Carg27857 (gene) Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGGACTGAAAATCATGCTCAGCAGCAGTTTCCTACTAGGCCTGTTGGCACACCTTTTGCTACCACTCAGACCGCGTCACCCTTTTCATCCTCTGGTCCTGTAGTTGGATCAGACGCCTCTCGTTTTAGACCTGCCTCTCCTGCTATGCCGACAAACACAATGCCTTTTCCTCCATCCTCTGGTCCTGCAGTTGGAGCAGGGAGCCCTGGGTTTAGACCTATGCAACCAAGTAGGTTCCTTGATCCATCTGTTCCACCACCATCAGCATCCAGTGTCCCAGCAACTGCTGGGCCTTTCCAGCGTTTCCCAGCTCCACAGTTTGTTTCACCAACTCAACCACCTCCTGCACGAATTCCACCAATGGGGCAACCTCCTGCTGCTTATGCATCGCCACCTCCAGCTTCTTTTCACCAGCAGACTCAGATTCCTTCAGTGCCTATGGGATCTCCTCCTCAAAACTTAGGCCCTCCTCCCACAAATGTTCCACAGCCTATGTTAGATCCATCTTTTCCATCAGCCAGGCCTAACTTTCACTCCTCTTTGCCTGGTTATGTCCATAAGCAGCCCAATGCAGATTTACAATCCCAACAAATCCAACCTCCTTTGGTTAGTCACCAAGGGCAGTATGTTCCTCCTTCAGCCCCAGCTTCCCCTTTCCTTGGTCACCAAGGAGGTTATGTTTCTCCTCCTCAAGCTGCAGCCTCACAAGGTTTGCTGTCTACAGACCTAAAGCACTATCCAGGCACTGGGCCGCCCCTTAGCTCCATTCAAGGATTAGCTGAAGATTTCAACTCACTTTCTATTGGATCTGTTCCTGGATCAATTGATGCAGGAATTGATCCAAAAACACTTCCAAGGCCATTGAATGGTGATGAAGAGCCTAAATTGTTTTCCGAGATGTACCCCATGAACTGTGATCAGAGATATTTACGGCTTACAACCAGTGCCATTCCCAGTTCCCAGTCACTTGTCTCAAGGTGGCATCTACCTCTCGGAGCAATTGTTTGTCCACTTGCAGAAGCTCCAAGTGGGGTTAGTGTTTCTATGCTAGAAATAACTAATATTTTGATTTCTGTGCATGCTAAAGTTACCTTATTAAATTTCTTTTATTTTGCTCTAGGAAGAAGTGCCAGTTATCAATTTTGCTTCAACTGGTGTCATCCGCTGCAGAAGGTGTCGCACTTATATAAATCCATATGCCACATTCACAGATGCAGGAAGAAAGTGGCGCTGCAACATTTGTTCTTTGCTGAATGATGGTACGAAGGCTTATAATTCTCATGGCTCCTGGACACTAGAATTAGTAAATTTGACCTATTGTTATATGCAGTTACAGTTTCTTATTTGGAAGCCTAGTGCATAGGAGATATATTTTTTAAGAGCCAAAGTCGCATCCTTTCTTTTGAATTTCAGCCATAGGCTGTGACCTATATTGATTTTTCTTTTTATTTTCCCCTTCCTTTCTTGGACAAACAATTTAGTGTTACTGTAGAGCTTGAGTGTAACATTCACTTCATTTACTGCTTTTGTTTCCTTTGGAAGGTAGAATATTTACCTATTTGTATTATTTTTTTGGAAAATGCCATTTCTTTTTGTATACAGCTATTTACCGTGTTGGCTTATATTGAATTATGTCGATTCCCTATTCAGTTCAGGGTGACTATTTTGCCCATTTGGATGCTACTGGCCGGAGAATTGATTTGGATCAGCGACCTGAGCTTACTAAGGGTAGTGTGGATTTTGTTGCTCCAACCGAGTATATGGTTCGGCCACCTATGCCTCCACTGTACTTTTTCCTTATAGATGCTTCTATAGCTGCAGTTAGAAGTGGGATGTTAGAGGTAAGTATTTCTATACGATTATTACTATTAATATTAGTTTTATTTTCCTTGATTATTACTATTACTATTAGTTTTATTTTCCTTGATTATTACTATTACTACTAGTTTTATTTTCCTCATCTCCCCTTATTGCAAGTATAAATTATTTTGCTTGCTTTTCATATTTAATATTACTATTAGTTTACATGTGCCCTTTCTAATAGAGAAAGTCTAACTAAATATCTTGATACTAGACAATGATAAATCTAACCAAATCACCGTATAGTAACCGTAAATCTAACTAAATCCCTAGTATCAATAGGTAACAGTAAATTTAACTTCTGACTATTAAATCCCTAGATACTCGTAAATCTAAATAAATCTAGGTAATAACACAGTAGGTCAAGATTACATAAATATTTCTTAAATCAAGGTTATTCCTTCAATACCCCTCAAGTCTATCCTCTTTTATTGAGAATTTTTTTTTTTACAATCTAAAAGAAATTATCATAATATGAAGTGAATGGTAGCTTTTAGGTTGACGAGGAAGGTTTCTCTGGTGTAAACTGTTTCTGAATATATTGAATGACAATCTGTCCATTGCCATCCTAACAGTGGTATTTATACTCTGGTTATAACCAAGAAATCTAAACTAATATCTAGGGGTTTAGTTAGATTTATTCTTCTGTATTGTTACCTAATATCTATGCATTTAGCTAGTCTTTTTGTATTATAAAAGGCATATGTACCTCTGAAAATTAAGAAGAGGCGTGAGTAAGATAATTTCCACTTGCAACAATAACTAACAAGCAACTAATGGTTCTAGAACTTATACTATACCATTCTTAACATTTTATTTTGGTTAACCGGTGCACTCCAATTTTTTTTTGAGAAGAACAAATTTTATTGATGAATGAAATAAAAGGAGCTCATGAAAACTTAAAAATATTAAGTGCATGGCCATTGCTTTGAGTGATATATCTTTGTAATACAAAGAATTGAAAAAGAATCAAAGTTGAAAGGGTAGTCACAAACGGGTGTTTATTCTTAGACCAATACAAAGAAATGAAAAAGAATAAAATCTAAGAAACTATCAAAATATTAAGCGCATGGCCATTGACTTGAGTGATATACTAGGTGTGTGGCTCCAACATGCGAGCCATTTGCTTCACTTAAGCTACACCTTTTTGTTACTTCACGCCTGAAGGAAATTAACAGACTCATCGTCTTTGTGTGCATCTTCAGCTTTGTAAACACTGACCAAAATCTATTTTTGTTGGGTGAAAATCTTTGAAAGAGATTACCATAATATGCTTAGACATTGAGTTGCTAGATTTTTTTGGGTTAATAAAAGAGAATCTTTTTCTCATAAAAAAAATGAAAAAGAATCTTCTTTATTATCATTTCTTATATAAGAATCTATTTTATGCGTCAATTTTGGTTATAATTGCATTTTAATCATGAAATTGCCTTGTTTTCCTTGCTGTTTGTCTTCCCCTGCCTGTTTTCTTTTCTCCTTCCTTTTGTTACATGGTCTCCCCTTATTTGGCACTCTTCCTTTGAACCAGTTCCTAGGATGGCCCATTATCTAGCCGTAGATATACCTTGTCTATGGTTGTGTCTCATATAGTAGGGTTGTCTATGGTTGCTGCTAGTGCAGGCTTTGGGGGTGGAAGTTTGCTTGGGTATCGGTTGGACATAGATTCTCTGCAATAAACCTCCTCTCATTTTCCTCTTTGAGTGGGTCATTGTGAGTGGTTAGCATTTGAAGGGGGGAACATTGCAGAATTCCTAGCGAGACTCAGTACTGGGACTCGATTATTACAAGAAACGAGTCCTTTCTTTGATTTAATGAAAAGAAATGAAATGTTATAGGAGAGAACAACAAAAAATGAAAATGAAATAAAATAGAAATAAAATGTTAAAGGAGGAAAAAAAAAAATGAAAATGAGATAAACTAACTATGGGATATGAAAGCACCGGATTAATTGAGTTTTCTGTAAATCCTTCTTACAAACAAATACGGGTCTCCAATGCAGATTCAAAGGGCAAGATGTTGCGATAAGATTTTCTTGTAGGAATGTGAAACAAAGCTCTTCCAATAGTTCTGAACTTCCAAAGTTATATCTATTTGGTCCTGTACTCTGAAATGTGAAACAAAGAACACATATTTTAATTCAATTGCAAAATTCACATTTAAGAGTAGTTTACCTTTTACGACTAATTTCTCTTTGTTGAGGATCAAGGAAGGAAGATTAAGAAAGTAGCTCAAAGTCCTTTAGGAATTTTTCATAGAGTGGAATTGATTTGTCTTCCAGGATCGTTGGGTGAAGTAGTAAGAAATTATAGAAAAAGTGCAACAATTGAATGAACTTGGCCTTGAAGAAAGTGGTTGTGCCTTTAGTTTGAATCTCAAGTTGCGGAGGGTCTAAGACTTGAAAGAGCGACTATGAGAAAGCCTTATTCTTTGAGGTGGGTGGTGAACTTTAATTCAGCAAGTCCTTAGAGGGGTTTCTTTATACTTTCTTTCTTAATTCTATTTTCTGTCTTTTGTGTGCTTCACTCCAGAAAGATACATTTTTTGTGGGAAGGTTGGAGGTGGATGGGAGTTCACACTAGATGAGTTGGGATGTTATGTCTAAGGAGTTTAGAGAGGACGGGCTACGTATGGGGAATCTAGCAAATAGAAATTTAGCTTCCGTAGGCTAGTGGTTACAAAGCTTTTTCTAAAGCCTACTTTTCTTTTGTCTTGTATTGGCAACTTCATTTAATTCTTAGAGGGACATGGATTTCACATTTGTTTTTTTCGAGGACTTTAATTTGCTTACCTCCTTAATCTCTGATTTGGTAGAAAAAACATTTGCCAACCGGTTACTGCATTTTTTTAAAGCCCAATTTTTTTCTGGTAGAAGGTCATCATGAGCAAATATTGTTGTCAAATTGTAGTGGATCAGGAATGCGATTTCTGAAGACACACACATTAATGAGTCCTCGGAAAGCCTTTTTCTTTTGCCTTGTACTGGAAACTTCATTTAATTCTTATAGGGAAATGGGTCTTGCATATATCTTCATGAAGATTTTTGGACCGGATCTAATTCCCTTAGTCTTATTTCCTCACCTCGTTAATATCTCAATTTGTAGAAATGACATTTGTTGATTCCCTCATCTATA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Homology
BLAST of Carg27857 vs. NCBI nr
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BLAST of Carg27857 vs. NCBI nr
Match: XP_023520795.1 (protein transport protein Sec24-like At3g07100 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023520796.1 protein transport protein Sec24-like At3g07100 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 2015.0 bits (5219), Expect = 0.0e+00 Identity = 1017/1026 (99.12%), Postives = 1020/1026 (99.42%), Query Frame = 0
BLAST of Carg27857 vs. NCBI nr
Match: XP_022931600.1 (protein transport protein Sec24-like At3g07100 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 2014.2 bits (5217), Expect = 0.0e+00 Identity = 1017/1026 (99.12%), Postives = 1019/1026 (99.32%), Query Frame = 0
BLAST of Carg27857 vs. NCBI nr
Match: XP_022989302.1 (protein transport protein Sec24-like At3g07100 [Cucurbita maxima] >XP_022989303.1 protein transport protein Sec24-like At3g07100 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 2006.1 bits (5196), Expect = 0.0e+00 Identity = 1010/1026 (98.44%), Postives = 1016/1026 (99.03%), Query Frame = 0
BLAST of Carg27857 vs. NCBI nr
Match: XP_038878991.1 (protein transport protein Sec24-like At3g07100 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1903.6 bits (4930), Expect = 0.0e+00 Identity = 958/1027 (93.28%), Postives = 982/1027 (95.62%), Query Frame = 0
BLAST of Carg27857 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SFU0 (Protein transport protein Sec24-like At3g07100 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At3g07100 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 1357.0 bits (3511), Expect = 0.0e+00 Identity = 703/1048 (67.08%), Postives = 820/1048 (78.24%), Query Frame = 0
BLAST of Carg27857 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P43288 (Shaggy-related protein kinase alpha OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ASK1 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 652.5 bits (1682), Expect = 1.1e-185 Identity = 316/370 (85.41%), Postives = 326/370 (88.11%), Query Frame = 0
BLAST of Carg27857 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q40518 (Shaggy-related protein kinase NtK-1 OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=NTK-1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 649.4 bits (1674), Expect = 9.2e-185 Identity = 319/376 (84.84%), Postives = 331/376 (88.03%), Query Frame = 0
BLAST of Carg27857 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P43289 (Shaggy-related protein kinase gamma OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ASK3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 647.9 bits (1670), Expect = 2.7e-184 Identity = 315/373 (84.45%), Postives = 327/373 (87.67%), Query Frame = 0
BLAST of Carg27857 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P51137 (Glycogen synthase kinase-3 homolog MsK-1 OS=Medicago sativa OX=3879 GN=MSK-1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 641.3 bits (1653), Expect = 2.5e-182 Identity = 314/373 (84.18%), Postives = 324/373 (86.86%), Query Frame = 0
BLAST of Carg27857 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EZX9 (protein transport protein Sec24-like At3g07100 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111437765 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2014.2 bits (5217), Expect = 0.0e+00 Identity = 1017/1026 (99.12%), Postives = 1019/1026 (99.32%), Query Frame = 0
BLAST of Carg27857 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JFF9 (protein transport protein Sec24-like At3g07100 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486411 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2006.1 bits (5196), Expect = 0.0e+00 Identity = 1010/1026 (98.44%), Postives = 1016/1026 (99.03%), Query Frame = 0
BLAST of Carg27857 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LW45 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G560670 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1882.1 bits (4874), Expect = 0.0e+00 Identity = 944/1027 (91.92%), Postives = 973/1027 (94.74%), Query Frame = 0
BLAST of Carg27857 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DYA6 (protein transport protein Sec24-like At3g07100 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492101 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1880.5 bits (4870), Expect = 0.0e+00 Identity = 944/1027 (91.92%), Postives = 971/1027 (94.55%), Query Frame = 0
BLAST of Carg27857 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HAI1 (protein transport protein Sec24-like At3g07100 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111462103 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1867.0 bits (4835), Expect = 0.0e+00 Identity = 940/1026 (91.62%), Postives = 966/1026 (94.15%), Query Frame = 0
BLAST of Carg27857 vs. TAIR 10
Match: AT3G07100.1 (Sec23/Sec24 protein transport family protein ) HSP 1 Score: 1357.0 bits (3511), Expect = 0.0e+00 Identity = 703/1048 (67.08%), Postives = 820/1048 (78.24%), Query Frame = 0
BLAST of Carg27857 vs. TAIR 10
Match: AT5G26751.1 (shaggy-related kinase 11 ) HSP 1 Score: 652.5 bits (1682), Expect = 7.7e-187 Identity = 316/370 (85.41%), Postives = 326/370 (88.11%), Query Frame = 0
BLAST of Carg27857 vs. TAIR 10
Match: AT3G05840.2 (Protein kinase superfamily protein ) HSP 1 Score: 647.9 bits (1670), Expect = 1.9e-185 Identity = 315/373 (84.45%), Postives = 327/373 (87.67%), Query Frame = 0
BLAST of Carg27857 vs. TAIR 10
Match: AT3G05840.1 (Protein kinase superfamily protein ) HSP 1 Score: 647.9 bits (1670), Expect = 1.9e-185 Identity = 315/373 (84.45%), Postives = 327/373 (87.67%), Query Frame = 0
BLAST of Carg27857 vs. TAIR 10
Match: AT5G14640.1 (shaggy-like kinase 13 ) HSP 1 Score: 607.8 bits (1566), Expect = 2.2e-173 Identity = 295/365 (80.82%), Postives = 315/365 (86.30%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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