CcUC01G013720 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC01G013720
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr01: 26273183 .. 26276429 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC01G013720
SyntenyCcUC01G013720
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAATACTACGGATTTCTATGCTTGCTTTGTTGTCAAATGCAATGATCTTTCACAAAAAAATCCAAACATCTCCAAAAGATATTTCTTTTTCCTTTCTAAATTAGGTATCGTAAGAAAAGTTTTCACATCTTCTCATGGGAAAATCAAAATTTCTTGCCATCTGCCTTCATTTTTCAAAATAATTTAGGATAGTTTAAAAAAAAAAAAATTAAGCATGACCCTCTGCCATTTTCTAAAATGCACTAAAATGAATGTTAATATTCATATTTTCATTTGCGCACACCATTAATGAGAATTCAAAGCAACAAACACGAGCGCGTGAGAGAGAAGAAAAATCCTAACATGTAAGAGTATTATTGTACTAGATTAGTTGAATGAGAGAAAAAAATCCCTAACATGTGAGAACATTATTCTATTTGTTTACTTGAACGAGAAACAATGTCATATCCAGAACTTTGGGTCAAAAAAAATGTCTAATAAGTTAATGAATTCTTGATTTTGGTGTCTAATAGATTGCTAAAATATCTATTTTGCTTCCAATAGGTCTTACTTTTTTTCAAAAATGTTAAAAAAAATGTTATACTATAAATTAAATTATGATGTATCTAAGAACAAAATTGACAAAAAAAAAATTCAATAAAATGATTAACATGAAAATATTTTAAATATTTTTTAGATCCATTATATATAAATTTGAAATTTTATAAATTTATTAAACATTTTTATACGACTTATTATAGTTAAAAGTTTAGGAATTTATTAGCCACAAATTTTAAAGTTTAAATCCTATAAAATATTTATTAGCAGGTTGAATGCAAAAAAAAAGTCGGAAATGATTTAAAAAAAAAAAAAAAAGGAATTATTGCTTTTTGAAAAAAAGGTTGAAAATTAGAATAACAGATATACATTTTTTGGAAAATTAAAAAGATTTATATACATTCATTGAAAAATTAAAACAAACAAAATAAATAAATAAATAAATATATATATATATATATTATAAAATATAAAAAACAACGCACAAGCTTTGGTTCAAAATAATAACTAGGGGCCAAACGAACCTGTGCCTCTAACCACTAAGCCAAAGATAGACTATGAGATAAAAGGTATCACAAACATATAGATATTTAATATAAATAAAACATGTCATCAATCTAAGAGGCACATGCCCCGGACCCCTTAATACATCCATCTTTGATGAGAGGAAAGGAGGGATAAAGAGTCATGTGAACACTTTGTACGAATGACTTCAATTTTACACCTACTAAAATCGAGGGGAGTCGTATGAATAATTATGGTCTATATAATTTGGATTGACTAGGAATTTTTTTTCTTTCAAAAAGTCATTTTCATTTAATCACTTTTGATAAAAACTGCTTAATATAAAACTTTCTTTAAAGTAGTTTTATATATTGGTTTGTTTGGTTTATTATATACTAAAGATGTTTTTATTAATTTCAAATGATTATAAATGATGATTATTGAAAACCATGAGCTATTGATTTAAAAACACATTTAATGGCTGAGTTTTTTTTTTTTTTGAACCATATGATCGATATAATTGGTCATTAGAATTAATTATTAGGAGTTGGTCAATGGAGATAATTGATAATAGTAGCCGGAGGTGGTCGTTGCTGGAATTGGTTGCCAAAGGGAGTCATCAAAGTTGGCCATTGTGGTTGATTACTGGAGGTGGTTGATGAATTTTGTAGTTAAAGGTAGCAGCCGGAGTTGGTTAATAGAAGTTTCGTTGGAGTACGTTATTGGTGGTGATCGTCATAGGTTGCCAATGATGGTCTTTGGAGGTTTTCGATAAGGGTGGTGGTAGCCGGTAACAATGAGGGTGGAAGTGCAAAACATTTTGGTAATTTAAGTATTATACAAATGGATTAAGCATAAAAATAGAGCCATTTGAAAAAATCTTTGCAAAAAACGTGTACTATCAAAACTATTTATAAAAATGTTGTTGATTCTTTGTTATTAATTTTAGTCTTTTGAGAAGATTGAACTTGAAAAAAAATGAGTTTTATAATTGCCCTCACAACCATGTGGACAACACCGCTATGATGGAAAGGCTCAGTGTCACGGTCATTTTCATGGTAGGGTTGAGACACTCTCCCTCACTCAATCTCATCATCGACCTCGATGATATTCTCCTTCCTTAGATAGGATCTAGACACTCAGCTCCGTTTATTTATTTATTTATTTATTATTATTATTTACTAACTAAACCAAATTTTGTTAGCAATATGAAGCGGTTTACAAGGAGATTAAATTGGATCAACTAAAAACCTTAGCAACCAAATTTTGTTTAGGTACCAAGATTAATTGAACACCTGTGCAATTTAGATTAGATTGCTAACTTGCATGCATACTCAATTTTTAAGCAATTAAATTTAATCCTATGATTTTGAAAAAGTTAGAATTTAGTCACTATAATTTTAAAGGTTAGAAATTTAATCCTAAACCTCGTAAATAGTTCTTATGGTTCCAATTTAATCATAATTTGATTAAATTGCACATAATTTAAGTATGGATACAAGTTGTAATTTAGGTCACGTTTACAACGGGTGAAAGGTAGACCATCAATGGTAGTGCAAAAAGTGGGCCTCAGTTAATTACTTTTGTTGTTATTTACGTGTATTCCGTAATCGTAATGAGTTGTGGGATCTGCCTTAAAATTTTTAATCAAATCATGCAATCTAATTGAAGAACTAATTGTGGTTCAAAATTATGTGGGATCTACTATCTTTGTCATTGCCGATATCATTACTGTTACTATTACAAATATTGTTACTGTAACCGTGAAAATTATGAATTTGTTACATTTATTGTTACTTTTACCATTAAGGTCAAGCAGTAACAGTAACAATAATGGTAACAGTAAAATGTCACATATTCATAATTCTAGATAAACACGATAAAAAACGATCTAATTATGTTTGTGATTCAAGTTTATTACAATTCATCCTTCAATAAAATCTCATTCTAATTACATCAATTTTTATTATAATTTGATAAACGTAGCCTTGGATCAAATTGCACCAGAATTTACGTGAACAAAATTTGGCTGCTGAGGTTTTTAGTTAATCCAATTTAATCTCCTTGTAAACCCCCTTCAGATTGATAACAAAATTTGGTTTAGTCAGTATAATAAAATGAAAGAAACGGAGTTGAGTGTGTACATCACGGCGGTGTTGTCCACGTGGGCGTTGAGGACAGTTCCAGTCTTCACAAAAGGATAA

mRNA sequence

ATGAATACTACGGATTTCTATGCTTGCTTTGTTGTCAAATGCAATGATCTTTCACAAAAAAATCCAAACATCTCCAAAAGATATTTCTTTTTCCTTTCTAAATTAGGTATCATTGATAACAAAATTTGGTTTAGTCAGTATAATAAAATGAAAGAAACGGAGTTGAGTGTGTACATCACGGCGGTGTTGTCCACGTGGGCGTTGAGGACAGTTCCAGTCTTCACAAAAGGATAA

Coding sequence (CDS)

ATGAATACTACGGATTTCTATGCTTGCTTTGTTGTCAAATGCAATGATCTTTCACAAAAAAATCCAAACATCTCCAAAAGATATTTCTTTTTCCTTTCTAAATTAGGTATCATTGATAACAAAATTTGGTTTAGTCAGTATAATAAAATGAAAGAAACGGAGTTGAGTGTGTACATCACGGCGGTGTTGTCCACGTGGGCGTTGAGGACAGTTCCAGTCTTCACAAAAGGATAA

Protein sequence

MNTTDFYACFVVKCNDLSQKNPNISKRYFFFLSKLGIIDNKIWFSQYNKMKETELSVYITAVLSTWALRTVPVFTKG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC01G013720.1CcUC01G013720.1mRNA