CcUC02G022600 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTTGTCTCCAAAGAAAACATGGTCGTTTTTATTGGTGTTCTTTTGTTTAGCATCAACTTGATTGACAGTGCATTTGCAATTAGATCCATCAATCATGTTTCTAACAAAGATGATGTGAATGTTGTATGTAATCCTAAAGATCTTCCTATAGTTTATGAACTACGTGATGGTGCTAAGAAATATGCAAGAGGGTACAATCCAATTGATCTCTGCAAACCTCTACAAGATGGCCAAGATAGGATTCATGGAGATGAAGTAAGAAATATGGTTGATGGTTCTTCAAAACAGATTAAAGGGGATAAAGACATTGTTCATCCTCAACCATATATTGTTTAAAATTATTAGGTGATGAGTTCATCAAAATATTATTTTTATGTGTTTCTTAAGCATATTTCAATAAAATATTCCACCTGTTGGTTCATATTTAAGCAATGGAAAAAGCCTCAAAATTGTTCCTCTAATAAGGACATGCACAAGAGTGAACTTCATTTTTATTTTTAGAGTAATAATCAATTCAATTATACCCGTAAATGTTGAGAGCAATATCCTTTGCTTATACAAAATAGAACCTTAAACATTTGTAAATGAATCAATTTAGAGTGTCTCTTAAGATTCTATTATAAAACTACTTCACACGTGTACGATTTCTTTGAATATAGGGATTGATGTCTAATATCAAAGAAGAACGTTGGAGTCAAATATACTGTAACTTTTTTCATTAATTTATCATTGATTTTTCATCTTCTCCCAAAATTTTCCATTTTATGCCGCTTTTATATTAGTAAGATTTCTAACAGCATAATGCAACCTAGCTCATTATATTCATATCATTCGGTACAAGAGAAACAGATCAATAATGATCTGATTTTTTTTCTCAAAGTATTTGCAGTTTAATTAAACAACTTGAAATAAGAATTTATATAGGTAATTATTTTAAATGACAAAATTATTAGAAATATTTTTAAATATAGTAAAAAAAAAAGTTTATACAAATTAATAGACGTCTATCAGTTTTCATCACTGATAGATAGTCATAGACTACTTTTTCCATTTTACTATATTTGTAAATAAATCGGCTCATTTTACTATATATCAAATAACTCATTTAACAATTTTATGTAATGTAGATTTCTATCATTTTATAATTAGATTTCACCTCTTTTCCTTTCATTTAAATTCAATATTGTTTGTGATTAATATTATGGCAATGCAAAATAATTGTCATTAAAGTAAATTTGGAACGAATGTAATTTAACAAAAATTGGATTTCACCTTTTTTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTCTGTTCCTTTTTCATTTAAATTCAATGTTTGTGATTAATATTAGGTATGACAAAAGTAAAAAATTGTCGGTAAGTAAATTTGAAAAGAATTTAATATTAACTGTTTTGTTTTAAATTGTTAATTCTTTTTTTAAAGAAAAAAAGAAAACCAGAAGACAATTACTTTTCAAAACTATAAAATTGCGCATTGTCTTAAAAGATAAGATATGGTTTAAAGCATATTCATTTGAAAATGTATGCGGTAAAGATTAGTTTAATCTAAGAGATGCTTTAAAAAAGATTAAACGTAACCATTTTAAATCTAATGGGATGATTTTGTTTAATTAAGCTACTAGTTGGTAACTATTTTATTTTTTATTTTTCGTTTTTAATTTTTTTAAATTAAGACTACAAACACTCCTTCCGCCTTTAAATTTTTTGTTTTTGTTAACTACTTATTACCAATATTTTCAAAACTAAGCAAGATAATTTTGAAAACTAAAAAAATGTAGTTTTTAAAGCTTGTTTTTGTTTATGGAATTTGACTATTGTACATGAGAAAGAAGTAAACCATTGCAAGAAATTGAGAAGAAATAAGTTTAATTTTTAAAAACTAAAAATAAAAAATAAAATATTTACCAAATGGTAATTAGTTTTTCCTTTTTCATGATAAGTTCTAATTGTTACCTATGATGTGAAAAAAGNTACTATTGATCTCAAGGTTCAGAAGTTCTAAAAGTTTATCGTACCTACTATTTTCATTGATTATGGATATCTTCAAGAAAAACATGTTGATTTTTGTTGGTGTTTTTGTTATTAGCACAAACCTAATTGAAATTACGAAAGCAATTAGATCCATCAATTATATTGGTGCTCCTCAAGGTGGTGTGGAGGTTGTATGTAGCCCAGAAGATCCAAGAGTTTACAATCTGAATTATGCTAACCAAGAATCAAGTGAATTCAATGATGTTGATGGTTGCAAACCTCAAAAAGATTATCAACATAACATCAATGGTGATGGATTGGGAAATATGGCTCCTCAAAGCCCAAAAGAAGATAAAAGTATTGTTACTTCTCTACCATATATGAATTAAATTCATGTGGCAAGTTCATTCTCTTTTTGTTTTTTAAAGGATTCTTTGCTTGTTGTCTTATCCCCATATAAATTGCAATGAAGAAAAAAAAGGACAGAATTCGAAATTGAGAAATAAATTGCTTTTTCCTCTTTTCTCTTTTGGCAATATATGAGTATAGAATTTGAAGTTGATTTGTTGCATTGTTAATTAAAGTGATTTATAAGTATTCAAATCATATTAAGGATTCTTTGTGCGTTGTTCGATCACACAGATAATGTGTGAGACTTTGTTTTGGTTATATCTCTTTCGATGGAATTTTGCTTTAGCTAAATGATTAATCGGTGTCTTACATTCTTTTCATGTTCTTTTCAATCATGCTTATAAACGGAATATAATATTAAAAAACTTTGATGTTTAAAGCCCTCGTGAAGGAAAAGTAGGAGAAGACAAAGGTGAGATAGAGAAAAAAAAATGATGTTAATTGAAGTTTAAAAGAAAAAATGTTGGATGAGAGGGGAGAGGGAGAAGAAGGATAGAAAACAATACAGAGAGTCAAAGACCAAAGATAAAAGGAACTTGGGTGCCCACTTTTTGTGCAGCCCAAGCAACATCCAATAATAACGTGTCATGTAATAAAAAAAATATATTTTTTATTTTTAGCGTGTAAGAAAAAATGGAGCATGTGATTAGCAACTAATCATTGTCCTTTTGTAATCTAAACTAAAAAAGAATAGTTCCACCACTAAAAAGGTGGAAGAAAACTAGTTTTCAAAAAGCATGTCACTTCTGAAGTTAGTTTCTATGTTAAGTTTTAGCAATTAATTTTATGTTTGGCCCAAAAACGACCTCACAACATATTAACATTAATTTTATAACTTATTAACTTGTTACATTATAGGTTTTATGACTAAACAAATTCAATCCTTACCTCAAATGCTCCCAGAGAAAAAAGAAAGTGTTAAAATACTCAATTTGGTTTATGTACTATGGTTTCATGACTAAACAATTTCGTTAAGTCTTAAATTAAAATTAGTAATTACTATTAATTATGTTTGAAATTAATTTTTATCAAACTTAATAAAATAATAATAATAATAATAATAATTTCCATTGAAGATGAGACAAAATAAATGTGATAATCTTTCCAAAACTTTATAGTTAACGTTGTTAGAGACTAAATTTGGTGTTGAAAGTTAACCATAAATTAACAATAGAAAATAATTTTAAGATCCATTGAATGTAAAGGAACTAAAATCGAAGAGCTTTAAAATTACATGAGATCAAAATTAACAATCGGAAACCTTGAAAATAGTGAATAAGGAGATTATCATATAGTGGGAGTCAGTCAACATCTTTTCGACAGTATTTGACAAGGTGGCTTTTGAAAATTAACCTTGTTATATGTTTCAAAAGTCCAATGTTTTGAACTTAGGTGAAATGACAATGCTTGAGACTAAACGTTTAGTCTCTGTAAACATCGTTGTCTTCAATAGCAAACAACATTTTTACTAAGACATTCACATTTACATTCACATACTTTTTTTTTTTTCTTTAAGAAACTGTACATCCATTTTTGGTTTTTTTTTTTTATCGACGTCAAAGCCTAGACTTATAGTAGTGATAAGAAGGAATTAAGTAGAATCTTGCATTGGAAACACCATTGTGGGTATGTTGTAATTCCCGGTCAATGGATTTAATAGCTTGGGGCATGTGGAGTAAACCTAAGGGTGCTTCTATAAGCCTATGCATGATGATGAAATTATTCCCAAAAAATAGGCTATCCATATGCAAATTAGACGATACATGAATGAAAAATGACAAAAAATAAGCCATATTGACACATATGTGACATAAAAGCTTAGGCTATCCATATGCAAATTAGACGATACATGAATGAAAAATGACAAAAAATAAGCCAGATTGACACATATGTGACATAAAAGCTTCAAGTAAGTGAGGCTAATTCTAAGGTCGTAAATGATAAAGGTCTCTACATTGGTCACAAGGTTGTATATAGCTATGTGATCAAATTGAGTGAAAAAATTTCGTTTTCCACACATAAGCATAAGCTTCTTGCAAGTCGAGCTATCGTACACTACTTCATCCTTGATTATATTCCTATTGAGTAAAGCTTGGGTACGAGGTTTTGTGATAGTGTGTGAAGTAAAATAATAAAGCAATCAATCAAATAAATAAAATGAACTCTAAAAGAATCATATCATGTCATTTTTGTCCTATTAAATTAAGGGGCAGATCTATTAAGAGGCCAAGGGAGAATGTGCCCCTGGAATGGAGACATTGTATATATATGTACATTGATTTTCGTAAATGTAAAAATAAAAATAAATAAATAAATATTTAAAAAAAAATTGTAGTTATAACTTAGTTATATATATTTTCTGTTACAAAATAAACAATCTAATACCTTTGATTCTATCGAAGGCACGGTAAATATGCCTTCTCTCTCCCAAGTCGAAGGTTTGAGTCTTAAATGTTTATTTATGTCTATCATTGATAGACATTTTTAAGTTTTAGTACACTTGAAATAGGTGAGGAAACTTAATTCCATTTTAATTTTTCTCACATACACATGTAAAAATATACAAATATTTTTGGATTTTTATAAAATTGCTTTAGTGAAAATTGATTGAGTGGTTTTTTTTAATAGATGATTGAATAATTGTTTGCTAGTGTATTTAGGTAAATAATTCTATAAAGCTTTATACTTTATAATAATTTGTAATTAATATTACTTAATTTAGATATCATATATCAATGAATTTCAAATTACATTTAAATGAAGTTAATTTATATCCAAAGCTTAGTCCCTGAGTATTGAAAATTGTGACTAACTTTCAATTTTGACTTTAGTCCCTTAAAAATGTTTAATAAATCTATAAAATCTTCAATTTTAATCTAGTATAAATTATAAATATTAAAAATGTTTAAAAATTAACTGTATAAGACGAAGAAAAATCAATTTTGCGTCAAATATGTAAGAGATCTGTGGGATGCAAAATTAATATTATTTAGGAAACTATTAAACACAAAAAATCAAGAATTCATGGATCTATTAGATATTTTTAAGTTTAGGAACTATAATATAAACACAAATCTAGAAGTTCGTGCGCTAAACTTCAAATCTTAAATACATTTGTGCTCCCTTAATATGAAGTTCTAGATCCATCATTGGCCAAGTTGCAATTTAACTTTTTTAAGTTTAATCTAAGAGAATTTTATAATAAAAAATGATAAATCATTTTAAGTTGCAAAACTGCTTAAAAATAGTTACAACTAATAGCAAAATACACCATCTATCACGATATATCGCGGTCTATTACAGATAGACAGTAGAATTTTGCTATATTTGTAAATATTTTTGTTCTTTTGCTATATTTGAAAAGAGTCCATAAAAAATTAAGGAAACCATGTTAAATCTAAGTGCATAATTTTGTTTAATTAATTTTGTCTAAATTGTTAGCTAGTGTGTGAAAAAAGGAAAGAAAATGTTTGTTCTAAATTTGATCTCTTGGTGTGAACCGATGATCTGTATATGTAAAAATAGAGAATAAAAAACGAGTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTGGGTATGTTGACGAAGTTGTTTCCTTCCAACAAATTTAAAAGAAGATAAAGATGTAATTAAAACTAACAAAGACCCAAAAAAAAAAAAGTTGTGAGAGGGGACTTACTCCAATATAAATATATTGATATTTCAAAACTTTTGTCAGAGCAAAAGGCAATTATACTATTGATCTCAAGGTTCAGAAGTTCTAAAAGTTTATCGTACCTACTATTTTCATTGATTATGGATATCTTCAAGAAAAACATGTTGATTTTTGTTGGTGTTTTTGTTATTAGCACAAACCTAATTGAAATTACAAAAGCAATTAGATCCATCAATTATATTGGTGCTCCTCAAGGTGGTGTGGAGGTTGTATGTAGCCCAGAAGATCCAAGAGTTTACAATCTGAATTATGCTAACCAAGAATCAAGTGAATTCAATGATGTTGATGGTTGCAAACCTCAAAAAGATTATCAACATAACATCAATGGTGATGGATTGGGAAATATGGCTCCTCAAAGCCCAAAAGAAGATAAAAGTATTGTTACTTCTCTACCATATATGAATTAA ATGGTTGTCTCCAAAGAAAACATGGTCGTTTTTATTGGTGTTCTTTTGTTTAGCATCAACTTGATTGACAGTGCATTTGCAATTAGATCCATCAATCATGTTTCTAACAAAGATGATGTGAATGTTGTATGTAATCCTAAAGATCTTCCTATAGTTTATGAACTACGTGATGGTGCTAAGAAATATGCAAGAGGGTACAATCCAATTGATCTCTGCAAACCTCTACAAGATGGCCAAGATAGGATTCATGGAGATGAAAAAAACATGTTGATTTTTGTTGGTGTTTTTGTTATTAGCACAAACCTAATTGAAATTACGAAAGCAATTAGATCCATCAATTATATTGGTGCTCCTCAAGGTGGTGTGGAGGTTGTATGTAGCCCAGAAGATCCAAGAGTTTACAATCTGAATTATGCTAACCAAGAATCAAGTGAATTCAATGATGTTGATGGTTGCAAACCTCAAAAAGATTATCAACATAACATCAATGGTGATGGATTGGGAAATATGGCTCCTCAAAGCCCAAAAGAAGATAAAAAGCAAAAGGCAATTATACTATTGATCTCAAGGTTCAGAAGTTCTAAAAGTTTATCGTACCTACTATTTTCATTGATTATGGATATCTTCAAGAAAAACATGTTGATTTTTGTTGGTGTTTTTGTTATTAGCACAAACCTAATTGAAATTACAAAAGCAATTAGATCCATCAATTATATTGGTGCTCCTCAAGGTGGTGTGGAGGTTGTATGTAGCCCAGAAGATCCAAGAGTTTACAATCTGAATTATGCTAACCAAGAATCAAGTGAATTCAATGATGTTGATGGTTGCAAACCTCAAAAAGATTATCAACATAACATCAATGGTGATGGATTGGGAAATATGGCTCCTCAAAGCCCAAAAGAAGATAAAAGTATTGTTACTTCTCTACCATATATGAATTAA ATGGTTGTCTCCAAAGAAAACATGGTCGTTTTTATTGGTGTTCTTTTGTTTAGCATCAACTTGATTGACAGTGCATTTGCAATTAGATCCATCAATCATGTTTCTAACAAAGATGATGTGAATGTTGTATGTAATCCTAAAGATCTTCCTATAGTTTATGAACTACGTGATGGTGCTAAGAAATATGCAAGAGGGTACAATCCAATTGATCTCTGCAAACCTCTACAAGATGGCCAAGATAGGATTCATGGAGATGAAAAAAACATGTTGATTTTTGTTGGTGTTTTTGTTATTAGCACAAACCTAATTGAAATTACGAAAGCAATTAGATCCATCAATTATATTGGTGCTCCTCAAGGTGGTGTGGAGGTTGTATGTAGCCCAGAAGATCCAAGAGTTTACAATCTGAATTATGCTAACCAAGAATCAAGTGAATTCAATGATGTTGATGGTTGCAAACCTCAAAAAGATTATCAACATAACATCAATGGTGATGGATTGGGAAATATGGCTCCTCAAAGCCCAAAAGAAGATAAAAAGCAAAAGGCAATTATACTATTGATCTCAAGGTTCAGAAGTTCTAAAAGTTTATCGTACCTACTATTTTCATTGATTATGGATATCTTCAAGAAAAACATGTTGATTTTTGTTGGTGTTTTTGTTATTAGCACAAACCTAATTGAAATTACAAAAGCAATTAGATCCATCAATTATATTGGTGCTCCTCAAGGTGGTGTGGAGGTTGTATGTAGCCCAGAAGATCCAAGAGTTTACAATCTGAATTATGCTAACCAAGAATCAAGTGAATTCAATGATGTTGATGGTTGCAAACCTCAAAAAGATTATCAACATAACATCAATGGTGATGGATTGGGAAATATGGCTCCTCAAAGCCCAAAAGAAGATAAAAGTATTGTTACTTCTCTACCATATATGAATTAA MVVSKENMVVFIGVLLFSINLIDSAFAIRSINHVSNKDDVNVVCNPKDLPIVYELRDGAKKYARGYNPIDLCKPLQDGQDRIHGDEKNMLIFVGVFVISTNLIEITKAIRSINYIGAPQGGVEVVCSPEDPRVYNLNYANQESSEFNDVDGCKPQKDYQHNINGDGLGNMAPQSPKEDKKQKAIILLISRFRSSKSLSYLLFSLIMDIFKKNMLIFVGVFVISTNLIEITKAIRSINYIGAPQGGVEVVCSPEDPRVYNLNYANQESSEFNDVDGCKPQKDYQHNINGDGLGNMAPQSPKEDKSIVTSLPYMN Homology
BLAST of CcUC02G022600 vs. NCBI nr
Match: KAE8646139.1 (hypothetical protein Csa_016560, partial [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 99.0 bits (245), Expect = 7.8e-17 Identity = 64/109 (58.72%), Postives = 75/109 (68.81%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G022600 vs. NCBI nr
Match: KAA0036627.1 (hypothetical protein E6C27_scaffold191G001550 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK03365.1 hypothetical protein E5676_scaffold2392G00270 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 92.8 bits (229), Expect = 5.6e-15 Identity = 54/95 (56.84%), Postives = 62/95 (65.26%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G022600 vs. NCBI nr
Match: KGN44636.2 (hypothetical protein Csa_016656 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 80.5 bits (197), Expect = 2.9e-11 Identity = 43/86 (50.00%), Postives = 55/86 (63.95%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G022600 vs. NCBI nr
Match: KAE8646140.1 (hypothetical protein Csa_015664 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 76.6 bits (187), Expect = 4.1e-10 Identity = 41/86 (47.67%), Postives = 54/86 (62.79%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G022600 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K4C8 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G269040 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 104.0 bits (258), Expect = 1.2e-18 Identity = 63/105 (60.00%), Postives = 76/105 (72.38%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G022600 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K7P8 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G269030 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 97.4 bits (241), Expect = 1.1e-16 Identity = 59/95 (62.11%), Postives = 68/95 (71.58%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G022600 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BWB1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold2392G00270 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 92.8 bits (229), Expect = 2.7e-15 Identity = 54/95 (56.84%), Postives = 62/95 (65.26%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G022600 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K605 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G269050 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 80.5 bits (197), Expect = 1.4e-11 Identity = 43/86 (50.00%), Postives = 55/86 (63.95%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G022600 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K3T5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G270050 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 77.4 bits (189), Expect = 1.2e-10 Identity = 42/86 (48.84%), Postives = 54/86 (62.79%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
|