CcUC08G148060 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC08G148060
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr08: 9647315 .. 9653415 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC08G148060
SyntenyCcUC08G148060
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GTTGAGACTCAGTCGCGGCCCATAACTATGAATTTGGCCTTTAGTTGTATGTTACGATGCTTGGGCTTCTCAACAGATTTCAGCACCGCCTGCCTCGCAGTTCATGGTGAAATCATCCATACCAGATCCTGGACTTCAGAGGTCTATAAAATCCTCGGTATGCTTCTGTGCGCTGATTCTTCTTCCTTCGCCGTCTTCTTCCTCTTTTGGCTGTGAATTCTTAGGCTTTTCTTGTCTTGATTGATATCAATAACTTCAATTTTGCCCAATGATGGAAAATCACTATGAATTGAACGGTTGCAGATGGCTTTGCTTTGTTTTGTCATTAGCCTTTTCTTATCTCTACCTCCATCATCACCTCCTCTTTCATTCAGTCCATATATGTAATCACACACACATCACTGGTTGTAAAGGCTTTTGATGAACGAACACCGTTTGCTTTATACCGTGTATGATTCTATTAAAGCTATGAGATCTGAGGGCTTTGCTTCTTTAGTTATTTTGTTGTAGGTTTTATTGTTCATTGTTTGTGTATTGCGTGTTTTCTTGGATTTGGGGCAGTTTCTAACTGCAATTCTTATGAACATGCAGCCTATGAAGCAGATAATTCCACCCGTTTGACTAGTTGTTGTTATTGGGTTGTGTGTATTTGTTCGAATTGATACGTTAGTGTCTATTGTCTCTTTGACTTTGACAGGAGGCACTTTAGTAATTAGTATTATTATTTAATAATTGTTTTGTAATACGTAGTTTTTAAAATTTCATGGTTAAGTCACTTATTGAGATGATTCCTTTCAATTGTATTTCGAGAAAAAAATTAATGATTCCCATGATATTTGGTCATTTTGTTTGAAAATTCATGCTTTGCTTTGACTATTACATCTGCCCGATGATGGAATACTCTGATTAGAGCAGTTACTAATGATCTTTATTACAAGCCTTTGCCATTAACCAACTCACACATGATCTCTCTGTCTCTGTCTCTGTCTCTGTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTCTATTTATATAGCCATCTGATAATCCATCCATCTGCTTTCTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTAATGAGTGGTTAAGGATGTGTAGAGGCTAGTAATGAAAATCAACTGTATATCTAGCAATGATAAATTATGTTAATGAGATCTGAGGGCATCTTGAAAATGGTTAATTTTTCATGAAACTGCAACTGCTGTCCTTGTTAGATCTTACAATGGTGTGTTTGTGAATTGTGTTTATCAAGTAGAAACACTGTTTTGAAAAGTATTTTAAATGACTTTGTGATGTTTGTATTTTAAATTTGATCTTAAAACTTAAAGACAACTTTTAATTTATCAAAGTAATCAATTTTATTCAAAAGGGCCACACCTGTTGACCTTGTTAGATCTTATAATTGAAACATGTGACGTTTGTTTTAATTTCTTGTATTATGGAGAAGAAAGCTATTTCATTGATGGGAATGTTGTTGAAGTGTTATTAGGATTTAAGGGTATAGTAGTAATTACGGAAGGGAGTTGTTGAACTTTGTTATAAATAGAGAGAATGAGGAAGGAGGGGTTAGACATTATTTTGGTGAGTGAATTAGGATTTGAGAGTAATCTTGATAAGGGAGGATCAAAGTACCTTGACACACTTGGTTTATTTCATAGTTTTGATACTTTTATATTCCAATACATATGAGTTTTCTCATTCATTTTAAAATGTTTCAATACTGTTGTAATCATCCATGGTTCAGGTAAATGAACAAAAAAAGGAGTGAAAGTCTTTCCTTCTGTGGGATAGTTTTTAAACAATTATTGGGATTATAATGTTTCCTTTTATTCATTGTATAGATAATAAATTAGAAGGATGACAATGATTAATATTGAAAATGATAAAGGGAAAGATTAATTATATTATTTAGAGTTTATATTAAAAACAATACTTGAAATGTGCATAGTAACATCATTTATAGTTTACGTTTTAATTAACATGAACAAAGTTTATTCACAAGTTTCCTCTAGCATCCTAAAATTACCCTTGCCCAATGATGGAAAAACTCATGCTGTGGAGCGATTGCATTGATTTCTAATACTAGCTTTTGCCCTCAACCACAACAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCAAACACACACATACATATATATATATATATAACCCTTTTTCATTTCCCATCTCTTCTATTATTGTGGTTAGAGATGAGTAGAGGCTAGTATCGAAATCTCATGCAAATATTGTCAATGAGGAACTAAGCTATGAGATCTGAGGGTACTGTGCAAAACTGTCATCATTTTTCCTTCTTAAGGATGCATGTGAATTTTGATACCATTTTCACCTTGAAGTAATTAATCTAGCTTTGGATTAGTGTTTGGTTTAAATGTATTACATGTTATACTAATTGTAGACGCAGTTGTTTTGCTTAGTACTCTCCTGAAAAGGAACATGTGAATTGTATAGTGCCCATTTGATAAAAGAGGTATGCGTCGCCCTTATTTTGTGTTCCTATGCCCTCTGGAGCCCTTGCCTGGTCTTGCTACGATGCTTGGTGTTCTCACAGATTTCAGCGCCACCTATCTTGTGGTTCATGGCGAAATCCACACCAGATCCTGGACTTCAGAGCTCTCTCTAAAATCCTCGGTATGCTTCTGTGCCCTAATTCTTCTTGCTTCATTGTCTTCTTCCCCTTCTGGCTGTGAATTCATAGGCTTTTCTTGTCTTTTCTTTTTACTCTTGATTGATTGATAGCAGTAGCTTCAATTTTGCCCAATGATGGGAAATCATTATGTATTGAATGGTTGCAGATGGCTTTGTTTGTCATTAATTAGCCTTTACTTATCTCCACCTCCACCGTCACCTCCTCTTTCATTCAGTCCATACAGCAATCACACTCATCACTGTTGGTAAAGGCTTTTGATGAACGGGCGTCGTTTGCTTTATACCACGTATGATTCTCTTAAAGCTATGAGATCAGAGGGCTTGGCTTCTATACTTTTTTGTTATACTTCTATTGCTTGTTTCCTTGGTCCAGTTGTAGAGTGTGATGATAGTTTCGCTGAATTTGGGGCAGTTTGTCACTGCAATCTTATGAAAATGAAGCCTAGGAAGTAGATAATTCCACCCGCTTGAACTCCTTGTTATTGGGTTGTGTGTATTTGTTAAAATTAATACATCAGTGTCTTTGTTGTGTTTAATTGATATCTTTGTTTCCTTGTTTGGTTCTTTTTGTTCTTCCAGGCTTTGCTTCCCTTACTTTTGTTTGAACCTACAACTACAACAAAACTTTATTTTTTTATTTTTATTATTTTTTTTCTCGGATTGTGATCTCAAGTTGTATAAGAAAATTTCTTTTGCCAAATTCATCTTTAAGAACCTTTTCCTTTTGTCTTAATTCTCTAGGCTCTTTGTTTCAGTCAGATCTTATTCAGATATGTGTTTTACAGAATAAAGAACATTTGGACCTCATTACTAGAGCTGTTTAAACCATTCGATGGCTTGAAAAACCCGATCAACCTAATCCATATGGTTTGGGTTGGGTTATCAACTCATTTGAGTTGGGTTCGATTCAAATAAATGAATGTTTCATGGTTGAGTTGGTTCATGGGTTCACCTAAAATAACCTAAACTAACCCAAAGCTCCCAAACCAACCACAATCTCTTTCTCTCTCTCTCTCCCTGCAAACACACACATACGTACATATATATATATAACCCTTTTTCATTTCTGGTTTCCCATCTATGCTATTATTGTGGTTAGAGATGAGTAGAGGCTAGTGTCTGAATCCAATGGGAATATTGTCAATGAGGAACTAAGCTATGAGATCTGAGGGTATTGTGACAGTTGTACAACCTATAAAACAGATCTTGTTCAAGTAAGGTCGCTCATTTTTGCTTCTTAAGGATGCACATGAATTTTGAACTATTTTCAGCTTGAAGTACTTAATTTAGCTTTGAATTAGTGTTTAGTTTAAATGTATTACGTTGTTATACTAACTGTAGATGCAGTTTGCTTAGTGCTCTCCTGAAAAGGAACGTTCTATGCCCTTTGGAGCCCTTGCCGGGTCTTGCTACAATGCTTAGGCTTCTCAACAGATTTCAGTGCCGCCTATCTTGTGGTTCATGGCGAAATCCACACCAGATCCTGGACTTCAGAGCTCTCTATGAAATCCTGGGTATGCTTATGTGCCCTAATTCTTCTTGCTTCATCGTTTTCTTCCCCTTCTGGCCATGAATTCTTGAGCTTTTCTTGTCTTTTCTTTTGTACTCTTGATTGATTGATATCAATAGCTTCAATTTCGCCCAATGATGGAAAATCATTATGCATTGAATGGTTGCAGATGGCTTTGTTCGTCATTAATTAGCCTTTACTTATCTCCACATCCACATCCACCTCCACCATCATCTGCTCTTTCATTCCGTCCATACATCTAATCGCACACACATCACTGTTGGTAAAGGCTTTTGATGAACGAGTCATTTGCTTTATGCCGTGTATGATTCTATTAAAGCTATGAGATCTGAGGGCTTAACTTCTATACTGTTTTGTTCCTCTTCTATTGTTTGTATTCTTGGTCCAGTTGTAGAATGCGATGATAGTTCCAGGAATTTCTTACTGCAATACTTATGAAAATGAAGGCCAGGAAGTAGATAATTCCACCCGTTTGAACTCCTTGTTATTGGTGGGTTGTGTGTATTTGTTTAAATTAATACATTAGTGTCTGTGTGTTTAATTGATACCTTTGTTTCTTGTTTGGTTCTTTCTGTTCTTTCAAGCTTTGCTTCCATTACTATTGTTTGAACCTTCAACTACAATAGAATTTTATTTATTTAGTTATTTTTTTCCGGTTTGTTATTTCAAGTTGTATAAGCAAATTTCTTTTAGCGAATTCATCTTTAAGATCCTTTCCCTTTTGTCTTAATCTTCTGGGCTCTATGTTTCTGTCAGATCTTTTTCAGATATGTGTTCTTCAGAATAAAGAACATTTGGATCTCATTACTAGAGGTCTTCAAACAATTCAATGGCTCGAAACACTTGATTAACCCAATCCGTATGGTTTGGGTTGGGTTGGATTCAAGTAAATGAAAATTTTATGGTTTGGCTGGTTTGTTCACCTAAAATAACCTAAACTAACCCCAAGTTGTTATTAATTTGAAAATGCATATTTTTTATACTTGTTATCTTTGCTCAAACTCTTGATGCTTGATTGTGGCCTGAGTTCTTTGAGATCTTTTAAGGGCATTTTCTTTTTGGTTAAATTATACAACTTACCCCTGGAACTTTGAACTTTGAGGTGGAGTTGTAGATAAAGTTTGGCCCTAGCTCTTGAACATTGCAATTGTTACGAAAAAATTCTTAGAGAGCTTTCCTTGAAAATGAAGGACGAAAATTGACGGGAAGATAATGTGTAAAAATAACAAAGACAATCGAGGTGTGCGTAAGCTGGCCTCACTGATATTAAAAAAATATATATATATATTTTGACATCATTTATTCTTCAATTTGAGCCATATAGAATATTTAAGATTGTTCTAACTTGAGATATGGTTGACATTATTTACAACATTCTCACAATTAATTTTTGCACACCAATGTACCAGGTTGTAAATGTTATGTGTGCCTTCAACTTTTACATGTTAGTAGTCACCTTGATTTTCATCCATCAGTCACCCACACATTTCTAAGGGTTTCTTTGTTGAAGGGTTAATTTGAAAGGAAAAATAACATTTTTGGTCCCTGAATTTTTAGTGATAGATTCATTTGGTCCTTGGGTTGTTAAAATGAACCCTTTTAGTCTCTGAGTTTTGGGAAATAGATTTAAATGATCTCTCATGTTATCTTTTCATTTAACGTTAAAATGTTTTAATATTGACGTGACATTTAAAATGAAAAATAGAACTTCTCATCTTTCCATTCTCTCATCTTTTATTGCATCTCCCTTTCTCTTTCTCCTTCGTGGTTCCTCCATCTCTATCGCGTACCCACTTGTTCAGTTGTTCCATTTCCATTTTGGTCGGTGGCAAACCCCCATCACTTCAACAACATAACCGAACTCACGGGAGGAGAAGATATGGATGAAAAAGAAAATCTTTGA

mRNA sequence

GTTGAGACTCAGTCGCGGCCCATAACTATGAATTTGGCCTTTAGTTGTATGTTACGATGCTTGGGCTTCTCAACAGATTTCAGCACCGCCTGCCTCGCAGTTCATGGTGAAATCATCCATACCAGATCCTGGACTTCAGAGGTCTATAAAATCCTCGGTATGCTTCTGTGCGCTGATTCTTCTTCCTTCGCCGTCTTCTTCCTCTTTTGGCTGCTTTTGATGAACGAACACCGTTTGCTTTATACCGTGTATGATTCTATTAAAGCTATGAGATCTGAGGGCTTTGCTTCTTTAGTTTTATTGTTCATTGTTTGTGTATTGCGTGTTTTCTTGGATTTGGGGCAGTTTCTAACTGCAATTCTTATGAACATGCAGCCTATGAAGCAGATAATTCCACCCTGCCCATTTGATAAAAGAGGTATGCGTCGCCCTTATTTTGTGTTCCTATGCCCTCTGGAGCCCTTGCCTGGTCTTGCTACGATGCTTGGTGTTCTCACAGATTTCAGCGCCACCTATCTTGTGGTTCATGGCGAAATCCACACCAGATCCTGGACTTCAGAGCTCTCTCTAAAATCCTCGCCTTTACTTATCTCCACCTCCACCGTCACCTCCTCTTTCATTCAGTCCATACAGCAATCACACTCATCACTGTTGGTAAAGGCTTTTGATGAACGGGCGTCATGCAGTTTGCTTAGTGCTCTCCTGAAAAGGAACGTTCTATGCCCTTTGGAGCCCTTGCCGGGTCTTGCTACAATGCTTAGGCTTCTCAACAGATTTCAGTGCCGCCTATCTTGTGGTTCATGGCGAAATCCACACCAGATCCTGGACTTCAGAGCTCTCTATGAAATCCTGGCTATGAGATCTGAGGGCTTAACTTCTATACTGTTTTGTTCCTCTTCTATTAATGCGATGATAGTTCCAGGAATTTCTTACTGCAATACTTATGAAAATGAAGGCCAGGAAGTAGATAATTCCACCCGTTTGAACTCCTTGTTATTGGTGGTTGTTCCATTTCCATTTTGGTCGGTGGCAAACCCCCATCACTTCAACAACATAACCGAACTCACGGGAGGAGAAGATATGGATGAAAAAGAAAATCTTTGA

Coding sequence (CDS)

GTTGAGACTCAGTCGCGGCCCATAACTATGAATTTGGCCTTTAGTTGTATGTTACGATGCTTGGGCTTCTCAACAGATTTCAGCACCGCCTGCCTCGCAGTTCATGGTGAAATCATCCATACCAGATCCTGGACTTCAGAGGTCTATAAAATCCTCGGTATGCTTCTGTGCGCTGATTCTTCTTCCTTCGCCGTCTTCTTCCTCTTTTGGCTGCTTTTGATGAACGAACACCGTTTGCTTTATACCGTGTATGATTCTATTAAAGCTATGAGATCTGAGGGCTTTGCTTCTTTAGTTTTATTGTTCATTGTTTGTGTATTGCGTGTTTTCTTGGATTTGGGGCAGTTTCTAACTGCAATTCTTATGAACATGCAGCCTATGAAGCAGATAATTCCACCCTGCCCATTTGATAAAAGAGGTATGCGTCGCCCTTATTTTGTGTTCCTATGCCCTCTGGAGCCCTTGCCTGGTCTTGCTACGATGCTTGGTGTTCTCACAGATTTCAGCGCCACCTATCTTGTGGTTCATGGCGAAATCCACACCAGATCCTGGACTTCAGAGCTCTCTCTAAAATCCTCGCCTTTACTTATCTCCACCTCCACCGTCACCTCCTCTTTCATTCAGTCCATACAGCAATCACACTCATCACTGTTGGTAAAGGCTTTTGATGAACGGGCGTCATGCAGTTTGCTTAGTGCTCTCCTGAAAAGGAACGTTCTATGCCCTTTGGAGCCCTTGCCGGGTCTTGCTACAATGCTTAGGCTTCTCAACAGATTTCAGTGCCGCCTATCTTGTGGTTCATGGCGAAATCCACACCAGATCCTGGACTTCAGAGCTCTCTATGAAATCCTGGCTATGAGATCTGAGGGCTTAACTTCTATACTGTTTTGTTCCTCTTCTATTAATGCGATGATAGTTCCAGGAATTTCTTACTGCAATACTTATGAAAATGAAGGCCAGGAAGTAGATAATTCCACCCGTTTGAACTCCTTGTTATTGGTGGTTGTTCCATTTCCATTTTGGTCGGTGGCAAACCCCCATCACTTCAACAACATAACCGAACTCACGGGAGGAGAAGATATGGATGAAAAAGAAAATCTTTGA

Protein sequence

VETQSRPITMNLAFSCMLRCLGFSTDFSTACLAVHGEIIHTRSWTSEVYKILGMLLCADSSSFAVFFLFWLLLMNEHRLLYTVYDSIKAMRSEGFASLVLLFIVCVLRVFLDLGQFLTAILMNMQPMKQIIPPCPFDKRGMRRPYFVFLCPLEPLPGLATMLGVLTDFSATYLVVHGEIHTRSWTSELSLKSSPLLISTSTVTSSFIQSIQQSHSSLLVKAFDERASCSLLSALLKRNVLCPLEPLPGLATMLRLLNRFQCRLSCGSWRNPHQILDFRALYEILAMRSEGLTSILFCSSSINAMIVPGISYCNTYENEGQEVDNSTRLNSLLLVVVPFPFWSVANPHHFNNITELTGGEDMDEKENL
Homology
[Close]
BLAST of CcUC08G148060 vs. NCBI nr
Match: KGN46021.1 (hypothetical protein Csa_004954 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 80.9 bits (198), Expect = 2.6e-11
Identity = 44/65 (67.69%), Postives = 50/65 (76.92%), Query Frame = 0 

Query: 74  MNEHRLLYTVYDSIKAMRSEGFASLVL-----LFIVCVLRVFLDLGQFLTAILMNMQPMK 133
           MNEHRLL T YDSIKAMRSEGFAS++        +VC++ VFLDLGQFL A+LM MQ  K
Sbjct: 1   MNEHRLLCTAYDSIKAMRSEGFASVLFYSRFCCSLVCLVLVFLDLGQFLNAVLMKMQHRK 60

[Close]
BLAST of CcUC08G148060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KE55 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G044020 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 80.9 bits (198), Expect = 1.2e-11
Identity = 44/65 (67.69%), Postives = 50/65 (76.92%), Query Frame = 0 

Query: 74  MNEHRLLYTVYDSIKAMRSEGFASLVL-----LFIVCVLRVFLDLGQFLTAILMNMQPMK 133
           MNEHRLL T YDSIKAMRSEGFAS++        +VC++ VFLDLGQFL A+LM MQ  K
Sbjct: 1   MNEHRLLCTAYDSIKAMRSEGFASVLFYSRFCCSLVCLVLVFLDLGQFLNAVLMKMQHRK 60

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CcUC08G148060 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KGN46021.12.6e-1167.69hypothetical protein Csa_004954 [Cucumis sativus][more]
BLAST of CcUC08G148060 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CcUC08G148060 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0KE551.2e-1167.69Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G044020 PE=4 SV=1[more]
BLAST of CcUC08G148060 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC08G148060.1CcUC08G148060.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
cellular_component GO:0016020 membrane