CcUC02G027510 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview


Name	CcUC02G027510
Type	gene
Organism	Citrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
Description	Wiskott-Aldrich syndrome protein family member 2 like
Location	CicolChr02: 17613511 .. 17640073 (+)
RNA-Seq Expression	CcUC02G027510
Synteny	CcUC02G027510

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

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Homology

[Close]

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Identity = 112/196 (57.14%), Postives = 122/196 (62.24%), Query Frame = 0


Query: 135 VGSQCTILTDNYGKDAYYLLQTPLLKNLLEMLIL---------------------QLFMV 194
           VGSQCTILTDNY +DAY+LLQTPLLKNLL   IL                     QL  V
Sbjct: 279 VGSQCTILTDNYCEDAYHLLQTPLLKNLLLAGILLDTKNLDASSQSSMTRDAEAVQLLSV 338

Query: 195 ---------CFLLVMRVQKESAFFDALIQNYGKLPNDGSTTVWGHSERIKERNQASISPH 254
                     +  +MRVQKES F D+L+QNYGK P+DGS    GHSERIKERNQ SISPH
Sbjct: 339 GSAPNSKNGLYDQLMRVQKESPFLDSLMQNYGKPPSDGSNNRVGHSERIKERNQTSISPH 398

Query: 255 GDAINQQKISNDLELAKLARFPQNSIRDFINMKLPLIFLVVKPNSLPFKTPAREASNPSR 301
           GDAINQQK SND   AK  R    S                KP+SLPF+TP REASNPSR
Sbjct: 399 GDAINQQKKSNDSGTAKTCRVSPKS---------------AKPSSLPFQTPGREASNPSR 458

[Close]

BLAST of CcUC02G027510 vs. NCBI nr
Match: XP_038893748.1 (uncharacterized protein LOC120082581 isoform X2 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 185.7 bits (470), Expect = 6.1e-43
Identity = 112/196 (57.14%), Postives = 122/196 (62.24%), Query Frame = 0


Query: 135 VGSQCTILTDNYGKDAYYLLQTPLLKNLLEMLIL---------------------QLFMV 194
           VGSQCTILTDNY +DAY+LLQTPLLKNLL   IL                     QL  V
Sbjct: 145 VGSQCTILTDNYCEDAYHLLQTPLLKNLLLAGILLDTKNLDASSQSSMTRDAEAVQLLSV 204

Query: 195 ---------CFLLVMRVQKESAFFDALIQNYGKLPNDGSTTVWGHSERIKERNQASISPH 254
                     +  +MRVQKES F D+L+QNYGK P+DGS    GHSERIKERNQ SISPH
Sbjct: 205 GSAPNSKNGLYDQLMRVQKESPFLDSLMQNYGKPPSDGSNNRVGHSERIKERNQTSISPH 264

Query: 255 GDAINQQKISNDLELAKLARFPQNSIRDFINMKLPLIFLVVKPNSLPFKTPAREASNPSR 301
           GDAINQQK SND   AK  R    S                KP+SLPF+TP REASNPSR
Sbjct: 265 GDAINQQKKSNDSGTAKTCRVSPKS---------------AKPSSLPFQTPGREASNPSR 324

[Close]

BLAST of CcUC02G027510 vs. NCBI nr
Match: KAA0055265.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold80G001080 [Cucumis melo var. makuwa] >TYJ99189.1 uncharacterized protein E5676_scaffold248G003990 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 181.8 bits (460), Expect = 8.8e-42
Identity = 112/197 (56.85%), Postives = 128/197 (64.97%), Query Frame = 0


Query: 135 VGSQCTILTDNYGKDAYYLLQTPLLKNLLEMLIL---------------------QLFMV 194
           VGSQCTILTDNY +DAY+LLQTPLLKNLL   IL                     QL  V
Sbjct: 387 VGSQCTILTDNYCEDAYHLLQTPLLKNLLLAGILLDTKNLDTSSQSSMTRDAEAVQLLSV 446

Query: 195 ---------CFLLVMRVQKESAFFDALIQNYGKLPNDGSTTVWGHSERIKERNQASISPH 254
                     +  +MRVQKES+F DALIQNYGK P+DGS    G SE IKERNQ S  PH
Sbjct: 447 GSAPISKNGLYDQLMRVQKESSFLDALIQNYGKPPSDGSNDGEGRSEHIKERNQPSSPPH 506

Query: 255 GDAINQQKISNDLELAKLARFPQNSIRDFINMKLPLIFLV-VKPNSLPFKTPAREASNPS 301
           G+AINQQK S+D+  AK ++     IRDFIN +    F V  KP+SLP +TP REASNPS
Sbjct: 507 GEAINQQKKSSDIGTAKTSK-----IRDFINKETVSNFSVTAKPSSLPIQTPTREASNPS 566

[Close]

BLAST of CcUC02G027510 vs. NCBI nr
Match: XP_008446103.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103488927 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 171.8 bits (434), Expect = 9.1e-39
Identity = 105/196 (53.57%), Postives = 120/196 (61.22%), Query Frame = 0


Query: 135 VGSQCTILTDNYGKDAYYLLQTPLLKNLLEMLIL---------------------QLFMV 194
           VGSQCTILTDNY +DAY+LLQTPLLKNLL   IL                     QL  V
Sbjct: 403 VGSQCTILTDNYCEDAYHLLQTPLLKNLLLAGILLDTKNLDTSSQSSMTRDAEAVQLLSV 462

Query: 195 ---------CFLLVMRVQKESAFFDALIQNYGKLPNDGSTTVWGHSERIKERNQASISPH 254
                     +  +MRVQKES+F DALIQNYGK P+DGS    G SE IKERNQ S  PH
Sbjct: 463 GSAPISKNGLYDQLMRVQKESSFLDALIQNYGKPPSDGSNDGEGRSEHIKERNQPSSPPH 522

Query: 255 GDAINQQKISNDLELAKLARFPQNSIRDFINMKLPLIFLVVKPNSLPFKTPAREASNPSR 301
           G+AINQQK S+D+  AK ++    S                KP+SLP +TP REASNPSR
Sbjct: 523 GEAINQQKKSSDIGTAKTSKVSPKS---------------AKPSSLPIQTPTREASNPSR 582

[Close]

BLAST of CcUC02G027510 vs. NCBI nr
Match: XP_023542616.1 (uncharacterized protein LOC111802467 [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 160.2 bits (404), Expect = 2.8e-35
Identity = 101/196 (51.53%), Postives = 112/196 (57.14%), Query Frame = 0


Query: 135 VGSQCTILTDNYGKDAYYLLQTPLLKNLLEMLIL---------------------QLFMV 194
           VGSQCTILTDNY +DAY+LLQTPLLKNLL   IL                     QL  V
Sbjct: 401 VGSQCTILTDNYCEDAYHLLQTPLLKNLLLAGILLDTKNLDGSAQSSMTRDAEAVQLLSV 460

Query: 195 ---------CFLLVMRVQKESAFFDALIQNYGKLPNDGSTTVWGHSERIKERNQASISPH 254
                     +  +MRVQKE  F DAL Q+YGK P+DGS    GH ERI ERN+ SISPH
Sbjct: 461 GSAPNCRNGLYDQLMRVQKERPFLDALQQSYGKPPDDGSNDGTGHVERIMERNRTSISPH 520

Query: 255 GDAINQQKISNDLELAKLARFPQNSIRDFINMKLPLIFLVVKPNSLPFKTPAREASNPSR 301
            D INQQK  ND   AK+ R    S                KP+ LP +TPARE  N SR
Sbjct: 521 DDTINQQKKPNDFGTAKICRASPKS---------------AKPSLLPIQTPARETPNISR 580

[Close]

BLAST of CcUC02G027510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BJR5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold248G003990 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 181.8 bits (460), Expect = 4.3e-42
Identity = 112/197 (56.85%), Postives = 128/197 (64.97%), Query Frame = 0


Query: 135 VGSQCTILTDNYGKDAYYLLQTPLLKNLLEMLIL---------------------QLFMV 194
           VGSQCTILTDNY +DAY+LLQTPLLKNLL   IL                     QL  V
Sbjct: 387 VGSQCTILTDNYCEDAYHLLQTPLLKNLLLAGILLDTKNLDTSSQSSMTRDAEAVQLLSV 446

Query: 195 ---------CFLLVMRVQKESAFFDALIQNYGKLPNDGSTTVWGHSERIKERNQASISPH 254
                     +  +MRVQKES+F DALIQNYGK P+DGS    G SE IKERNQ S  PH
Sbjct: 447 GSAPISKNGLYDQLMRVQKESSFLDALIQNYGKPPSDGSNDGEGRSEHIKERNQPSSPPH 506

Query: 255 GDAINQQKISNDLELAKLARFPQNSIRDFINMKLPLIFLV-VKPNSLPFKTPAREASNPS 301
           G+AINQQK S+D+  AK ++     IRDFIN +    F V  KP+SLP +TP REASNPS
Sbjct: 507 GEAINQQKKSSDIGTAKTSK-----IRDFINKETVSNFSVTAKPSSLPIQTPTREASNPS 566

[Close]

BLAST of CcUC02G027510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BEY4 (uncharacterized protein LOC103488927 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488927 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 171.8 bits (434), Expect = 4.4e-39
Identity = 105/196 (53.57%), Postives = 120/196 (61.22%), Query Frame = 0


Query: 135 VGSQCTILTDNYGKDAYYLLQTPLLKNLLEMLIL---------------------QLFMV 194
           VGSQCTILTDNY +DAY+LLQTPLLKNLL   IL                     QL  V
Sbjct: 403 VGSQCTILTDNYCEDAYHLLQTPLLKNLLLAGILLDTKNLDTSSQSSMTRDAEAVQLLSV 462

Query: 195 ---------CFLLVMRVQKESAFFDALIQNYGKLPNDGSTTVWGHSERIKERNQASISPH 254
                     +  +MRVQKES+F DALIQNYGK P+DGS    G SE IKERNQ S  PH
Sbjct: 463 GSAPISKNGLYDQLMRVQKESSFLDALIQNYGKPPSDGSNDGEGRSEHIKERNQPSSPPH 522

Query: 255 GDAINQQKISNDLELAKLARFPQNSIRDFINMKLPLIFLVVKPNSLPFKTPAREASNPSR 301
           G+AINQQK S+D+  AK ++    S                KP+SLP +TP REASNPSR
Sbjct: 523 GEAINQQKKSSDIGTAKTSKVSPKS---------------AKPSSLPIQTPTREASNPSR 582

[Close]

BLAST of CcUC02G027510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GQZ5 (uncharacterized protein LOC111456732 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111456732 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 157.9 bits (398), Expect = 6.6e-35
Identity = 100/196 (51.02%), Postives = 111/196 (56.63%), Query Frame = 0


Query: 135 VGSQCTILTDNYGKDAYYLLQTPLLKNLLEMLIL---------------------QLFMV 194
           VGSQCTILTDNY +DAY+LLQTPLLKNL+   IL                     QL  V
Sbjct: 405 VGSQCTILTDNYCEDAYHLLQTPLLKNLMLAGILLDTKNLDGSAQLSMTRDAEAVQLLSV 464

Query: 195 ---------CFLLVMRVQKESAFFDALIQNYGKLPNDGSTTVWGHSERIKERNQASISPH 254
                     +  +MRVQKE  F DAL Q+YGK P+DGS    GH ERI ERN+ SISPH
Sbjct: 465 GSAPNCRNGLYDQLMRVQKERPFLDALQQSYGKPPDDGSNDGAGHVERIMERNRTSISPH 524

Query: 255 GDAINQQKISNDLELAKLARFPQNSIRDFINMKLPLIFLVVKPNSLPFKTPAREASNPSR 301
            D INQQK  ND   AK  R    S                KP+ LP +TPARE  N SR
Sbjct: 525 DDTINQQKKPNDFGTAKTCRASPKS---------------AKPSLLPIQTPARETPNISR 584

[Close]

BLAST of CcUC02G027510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JZR4 (uncharacterized protein LOC111490295 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111490295 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 155.6 bits (392), Expect = 3.3e-34
Identity = 100/196 (51.02%), Postives = 110/196 (56.12%), Query Frame = 0


Query: 135 VGSQCTILTDNYGKDAYYLLQTPLLKNLLEMLIL---------------------QLFMV 194
           VGSQCTILTDNY +DAY+LLQTPLLKNLL   IL                     QL  V
Sbjct: 143 VGSQCTILTDNYCEDAYHLLQTPLLKNLLLAGILLDTKNLDGSAQSSMTRDAEAVQLLSV 202

Query: 195 ---------CFLLVMRVQKESAFFDALIQNYGKLPNDGSTTVWGHSERIKERNQASISPH 254
                     +  +MRVQKE  F DAL Q+YGK P+DGS     H ERI ERN+ SISPH
Sbjct: 203 GSAPNCRNGLYDQLMRVQKERPFLDALQQSYGKPPDDGSNDDARHVERIMERNRTSISPH 262

Query: 255 GDAINQQKISNDLELAKLARFPQNSIRDFINMKLPLIFLVVKPNSLPFKTPAREASNPSR 301
            D INQQK  ND   AK  R    S                KP+ LP +TPARE  N SR
Sbjct: 263 DDTINQQKKPNDFGTAKTCRASPKS---------------AKPSLLPIQTPARETPNISR 322

[Close]

BLAST of CcUC02G027510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C6V5 (uncharacterized protein LOC111008802 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111008802 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 144.4 bits (363), Expect = 7.6e-31
Identity = 96/196 (48.98%), Postives = 110/196 (56.12%), Query Frame = 0


Query: 135 VGSQCTILTDNYGKDAYYLLQTPLLKNLLEMLIL---------------------QLFMV 194
           VGSQCTILTDNY +DAY+LLQTPLLKNLL   IL                     +L +V
Sbjct: 404 VGSQCTILTDNYCEDAYHLLQTPLLKNLLLAGILLDTKNLDASSQSSMTRDAEAVRLLLV 463

Query: 195 ---------CFLLVMRVQKESAFFDALIQNYGKLPNDGSTTVWGHSERIKERNQASISPH 254
                     +  +MRVQKE  F DAL Q+YGK PN         +E I ERNQ SISP 
Sbjct: 464 GSAPNYRNGLYDQLMRVQKERPFLDALQQSYGKPPN---------NEHITERNQTSISPR 523

Query: 255 GDAINQQKISNDLELAKLARFPQNSIRDFINMKLPLIFLVVKPNSLPFKTPAREASNPSR 301
            D+INQ+K  NDL  AK +R    S                KP SLP +TPA+EA N SR
Sbjct: 524 DDSINQRKKFNDLGTAKTSRASPQS---------------AKPGSLPIQTPAKEAPNTSR 575

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CcUC02G027510 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_038893746.1	6.1e-43	57.14	uncharacterized protein LOC120082581 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_03889374...	[more]
XP_038893748.1	6.1e-43	57.14	uncharacterized protein LOC120082581 isoform X2 [Benincasa hispida]	[more]
KAA0055265.1	8.8e-42	56.85	uncharacterized protein E6C27_scaffold80G001080 [Cucumis melo var. makuwa] >TYJ9...	[more]
XP_008446103.1	9.1e-39	53.57	PREDICTED: uncharacterized protein LOC103488927 [Cucumis melo]	[more]
XP_023542616.1	2.8e-35	51.53	uncharacterized protein LOC111802467 [Cucurbita pepo subsp. pepo]	[more]

BLAST of CcUC02G027510 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CcUC02G027510 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A5D3BJR5	4.3e-42	56.85	Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold...	[more]
A0A1S3BEY4	4.4e-39	53.57	uncharacterized protein LOC103488927 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488927 PE=...	[more]
A0A6J1GQZ5	6.6e-35	51.02	uncharacterized protein LOC111456732 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC1114567...	[more]
A0A6J1JZR4	3.3e-34	51.02	uncharacterized protein LOC111490295 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111490295...	[more]
A0A6J1C6V5	7.6e-31	48.98	uncharacterized protein LOC111008802 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111008...	[more]

BLAST of CcUC02G027510 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PANTHER	PTHR12112:SF39	SUBFAMILY NOT NAMED	coord: 179..299 coord: 134..163
None	No IPR available	PANTHER	PTHR12112	BNIP - RELATED	coord: 179..299 coord: 134..163

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
CcUC02G027510.1	CcUC02G027510.1	mRNA