CcUC04G061820 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC04G061820
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr04: 13320880 .. 13326482 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC04G061820
SyntenyCcUC04G061820
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGGAAGACAACCCCGTTCGTGCTCGTGGTTGCCGCCATCTCAGTAAACGTGGGTGAGTTGTTTATTGACTATTTGTTTGGATCTAGAGTTGTCTTCCATAGTGATATAGACTTGTTAATTGAGTATTTTTTTTGGATCTAGAATTGTCCTCTGCAAATGAATGTTTGAATGAAATTAGTTCTCGTTTTGGAAGATTAGTTGTCGTTTTGAAACACATAGTTTAAATTAGTGGACTTTGCATTCTGAGACTTACCAAATATTATAACTACCATGTGAAAATTTGAATGAAATTGTAATGAGAATGATGAAATTACAATGAAAATGATTAATGTTGGTCTTTTAGGTTGATTTTGAGTTTGGAAGTCACACTTAAATATGTTCAAGTTGTTTTGAAAGTCATTAATGTCATTTATACACTTTTTAGATACATTTTTGTTGCTTTTGAAACTCAAAAGGACACTTAGACACTCTTGATGGGTTGAATTTAGGTTGGTTCATTTAGACACTTGAAGCTATTATCTGTTTGATGAAATGTTCGTTATAAGTATATCTTTTGTTTCTTTTGTTGTGTATACTTATCAGTGGAATTGCTTCTCATTAATTGTTTTCTTGATTTGCTTTGCTTTTATCGAACTTGTTTTTGGTCTTTTTACTTTTTTTACTTTTGTTTATTATTCTAGTAAAAACTTTAAACTAGAATAAAAAATATATGAATTTTCATAATTAGGTTGTTTAGAGAATTATCAATAACGGAACACTCTTGTAGGTGGACAAATAAGACTTTAAAGTATAATCAACATGGCACAAAATTATTGGGTTGTAGTTGGACAAATAAAACTTCCAAGTGTAACTTTTTTATTAATCAACATGTTACAAAATTCTCTTTGACACTTTTTAGGAACTTAAGACATTTTGAATTTTGATTGTTTTGGGAGTTAATAAGTCTCTTGGACACTTTTTATGCACTTTTTAAGTTGTTTTGAGGGTCAAAGTGACACTTAGACACTTTTAGGTGGGTTTTGAGTTTAAAAGTCATACTTAGGCATTTTGAAGTTGTAGTTGGGAGTTAAAGTGTCATTTGGACACTTTTTAGTTACTTTTTGATTGGTATTGAGTTTGTAAGTCATACTTAGGCATTTTGAAGTTGTTTTAGGGAGATAAAGTGTTATTTACACACTTCTTAGGTACTTTTTGGTTGGTCTTGGATATTATGAAGACTCTTGAGAATTATCTAGGTTGTTTTGGGAGTTAAAGTGTCACTTAGACACTTTTTAGGTACTTTTTGCTTGGTTTTGAGTTAAGAGGTCATAGTTATACATTTTGGATTTGTTTTGGATTTGTTTTGGATGAACTCACTGAAAAGTACGCAAAGATGGCGGAGCAAAATGAGAAGTTAATGAGTCAACTTGCGAAATGGGAAGATAGATGGACCAACGTTCAAAAATTGTTGGGACTAGAGGCGATGGACCTTCAACTTCTTAGGTATTTATTTTTTTAAAATTAAAGTTCAAAATTATGGTTGTGGCTATCCTGTAGTTACGGTAGCCAATTCATGCATTTAGTACCTTTATTATATGTTTAAGTTATAATGTGTTGTGGCTATCCTGCAGTTACGATAGCTAATTCATGCATGTTTGTACCTTCGTTATATGTTTAAGTTATAATGTGTTGTGACTATCCTGCATTTACTGTAGCCAATTCATGCATTTTTGGAGTTGTTTTTGGAGTTTAGACACTTTTTAGCCACTTTTTGGTTGGTTTTGAGTTAAGAGGTCATAGTGTGCATTTTGGACTTGTTTTTGTAGTCAAAGTGCCATTTAGACACTTTTTAGCCACTCTTTGGTTGGTTGAGTTAAGAAGTCATAGTTGTGCATTTTAGACTTGTTTTTGGAGTTAAAATGTCACACTCTACTTTTAAAAATCAACGCGTTGAAGAGCCTATAAAGAAAAGAAGTAAGAGGCCATGTTAGATGCATGGTCAGGACTAAGGTAACGCATGATGAAGGTGGACGCATAGGAAGTAATCCAAGAGCTTGAATGAAAAAAAGTGAAACGCGTAGGAGGTAATTATGAAGAAGATGTAAGCATTGGCAAAGGTAAGACGCATAAGCAAAAAGGAGTAAAGTTATGACGTGGAGTATTGGAAAGAGATCCAAAACTCGGAAAGGAAGGATAAATGCATAGTGAGGAATCGGGGAAAGAATACTATAGCAAACTGAGTATAGACTACTATCAATGGATGTTCTCGAGTGTTGGATAAAGCAGAAGGTTGAGAAGTAAGCTTAAAGACTAGACTAAGAGGTGGACACATACTAATTTATCATAAGAAATATTTTAGTACAAATAAAAGGTTAAATGAATAACCTTGGATTACAAGCCCAAGAACGCATAGAGGGATAATCAAGGAATCCTCAAGGATAGGAGGAAGATCATGGATGCATAATGAAGTAAAGGTGAACGCAAAGAGTACAAATGCATAAAGGGTGGTTTTGAGTTGGATTTGGTTAAGAATGGTAAATCACATCGTCGGATGTGTGATCACACAAGAGAATGATTTGTAGTTAAGACTTGACATAAGGGAAGAAAGTTGGATGCATGGTATGATGCGGTAAGGTGCAAACGCATTTGGGACATTGACGCCTAGTAGTATGCGGTGGAGAAACGGGTTCAAAGGTATTATGGTAAAGAGTAAAGGAAGTAAGTAATGAAGCTAAAACCTTAAAGGAAATTCAATGGACGGATAGGGGTAGTATGATTGAATGAATAGTTTGTATATTGGAATATGTTGGACGCATAAGATAAGCTTATACAGGCTAGGTGGCTTCATATAGACTTGACAACTTATATGTAGGAGGTGTTAGAAGACATGTTGAGTATTGCATGCAAGGTGACGCTTGGATAAATACATGGTTGGTTAGGCATGCAGCGTGACATGTGGCAAACAAGTGGCAAAAAAGAGAGGAGAAGTAGTATGACAAGCCCTCTATTCCAAAGCTATAAATAGGACCTTGAGGGAAAAGGAGCGACTGATGATGCTGAAGTAAGAATTCTTGAGAGAAAAGAGTGAGAGAAGGCAGAAAGGAGGAATCCTTACGTCTGTAGTAGAAGTCTGTGGCCAAGAGAGAAGATATTCTTGACAACTTAGCTATCTTGTGTTAAAGAAGTTGTCTTGCGTCTAAGGTGTCAGCCTTGCGTTTAAGACGAACAATGCATTCAAGTTGGACCTTGTGTCCAAGAGAGGTCGACGATCCAAAAAAAGAAGTAAAGAAGAGTTAGGCTGCACCTCGCGTTAGCTATCAACCTTGCGTCCAAGGGCAGAGTTGCGACCAACCGAGCTGCCAGAGGAATATAAAGCCTTGCGTTCCAGGGTTAGAACGCTGTGTCCAAGAAGCTGGGGAAATTGGAAATAGCTGGAAAGAGGAGGAACTATCCTTAAAGCGTTTTTGTGAGTGGTACCTTTCTTTCTTTGAAAATGGTTTATTGGAAATGTTGTTCTGATTTTATTATGAGCTGTGATTTGATGAAAAAGTGTTTATTTGAAAAGCATGATGCTTGAATATATTGTTCACAAGGCATGTTATATCTGTTTTTTATAAGATGTTAAAAAGCATGTTGTGAAATGTAGTTTATCGAGAAATATCTTATATTTCATGAAAGGTTTCATATAAACTATTTATGTGAAATGTTGATTTCTAAAATGTTTTAGAGGAGGCTCAATGCTGAGGGACATGAGAAGTCATGTGAGTTTCCCCGGGACCCAGAACTGAGGGACATGGAGAAGGTACTTGGCAACCCACCACATTCCTATGTGCACATAGAGGTTAATATTGCTGGTGCGTTGAGTTCTGCTCTGCATTAAGCCAGGAATGATTTCTACGTTGGGTGTGTTGAGTCTTGCTCCACCCCAACTAAGGATGTTTTCGACGTTGAGAGCGTTGAGTTTCGCTCCGCCTCAACTAAGGAAAATTTTTAAGAACAAACTGATTTCATGTACAACCATTCTGGAATGTATTTGTGTGATTTGATTAAGAAGTTGGAAAATATGATTTTATAGAAATGATGATTTGAATTACGTATTTTATGTTATAATGATTGTAACATGCCTCTTTTTGAAGATAGTTTTACAAAATCTGTCACTCACTGGGCTTTTAGCTCATCCTTTTATATGTTTTCCATTTTCCAGGTAGCATGATAGTTCCCGTTGCCAGACTAAGCCGAGGTTTGTCGAGATAATGGATTCTTTTCCCTTAGAAGTGTGGTTAAGGAGAAGGCTAAAGTAAGTTCGACAGTGGGAGTCGACAACGGAGTTGATGACTGCTGTCCTCGTGGTCCATCTCGGGCTACGAAAGGGTAGTTCGGAACAGGGTGACATAAAGTGCCATTTAGACACTTTTTAGCCATTTTTAAGTTATTTTGAGGGTGAAAGTGTCACTTAGACACTTTTTGGTTGGTTGAGTTAAGAGGTCATATTGTGCATTTTGGATTTGTTTTTGTAGTCAAAGTGTTATTTAGACACTTTTTAGCCACTCTTTGGTTGGTTTTGAGTTTAGAGGTCATAGTTGTGCATTTTGGACTTGTTTTTGGTTAAGACACCTTTTAGCCACTTTTTGATTGGATTTGAGTTAAGAGGTCATATTCTGCATTTTGGACTTGTTTTTGTAGTCAAAGTGTCATTTAGACACTTTTTAGCCACTCTTTGGTTGCCTTTGAGTTCAGAGGTCATAGTTGTGCATTTTGGACTTGTTTTTGGAGTTAAAGTGCCATTTAGACACTTTTTAGCCACTTCTTAAGTTGTTTTGAGGGTGAAAATGTCACTTAGACACTGTTTAGCCACTTTTTGGTTGGTTTTGAGTTAAGAGGTCATAGTGTGCATTTTAAGTTGTTTTTGTAGTCAAAGTACCATTTAGATACTTTTTAGCCACTCTTTAGTTGGTTTTGAGTTTAGAGGTCATAGTTGTGCATTTTGCACTTGTTTTTGGAGTTTAAGACATCTTTTAGC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mRNA sequence

ATGGAAGACAACCCCGTTCGTGCTCGTGGTTGCCGCCATCTCAGTAAACGTGGGTTGATTTTGAGTTTGGAAGTCACACTTAAATATGTTCAAGTTGTTTTGAAAGTCATTAATTTAAGAGGTCATATTGTGCATTTTGGACTTGTTTTTGTAGTGAAAGTGCCATTTAGACACTTTTTAGCCACTCTTTCGTTGGTTTTGAGTTTAGAGTCAAAGTGCCATTTGGACACTTTTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGAAGACAACCCCGTTCGTGCTCGTGGTTGCCGCCATCTCAGTAAACGTGGGTTGATTTTGAGTTTGGAAGTCACACTTAAATATGTTCAAGTTGTTTTGAAAGTCATTAATTTAAGAGGTCATATTGTGCATTTTGGACTTGTTTTTGTAGTGAAAGTGCCATTTAGACACTTTTTAGCCACTCTTTCGTTGGTTTTGAGTTTAGAGTCAAAGTGCCATTTGGACACTTTTTAG

Protein sequence

MEDNPVRARGCRHLSKRGLILSLEVTLKYVQVVLKVINLRGHIVHFGLVFVVKVPFRHFLATLSLVLSLESKCHLDTF
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC04G061820.1CcUC04G061820.1mRNA