CcUC04G062760 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAACAAGAATCAGCAAAGGAAAAGCTTTCCCTCAATGATGGCCATAGTGAATCAATAAATCCTGAGCAAAAAGATCTTCCTCCAGGATTATAGTAAGTCAAATAACGAAGGGATTGCAAAAAGAAGGCCAATGGAAGGTATGGGCATGCTTCTTCCTCTTATCACAATAGTCGAGGCCAGAATTGAACCAAAGGATCCAACACCAAAATCTTGATCAAAGATACATTAGAAACATGTTTGTGGAAGTTGCTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAACACAGTTACAGAAAGAATCCAAGGCTAACCTACAAATTGAATTTCAAGCAAAATCCCATCTTAAGTAGGGGAAGGGGAAGATAATTTCATTGCCCAACAAAGTGGTGGATGATGGATGGCCAAACAAGACCCAAAATGTGAAGCAAAAAAATTCCTTATGGCACCGTGTTGGTTGTTTATAGCCCACATTCTGCCTATTCCCCTAACCAAGATATATATAAAAAATTTAAATGGATGTGCATTATGAGGCCCATGCCCAAGTGGTATGACCCGACCTCAAATTTTGAGTTCGAGGCTAAAGCTGACCTCATGGTGACGGAGCCTTTTTTGCCCTATTCACATGCATTATGGGGGCCCACGCTTGAGTGGTATGGCCTAACCTCATATTTTGAGTTTGAGGCTAAGGTCAACCTTATGATAACGTAGCCCGTTTGCCCCATTCACATGCATTATGAGGCCCACGCTTGAGTGGTATGGCCCAGCCTCGAATTTCGGGTTTGAGGCCAAGGCTGACCTCATGGTAACAGACCCTTTTTGCCCTATAAAGGTGCATTATGAGGTCCACCTGTCGAGTGCTATGGCCCAACCCAATATTTCGGGTTTGAGGCCAAGGCTGACCTTGTGGTAATGGAGCCCTTTTCCTCCATTTACAAGGTTTTCTTACAAAATTCAAGGTAAGTCATGATGTCTGAAAAGCACCTAAAATGTGCTTTTATTGCCTTTGACTTAGGGATGTTTTTTATTAGATATAATGAGTTTGCTAGTGGTTTTCAGGTAATTAAGAAGAACTTAAGTGTCCAAGGCCAAATGAGCCAAACCAAGCCAAAACCGAGTAAAAAACGAAAGAAAATATGGGAAAACCCTAGAAACAGGGCAGTGCAGCTGAGAGCGTCACTGCATTACCCTTTACACTCCAAACCCGAGAGTTTAAAATTTGGGACAGCAGGAGAGCGCAGCGACGCTCCGACTAAATTTTCTAGAGCATAGCTACGCTCTCTTAGAGTGCAGCTACGCTCTCTTTCCAAAAATAAAAGTCTGCGATTTTGGAAAGTTCTTCTTAAGCAAGCATCTGATTTTCTATAAATTGGGAGGTCCTAAGCCGACTTCTACATCAAGAATTGGAGAATTAGAGACTTAGAGTGAGGGTTTAGTGCAAGATATGAAGATTCCATAGTGTCGAAAGGTTCAAGGATCATTAGTAGCGACATTCTCTCTTGACTCAAGACCATTTGAGAATCATGGAACTCTATCCGGGAGCTACAGAACTAATGACTTTATTAGAAAGTCGAATTACTAACTTTTACACGAATTTTCAAGTGGATGAGATCGGTCGAGTGGTCTCAATTGGAGATGAGATTGCACGTGTTTAAACCACCTCCTCCTCACATACAATTAGTGGAGATTTCCCTTTGCTTAAAAAATGGATTTTTAAATTCAATTTTATAAAATTGATTTTCTAAATCAAAATTAATTTTAAATAAAATTAATTTAAGATATGATTAATTTAAATAATAATTAATTTAATTAAATTTATTATTTTTCCACTTTTCTTGGCAAATTCCACTACGATGAATCTCTATTCATCTTTAAAATATTTAAATCACATTTAAATATTTCTAACTCTCCAATTTCGTCTAATTCATAATTAAGCGAAAAAACCATATACAATGCTCCTCAACTGCATTTGAACATTTCAAACTCACTCAATATATTGTTCTAAGGTTTAGTCCATGATCTAACAAGAGGACCTAATGGACTTACAGATCATGAGCTTCAGCGATCCGAAATTAACTAGCTAAACTCATTAACCTAGTTAATTAACATTCGTTAGCACCAGGTCACTCCACTAAATCTGCACTCTCCTCACTGTAGATATATTATGTCCACTTGATATAACTGTAATAAGTAAATCGAACCTTCACAAGTTGTTAGTAATTATAGTTGGGTCAAAATTACTATTTTACCCCTATAATTACATCTCATTCCTTAAGTCCCGGTGATCCTCTAATTAGTAAGGGAATCCATTTGAGCCTTAAGAGAGTTTACCTCATCCACCTCATACAATCCGGCAGCTTTTGGGATGATTGGGAAGGATCGTTCACATGGCCAATTGTAAGATGTGGTGGCCAAGTCCTCTAGTATGGTATAAGCCTCTTGAGCATTCTTAGAAAAGATTGACCCTCTAGCGGTAGCATCTAGGATGGACTTGGTTGAACTTGACAATCCATTGTAAAAGAGATGAATTTACAACCAATCCGACTACCCATGTTGAGGGCACCTCCTCAAGAGATTCTTGTACCTCTCCCAAGCCTCATACAATTGTTCACCTCAAGTTGGCTGAATGTTCCTATCTCCTTCCTTAGCCTTTGAGCTTTAGCAAGTGGAAAATATTTATTCAAGAAAGCTTGAGCTAAGATCTCCCACATTGTGATGCTATCCAGAGGGATGGTTTCTAACCAATCATTTGCACGGTCCTATAAAGAGAAAGGAAAAAGTCTTAGTTTTATAGCATCATTAGAGACCCCATTCATCTTTACCGTCCCGCATATCTCTACAAAAGACCGTAGGTGCTTGTGAGGATCTTCATTTGTTCTTCCTTTAAAGGCTAGCTCTCTAGCCATTTGAATCAACCCCGGTTTCAACTCAAAGTTGTTGACATTGATGGACACATTCATTGTTCGGTTGATTTGCTGATAATGTCGGTTTCAAGTAGTCTCGAATTGCCTTTGGTATCTCCTCTGCCATCTCCCTAGATTGATTGTGTTGAGCCCTTAGATTCTTTCTATAGGTCCTATCAATCTTAGGATAAAAAAGGGGGAGGTTAGTATTATCACGAGGCATCAACCGACAAAATAATAAACCAAATAATAATATACACCTCAAATTAAGATCTATCAATTCTAATGAATATTGAGCAAATAAAACTGTTCTTTGGATCCCCGACAATGGCGCCAAAAACTTGATGCACACTTTAAGTGTTAACTGCAAATGTACGGGTCAAGTTATAATATAAGACGGTAAAGTCTGAATATCATTCTACTGAGGATTTTATTGTGAAGGTTTAAGTTATTTAGCTATTCTAGAATCGAATCAATTTTATTTGAGGATTGGAATTGAAGTTGTGTTTTAGGAAATAAAACTAAATAAGAAAAGCAAATAAAGTAAGAAACACAAGAGTCAAAGAGAGTCCTAGGGCAATGAATCCTTGTTTACTTCATCATGCAATATTCTAGGATTAATGAATTTTATTGTAATTCTTATGCTTAAGTCTAGAAACATAAATCCAAATTATTTTCTCTAAAAATAACATTTTCTCATGCAACTCAATTGATTACTAATCTCTTGAAATCAATAAAAATTGCATGGAATTAAGAATAGTTTTTAGCAACTTTCATTGTTAACCTAACTATTTTCATGAGAGATTAACAACGATTCTTTGTTTTAGATCTAGTTAAATATACAATCTTTCAATCATACATCTAATCTATCATTCAAACATGTCCATTCAACAAGATTAAGCACAATAACAAAGAAAAGCATAATCATTACAACAAAACCATGAAGAGTTTACAATATCAAAATGAATTCATAAACAATTTATCAAAACCCTAAAACTAAAGAGTTTAGTCACTCATAGCTTGAAGCAACATGTTCAAATAATATAAACAAAGAAAGAGTGTAAAGAAAGAGAAGCTCTACTTAAAAGAGGCTCTTAATTGATGAAGCACCGTCATGATCTCGTTGACCTTCACCTTGGAAACTAGAACGACACCACGACTCTCTCTTGAACTCTTTTCTCTCTTCTTTGTAGCTAACTCACTCTTTGAACTCTCTAATTTCACTCAATTCTCTCCTTTTTGTATCTCTTTTTGTTTGTAGATTCATGATTAGGGTTGCTCATGCTTTCTTCTTTAAATAGAAGAGACTAATTGAAGAAAATGGTGATGCTTGGTGGCTAATTAATGCTAACACTCAACCCAACTCAAATCTGAAAAAACCAGTGTATTCTTCAGTTTTTGCTCCAAATTGAACTCAATTCTAGTTCCCAGAGTTTGTTCTAAGGCTTGAGAATAACAAGGAAGACTCTAAAGGTTGTCTATGAAGTGTTCATGATTAGAAATTCGAAGGAGAGTGCTTCAATTTTGAGCTACAACAAGTAAGTGTTCCTCCTCTGTTTTTCGTTTTAGAACAAGCATGTTTAATCTTCAAAATTGATGTAATTAGAGGGTTTTAGATCCTAATTGTCACACCCCTCCCAGATACCTTTTTAACCTAAGAGGAAATGCGATGACAGCAGACACCAACTCTTTTACGGCATCTACTGTCAACTTGCTCAACCATGACCAAACACCTAATAAACAGATATAAACCATGTTAGGACATCAATCTTTTACCAAGGTTAAGCTATCATACAAATACTGGTTTACATTCAAACTTAAAAGTTACATGAGTTCAGTTCACTAACTCCTGCTCCTTAACCCTCTATATATACAACACATGTTTAAGATCAAATATTTACAATGTTCTAAGTTCACAGGCACTGGTGGTAGGCTCAGACGAGTTGCTGTGTAGGCTAAGCACTCTGGACTCGCTTGCTACCTGAAAAAAAAAAAAAAAAGAATACAGAGAAAAACATGAGTTAGGTTGCCCAGTGAGTGGCCTATTTAGTATAAACCTTTTGTTAACTCAGAAACAATTCAAAACTGTATTCAATTTATAATTA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Match: EFH44670.1 (hypothetical protein ARALYDRAFT_330174 [Arabidopsis lyrata subsp. lyrata]) HSP 1 Score: 155.2 bits (391), Expect = 7.5e-34 Identity = 73/82 (89.02%), Postives = 75/82 (91.46%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G062760 vs. NCBI nr
Match: QIT04093.1 (Ycf2 protein [Luffa aegyptiaca] >QIT04110.1 Ycf2 protein [Luffa aegyptiaca] >QKX48604.1 hypothetical chloroplast RF21 [Luffa aegyptiaca] >QKX48623.1 hypothetical chloroplast RF21 [Luffa aegyptiaca]) HSP 1 Score: 154.1 bits (388), Expect = 1.7e-33 Identity = 81/119 (68.07%), Postives = 82/119 (68.91%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G062760 vs. NCBI nr
Match: YP_009752370.1 (Ycf2 protein [Bryonia marmorata] >YP_009752388.1 Ycf2 protein [Bryonia marmorata] >QIT04344.1 Ycf2 protein [Bryonia marmorata] >QIT04362.1 Ycf2 protein [Bryonia marmorata]) HSP 1 Score: 154.1 bits (388), Expect = 1.7e-33 Identity = 81/119 (68.07%), Postives = 82/119 (68.91%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G062760 vs. NCBI nr
Match: QJR53001.1 (hypothetical protein RF2 [Herpetospermum pedunculosum] >QJR53017.1 hypothetical protein RF2 [Herpetospermum pedunculosum]) HSP 1 Score: 154.1 bits (388), Expect = 1.7e-33 Identity = 81/119 (68.07%), Postives = 82/119 (68.91%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G062760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0ZIV6 (Protein Ycf2 OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=ycf2-A PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 149.8 bits (377), Expect = 4.1e-35 Identity = 79/119 (66.39%), Postives = 80/119 (67.23%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G062760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B1A978 (Protein Ycf2 OS=Carica papaya OX=3649 GN=ycf2-A PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 148.3 bits (373), Expect = 1.2e-34 Identity = 78/119 (65.55%), Postives = 79/119 (66.39%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G062760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0ZZ78 (Protein Ycf2 OS=Gossypium barbadense OX=3634 GN=ycf2-A PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 148.3 bits (373), Expect = 1.2e-34 Identity = 78/119 (65.55%), Postives = 79/119 (66.39%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G062760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2L949 (Protein Ycf2 OS=Gossypium hirsutum OX=3635 GN=ycf2-A PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 148.3 bits (373), Expect = 1.2e-34 Identity = 78/119 (65.55%), Postives = 79/119 (66.39%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G062760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0G9Q1 (Protein Ycf2 OS=Daucus carota OX=4039 GN=ycf2-A PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 147.1 bits (370), Expect = 2.7e-34 Identity = 77/119 (64.71%), Postives = 79/119 (66.39%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G062760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: D7MHQ6 (AAA domain-containing protein OS=Arabidopsis lyrata subsp. lyrata OX=81972 GN=ARALYDRAFT_330174 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 155.2 bits (391), Expect = 3.6e-34 Identity = 73/82 (89.02%), Postives = 75/82 (91.46%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G062760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: D7KRS3 (Protein Ycf2 OS=Arabidopsis lyrata subsp. lyrata OX=81972 GN=ycf2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 155.2 bits (391), Expect = 3.6e-34 Identity = 73/82 (89.02%), Postives = 75/82 (91.46%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G062760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A343F2F1 (Protein Ycf2 OS=Citrullus colocynthis OX=252529 GN=ycf2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 154.1 bits (388), Expect = 8.1e-34 Identity = 81/119 (68.07%), Postives = 82/119 (68.91%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G062760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6H0ET42 (Protein Ycf2 OS=Trichosanthes kirilowii OX=3677 GN=ycf2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 154.1 bits (388), Expect = 8.1e-34 Identity = 81/119 (68.07%), Postives = 82/119 (68.91%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G062760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6M3RUH1 (Protein Ycf2 OS=Trichosanthes rosthornii OX=676073 GN=ycf2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 154.1 bits (388), Expect = 8.1e-34 Identity = 81/119 (68.07%), Postives = 82/119 (68.91%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G062760 vs. TAIR 10
Match: ATCG00860.1 (Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA type, core ) HSP 1 Score: 140.2 bits (352), Expect = 2.3e-33 Identity = 75/119 (63.03%), Postives = 76/119 (63.87%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G062760 vs. TAIR 10
Match: ATCG01280.1 (Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA type, core ) HSP 1 Score: 140.2 bits (352), Expect = 2.3e-33 Identity = 75/119 (63.03%), Postives = 76/119 (63.87%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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