CcUC05G104050 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC05G104050
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr05: 31766888 .. 31770517 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC05G104050
SyntenyCcUC05G104050
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
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GTTTAACTTATTTCAAAGGTATCTAGTTCATAATTTGTAACCTAAACAAATCTTTTGCCGCCACTAGCTTCGATGGCGGGAGCCAACGATCGAAGGAAACACCACCGAAACGCTGTAGTAGAGAGAGGAAGAGAGATTTGGTAGACTGGCGTAGTGAACAGAAATCAGTAATTTCTTCTCAAGAGCCATTCCCCAAATGCCGCTTCAAGGCCTTGTGCAATGGATGTTCATCGATGTAGTGAAGCGTGAAGCTCGGTGAGGCCTTGTTTTAGGTTTTGCATTTTCTTATTCTACTTTTCGCATCTTTGATTTTCTTCCGGTTGTCGAATTTTCGCACATGAATTTGTGAATTACTTTGTTTTTCAATATTCACTCGATTCGATCTCAGAGTCGATGATGTATATATGAATGCTTGTAATGCGGGCGTTTCTATTCGAAAGGATGCGCCGATGAACAGAGAGGAATCAGCAATGTTTTCTCAGGAGCCGATCCCTAATGGATGACCGTCGAAGAAGTTGGTCGAGTTATTGTTTGAGGTTTTTGCATTTTTCTTCTTCGCATTTTCGCATCGTATTTCGAGATACGAATTTGTGAACCTTTTTTGTTTTTGAAAATTTACCATTCGTTCTCAGGACCACTAGTGTATGGATACTCGGACTGTGGTTGTTGTTTCTATGTGAAAGTACTTTCGTCTTCTAATTCCTTTCTAATTGTTTCTCATATCACATATCGCTTGAATCGTTTCATTTCCTTGAGTTTTGATGTTTTGACTTGCAGAATCAAAAACATTCAAAGAAGAGAAGACAGAGGAATTCTTCGAAAATTTGAAGGCTAAATCAATTGGATGGCTGTTGATGTCATGGATCCACGGGGTCTCTCACATCCAAAACGGCAAATAACTCGGTAGGTAGTAGTTTAGAAATTCTTTTATTTTGCGTACATACACTTCCATTTTGCTTTACTATTATTATTCTTTTACTATGTAGAAGATGGATCTTAGGCCGAATCTTGTTTCTCTTGAAGAATATTAGTGTTAGATCACTCTGAGTTTAAGCTTACAAGTTAGAGGAAGTTTAAATTTCTTAAAATACGTTCTTAACACTTATTACATAAAATAGAGAGGAAATAATATTTTAGGAAGTCATTGTTATACATTATTTAATCACCATGGATTCAAAAGTATAGGCTTATACGTTAGGATAGATAATACTCCCCCAGCATCTCTGTTATTGTTAATTTATGTTCATCCAAGGGTGACGGTCGCTTCTTCATCAAGAAATATTACTCGTTTGTGCCACGCCCACAAATAAAGATACTGACATAATGTATCATAGGAAAATCGTCTCTTCTGGGCTTTTTGTTTCTGAACTTTTTGTCTTTATCAATCAATTGAAACAGGATAAAGCAAAATTTTGTCTTTATCAAAATTCCCTGTTAGTCGAATTGAACCTCCGTAGCACAGCGTATTTCTCTGAAGAGAATATAGGTGACCGGCAAATTTTTATAGTAATTTTGAAAATTATATTTAAGTTTGCAAAGATGACTTCGGTCGAGCAACGGACTAGAGGTAAACATGGAAAGGGAAGATTGCCTCTACAGCTTCTATATCCACCCTCTAAGCCTGTTAGAAATTTTATTTTGTAGCTCTGAATGTTTAATTTAGCTGTACTCGGTCGCTTTTGTGGGTAACATTTGGATGCAATGTGGAAACATAAAAGAGATATATCGAATGGGAAAAAAGGTATCCATGATCACGACTCTGCAATTGGTCTCATGACTCTCATCATCAAGGTAGCACAGGAATATTTCTAACCGAGGTGAATCTCTCCCTGGTTTCTTACATTCAATACTTTCAGTTATGTGATTGTAATGCCTGTCAGAAAATGATCTAATTGACGCAATTAAAAGACTACTGTCTATGTACAATACAATGGTTACCCAAGAAAGAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAGATTTTATGAGGTTCTGTCTCTGTACATACAATCGTTTGCAAGCCAAATATTTTGCCCTTTCTTGACCTTAACAGGCAATGAAGGTCCAACAAGAAAGATGAAGCACACACCTCAATCAGCACATGTAAATTTGTAACAGTGCTCTTGTGTCCCTATGGAGACAGCCCTGATATCAGAAAACTCTATAGAGATGAGCATGGCGGCCAAAACTGCAGCTGTCAGAAGCCCCATGTTGTTCTCATAGCGATTTCCTGCATTATGTGGTCGACCTTGGCGGTGACGTGCTTGTGCTGAACCAGCTGCATAAACAGGGATTACGGCTGTTCCTCCTCCTGTATGAGGTCTACTGCCACCACCATTTTCTCCACCGCCGCCGGCTGCACTTCCACGACCTGCACTTCCATGACCTGCAGTTCCACGACGAATCCCATTAGAAACGGTGACTGGACTTGCACTGTATCTTCTGTCAATCTGGTTAGTAACTCCATCTTTGCCATGTTTTCTTGTGTAAGTTTTCTGTTGGTAATTAGACTCTGCATACATATAGAACATATTAAAAAAAACACACTACTATTTAGTGGTAAGTTTTCTGTTTTATTTTCTTGGAAATGCGTAGGTATATACTATTCGTGGCACGCACTTTTGAGGCACAAAAATTTCCATTTTATAAGTTTCCAATTATCTCCAAATACATTTCTGATTTAAATCTCATTTTAGACTAACTTTTGAGTTTGCACTATTTTCGTAATTTTTAAAATGTCTGTCTTGGTCACATAAATTTTTTGGTTTGTTCTATTTTGGTCGTTAAACTTTCAAAATGTCTATTTTAATTCCTAAACTTTAAAAAGCAATAATTTGATTGTCTTTGCTATTTTACTTTTCTACTTATACCGCTTCGCTCGTCCAATGTTTGTCTATAACTTAAACGATTTGAAATCACATTCATATTAATATACGTAGATACAATCATCATTGGTTGGCCTAGTGGTGAAAATGGTTAAGAGGTCATGGGTTCAATCCATGATGGTCACCTACCTAAGATTTAATATCTACGAGTTTCCTTGATACCCAAATGTTGTAGTCTTAGGCTAGGTGTGTGTAGTCATTTAGTAATTAATCTTAATAATTTTGTTCAATTGTATTTTTTCTGTTCTTGAAACTCCTTTTTGTCTCTACCCAAGTTTTAAATTACATTTGTAGTATTAGTATATATATTCTCTAATTAAATGCAGACTAATAGGAAGAGCTTGATGAACAAGTTTTTGAGCTATAGTAATAGAAAACACTTCTAAGAAAACAAACTTTTTGCAACCAAACATATATGTAACTTGTAAGCATCCTGTATCATAAAATAAATGAAAACTTTAATCATTTGATAACTTTGTTTTTATTAAGTATTACCATTCAAATAGAAAAAACTAAATCAAAGATTATGAATATCTTGACTAATTAGAATAGTTGATTATTGGATCACTTCTGTCAGTATTGAGTTGCAGCATCTTGACAGATATTGATTTAAAGTATTCTCTCCCAAAAGCTAAAGTTAGTGGAAAACCGATACATTGTTATGCCCCTCCATTTACAGGATATTGAACTTTGTTTTATTTGTATATTCATTTTCATTCGACGTTGTAAAAGACATATTGACTTGCACTCCTC

mRNA sequence

GTTTAACTTATTTCAAAGGTATCTAGTTCATAATTTGTAACCTAAACAAATCTTTTGCCGCCACTAGCTTCGATGGCGGGAGCCAACGATCGAAGGAAACACCACCGAAACGCTGTAGTAGAGAGAGGAAGAGAGATTTGGTAGACTGGCGTAGTGAACAGAAATCAGTAATTTCTTCTCAAGAGCCATTCCCCAAATGCCGCTTCAAGGCCTTGTGCAATGGATGTTCATCGATGTAGTGAAGCGTGAAGCTCGAGTCGATGATGTATATATGAATGCTTGTAATGCGGGCGTTTCTATTCGAAAGGATGCGCCGATGAACAGAGAGGAATCAGCAATGACCACTAGTGTATGGATACTCGGACTGTGGTTGTTGTTTCTATGTGAAAAATCAAAAACATTCAAAGAAGAGAAGACAGAGGAATTCTTCGAAAATTTGAAGGCTAAATCAATTGGATGGCTGTTGATGTCATGGATCCACGGGGTCTCTCACATCCAAAACGGCAAATAACTCGGTAGGTAGTAGTTTAGAAATTCTTTTATTTTGCGTACATACACTTCCATTTTGCTTTACTATTATTATTCTTTTACTATGTAGAAGATGGATCTTAGGCCGAATCTTGTTTCTCTTGAAGAATATTAGTGTTAGATCACTCTGAGTTTAAGCTTACAAGTTAGAGGAAGTTTAAATTTCTTAAAATACGTTCTTAACACTTATTACATAAAATAGAGAGGAAATAATATTTTAGGAAGTCATTGTTATACATTATTTAATCACCATGGATTCAAAAGTATAGGCTTATACGTTAGGATAGATAATACTCCCCCAGCATCTCTGTTATTGTTAATTTATGTTCATCCAAGGGTGACGGTCGCTTCTTCATCAAGAAATATTACTCGTTTGTGCCACGCCCACAAATAAAGATACTGACATAATGTATCATAGGAAAATCGTCTCTTCTGGGCTTTTTGTTTCTGAACTTTTTGTCTTTATCAATCAATTGAAACAGGATAAAGCAAAATTTTGTCTTTATCAAAATTCCCTGTTAGTCGAATTGAACCTCCGTAGCACAGCGTATTTCTCTGAAGAGAATATAGGTGACCGGCAAATTTTTATAGTAATTTTGAAAATTATATTTAAGTTTGCAAAGATGACTTCGGTCGAGCAACGGACTAGAGGTAAACATGGAAAGGGAAGATTGCCTCTACAGCTTCTATATCCACCCTCTAAGCCTGTTAGAAATTTTATTTTGTAGCTCTGAATGTTTAATTTAGCTGTACTCGGTCGCTTTTGTGGGTAACATTTGGATGCAATGTGGAAACATAAAAGAGATATATCGAATGGGAAAAAAGGTATCCATGATCACGACTCTGCAATTGGTCTCATGACTCTCATCATCAAGGTAGCACAGGAATATTTCTAACCGAGGCAATGAAGGTCCAACAAGAAAGATGAAGCACACACCTCAATCAGCACATGTAAATTTGTAACAGTGCTCTTGTGTCCCTATGGAGACAGCCCTGATATCAGAAAACTCTATAGAGATGAGCATGGCGGCCAAAACTGCAGCTGTCAGAAGCCCCATGTTGTTCTCATAGCGATTTCCTGCATTATGTGGTCGACCTTGGCGGTGACGTGCTTGTGCTGAACCAGCTGCATAAACAGGGATTACGGCTGTTCCTCCTCCTGTATGAGGTCTACTGCCACCACCATTTTCTCCACCGCCGCCGGCTGCACTTCCACGACCTGCACTTCCATGACCTGCAGTTCCACGACGAATCCCATTAGAAACGGTGACTGGACTTGCACTGTATCTTCTGTCAATCTGGTTAGTAACTCCATCTTTGCCATGTTTTCTTGTGTAAGTTTTCTGTTGGTAATTAGACTCTGCATACATATAGAACATATTAAAAAAAACACACTACTATTTAGTGGTAAGTTTTCTGTTTTATTTTCTTGGAAATGCGTAGGTATATACTATTCGTGGCACGCACTTTTGAGGCACAAAAATTTCCATTTTATAAGTTTCCAATTATCTCCAAATACATTTCTGATTTAAATCTCATTTTAGACTAACTTTTGAGTTTGCACTATTTTCGTAATTTTTAAAATGTCTGTCTTGGTCACATAAATTTTTTGGTTTGTTCTATTTTGGTCGTTAAACTTTCAAAATGTCTATTTTAATTCCTAAACTTTAAAAAGCAATAATTTGATTGTCTTTGCTATTTTACTTTTCTACTTATACCGCTTCGCTCGTCCAATGTTTGTCTATAACTTAAACGATTTGAAATCACATTCATATTAATATACGTAGATACAATCATCATTGGTTGGCCTAGTGGTGAAAATGGTTAAGAGGTCATGGGTTCAATCCATGATGGTCACCTACCTAAGATTTAATATCTACGAGTTTCCTTGATACCCAAATGTTGTAGTCTTAGGCTAGGTGTGTGTAGTCATTTAGTAATTAATCTTAATAATTTTGTTCAATTGTATTTTTTCTGTTCTTGAAACTCCTTTTTGTCTCTACCCAAGTTTTAAATTACATTTGTAGTATTAGTATATATATTCTCTAATTAAATGCAGACTAATAGGAAGAGCTTGATGAACAAGTTTTTGAGCTATAGTAATAGAAAACACTTCTAAGAAAACAAACTTTTTGCAACCAAACATATATGTAACTTGTAAGCATCCTGTATCATAAAATAAATGAAAACTTTAATCATTTGATAACTTTGTTTTTATTAAGTATTACCATTCAAATAGAAAAAACTAAATCAAAGATTATGAATATCTTGACTAATTAGAATAGTTGATTATTGGATCACTTCTGTCAGTATTGAGTTGCAGCATCTTGACAGATATTGATTTAAAGTATTCTCTCCCAAAAGCTAAAGTTAGTGGAAAACCGATACATTGTTATGCCCCTCCATTTACAGGATATTGAACTTTGTTTTATTTGTATATTCATTTTCATTCGACGTTGTAAAAGACATATTGACTTGCACTCCTC

Coding sequence (CDS)

ATGCCGCTTCAAGGCCTTGTGCAATGGATGTTCATCGATGTAGTGAAGCGTGAAGCTCGAGTCGATGATGTATATATGAATGCTTGTAATGCGGGCGTTTCTATTCGAAAGGATGCGCCGATGAACAGAGAGGAATCAGCAATGACCACTAGTGTATGGATACTCGGACTGTGGTTGTTGTTTCTATGTGAAAAATCAAAAACATTCAAAGAAGAGAAGACAGAGGAATTCTTCGAAAATTTGAAGGCTAAATCAATTGGATGGCTGTTGATGTCATGGATCCACGGGGTCTCTCACATCCAAAACGGCAAATAA

Protein sequence

MPLQGLVQWMFIDVVKREARVDDVYMNACNAGVSIRKDAPMNREESAMTTSVWILGLWLLFLCEKSKTFKEEKTEEFFENLKAKSIGWLLMSWIHGVSHIQNGK
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CcUC05G104050 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CcUC05G104050 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CcUC05G104050 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CcUC05G104050 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC05G104050.1CcUC05G104050.1mRNA