CcUC10G192540 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC10G192540
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionThioredoxin
LocationCicolChr10: 9681429 .. 9720908 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC10G192540
SyntenyCcUC10G192540
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
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mRNA sequence

TGGAATATATATTTTATAACAATAGTCACATTTTTGCCAGATACGCTTGCGTTAAGATCCACACAATTAGAGCGCGTAATAAAAGCAAACTTAAGGGAACACCGAATTTTGTTGGAACCAATGGCTGAAGAAATGCAAGTGATTGAGATTCGTAACCCTGAGGAATTCGATTCGCAAGTCAAGCGTGGAGACGATGCCCTTAAACTGATTGTGTCGAATTTTACTGCTTCCCAATGTCCGCCATGCCGTTTCATTGCTCCAATTTTCATACAATTGGCTAAGAAGTCCCCCAATGCAATCGCTGAGAGGTTGAATGTTACTGCAATGCCGACCTTTGTTTTCCTGAAAGGAGAGTGGAAGTTCATAGGATTGTGGATGCTGACAAAGTGGCATAAATATACGGTCAGCTAATTCGAAGATCGTTCTCCCTTTTATTATTGGTGGTGTATTGATGATTCTGGTTTTGAGTTTGTCCTACTTGTGAATTTTCATCACATTGTGTTTCAGTTGTTTACTTGTTTGATGAATGTATGTAGAACAATCAATGTATAATAAGATTTAACATATATGATAAATTAGTTGCTTAAGCTTTTGAATTCTAATCTTTGGCTCATTTAGGCTAAATGATAAAAAATGCC

Coding sequence (CDS)

TGGAATATATATTTTATAACAATAGTCACATTTTTGCCAGATACGCTTGCGTTAAGATCCACACAATTAGAGCGCGTAATAAAAGCAAACTTAAGGGAACACCGAATTTTGTTGGAACCAATGGCTGAAGAAATGCAAGTGATTGAGATTCGTAACCCTGAGGAATTCGATTCGCAAGTCAAGCGTGGAGACGATGCCCTTAAACTGATTGTGTCGAATTTTACTGCTTCCCAATGTCCGCCATGCCGTTTCATTGCTCCAATTTTCATACAATTGGCTAAGAAGTCCCCCAATGCAATCGCTGAGAGGTTGAATGTTACTGCAATGCCGACCTTTGTTTTCCTGAAAGGAGAGTGGAAGTTCATAGGATTGTGGATGCTGACAAAGTGGCATAAATATACGGTCAGCTAA

Protein sequence

WNIYFITIVTFLPDTLALRSTQLERVIKANLREHRILLEPMAEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFIQLAKKSPNAIAERLNVTAMPTFVFLKGEWKFIGLWMLTKWHKYTVS
Homology
[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. NCBI nr
Match: XP_004152672.3 (thioredoxin H1 [Cucumis sativus] >KAE8652116.1 hypothetical protein Csa_022569 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 98.2 bits (243), Expect = 5.8e-17
Identity = 53/90 (58.89%), Postives = 62/90 (68.89%), Query Frame = 0 

Query: 41  MAEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFIQLAKKSPN-- 100
           MAEE QVI I N +EFD QV+ G +A KLIV +FTAS CPPCRFIAPIF +LAKK+P+  
Sbjct: 1   MAEEGQVIGIHNVKEFDEQVRIGKEARKLIVVDFTASWCPPCRFIAPIFAELAKKNPHAI 60

Query: 101 ----------AIAERLNVTAMPTFVFLKGE 119
                     AIA R NV AMPTF F++ E
Sbjct: 61  FLKVDVDEVQAIAARFNVDAMPTFAFVRDE 90

[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. NCBI nr
Match: KAG7029409.1 (Thioredoxin H5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 98.2 bits (243), Expect = 5.8e-17
Identity = 53/99 (53.54%), Postives = 66/99 (66.67%), Query Frame = 0 

Query: 31  LREHRILLEPMAEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFI 90
           L++   L EPMA E QVI +R  +EFD+ VK+G +A KLIV +FTAS CPPCRFIAP+F 
Sbjct: 16  LQDPDFLFEPMAAEGQVIVVRKVDEFDALVKQGIEAGKLIVVDFTASWCPPCRFIAPVFA 75

Query: 91  QLAKKSPNA------------IAERLNVTAMPTFVFLKG 118
           ++AK   N             IA++  VTAMPTFVFLKG
Sbjct: 76  EMAKAHVNVVFLKVDVDDLKEIAQKFEVTAMPTFVFLKG 114

[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. NCBI nr
Match: XP_022997319.1 (thioredoxin H5-like [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 98.2 bits (243), Expect = 5.8e-17
Identity = 52/99 (52.53%), Postives = 65/99 (65.66%), Query Frame = 0 

Query: 31  LREHRILLEPMAEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFI 90
           L++   L EPMA E Q I +R  +EFD+ VK+G +A KLIV +FTAS CPPCRFIAP+F 
Sbjct: 16  LQDTDFLFEPMAAEGQAIVVRKVDEFDALVKQGSEAGKLIVVDFTASWCPPCRFIAPVFA 75

Query: 91  QLAKKSPNA------------IAERLNVTAMPTFVFLKG 118
           ++AK   N             IA++  VTAMPTFVFLKG
Sbjct: 76  EMAKAHSNVVFLKVDVDDLKEIAQKFEVTAMPTFVFLKG 114

[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. NCBI nr
Match: XP_038884374.1 (thioredoxin H-type-like [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 94.0 bits (232), Expect = 1.1e-15
Identity = 53/90 (58.89%), Postives = 60/90 (66.67%), Query Frame = 0 

Query: 41  MAEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFIQLAKKSPNA- 100
           MAEE QVI I   EEFD+ VK G++A KLIV +FTAS CPPCRFIAPIF +LAK + N  
Sbjct: 1   MAEEGQVIGIHKVEEFDTLVKLGNEAGKLIVVDFTASWCPPCRFIAPIFAELAKANVNVI 60

Query: 101 -----------IAERLNVTAMPTFVFLKGE 119
                      IAE+  V AMPTFVFLK E
Sbjct: 61  FLKVDVDEVKEIAEKYGVNAMPTFVFLKDE 90

[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. NCBI nr
Match: XP_023545550.1 (thioredoxin H5-like [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 93.2 bits (230), Expect = 1.9e-15
Identity = 50/89 (56.18%), Postives = 61/89 (68.54%), Query Frame = 0 

Query: 41  MAEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFIQLAKKSPNA- 100
           MA E QVI +R  EEFD+ VK+G +A KLIV +FTAS CPPCRFIAP+F ++AK   N  
Sbjct: 1   MAAEGQVIVVRKVEEFDALVKQGIEAGKLIVVDFTASWCPPCRFIAPVFAEMAKAHVNVV 60

Query: 101 -----------IAERLNVTAMPTFVFLKG 118
                      IA++ +VTAMPTFVFLKG
Sbjct: 61  FLKVDVDELKEIAQKFDVTAMPTFVFLKG 89

[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0D840 (Thioredoxin H1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=TRXH PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 80.9 bits (198), Expect = 1.2e-14
Identity = 41/87 (47.13%), Postives = 56/87 (64.37%), Query Frame = 0 

Query: 42  AEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFIQLAKKSPNA-- 101
           AEE  VI   N +EFD+Q+ +  +A K+++ +FTAS C PCRFIAP+F + AKK P A  
Sbjct: 3   AEEGVVIACHNKDEFDAQMTKAKEAGKVVIIDFTASWCGPCRFIAPVFAEYAKKFPGAVF 62

Query: 102 ----------IAERLNVTAMPTFVFLK 117
                     +AE+ NV AMPTF+F+K
Sbjct: 63  LKVDVDELKEVAEKYNVEAMPTFLFIK 89

[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2YIW7 (Thioredoxin H-type OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=TRXH PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 80.9 bits (198), Expect = 1.2e-14
Identity = 41/87 (47.13%), Postives = 56/87 (64.37%), Query Frame = 0 

Query: 42  AEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFIQLAKKSPNA-- 101
           AEE  VI   N +EFD+Q+ +  +A K+++ +FTAS C PCRFIAP+F + AKK P A  
Sbjct: 3   AEEGVVIACHNKDEFDAQMTKAKEAGKVVIIDFTASWCGPCRFIAPVFAEYAKKFPGAVF 62

Query: 102 ----------IAERLNVTAMPTFVFLK 117
                     +AE+ NV AMPTF+F+K
Sbjct: 63  LKVDVDELKEVAEKYNVEAMPTFLFIK 89

[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q39241 (Thioredoxin H5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TRX5 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 76.6 bits (187), Expect = 2.4e-13
Identity = 41/88 (46.59%), Postives = 55/88 (62.50%), Query Frame = 0 

Query: 41  MAEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFIQLAKKSPN-- 100
           MA E +VI     E ++ +VK  +++ KLIV +FTAS CPPCRFIAP+F ++AKK  N  
Sbjct: 1   MAGEGEVIACHTLEVWNEKVKDANESKKLIVIDFTASWCPPCRFIAPVFAEMAKKFTNVV 60

Query: 101 ----------AIAERLNVTAMPTFVFLK 117
                     A+A+   V AMPTFVF+K
Sbjct: 61  FFKIDVDELQAVAQEFKVEAMPTFVFMK 88

[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q42403 (Thioredoxin H3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TRX3 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 76.3 bits (186), Expect = 3.1e-13
Identity = 42/93 (45.16%), Postives = 56/93 (60.22%), Query Frame = 0 

Query: 41  MAEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFIQLAKK----- 100
           MA E +VI     E++  ++K  +++ KLIV +FTA+ CPPCRFIAP+F  LAKK     
Sbjct: 1   MAAEGEVIACHTVEDWTEKLKAANESKKLIVIDFTATWCPPCRFIAPVFADLAKKHLDVV 60

Query: 101 -------SPNAIAERLNVTAMPTFVFLK-GEWK 121
                    N +AE   V AMPTF+F+K GE K
Sbjct: 61  FFKVDVDELNTVAEEFKVQAMPTFIFMKEGEIK 93

[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P68177 (Thioredoxin H-type 1 OS=Brassica napus OX=3708 GN=THL-1 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 75.1 bits (183), Expect = 6.8e-13
Identity = 38/87 (43.68%), Postives = 56/87 (64.37%), Query Frame = 0 

Query: 46  QVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFIQLAKKSPN------- 105
           +VI     E++++++K   ++ KLIV +FTA  CPPCRFIAPIF++LAKK  +       
Sbjct: 12  EVIACHTVEDWNNKLKAAKESNKLIVIDFTAVWCPPCRFIAPIFVELAKKHLDVVFFKVD 71

Query: 106 -----AIAERLNVTAMPTFVFLKGEWK 121
                 +A+  +V AMPTFV++KGE K
Sbjct: 72  VDELATVAQEFDVQAMPTFVYMKGEEK 98

[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KB35 (thioredoxin H5-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492267 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 98.2 bits (243), Expect = 2.8e-17
Identity = 52/99 (52.53%), Postives = 65/99 (65.66%), Query Frame = 0 

Query: 31  LREHRILLEPMAEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFI 90
           L++   L EPMA E Q I +R  +EFD+ VK+G +A KLIV +FTAS CPPCRFIAP+F 
Sbjct: 16  LQDTDFLFEPMAAEGQAIVVRKVDEFDALVKQGSEAGKLIVVDFTASWCPPCRFIAPVFA 75

Query: 91  QLAKKSPNA------------IAERLNVTAMPTFVFLKG 118
           ++AK   N             IA++  VTAMPTFVFLKG
Sbjct: 76  EMAKAHSNVVFLKVDVDDLKEIAQKFEVTAMPTFVFLKG 114

[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LLJ2 (Thioredoxin OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G362505 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 6.9e-16
Identity = 52/90 (57.78%), Postives = 61/90 (67.78%), Query Frame = 0 

Query: 41  MAEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFIQLAKKSPN-- 100
           MAEE QVI I N +EFD QV+ G +A KLIV +FTAS  PPCRFIAPIF +LAKK+P+  
Sbjct: 1   MAEEGQVIGIHNVKEFDEQVRIGKEARKLIVVDFTASWRPPCRFIAPIFAELAKKNPHAI 60

Query: 101 ----------AIAERLNVTAMPTFVFLKGE 119
                     AIA R NV AMPTF F++ E
Sbjct: 61  FLKVDVDEVRAIAARFNVDAMPTFAFVRDE 90

[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HFK3 (thioredoxin H5-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463007 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 92.8 bits (229), Expect = 1.2e-15
Identity = 50/89 (56.18%), Postives = 60/89 (67.42%), Query Frame = 0 

Query: 41  MAEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFIQLAKKSPNA- 100
           MA E QVI +R  EEFD+ VK+G +A KLIV +FTAS CPPCRFIAP+F ++AK   N  
Sbjct: 1   MAAEGQVIVVRKVEEFDALVKQGIEAGKLIVVDFTASWCPPCRFIAPVFAEMAKAHVNVV 60

Query: 101 -----------IAERLNVTAMPTFVFLKG 118
                      IA++  VTAMPTFVFLKG
Sbjct: 61  FLKVDVDDLKEIAQKFEVTAMPTFVFLKG 89

[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CST8 (thioredoxin H-type 1-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013893 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 87.4 bits (215), Expect = 4.9e-14
Identity = 47/88 (53.41%), Postives = 57/88 (64.77%), Query Frame = 0 

Query: 41  MAEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFIQLAK------ 100
           MAEE QVI + N E FD  +K+G ++ KLIV +FTAS CPPCRFIAPIF +LAK      
Sbjct: 1   MAEEGQVIGVHNVEAFDDLLKKGTESGKLIVVDFTASWCPPCRFIAPIFAELAKAHIGVI 60

Query: 101 ------KSPNAIAERLNVTAMPTFVFLK 117
                      ++E+  VTAMPTFVFLK
Sbjct: 61  FLKVDVDEVKEVSEKFEVTAMPTFVFLK 88

[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LPD3 (Thioredoxin domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G362500 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 8.4e-14
Identity = 47/90 (52.22%), Postives = 60/90 (66.67%), Query Frame = 0 

Query: 41  MAEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFIQLAKKSPN-- 100
           MA+E +VI I + EEFD+QV+ G +  K+IV +FTAS CPPCRFIAPIF  LAKK+ +  
Sbjct: 1   MAKEGEVIAIHSVEEFDAQVRIGKEMSKVIVVDFTASWCPPCRFIAPIFADLAKKNHHAI 60

Query: 101 ----------AIAERLNVTAMPTFVFLKGE 119
                     AIA R +V AMPTF F++ E
Sbjct: 61  FLKVDVDEVQAIAARFDVEAMPTFAFVRDE 90

[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. TAIR 10
Match: AT1G45145.1 (thioredoxin H-type 5 )

HSP 1 Score: 76.6 bits (187), Expect = 1.7e-14
Identity = 41/88 (46.59%), Postives = 55/88 (62.50%), Query Frame = 0 

Query: 41  MAEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFIQLAKKSPN-- 100
           MA E +VI     E ++ +VK  +++ KLIV +FTAS CPPCRFIAP+F ++AKK  N  
Sbjct: 1   MAGEGEVIACHTLEVWNEKVKDANESKKLIVIDFTASWCPPCRFIAPVFAEMAKKFTNVV 60

Query: 101 ----------AIAERLNVTAMPTFVFLK 117
                     A+A+   V AMPTFVF+K
Sbjct: 61  FFKIDVDELQAVAQEFKVEAMPTFVFMK 88

[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. TAIR 10
Match: AT5G42980.1 (thioredoxin 3 )

HSP 1 Score: 76.3 bits (186), Expect = 2.2e-14
Identity = 42/93 (45.16%), Postives = 56/93 (60.22%), Query Frame = 0 

Query: 41  MAEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFIQLAKK----- 100
           MA E +VI     E++  ++K  +++ KLIV +FTA+ CPPCRFIAP+F  LAKK     
Sbjct: 1   MAAEGEVIACHTVEDWTEKLKAANESKKLIVIDFTATWCPPCRFIAPVFADLAKKHLDVV 60

Query: 101 -------SPNAIAERLNVTAMPTFVFLK-GEWK 121
                    N +AE   V AMPTF+F+K GE K
Sbjct: 61  FFKVDVDELNTVAEEFKVQAMPTFIFMKEGEIK 93

[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. TAIR 10
Match: AT3G51030.1 (thioredoxin H-type 1 )

HSP 1 Score: 69.3 bits (168), Expect = 2.7e-12
Identity = 37/87 (42.53%), Postives = 52/87 (59.77%), Query Frame = 0 

Query: 42  AEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFIQLAKKSPN--- 101
           +EE QVI     E ++ Q+++ +++  L+V +FTAS C PCRFIAP F  LAKK PN   
Sbjct: 3   SEEGQVIACHTVETWNEQLQKANESKTLVVVDFTASWCGPCRFIAPFFADLAKKLPNVLF 62

Query: 102 ---------AIAERLNVTAMPTFVFLK 117
                    ++A    + AMPTF+FLK
Sbjct: 63  LKVDTDELKSVASDWAIQAMPTFMFLK 89

[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. TAIR 10
Match: AT1G19730.1 (Thioredoxin superfamily protein )

HSP 1 Score: 67.4 bits (163), Expect = 1.0e-11
Identity = 39/88 (44.32%), Postives = 50/88 (56.82%), Query Frame = 0 

Query: 42  AEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIFIQLAKK------ 101
           AEE QVI     + +  Q+ +  ++ KLIV +FTAS CPPCR IAPIF  LAKK      
Sbjct: 3   AEEGQVIGCHTNDVWTVQLDKAKESNKLIVIDFTASWCPPCRMIAPIFNDLAKKFMSSAI 62

Query: 102 -------SPNAIAERLNVTAMPTFVFLK 117
                     ++A+   V AMPTFVF+K
Sbjct: 63  FFKVDVDELQSVAKEFGVEAMPTFVFIK 90

[Close]
BLAST of CcUC10G192540 vs. TAIR 10
Match: AT2G35010.1 (thioredoxin O1 )

HSP 1 Score: 57.8 bits (138), Expect = 8.0e-09
Identity = 32/102 (31.37%), Postives = 51/102 (50.00%), Query Frame = 0 

Query: 30  NLREHRILLEPMAEEMQVIEIRNPEEFDSQVKRGDDALKLIVSNFTASQCPPCRFIAPIF 89
           +L   R L      E  V+ +++ EEF + + +  D     V  FTA+ C PCRFI+P+ 
Sbjct: 69  SLPHRRSLCSEAGGENGVVLVKSEEEFINAMSKAQDGSLPSVFYFTAAWCGPCRFISPVI 128

Query: 90  IQLAKKSPNAIA--------------ERLNVTAMPTFVFLKG 118
           ++L+K+ P+                  +LN+TA+PT  F KG
Sbjct: 129 VELSKQYPDVTTYKVDIDEGGISNTISKLNITAVPTLHFFKG 170

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CcUC10G192540 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_004152672.35.8e-1758.89thioredoxin H1 [Cucumis sativus] >KAE8652116.1 hypothetical protein Csa_022569 [... [more]
KAG7029409.15.8e-1753.54Thioredoxin H5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma][more]
XP_022997319.15.8e-1752.53thioredoxin H5-like [Cucurbita maxima][more]
XP_038884374.11.1e-1558.89thioredoxin H-type-like [Benincasa hispida][more]
XP_023545550.11.9e-1556.18thioredoxin H5-like [Cucurbita pepo subsp. pepo][more]
BLAST of CcUC10G192540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
Q0D8401.2e-1447.13Thioredoxin H1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=TRXH PE=1 SV=1[more]
A2YIW71.2e-1447.13Thioredoxin H-type OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=TRXH PE=1 SV=1[more]
Q392412.4e-1346.59Thioredoxin H5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TRX5 PE=1 SV=1[more]
Q424033.1e-1345.16Thioredoxin H3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TRX3 PE=1 SV=1[more]
P681776.8e-1343.68Thioredoxin H-type 1 OS=Brassica napus OX=3708 GN=THL-1 PE=2 SV=1[more]
BLAST of CcUC10G192540 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1KB352.8e-1752.53thioredoxin H5-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492267 PE=4 SV=1[more]
A0A0A0LLJ26.9e-1657.78Thioredoxin OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G362505 PE=4 SV=1[more]
A0A6J1HFK31.2e-1556.18thioredoxin H5-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463007 PE=4 SV=1[more]
A0A6J1CST84.9e-1453.41thioredoxin H-type 1-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013893 PE=4 SV... [more]
A0A0A0LPD38.4e-1452.22Thioredoxin domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G362500... [more]
BLAST of CcUC10G192540 vs. TAIR 10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT1G45145.11.7e-1446.59thioredoxin H-type 5 [more]
AT5G42980.12.2e-1445.16thioredoxin 3 [more]
AT3G51030.12.7e-1242.53thioredoxin H-type 1 [more]
AT1G19730.11.0e-1144.32Thioredoxin superfamily protein [more]
AT2G35010.18.0e-0931.37thioredoxin O1 [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableGENE3D3.40.30.10Glutaredoxincoord: 29..125
e-value: 3.2E-14
score: 54.7
NoneNo IPR availablePIRSRPIRSR000077-4PIRSR000077-4coord: 47..99
e-value: 6.5E-6
score: 24.0
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR10438:SF399THIOREDOXINcoord: 41..118
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR10438THIOREDOXINcoord: 41..118
NoneNo IPR availableCDDcd02947TRX_familycoord: 54..117
e-value: 1.89075E-15
score: 64.8869
IPR013766Thioredoxin domainPFAMPF00085Thioredoxincoord: 50..116
e-value: 2.3E-7
score: 30.7
IPR036249Thioredoxin-like superfamilySUPERFAMILY52833Thioredoxin-likecoord: 39..117

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC10G192540.1CcUC10G192540.1mRNA