
CcUC04G061000 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCTAGTTTATACACCACCTACTTCTTAGGGTGGTCATAAATGAGAGATCGGACGTACTTTCGTTTAACTTTTTTGGGAATAGAGTATGGTTTGGCAACTACGAGTTTGCCCTCATAACTGGGTTTAGGGTTAGGATGACGAATGTACAAAGTGCAATGAACCCAAGAGTAGGTTTTTAAGGTTATACTTTGAAAACAAAACAAATAAGAAATAGTCTAAAGCAACTGTGTGATGATGGGGAGGGAGAATAAACAGAAATTTGACCAGAAGCTCCTAAGACTAGTGGATGATTAGGAGGTATTTTGTAATTATGATTGGAGTGGGGTCAATTTCAGTAAGACAATCACCAGCTTGAAGAGAGTTTTGCCCCATGCAATCAAACATGGCAACCCCACAGAGACTACAATATACACCCTATACAGTTTCCTTATTGCCTTCCAAGTTAGATAAACATTTTTCATTTATTTTCTTATTAGATCAGTTGGTATTTATTTTCTTGTACTAAACTTAACAATTGTTTTTGGTGTGGCATGTGAGACGATTTCGTCTCTTATGAACCTAGTTGCTATTCGTGCCAGTAAGACGACAATTCCAAAGCTGTCTCAGTGGGTGTGCAATACTTCCATGCCATAGAACATCCTCCACAGGGATATCTACGATTCAAACAAGGTAAGTAAAACAAATGGCTTCTAATTATTTCCTTCTCCATGTTTCGCTACTAATTATATAGTTCAATTGGTGTGATATGCAGGCAAGGTATATAATTACCACGAGGATGGTAGCCAGTGCGAGGGAGGTGGCTCATATGGAGTATATATGACAGGAAATTGGGGCATGTGCTTTGTTGCCTGATATTATCAACTTCGGCCTACTAGCATTTCTACTGCACGACACTAAACGTCACGAGGAGGCCCCTATCCAGGAAAATCATGAGGGTCAAGTAGATATCGTGACGAGGAGGCTCCTGTCCACGAGGAGGCAGATTAAGAGAATGTTCACGACAAGGGGCTTGATAACTTGTAGAAATACAAGTTATTACAGCCTTTCTCTTAGAAAAATAGAGAATCATGCGGTAATTTGTGTTGAATTCTATTGATAAATCTTCCTATGCATTCCACTCTTGTAAATTGAAGAAGATAAGTATTTTATAGCTTTTTGAGCCAAAACGCATGTTTTAACGCAGGAACGCAAGCAACCTGTGGATGCGCTGACAACCGCTCAATGCAGGATGATGAGTTAGAACATATGGATGCATCAACATAAGTGAATGCATGAACCTAAATTCTCCATGGACACATAACAACTAGAAACGCAAGGCAGCAGAAAATCAGATCAGAATCTTGAAAGATTGTCGAAAGATTGACATGCATAATTCGTGGCTAAAGTGGTGGATCTAAATTGAAGGAGAATTACGCAATTAGGCGAGATAGACGCACGACATCAATTTCCTCCAATCACGCAGATTTGCCACTGATTACGAACGCAGCCTCTATAAAAGGGCAGACCTACAAGCTGAAAAAGGGTTGTTGATTCTCGGAAGAATTCCTAAGTGACAGCAAAGTTCTCTCCAGAAGACAACCGGAGACGAATAGCTCGAGAGAGAAGAGTCTTCCCTCCGCCCAACCACTTCACAGCAGATCTCACGCTTCCATTCCAGTGACTCAAGACATTGAAACGCTTTCCTGCTTTCTATCTCTTTTTCTAGTTGTGATTTTAGATTTGTGTCAAGACATTGAGCTGTCTAAAATTGTATTCCGTTCATTAATCTACAATTCTTCCATTTCTATCCATTTCTCTACACTTTCCGTTTATTACTTTGAATCCATGAGTAGCTAATCTTTCAAGGGTCACGGGTTGCGTTAGCATCTAAATAAGACCCATAGTGTAACTATTGTATCTTGTCAATTGTAATCTTAATCCGGTGCTTATGTCCATCTAGCTAATCGATATAAGTAGTAATAATCAGACTACTCGAGAGGGTACGTGATTGTGGAACTCAATTGACAAGGCTAAGAAGTGTTACCTAGACATAGGAATAACCTTGGTACTTAACACTCTCCTATGCAGTATAGACATATAATGCATAGCGGCTGACAACCGGGAGAAGAGTCGCAAGTATGAATAGACTATCACCATGCATTTCTGATTTTAGATGTTAACCAACCCCAACCTTGTTTTTACTCATTCATACAATTCAATTAGCTGACTTTGCTGTGTCGCATACCTTACTATTTACCACATTTTAATCTAGTGTACATGTTATTGCTTTCTTTAGTTAGACGCATCCTTCTCAACTATTTTTGGTTACCACTCCAACTCAAATAATCCAATTAATTACAGAATCAGCATAGTCCCTGTGTTCGACCTTGGACTCACCGAGTATACCTATTTCTTTGCTTATACTTGGGTTACGAATAGGAAAACTTGACAGATCATAAATGCATAACATTAAGCATGTTCAATGCATAGTATGTTAAACGCATAGGAAGCTTAATAATAATAGATAGACGCAGCAGCAAGTTTTGGATTTCAAATCTGTTGCAAGCACAACAAATTTTTGGCGCCGTTGCCGAGGACTTATTTTATCTGTCAACAATAGGGCTCCCTAATGATGGGCCCGAGGGTCAAATGGATGATCGTCACATCGTGATGAGAAGAGCCATGATAAGGAGGTGGCGAGGGACGAGACTGTAGGTGATGGTCACGTGAGCAGTCCCCATATGACTGATGAATTTAGACGAATTGGAGTAGTTTGAGACCAAAGTGAGGTCAGATTTCGCAACCATTAGATTAGAGTTCACCACTATGAGGTTTGGTTCGCTGACGTCAAACGAGACCTGTCAGCAATCATGGGCTACCTTAGAGAACTCACAGAGGTATGTTCTGACTTACATTTAAGTTCCTTATTCGTGTGTTATATATTTTATGTTAGCCAAAGTCTTATTTATTCACATGTTGCAGGGTAAATAGTTGAGATTCCACTGTTTGGTGGATCTCAAAATAAAGATGGAGAAGGCAGGAATAGGAGTGACGGCATGACATCTGAGACTGATAGCTTGAGTGGTCATGTCGATCTGGAGCACATCAGCATGCTAGGTGAAGGATCAGGGCATGTGGAAAATAAAGGTAGAGCATCTAATGCATAAACTTTAGTTGAAGTTGTAGATCAACAATGCAATGACAGTATGAGTGTGTTTATTATGACTTATATTGGGCTGATTGAGGATCAGAGCAGCTATCAACATGTGGACATTACAGATCCTGACATTCATTCAATTAACAATCAAGGCATTTTTTATGCTGGTGCTCTTGCAAAGACTACCACTTCGCCAACGACTACCTCTTAGCCATAGACTGCCTCTTAGTCAGATACTAGCATTAAGCCAGATACTGCCACTTAGTCAGAAACTGTCACTGTTCACGCCTCTCATCCCACACCGACAATGCACATCATTAATGATGACAACTTGGACCCCACTACCTCATCTAGTAAGCAGGCAGAGGCTATCGATGTATTGGCTTTAGATCCCAGTTCAGTTGGCCACCTAATGACTTCCCAAGTTAGTTATGTGAAATATTAAGTAATTTAGTAAATAGATTTGTTATACACTTAGTGTAATGTTTCTTTCATGCAGGTCACAGCCCAGGCAAGTGGTAACTTCTATTTACAAGAATCTTCGATCGGCTATCGAAGCGGATACAAAGAGGTTAAATGAAATTTGGGAGCTAAATAGATTGGTAGTGAAGCTAGAGATGGGGAAGTTGGAAGATATTCCAATTCTGATTACACAGTTGGGCATACTTCATTCAAATCCCATTACGTCACCCATGAAGAAAAACACTCCCATCAAGGAAATTGCTCAAAAGTGAAAGCAACGATAGACATGGAAACTGGGTAGCCCATACACTGACCTGCGTTTGAAGAAGTCAAAGAAAACTAAGGCATACAACCCGATGGCCCACATACCAATTGCATTCGAATGACAGATGAAAGAGTGGATCGATGACCCTCTTGTTTATCTAGAAAAACCTCGTTGTTGGGTTATTTTATCAATAAAACTGAATGGATGGTGGATAAAGCTCCTTTGACCACATGACTTCATGGACGACAAGGAAATCAAGCAATTTACTTTAACTTTTTATTTTATTATTCTTATTTCTTTCTTTTCATTTTCATTTTATACTTGGATAACGACGTCTTGTCATATACAGATGATGGATCTATTAGTTGTGTTCTTGTGTAACAAACTGGTTTACGAGAAATCACACGACGAGCTTACGCACAGTTTCATGATGGGCGACCAAGTTGTGACGATTCGTTATTCTACTTGTTATCTTAATCTATTACTCAATTACTTGTTTCTGAACTAATACAAACTGCATTTTTTTTCACTTTACTGGACACATAACTTCTTCCATAAACCAAGTAAACCGTACAGCGAAAGGAAATAGCCGAAACAAGTAAGAACGTATACTTGGGAGAATTACAGCAACTTGTTGAAGTATGTGATGGGGGAAGGTACAGACTACACCATCCTTTAAGCCACTATTGACACCATCTACATGCAGTACAACATACTCAACCTCCATTGGGTTCTGGTAAAGATCAATTTGGGGGCCGATAAGTTGTTAGTTTGGGATTCATTAAGATTGATGACGATCCGACTGGAGTTGGAAGGACACTTGGAGGTCATGCGAACCATCCTTCTAGTGCTACTGCATAAGTGTGGGGTGACTACAGCTCGGTCAAAACTCCCACTTACACCATGGACTGTGAAACAAGTACAAAATGTACCATAACAAACGAGAAGTGGGGACTGTAGGGTTTTCTGTGCAAATTTTTTTGAGTATATTGTCACTGGATCCCCTGCGTCTACACTAACCCAAGACAAAATCTATAAGAAGCTTTTGTGATATTTTCAGTAAAGGTTGACGAGAGTCAAAGTTTATGAGAAATTTCTTGTAATTTTTTACTTTAGTCAATTCTTACG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MASWQLSTPKERRSFLSKPLSFSSPPFSSFLQISTPPLSHFFASISVSFSFHSVSLSISTMDAAMPLCKSARAPSLTGLFAGTTNGLRSSQCTFMGAKKVSFPRQRATGVQYSRKSWKNGRGLQVMCRADKILVANRGEIAVRIIRTAHELGIPCVAVYSTIDKDALHVKLADESVCIGEAPSSQSYLVIPNVLSAAISRGCTMLHPGYGFLAENAVFVEMCREHGINFIGPNPDSIRVMGDKSTARDTMKKAGVPTVPGSDGLLQSTEEAIKLAQEIGYPVMIKATAGGGGRGMRLAKEPDEFVKLLQQAKSEAAAAFGNDGVYLEKYVQNPRHIEFQVLADKYGNVVHFGERDCSIQRRNQKLLEEAPSPALTPELRKAMGDAAVAAAASIGYIGVGTIEFLLDERGSFYFMEMNTRIQVEHPVTEMISSVDLIEEQIRVAMGEKLRFKQEDIVLRGHSIECRINAEDAFKGFRPGPGRITAYLPSGGPFVRMDSHVYTDYVVPPSYDSLLGKLIVWAPTREKAIERMKRALDDTIITGVPTTIEYHKLILDVEDFKNGKVDTAFIPKHEQELAAPQKMVVAKDLANAVA Homology
BLAST of CcUC04G061000 vs. NCBI nr
Match: XP_038882709.1 (biotin carboxylase 1, chloroplastic [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1041.2 bits (2691), Expect = 3.4e-300 Identity = 525/532 (98.68%), Postives = 528/532 (99.25%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061000 vs. NCBI nr
Match: XP_008449521.1 (PREDICTED: biotin carboxylase 1, chloroplastic [Cucumis melo] >KAA0062460.1 biotin carboxylase 1 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK27422.1 biotin carboxylase 1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1030.0 bits (2662), Expect = 7.9e-297 Identity = 517/532 (97.18%), Postives = 524/532 (98.50%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061000 vs. NCBI nr
Match: XP_022925189.1 (biotin carboxylase 2, chloroplastic [Cucurbita moschata] >XP_023518312.1 biotin carboxylase 2, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1010.7 bits (2612), Expect = 5.0e-291 Identity = 509/528 (96.40%), Postives = 516/528 (97.73%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061000 vs. NCBI nr
Match: KAG6595714.1 (Biotin carboxylase 1, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1009.6 bits (2609), Expect = 1.1e-290 Identity = 508/528 (96.21%), Postives = 516/528 (97.73%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061000 vs. NCBI nr
Match: XP_022966273.1 (biotin carboxylase 2, chloroplastic [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1008.8 bits (2607), Expect = 1.9e-290 Identity = 508/528 (96.21%), Postives = 515/528 (97.54%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061000 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9HBA8 (Biotin carboxylase 1, chloroplastic OS=Populus trichocarpa OX=3694 GN=POPTRDRAFT_831870 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 939.5 bits (2427), Expect = 1.9e-272 Identity = 472/532 (88.72%), Postives = 497/532 (93.42%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061000 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9N843 (Biotin carboxylase 2, chloroplastic OS=Populus trichocarpa OX=3694 GN=POPTR_0018s14250g PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 934.9 bits (2415), Expect = 4.6e-271 Identity = 467/524 (89.12%), Postives = 493/524 (94.08%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061000 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O04983 (Biotin carboxylase, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CAC2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 887.9 bits (2293), Expect = 6.4e-257 Identity = 453/536 (84.51%), Postives = 484/536 (90.30%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061000 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q06862 (Biotin carboxylase OS=Nostoc sp. (strain PCC 7120 / SAG 25.82 / UTEX 2576) OX=103690 GN=accC PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 626.7 bits (1615), Expect = 2.7e-178 Identity = 295/439 (67.20%), Postives = 363/439 (82.69%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061000 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P49787 (Biotin carboxylase 1 OS=Bacillus subtilis (strain 168) OX=224308 GN=accC1 PE=3 SV=3) HSP 1 Score: 530.4 bits (1365), Expect = 2.6e-149 Identity = 256/443 (57.79%), Postives = 329/443 (74.27%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061000 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V5F1 (Biotin carboxylase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold325G001130 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1030.0 bits (2662), Expect = 3.8e-297 Identity = 517/532 (97.18%), Postives = 524/532 (98.50%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061000 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BM82 (Biotin carboxylase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491380 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1030.0 bits (2662), Expect = 3.8e-297 Identity = 517/532 (97.18%), Postives = 524/532 (98.50%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061000 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EBF3 (Biotin carboxylase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111432504 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1010.7 bits (2612), Expect = 2.4e-291 Identity = 509/528 (96.40%), Postives = 516/528 (97.73%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061000 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HRJ7 (Biotin carboxylase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111465985 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1008.8 bits (2607), Expect = 9.2e-291 Identity = 508/528 (96.21%), Postives = 515/528 (97.54%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061000 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KYI1 (Biotin carboxylase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G438530 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 999.6 bits (2583), Expect = 5.6e-288 Identity = 496/530 (93.58%), Postives = 519/530 (97.92%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061000 vs. TAIR 10
Match: AT5G35360.1 (acetyl Co-enzyme a carboxylase biotin carboxylase subunit ) HSP 1 Score: 887.9 bits (2293), Expect = 4.5e-258 Identity = 453/536 (84.51%), Postives = 484/536 (90.30%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061000 vs. TAIR 10
Match: AT5G35360.3 (acetyl Co-enzyme a carboxylase biotin carboxylase subunit ) HSP 1 Score: 872.1 bits (2252), Expect = 2.6e-253 Identity = 445/522 (85.25%), Postives = 474/522 (90.80%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061000 vs. TAIR 10
Match: AT5G35360.2 (acetyl Co-enzyme a carboxylase biotin carboxylase subunit ) HSP 1 Score: 808.5 bits (2087), Expect = 3.5e-234 Identity = 413/488 (84.63%), Postives = 442/488 (90.57%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061000 vs. TAIR 10
Match: AT1G03090.2 (methylcrotonyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial / 3-methylcrotonyl-CoA carboxylase 1 (MCCA) ) HSP 1 Score: 426.0 bits (1094), Expect = 4.9e-119 Identity = 219/461 (47.51%), Postives = 302/461 (65.51%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061000 vs. TAIR 10
Match: AT1G03090.1 (methylcrotonyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial / 3-methylcrotonyl-CoA carboxylase 1 (MCCA) ) HSP 1 Score: 402.1 bits (1032), Expect = 7.6e-112 Identity = 212/461 (45.99%), Postives = 289/461 (62.69%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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