CcUC02G024580 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview


Name	CcUC02G024580
Type	gene
Organism	Citrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
Description	Unknown protein
Location	CicolChr02: 8098487 .. 8112042 (+)
RNA-Seq Expression	CcUC02G024580
Synteny	CcUC02G024580

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGGTCATTCTAAGAGAAACAAGTTATTTGGGTATGTATGGATTAATAACCACTATGAAGGCTAATCTATATATAGGGTTGGTCATGGAAGTCTAAAGAGTACATGAAGATCGATCGTATGCGCCTTGTGAAGGCCGAGCCTCATGATGGACAAGAAGTGTTTAAAAACAACTTTGTAGCTTGGGTTCGTTGATTCATAACAGTTAAGATAAATTAGTAGCAATCAAATTAATTACCTCAGATATTAGTTAGCCAAGTGACCGTAACAAAATCTTTTTTCCTATATAATGAAGAGGGCACAAGACAATTAGGGCATGCTGAAAACACTCTAAATTCTCTATTCTCTAACCCTCTCTAAATTGTTACCAACTTGATTGTCGAAGTGTCGATGGCCAAGCACAACATTGGTGCAAGGTTTTCTCTATTTTGCATGACGATTGTTCGATTCCTTCCAAACATTACAAATTCACCATTGGTACCAATTTTCATATCGACAAATGAAAATTATTAATTTAGACTCTTCATTATGATTACCTTTAATTTGACGATCATTCATGCACTAATTCTCAAACGTGTATAGACTTCTTAAAATGTCTGTTTAATACAATGAATGTTTAGAGTAAATGCATGGATGATTCTCAAAATAAACTCTCACTCAGAGTCTAAATTGATTTATTTTTTAAAGTTTAAAGATTCAATTGATACAACTATAAGTTCGTACGAAGTTTCTTCAAACATAACATAATAGGGGGTGTAAATTGATACACTTACAAAAGTTTAGAATTTAAATTAATACAATTCTAAAGTTTATGGATATAAATTGATTTAAATTAAAAAAAAAGAAACAACAAGGGACATTTTAATTTCCAACAACTTCTTATTCAATTATATTAGGTTAAACAATTATTTTGGTCATATACTTTGAAGTTTGTCAACTTTTAGTCCTAATTTCATAAATCTTGAATTGAGTCCCTCAAAATTAATTTTTATCGAATTGGTTAAATAATAATAATAATTTTCATACAAATAGATAGAATATGTGAATAAGTTTTTAAAATTTATAGTAAAAATGCTAATAGATAATAAAAAGGTTTGAAAAAGTCAATAATAAACTAGCATTGGAAACTAAATTTAAGATTTAATGAAAATAGATGGACTACGATTGAACAATTGAAAGTATAAAGACTCGAAATTGAACCAACTTCAAAGTGTAGGGACAAAAAATAGTATTATAACCATTATATTACAATAGAAACTCATTAGATTCCACGGAAAATAAATCATTTGATAACTATTTTCCTTTTTGGTTTCTATTTTTAAAAATTATATTTGCGTAGGATAAATTACCTTTAAAATATTTTCAAAATTGATAAAATTTTAAAACTAAAGTTGAGAAGGATTACATGTGACAACCCAAATCATTAAGGTAAATCCTCTTATTAAGTTAATTTAAGTCATTATGCATCAAAAGAAAATTATATTTATTTATATGTATTTATGTAGTTATTTAGTTTAAGGGAGAAAGTTTTAAAATTAGCATTTATAGTGGTTGGTGAGTCTTAGGTGGATTTAAGGAAGTTGTTGGGAATTGGCAAAGGATAGTTTACTTTGGGGCAAATAAAATAAAATAAATAGATTTGGTTGGATTTGAGTGTGAATAAAGGAGATTTTATTTTATTTGGTTGGGAAACAAAAAGGGAAAAGTGGAATTAATGGGTTAAGGAGGGAAAGGAATTAGGGTTTATTTTAAACCCTCCTCTATTTGCGTGTAGTCAAAAAAAAAAGAGAAAAGAAAAGCTTTTCCCCCCATCTCTCTCCCTCTGCCCTGCCATCTCTCTCCCTCTCCACTGCCTCTCTCTCCTCCCTTCCTCCACAGTTTTCGTCACCGCCGCCGCCCTTCCTTCGTTTCTGGTCTCTCTTGTTCTCGCCACCTCTCTCTCTCTATTTCCGCTCGTTCCCGGAGGTTTCACGCTCGAAATTCACGCTCTCCACGCCAGGGTATCTTGTCTTCTGCAGCTCTCTCGCTCTTTCGCTGACTCACGCTCCCCCACTCTCACACTCGGAAATCACGCTCTCCACACCAGGGTCACACTCTCATGCTCTCTGGCTGGACTCTCGCTCGGCTCTCACTCTCGCTCAGAACTGTGTTCTCGACGGTAGTTAACTGCTCGTCTGACCGTCCATCGTCAGACCAGTACTCCCTAAGTAAGTATCTCAGACCTGAGTAGGTTAGTGGCATATTTGGGGATTACGAATTAATTGGTAAATCTTAATAGGTGGTCGGGGATTGCTTTAGTCCGTAGGGTCGGAGGAAACTGCGAGTTTGGTCACGTTCGGGTAAGGACTCTCTCGAACAAATTTTGAATTTGCTTATGATAGGTTGGGCTTGATGAATAACTTGCATTAGGGGAACTTTATTCCCAGTTGGTTCAGGAATTTTGCAAGAGTTGCAGTGTGGTTAGCTTTATGGATCAACTCTCAGGTAAGTGATCTTACTACCTGAATCGCCTTCGGTCCATATGTCTAGTTACCATGATGTAGTAGATTTCCAAAGCCACGTATGATATAAGATGCTTGTATGAAATTTCCATGTCTTAAAGTTGTATGTGCCTCATAGTGTATAAGCTTATACTATGAGACGTTTATGAACAGTACTGTTAATATATGAATTCATGGAATGGAAGGTGTGTGAATTTGATTGATCATGTATGATGGGTAGTGGTAACTCCCCTACGTCGGTTGGATGTGTATAAGCTTATACTATGAGACGTTTATGAACAGTACTGTTAATATATGAATTCATGGAATGGAAGGAGTGTGAATTTGATTGATCATGTATGATGGGTAGTGGTAACTCCCCTACGTCGGTTGGATGTCCACAGAAGGTTGTGTTCCTTTGGGATCACTAGAGGATGTGTTCCTTCGGGTTCACTAGAGGATGTGTTCCTTCGGGTTCACTAGAGGTTGTATTCCTTCAGGTTCACCAGAGGTTGTGCTCTTTCGAGTGCACTAGAGGTTTGTGTTCCTTCGGGATCACCAGAGGTAAGAGTTTCCTTCGAGGCTCTAGAGGTTAATGGGCATCCATAACCAACAGTGGGCGGGTATAACCATTTCCCTATAGAAGTATGATAGATATGCATGTCTCATGTTTGACGCACTTAAAGGACTTAGGTGCCTAGCCCGACTTAGGTAGTGAGGTCACTTACTGAGTAATATAATTACTCATCCTTTCTTCAGGTAAAGGAAGGAATGTGTCGGCGAATGACAAGAAGAATCCTTTATGGTATCACGGGACCCATAGTAGCTTCCACGTAGTCTTGCATGTTTTACTAAAATTGTTGTCCAACTGTCTAATTTTGTTTTGAGACTTGTCTATTTTTTTAATTATGTGGATTTTTTTTTATTCATTTATTTTATTAGGGGTACCCCGAACCAAAATTTCCTTTCTATTTATTAATGTGTTATTTTCTTGAGTTAATATAAGTAGAAATTTTCATGAAAAGCTTTGATCCTTCTTCATTGTTCAGCGTAGTGTCGTTCATTGAAGTTTTGCATGCATTGAGTAATGGTCCATATTAGTTTGTATAAGTCGGGTCGTTACAGTTGGTATCAGAGCCCAGAGTTTTGGGTTATGTAGACTTGCTTACTAAGTAAGTCGAGGGGTTCCCATAACCATTAAAGGATTCTTCGTCATCGCCAGGTACGCATTTCCAATTACATGTCTTTAGAATATTCTGCCTACAACGTACTAGTTTACCCTTGCATTGATACTTTGACATAACACCATTAGCAAGGAAATTAATGGTACCTGTGGTCCGTAAATTAGGATTGGCTCGTGGAGGTAGAGTTAGAGGTAGAGGCAGGAGGGGTAGGGCAAAAGGATTACTAAACCCTCAAGTCCAGGACCCTATGGAGCAAGACACCCCTGCACCACAAGGACCTCCACCGCCACAAGATCCCGTCAGGCAAGAGGAGCATGGAACCAGGGCAAGAGGAAGGCCTTGTAACGTGCCTGAGCCGTCCCAGACACAAGACCCACCAGTGGCCCAAACCGATTTCGCTGCAGTGGTAGCTCAGATAGGGGAGACTGTTACTGCCACTTTGTTAGGCAAGATTCAGGAGCTAACTCGCACCTCTGTGGCAGAACAATTAGCCCAACGGATTCCACCCCCGCAGGTGCCGGCCCAGCATCAGCATTACCAGGACTTATCCCCAGAAGCAAAACATCTGAGGGACTTCAGGAAATACAATCCGCGCGCTTTTGACGGGTCATTGAAGGACCCTACCAAGGCAGAGATGTGGCTATCGTCCATCGAGACTTTCTTTCGATATATGAAGTGCCCAGAGGACCAGAAGCTTTAGTGTGCAGTATTTGTTTTGACAGATGACGCCGAGATCTGGTGGCAGTCGGCAGAGAGGTCAGTGGTTACCATAGGAGGATCGGTTACCTAGGCTCAGTTCAAGGAGCGATTCAATGAGAAATATTTCTCCGCCAATACGAGGTACAATAAGCAGGTGGAGTTCATGAAGCTGAAGCAAGGGATCATGTCCGTTAAGGAGTACGAGAGAGAGTTCACCAAGTTATCCCGTTTTTCCCTCAAGATGGTAGCTATTGAGGAAGATAAGACAGAGTGCTTTGTGCAAGGTCTGAAGGATGGGTTAAGGGGTCTCGTGCAAGCCTTGGAACCCAGCAGTTACGCAGCAGCATTTCGAGCAGCAGTGAGGATTGACTCCCGTGCCGGAGAAGAGTATGTCAGAGCTATGACATCAGAAGCCTCTTTAGGCCAGAAAAGGAAGTTAGAGCAGAAAATCCAAGAGTTTCCTCCAAAGAACCGGGCAAACAGGCTCATACAGCACTTCAGACAACAGCCTTCGGCCTTGGGCTTAGTAGAGAGAGAAAAGCCAATATGTGGTTCCTGTGGAAAAAGTCACTGAGGGCAATGTTTAGCAGGCTCAGGAGTTTGTTTTCGGTGTGGCCAAGAGGGGACATGTCTAGCAA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mRNA sequence

ATGGACTTCTTGAGGTACCCTAAAACAAAAGATATTTGGATTTGGATTGAAAGGAAACTCGGTTCTGGAGTCCATGGCTTCTTCGGGAGCGGCAGCGACGGCGGCAATGGCAGACAAGAGGAGGCCTCTTCTTCCATTTGCAGAACCGGCAGTGGCGGTGGCGGTGGCGGTGCGAGGCTTGTTGGCTTGGTTTCTCTGAACGGATTGAACGTTGGAGGAAGCGAATTTGTTGAGAGTGACGGCGAGAGCCATCAGAATGATTTGGCCGATGGAACTCATCGGAGTGATAGTTTTGAGTTTGAGGATGAGGTTGAAGAATAG

Coding sequence (CDS)

ATGGACTTCTTGAGGTACCCTAAAACAAAAGATATTTGGATTTGGATTGAAAGGAAACTCGGTTCTGGAGTCCATGGCTTCTTCGGGAGCGGCAGCGACGGCGGCAATGGCAGACAAGAGGAGGCCTCTTCTTCCATTTGCAGAACCGGCAGTGGCGGTGGCGGTGGCGGTGCGAGGCTTGTTGGCTTGGTTTCTCTGAACGGATTGAACGTTGGAGGAAGCGAATTTGTTGAGAGTGACGGCGAGAGCCATCAGAATGATTTGGCCGATGGAACTCATCGGAGTGATAGTTTTGAGTTTGAGGATGAGGTTGAAGAATAG

Protein sequence

MDFLRYPKTKDIWIWIERKLGSGVHGFFGSGSDGGNGRQEEASSSICRTGSGGGGGGARLVGLVSLNGLNVGGSEFVESDGESHQNDLADGTHRSDSFEFEDEVEE

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CcUC02G024580 vs.


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BLAST of CcUC02G024580 vs.


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BLAST of CcUC02G024580 vs.


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BLAST of CcUC02G024580 vs.


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InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 74..106
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 28..54
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 80..99
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 36..50

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
CcUC02G024580.1	CcUC02G024580.1	mRNA