CcUC08G152740 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TCCATTACTTCTTTTGACCAAACAGCCACCACTCCGCCATCTCTCTCTCTGGACGGTCTTTCGACCGTCGCCGGTGATAGGAAATTGCAGTTCCTTCGCAATATCAACTTGGGTTGTGTAGATCCTTCGAGTTTCGAGACGAATTTCTTCACCGTCGTTGTCGATTTTGTCGGAGGATTCCGTGTTTTGATTTCTTCATTCTGTGATTTAGGTGTTTGTTGATGTCAACGGTGTCGTCTTCGATGGGATTGTGTGATGAGGGGGATTGGCCACCAGGGTTTCGGTTTCACCCGACGGATGAGGAGCTGGTTTTGTATTACTTGAAGTTCAAAATCTGTAAACGCAAATTGAAGCTCGATATCATCCGTGAGACCGATGTTTACAAGTGGGAACCCGAGGAATTGCCTGGTAAAGAAATTCTTCTTCCATGCTTGATCTGATTTATTGATGTTCTTCCGGTTTTTCTTTGACCTAGTCTAAGTTTGATTGAATTTGTTGTAGATTGATTTTATTTGATTGTTTATAATGGATTTTGGGATCTTTCTGAATATACCGGTGTGGTTTTCGTTTGTTTAAGCTTATCGTCAAATTTTAATGATATCATATAATTCGATATTATCATTTAACCTCTTGAATTCGTAGTTGATGATATTCCTTGTTACCATTTTCGGCATCATTTTCTATGTGAGTAGTTTTTATCCACTCAGTCGTTATTACTGAAAGGAAATCATGTACTAGCCGAAGCCATAATTGATCGTTGATGATATAATCTTCCAGAGTTTTATAGAGTTGGTCTCTCTTTCTGTAAATGTTAGTTGCTCTATGATTCTCTTGTTTTTTGGATATCAATGAGTATTGGTGGTGTTTCTAATCATGAAAAAATAAATGCAGGTCAATCTAAGTTAAAAACTGGTGATAGACAATGGTTCTTTTTCAGTCCTAGGGAACATAGGTACCCAAATGCATCAAGATTGAGTAGAGCTACAAGATATGGCTACTGGAAGGCCACGGGAAGGGATCGAATAATACAGTGCAATTCACGTAATGTTGGAGTGAAGAAGACCCTGGTGTTCTATCAAGGTCGTGCCCCTAATGGTGAGCGTACTGACTGGGTTATGCACGAGTATACCTTGGATGAAGACGAGCTTAAGAGGTGCAAGAATGTAAAGGTAACTGTGTGTTTAAGCTCTTCTTTTACTTAATATTTCTTGCGTGTTCTTTTTTGATTAAACTGCGAGTCTTTATATTTCAGGATTACTATGCACTCTACAAACTTTTCAAGAAAAGTGGACCTGGGCCGAAAAATGGCGAGCAATATGGAGCACCATTTAGAGAAGAAGATTGGGTTGATGATGCTGATGGTCAGGAGCCACAAGTGAAAAAACTTGATGAGGTTGATTCTGTAGTTCGTGAAAGAGAGAATGGTCAAATTCAGCTTACATCAGATGATATCGAGGAGCTTATGAAACAAATTGTAGATGATCCTGTGCTAGAGTCGCCATCAGCCAGTGGTTATCATCAATTTGACTCTGGTGTGCAGGTTGGTTGCCCTGAATGTTGCATTCTGATACTTTGTTCCCATTCGCATGTTAATTTCCCTTGGCGAATTGACTGGCCATCACTTTGAGATCAAATCCTTTCTTATTCAATTGACCATATAGCAGTAGGAACTGGGAACATTGGTACATATGAGCTGCATATCTAACCTTCTAAGTTGTAATGAAGTTTAATTTTCATTGTCAATCATGTTTAGAACTCTTAAAAGTAGCATTCTGGTTGGTGGTACAGGAAGAAACATCTACTCTAACCTGACATACATGCTGTATTTCATTGGTTATTTGGTCTGTCATTCCTTTCTTATGTGCTTTATTTGCTCCTTGTCATCGGTTAGCTTATGATTTATCTCCATTCTCTGTGTAGGTTGATGATAAAGAAGAAACTGTAAGTACTATGATCGATGCTTACTCCCGGGATCATATACTTCCTGAACCAGATAAAGTATATCACTCTAGTGGCCAGCCCTGTGATTTGCATGCAACCTTTGACTTTACACAGTCTGGTTTCTCTCAGTTGCAATCATTTGAAGGCGAGGTATCATCAGCTCCCAAATATTGTGAGGAAGAAGAAGATTTCTTGGAGATCAATGATCTCATTAGTCCTGAACCAACTCCTGTGGCAAATGTCAACCCCCTGGGAAATTTACCACCTTCAGAGTTGGATGGATTGAGCGAGTTAGACCTGTTCCATGATGCAAATATGTTTCTTCGTGACTTGGGACCCATCATCCCTGAAACGGTTTTAGATCCATATTTGAATGCTCTTGATATTGATGTTGCAAACAATTTGAATGGAAATTTGCAATATGATCCCTATCAACAAAATCAGATGGACAATGGATTCTGGAAGAACAACGAGACAGAAAATGCCTTTAACTTCCCCGAATCGCATGGACAGTTTGTTACTCAATCAACTTTAGGTATATAGTTCAGCTCAAACTTGATATCTCTGTCTTCTTATATCAAACGTTCGACAGTCTATTTTTACTGAGGTCTTTCTTTCTGTTTGATCTGCACAAAGTTGCTGGCTCGATTAGCTCATCCACATAGAGCTCTTGTTCAGATGAATGGGGTTTGTTTGATAAGCCATACTATACTCCACATGGCAAGAACCCCTCTGTGAATTATTGAGCCAGCTTCAACAGCTACCTAGAACGAGTACTTCTCGTGTATTATCGAATTCTCTGATTCAAGAGGAGCAATTCTCCAATTATATTTGTTGACTTCATCATAAACTGCCATTTTGGTGCCAATGCCAGGTGCCATTTTATCAATGTGAAGCAGTAGGCAGTGTCTAATTCTGAAACTTTCTGATCTTGTTTAGGTGGGGGATATGAATCTGTAAGTTCTTCAGCAGCAGGAACAAGGGAGAACCGAAGTGCAAATGATGGAGGTGGTTCTGCAAGTTGGTTCTCTTCCAATTTGTGGGCCTTTGTGGAGTCGATACCGACCACTCCTGCATCAGCTTCAGAGAATGTCAACCGTGCTTTTGTGCGGATGTCTAGCTTTAGCAGGTTAAGACTAAATACTCTGAACACCCTTAACACCAATGTCACTGTTCGTAATCCCGAGACCGGTGCAAGGAGGAGAACGGGTATGAATAAAGGATTCTTTTTATTTTCAATTCTTGGAGTCTTGTGTGCGATTCTATGGGTGTTGATAGGAAATATTAGATTATGGGGTAATTGCATTGCTTCGTGAACCTATTTCATGAAAGTTCTGCCATCTTTTATACCTTTGTTATATGCATGTCTTAAAGTTCCAATATTCATGGAATCTTCCACTTCATGGAAACTGAATATTGGATGTAAAGCAATCCCAGTTATCGCTGATTATAGATGAGAGTTCTACAAAATCTAGTTTGATTTCGATTCACAGGTCTATCTGCATTGATTTTACTTTATCTCTCTATTATGAAGTTTATTAGTGAATATGACGTGCAATTGTTGAGCAAGTAAATAGAATACTATGAATGGCTAATTATATATAATTTAATGTCTAGTGATTTCGATGATTTGTTTAATTATCGTTGTTAGTTGTTTATTACTTGTTACTTTTAAGGAAAAATATATCAATTAATATCCTTAACTAAATTGTATCAATCTAAACTCTCATTTAGATTTCATCCGAAAACATCGTGTAAGATTTGCAAATGTATCAATTAAACTTTTAAATTGTCATGATTGAATCAATTTAGACTATTTATTAGGATTACTTATGGATGATAAATTTAGACTATTTATTAGGATTACTTTTGAAAATCATCCATGTATCAATTCTTACATGTGTCGACTTCTTCACATGTTGGATTAATTTAATGGACATTTATATTGGACCATTTTTAAAGGAAATTATGAGAATTTAAATTGATTTGTTTATGAAAGGTTTAGATATTTTATTTCGGGATAAGGAATAAACAAACCATGGATAAATCTAAGCGACTCAGTTAGTTATTTCTTTCATCGTCCCAAACATGCCAATATTAGAGATAATGTTAACAGATGTTTATCAAAATGTAATATAATGTTGGATATAAATTAATACATTTACAAAAGTTAATGATTTAAATTGGTACAATTATTAGTTTTCACTTTTAATTGATACTGCGGAGGTATAAATTAAATTTATACTAACCTCGTAAAATAATGATATCTCTTTCTAATTCATTTATTTTAAGAATTTGACTAGAAAGAAATTAATCACGGAGAAATTAATATAGGGTAATTGTTTTAAATGATAGAAAATATTTTTATATAGCAAAATTTCATTGTTTATCAGTATGATAGTGATAGATATTGATAAACATCTATTAGTGTCTATCACTAATAAATAGTGATGATGATAGTAGTTGTTTATCTCATTTTGCTATATTTAAAAACACATTACTAATATATGTAGACATAGTTATTTTTTCTTATATTAAAAAGAATGAATGAAATAATAACAATAAGATGCAAATACTAAGGGTTGAGTATATGAGTGCCTGACCAAGCTTTGGACTTTTGACTTAAGTATTTACAAAATTTAAGCATGTGGTTAAGTAGGTTGTTTAAAAGTTTTAAAAACTTGTGAGAATTCTTAAGCATATTAATAAATTAATTCAGTATCGGATACTTATTGTAATATAGTTAGGGGTATTCAAACCACATATTTCTTGGTCATCAACACATTTATATTTTTATTAGATTGGATGTTACTTTTATTACTAAATATTAATTAATTAATATTAATAAATAGTCAGATGAATGAAAACATGAATGGTAGTGATAGGAAACACATAAGTTAAATTCTTAATAAATGTTTAATTTTCTTACTAATATTAAACTAAGATGTTAATTGAATTATAGAGATTATTCCAACAATTGGGAGAGGAAATTGACAGCTCAACACAATACTTGAGGTAAGCAATGAAACACAAACAAGTTTGCAATATTTAGC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MSTVSSSMGLCDEGDWPPGFRFHPTDEELVLYYLKFKICKRKLKLDIIRETDVYKWEPEELPGQSKLKTGDRQWFFFSPREHRYPNASRLSRATRYGYWKATGRDRIIQCNSRNVGVKKTLVFYQGRAPNGERTDWVMHEYTLDEDELKRCKNVKDYYALYKLFKKSGPGPKNGEQYGAPFREEDWVDDADGQEPQVKKLDEVDSVVRERENGQIQLTSDDIEELMKQIVDDPVLESPSASGYHQFDSGVQVDDKEETVSTMIDAYSRDHILPEPDKVYHSSGQPCDLHATFDFTQSGFSQLQSFEGEVSSAPKYCEEEEDFLEINDLISPEPTPVANVNPLGNLPPSELDGLSELDLFHDANMFLRDLGPIIPETVLDPYLNALDIDVANNLNGNLQYDPYQQNQMDNGFWKNNETENAFNFPESHGQFVTQSTLGGGYESVSSSAAGTRENRSANDGGGSASWFSSNLWAFVESIPTTPASASENVNRAFVRMSSFSRLRLNTLNTLNTNVTVRNPETGARRRTVGNIPYDATEEQLIEICQEVGPVVSFRLVIDRETGKPKGYGFCEYKDEETALSARRNLQGYEINGRQLRVDFAENDKGADRNREQGRGGPGLVANAGGPTPHGESSQHQPIGLHIAITAAAVMAGALGGAQVASNQNTLQSATTPNDPLTLHLAKLSRSQLTEVMSGLKAMATENKDLARQLLLARPQLSKALFQSQIMLGMVTPQVLQKPNLQQPSTHPQLPLHEIQQGQPSSLEIQPGFSPLAPNRMQTGFVPKKETPLSLTPQNPLAPHQFSASQRPPLQSQIQLSPALQGSLTGIPGGSSLPSISLQGNISVRQQVQVPTSSSLKPHMRPPSQQYLGHGGALIPGHIAHIANPEAKPSLLPHPSLSDADFQPGPSTAYSASQIVGSDVDKSSQVPLGVDGKRNVLHGFSGTTNRPVKQIKLEDGKGSPFSAGGLSASIGINGSGQLGIASDPNLAGMQLSEKPTSLLPHNVESVLLQQVLNLTPEQLNSLPIEQRLQVIELQHALRRDQMRPS Homology
BLAST of CcUC08G152740 vs. NCBI nr
Match: XP_038885018.1 (NAC domain-containing protein 17-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 982.6 bits (2539), Expect = 2.6e-282 Identity = 480/526 (91.25%), Postives = 501/526 (95.25%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC08G152740 vs. NCBI nr
Match: KAA0031655.1 (NAC domain-containing protein 17-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYK04455.1 NAC domain-containing protein 17-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 943.3 bits (2437), Expect = 1.7e-270 Identity = 468/530 (88.30%), Postives = 492/530 (92.83%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC08G152740 vs. NCBI nr
Match: XP_008456695.1 (PREDICTED: NAC domain-containing protein 17-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 942.2 bits (2434), Expect = 3.8e-270 Identity = 466/526 (88.59%), Postives = 489/526 (92.97%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC08G152740 vs. NCBI nr
Match: XP_008456694.1 (PREDICTED: cleavage stimulating factor 64 [Cucumis melo] >KAA0031656.1 cleavage stimulating factor 64 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK04454.1 cleavage stimulating factor 64 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 922.5 bits (2383), Expect = 3.1e-264 Identity = 478/517 (92.46%), Postives = 491/517 (94.97%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC08G152740 vs. NCBI nr
Match: XP_038885247.1 (LOW QUALITY PROTEIN: cleavage stimulating factor 64 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 922.5 bits (2383), Expect = 3.1e-264 Identity = 486/517 (94.00%), Postives = 495/517 (95.74%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC08G152740 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A4FVP6 (NAC domain-containing protein 16 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NAC016 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 374.4 bits (960), Expect = 4.2e-102 Identity = 232/524 (44.27%), Postives = 312/524 (59.54%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC08G152740 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9XIC5 (NAC domain-containing protein 17 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NAC017 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 367.5 bits (942), Expect = 5.1e-100 Identity = 236/540 (43.70%), Postives = 320/540 (59.26%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC08G152740 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M9G6 (Cleavage stimulating factor 64 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CSTF64 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 338.2 bits (866), Expect = 3.3e-91 Identity = 235/523 (44.93%), Postives = 300/523 (57.36%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC08G152740 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4IED2 (NAC domain-containing protein 13 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NAC013 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 303.1 bits (775), Expect = 1.2e-80 Identity = 222/554 (40.07%), Postives = 295/554 (53.25%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC08G152740 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84K00 (NAC domain-containing protein 78 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NAC078 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 225.7 bits (574), Expect = 2.4e-57 Identity = 109/213 (51.17%), Postives = 147/213 (69.01%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC08G152740 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BZ67 (NAC domain-containing protein 17-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold409G00600 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 943.3 bits (2437), Expect = 8.3e-271 Identity = 468/530 (88.30%), Postives = 492/530 (92.83%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC08G152740 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C3X9 (NAC domain-containing protein 17-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496564 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 942.2 bits (2434), Expect = 1.9e-270 Identity = 466/526 (88.59%), Postives = 489/526 (92.97%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC08G152740 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BZN4 (Cleavage stimulating factor 64 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold409G00590 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 922.5 bits (2383), Expect = 1.5e-264 Identity = 478/517 (92.46%), Postives = 491/517 (94.97%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC08G152740 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C3F6 (cleavage stimulating factor 64 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496563 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 922.5 bits (2383), Expect = 1.5e-264 Identity = 478/517 (92.46%), Postives = 491/517 (94.97%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC08G152740 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K9G3 (NAC domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G052680 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 918.7 bits (2373), Expect = 2.2e-263 Identity = 457/536 (85.26%), Postives = 482/536 (89.93%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC08G152740 vs. TAIR 10
Match: AT1G34180.1 (NAC domain containing protein 16 ) HSP 1 Score: 374.4 bits (960), Expect = 3.0e-103 Identity = 232/524 (44.27%), Postives = 312/524 (59.54%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC08G152740 vs. TAIR 10
Match: AT1G34190.1 (NAC domain containing protein 17 ) HSP 1 Score: 367.5 bits (942), Expect = 3.6e-101 Identity = 236/540 (43.70%), Postives = 320/540 (59.26%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC08G152740 vs. TAIR 10
Match: AT1G34180.2 (NAC domain containing protein 16 ) HSP 1 Score: 366.3 bits (939), Expect = 8.1e-101 Identity = 232/536 (43.28%), Postives = 312/536 (58.21%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC08G152740 vs. TAIR 10
Match: AT1G71800.1 (cleavage stimulating factor 64 ) HSP 1 Score: 338.2 bits (866), Expect = 2.4e-92 Identity = 235/523 (44.93%), Postives = 300/523 (57.36%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC08G152740 vs. TAIR 10
Match: AT1G32870.2 (NAC domain protein 13 ) HSP 1 Score: 307.4 bits (786), Expect = 4.5e-83 Identity = 216/545 (39.63%), Postives = 291/545 (53.39%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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