
CcUC04G060980 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCCTCAGGTGGCGAGCGCGATCCAAACGCCTAACTAGAAGAGAACCTCGTCTGGGCATTGAACTTTTGGTGTACCTCCTAAGGACTTGTAAATATTCTTTGTATTCCTACTTCTCGTATATACGCTTGTCCATGAGAAAGAGTTGGTGTTTGTAAACTTAATCTTTTAGATAATGAAATTTCTTGTTGAAATATCCACTTGGTACTATTAAGTGATTATAGTTTCCGCTGATTGGCATGACTGAGCTGTTAGGTTAGTGATGATTTAAATGTTTCCTCGTGATATGTATGTGTGGTCTCACTCCTAAACCTATGTTGTAGGATAATCTGGGTGAGGGTGTGACAATTTGTAAGCCAATCTCGCTAGTAATCTCGCTCATTATGGATTATGTTGGGGGAAATGAGTCTCGGGGATGAAGCATGATTAGAGTTTAATTATGCACACTTAATGATAATGGAAAGGAAGTTTAAGGAAAGCTTAACGTGAGAAATGTGTATTTACAGGCCAAGAAGAGCTCGAAAAGGCGTATAATCCACTTAGGGCCTAGGACAAGTGGTGAGTGACACTTTCCTTTTCCTAAATGATTTTAGTTAAAATGTTTAGCCAAGCTTTCGTATAAAATGTACTTTGATGATAATTTGAAAAGCATGATGGCTGCTTATATTTGATTTATGGCATGAATGCTTATATTTGATTTTATGACATGAAGGCATTGCTGAAAAACATGTTTATAAGATGTTTTTTTATTGAGTTACGCTCTGTTTTCCATGAAAGGTATTTAAAATGAACCGTTTATGCAGAACATACCTGTTTCTAAAATATTTTCTAAGGGACCCAATGCTGAGGGACATTTGAGAAGGCATGTGGGCAGCCCAGTGACTAAGGACCCAGTACTGATGGACTCGGAAAAGGTACTTGGGCATCTGGAGATATTTCTACGTGCACATAGAAGTTTTCAACGTTGGGTGCGTTGAGTTTTACTTCGCCAACTAAGGTTGTTTTCGACGTTGGGTGCGTTGAGTTTTGCTCCGCCTCAACTAAGGTTGTTTTCGACGTTGGGTGCGTTGAGTTTTGCTCCGCCTCAACTAAGGTTGTTTTCGATGTTGGGTGTGTTGAGTCTTGCTCCACCCCAACTAAGGTTGTTTTCGACGTTGGGTGTGTTGAGTCTTGCTCCACCCCAACTAAGGTTGTTTTCGACGTTGGGTGCGTTGAGTTTTACTCCAGCTCAACTAAGGTAAATATTCGTTTTCGATATTGGGTGTGTTGAGTCTTCTCCACCCCAACTAAGGTTGTTTTCGACGTTGAGAGCGTTGAGTCTTGCTCCGCCTCAACTAAGGGAAAAGATCGCAAAACTAATATGGATTTCTGTATGATTTTTCTAAAACGATCATGTATAATTTGGCAGAGGCATTTGAGCATGTTTTTTCCAATAATTATGAGTTGATTCCATGTTTTATACGTATTGTGATAACAATTTTACCCTATTGGTTTCCGAACCAAAGACATTTTTACAAAACTAATCACTCACGGGGCTTTTAGCTCATGCTTTCCATGTTTTCTTTTCCACCCAGGTAGCGAGGACGTTCCCGGTGCTTTGCCTACTTGTTACACCCCTTCCAAAACTACCCTCCTTTAGCCCGAGACGGAGCGTGAGGACAGCAGTCATCGACCCTATTATCGACTTCCACTGTCAAACTTCCTTTAAGCCCGTTTAACCGCATTTCCTAGGACCGCAATACAATTAACTTTTGACAAACCTTGACTTCGATCGGCAATGGGAACTGTCATGCTACCTGGAAAATGGAAAATATATAAAAGATGAGCTAAACGCCCAGTGAGTGACAGATTGTGTGAAAAACTATCTTTAGTTTAAAAGAAGGCATGTTATCATCATTATATCACAACATACTTAGTTCAAATCATCATTTCTATAAAATCATACTTTCAACTTGTAATCAAATCACATAAATACACTTCAGAGTAGTTGTACATAAAATCAGTTGTTCTCAACAATTTCCCTTAGTTGAGGCAGAGCAAGACTCAACGCTCTCAACGTCGAAAACATCCTTAGTTGGGGTGAAGCAAAACTCAACACACCCAACGTCAAAATCATTCCTGGCTCGATGCGGAGCAAAACTCGACGCACCAGCAGTATCAACCTCTATGTGCACATAGGAATATGGCGGGTTGCCCATGTATCTTATCATGTCCCTCAGTACTGGGTCCCGGGGAAACTCACATGCCTTCTCATGTCCCTCAGCATTGAGCCTCCTCTAAAACATTTTAGAAACCAACATTTCACATAACTAGTTCATATGAAATCTTTCATAAAGAAATAAGATATTCCTCGGCAAATTACATTTCACAACATGCTTTTCAAAACAATAAGACATGCCTTGTGAACTAAAAATATTCAAGTACCATGCTTTTCAAATAATCATTTTTCATCAAATCATAGTTCATAATGAAATTAGAATAACACTTCAAAATAAACAATTTCGAAGAAAGAAAGGTGTCACTCACAGAACACTTTAAGGATAGTTTCTCCTCAATCCCGCTATTTCCCCTTTCCCGAGCTTCTTGGACGCAGCGTTCTATTCCTGGAATGCAAGGCCTAATATTCCTCTGGCAGCTCGGTTGGTTGCAACCCTGCACTTAGACGCAAGGTTGATAGCTAACACGAGGTGCATCCGAACTCTTCCTTACTTCTTTTTTTTTTTTTGGATGCGTCGACCGCATAAGGTCCCACTTGGACGCACCGTTCATCTTGAAGCTTAAACGGAAGGCTGACCCTTTTAAACGCAAGACAATTCTTTAACACAAGATATAGCTAAGTTGTCAAGAATATCTTCTTCCTTGGCTGTAGACTTTATTATGGACACAAGGATTCCTCCTTTCTCTCAAGAATACTTACTTCAGCATCATTAGTCACTCTTTTTCTCTCAAGGTCCTATTTATAGCTTGGAGTAGAGGGCTGATCATACTACTTCTCCTCCCTTTCTGCCACTTGTTTCCACATGTCACGTTGCAATTTAACCAACCATGTATTAATCCAAGCGTCACTTTGCATGCAATACTTAACATGCCTTTTAACACCTCCTGCTTATAAGGTGTCAGGTTTATATGAAGCCACTTAGCCTTTATAAGCTTATCTCATATGCCCAACATATTCTAATATACAACTATTCATTCAATCATATTGCCCCTATGCGTCCACTGAATTTCCTTTAGGGTTTTAGCTTCATTATTTACTTCCATTACTCCTGGCCATAATACCTTTGAACTCGTTTCTACACCGTACATTACTAGGTGTCAATGTCTCAAACACGTACTATGCGTTTGTACCTTACCGCATCATACCATGCGTCCAACTTCCTTTAAACTCTTGAGTTACAACCTATGCGTTTACCCGAAATCAAAGTTATGTTTCCATTTACCATGGAATTGGGCTCCTCAACTCATAGCTGGTAGCCACCCCTCAACACACAGCAACCCTTCGATCATAGTCACCTTAAACACTAAATGTCTTGGTCTTTGAGCATAGACTTCTTTATCAACACTAAAATCCTTACTAACGTATAATAAACCTTCAACCTGCTCACGCCTTAAGGTTCCTCAGCTTCTCTTTTCTTTCTAGCTTAACACCCTCAAAAGCTAATCCCATAACTTGTTAATTTCCATAACTTATTAATTTCCAAGACTAAGTGTGAGCCATGCGTTTCCTCTTTTTCCTAATTCTTGTTTCTCTTTTCAAAATTAAGTATCAAATTTCCTCAAAATTAAGGTACCACGCTTTAACGCTTACATCTATGCGTTAACCAAACTATGCTCAAGAATACATCTAAATTTTGACTAATCTCCAAACTATGCTTTCAATCCTTCATTCTTACTCTTAGTGGAATATCCATTGTTTTCCTAATATTAGGCGTTCAACTAGTCTTACTTCTTTTCTTACTTCTTCTCTTACTAGTCATCTTAAGAATTCTGAGTTAGGGTCTTACATTACTCCAGCTCGCCCTGCTTAAGCTTCGAGTTATCAGAAACAGTTCAACTTGTGGTTATTTTATGTGTATACCTATACAGGTGGCATGTAGACCCAGTTGTACATCTGCTGGAATGTATGATGGGATGTTGTATAAGTATATTGTGAATATGTTGGAATGTTTAAATTACATAAGCATAAGTTCTTGTGGCTTGAATCTAAGAGTAGATATATATGACATAATTTAACAGGTTAATTAGGTAAGGATGGGCAGTATACATCACAAAAGGTGTGATATTTATTGTCCCCACATCTCCTCTCGGGTTGAGTAGGGTAATCTGGGAGGGGGTGTGACAAGTTAGTATCAACGTGAAAGAGTCTTGGGGATAAGATCATGCATTGTAGTGTACGACCATGTATTTCTAGCAAGTAATAATGTCATGTTTTAATTTAGGAAACATGCCACCTTGAAGCAGGCGAGCTAGGCAAGCAGCAGCCGGAACTTTTGAAGCTACTGGGAGTCGTGGAGATATGTCTGAGGGTGAATCTAGTCATCCTCAAGTTGGGGCCAATGTTAAGGAGTAGATATTTACTAGAATTGCAGAAAGGTTGGCTGCAGGCATTGGATTAGTGCAGTCAAATCCTGAAAAGAAATATAGTATTGAAAGATTGAAGGCTTTAGGTGCTACCACTTTTGAAGGCACCGTAGGTCCTGCTGAGGCAGAGGCATGGTTGAATTTACTCAAGAAATGTTATCGTGTGATGAGGTGCCCTGATGATAGAAAGGTAGATTTGGCAATGTTTTTGCTCTAAAAAAGGGCAGAAGATTGGTGGAGAATTGTAGAAAGCAGGAAAGAAGATATAGAAGAAATAAGTTGGAATGAGTTTAAGAAAGCATTTCAAGAAAAGTATTGTCCAAGAGCATTCAGTGATGCCAAACGGAATGAATTTCTGAGGTTGGTACAGGGATCGATGTCAGTGGCAGAGTACGAGAAGAAATATACTCAGCT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Match: XP_022149365.1 (probable thiol methyltransferase 2 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 434.1 bits (1115), Expect = 1.1e-117 Identity = 221/315 (70.16%), Postives = 243/315 (77.14%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060980 vs. NCBI nr
Match: XP_004144344.1 (probable thiol methyltransferase 2 [Cucumis sativus] >XP_031739580.1 probable thiol methyltransferase 2 [Cucumis sativus] >XP_031739581.1 probable thiol methyltransferase 2 [Cucumis sativus] >KGN54738.1 hypothetical protein Csa_012147 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 428.3 bits (1100), Expect = 5.9e-116 Identity = 221/311 (71.06%), Postives = 233/311 (74.92%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060980 vs. NCBI nr
Match: XP_022149366.1 (probable thiol methyltransferase 2 isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 424.5 bits (1090), Expect = 8.5e-115 Identity = 215/310 (69.35%), Postives = 235/310 (75.81%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060980 vs. NCBI nr
Match: XP_008449545.1 (PREDICTED: probable thiol methyltransferase 2 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 424.5 bits (1090), Expect = 8.5e-115 Identity = 220/312 (70.51%), Postives = 233/312 (74.68%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6AWU6 (Probable thiol methyltransferase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=HOL3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 271.6 bits (693), Expect = 1.2e-71 Identity = 137/269 (50.93%), Postives = 170/269 (63.20%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93V78 (Thiocyanate methyltransferase 1 OS=Brassica oleracea OX=3712 GN=TMT1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 251.9 bits (642), Expect = 9.9e-66 Identity = 130/272 (47.79%), Postives = 163/272 (59.93%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O80562 (Probable thiol methyltransferase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=HOL2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 250.8 bits (639), Expect = 2.2e-65 Identity = 124/244 (50.82%), Postives = 148/244 (60.66%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0WP12 (Thiocyanate methyltransferase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=HOL1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 250.0 bits (637), Expect = 3.7e-65 Identity = 127/273 (46.52%), Postives = 163/273 (59.71%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93XC4 (Probable thiocyanate methyltransferase 2 OS=Brassica oleracea OX=3712 GN=TMT2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 249.6 bits (636), Expect = 4.9e-65 Identity = 128/272 (47.06%), Postives = 162/272 (59.56%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D5I1 (probable thiol methyltransferase 2 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111017800 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 434.1 bits (1115), Expect = 5.2e-118 Identity = 221/315 (70.16%), Postives = 243/315 (77.14%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KYY5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G439050 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 428.3 bits (1100), Expect = 2.8e-116 Identity = 221/311 (71.06%), Postives = 233/311 (74.92%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D858 (probable thiol methyltransferase 2 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111017800 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 424.5 bits (1090), Expect = 4.1e-115 Identity = 215/310 (69.35%), Postives = 235/310 (75.81%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BN67 (probable thiol methyltransferase 2 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491394 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 424.5 bits (1090), Expect = 4.1e-115 Identity = 220/312 (70.51%), Postives = 233/312 (74.68%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EBC7 (probable thiol methyltransferase 2 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111432573 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 419.9 bits (1078), Expect = 1.0e-113 Identity = 216/310 (69.68%), Postives = 231/310 (74.52%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060980 vs. TAIR 10
Match: AT2G43940.1 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 271.6 bits (693), Expect = 8.5e-73 Identity = 137/269 (50.93%), Postives = 170/269 (63.20%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060980 vs. TAIR 10
Match: AT2G43920.1 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 250.8 bits (639), Expect = 1.6e-66 Identity = 124/244 (50.82%), Postives = 148/244 (60.66%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060980 vs. TAIR 10
Match: AT2G43910.1 (HARMLESS TO OZONE LAYER 1 ) HSP 1 Score: 250.0 bits (637), Expect = 2.7e-66 Identity = 127/273 (46.52%), Postives = 163/273 (59.71%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060980 vs. TAIR 10
Match: AT2G43910.2 (HARMLESS TO OZONE LAYER 1 ) HSP 1 Score: 231.9 bits (590), Expect = 7.5e-61 Identity = 120/263 (45.63%), Postives = 154/263 (58.56%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060980 vs. TAIR 10
Match: AT2G43920.2 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 227.6 bits (579), Expect = 1.4e-59 Identity = 103/155 (66.45%), Postives = 119/155 (76.77%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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