = 403/739 (54.53%), Postives = 525/739 (71.04%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G196440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3E0C2 (Putative beta-D-xylosidase 2 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold655G001400 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1342.0 bits (3472), Expect = 0.0e+00 Identity = 645/744 (86.69%), Postives = 688/744 (92.47%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G196440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BZ20 (probable beta-D-xylosidase 2 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494738 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1342.0 bits (3472), Expect = 0.0e+00 Identity = 645/744 (86.69%), Postives = 688/744 (92.47%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G196440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KYB5 (Fn3_like domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G003600 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1327.0 bits (3433), Expect = 0.0e+00 Identity = 639/745 (85.77%), Postives = 682/745 (91.54%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G196440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BZI0 (probable beta-D-xylosidase 2 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494738 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1265.0 bits (3272), Expect = 0.0e+00 Identity = 618/744 (83.06%), Postives = 661/744 (88.84%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G196440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: W9QMF9 (Putative beta-D-xylosidase 2 OS=Morus notabilis OX=981085 GN=L484_009762 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1163.7 bits (3009), Expect = 0.0e+00 Identity = 555/748 (74.20%), Postives = 639/748 (85.43%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G196440 vs. TAIR 10
Match: AT1G02640.1 (beta-xylosidase 2 ) HSP 1 Score: 1086.6 bits (2809), Expect = 0.0e+00 Identity = 520/743 (69.99%), Postives = 606/743 (81.56%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G196440 vs. TAIR 10
Match: AT5G49360.1 (beta-xylosidase 1 ) HSP 1 Score: 1007.7 bits (2604), Expect = 6.1e-294 Identity = 484/749 (64.62%), Postives = 597/749 (79.71%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G196440 vs. TAIR 10
Match: AT5G64570.1 (beta-D-xylosidase 4 ) HSP 1 Score: 835.5 bits (2157), Expect = 4.2e-242 Identity = 413/745 (55.44%), Postives = 529/745 (71.01%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G196440 vs. TAIR 10
Match: AT5G09730.1 (beta-xylosidase 3 ) HSP 1 Score: 801.2 bits (2068), Expect = 8.7e-232 Identity = 401/743 (53.97%), Postives = 516/743 (69.45%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G196440 vs. TAIR 10
Match: AT3G19620.1 (Glycosyl hydrolase family protein ) HSP 1 Score: 779.6 bits (2012), Expect = 2.7e-225 Identity = 385/738 (52.17%), Postives = 509/738 (68.97%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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