Carg22569 (gene) Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTTGGTTTTGAAAACTGGAGGGTGTTTTGAATCTCAAGTTCGCGAAACCAGAATGAGGAAATGGAATCTGTTATGGCCGTTTTGGGCCATAACGATTGTTCATGGTGTTGCGATTCTGATATTCGTTAAAGGATTTCTTCTTACTCGTACTGAGCTTCCTTTTTACAGTCGCTGCTCCGATGTTTCTCAGTCTCCCTGTTTCACTTCCGATTCACTTTCTGACAGCAATCCATCGGTTCCTCCTTCCTCCGATTCAGCGAATTCCAGCCGGTGCTGGAACAAGCCCGCCGTTAACCGCATCATCATCATTGTTTTTGACGCTCTACGGTTTTCTTCATTTCCCTTTTGTTTCTCATCATTTGTTATTCGCTGACTACGATTTGATTCTTTAATCTTCCTTTTTGTTTTCTTTTATATCAATTTGTATGTCAGGTTTGATTTTGTTGCTCCCAGTACATTCTTTGAAGGTCAGCTCACTTCACTTGCTTTGCTAGTTTAGAATGTAACCAGTCTCAATTATTTTAAGTTAAACCAGTGTGCCGTATGTTGTACATGATAAAATGCTCTGATACTTATGCCACAACCAAAATGCTTTCATACCAATTGTTCTAGCAGAAGCTAGATCGATTGTACTCACACACCCACAAACAGAAATTAAACAAAGAGACAAATATTTACATGGTTAGGAGAGAAGAAATTCCCCTACATCCACGGGTGGTAGCCAATCACTATAAACAAAGTGTTTACAATTGTATTGTTCCCTAATGCCACAACCAAATGTTATGATACCAATTGTTGTAGTGGAAGCGGAAGCAAGATTGATTGTACTTACACACCCACGAACATAAATTAAACAAAGAGAAAAAGATTTACGTGGTTCGGAGATAAGAAATTCTCCTACATCCACAGGTGGTAGCCAATCACTATAACTAAAGTGTTTACAAGTGTATCTCTCACACTCTCACACTCTCACACTACAAAGTCTCTCTTACAAAGTTTCTACCAATTGCCTCTAGGCAAATAGAAAATGACAATGACTCCACATCTCAAAACAATGCTAGACAAACCTTTATATAGGCATAACAATATAAACGTTATACATGAATCAAGATGATTCATGTATCAAAATGGAAGATGAATCAAAAGAGTTATGAACTAAATAAATGAGAGATGAACCAAATAAATGAGAGTTATAAACCAAAAGAATTATGAATCAAATAAATGAGAGTTATGAATCAAATAAATGTCAATACACGCATAGGAGATGCATGAACCTATTTTTTATGACAACTTACAACAATCTCCACCTTGTTAGATGATCCCTAAGTAGATAACCGGTTTGGTTGCCATCAAGTCTACAGACTACTTCTTCCGTGTCCAACATTGATCAAATCCAAGCAATGTCAAAACTTTTAAAGAGCAATTATCTTTATCAATATACCCGTAGGATTATCAACAATTTCAATTTTCAATAAACGAATGTCCCATTCATTGATAATTTCTTGAACAAAATGAAATCAGACATCAATATGTTTGATATGAACATGATGGATTTGGTTCTTCAACAAACAAATAGCACTCTGGCTATCACAAAACACCTTTGTGTTTTTGAGCAATACCCAAGTCATTAACTAAACCATGCATCCAACTAACTTCTTTAAAAGCTTCGGTGACTGTCATATACTCTGCTTCGGTGGTAGACAATACAACTGTAAACTACAATGTTGAATGACAAATACTCTGCTTCAGTGACTGCCATATACTCTGCTTTGATGATAAACAATACAACAGTAGACCACAATGTTGAACGCCAACAAATAGGTCCACCACGCTTCTGCTGCACCACTCTAATCATCAATTTACAAAGATAAGTTTCTCATTGCAAGCTTGCTTATTTGTTCTTGGAAATCATATTTCCAAGATTTGTGATAATCTCCATCCATTTGAATTTTATTGGCTTTGGTTGCTCAATTTAATCTTGAGCTTGCACAATTCGATGTAAAAACTGCTTTCTTGCATGGAGATTTGGAAGAAAAAATATATATGACACCGCCATTTAGTTTTCGAGTAGTTGAGCAACAACATTTGGTATGTAGATTGAAGAAATCTTTGTATGGGCTAAAACAATCTCCTCATCAATTGTATATGAAGTTTGATCACTTCATGGTGGAGCATTAGTACACTGATAATCAATTTGATCATTGAGTGTATTTTCGGTTCTTTGATGACAACTTGTTTATCTACTTGGTCTTTTATGTTAATGACATGTCGATTGCTTCCAAGGGACAAGTGGAGATTGATAAGTGTCGATCTACTATGGCTAGTGGACCTATTTGTTGGCGTTCAATGTTGTAGTCTACTGTTGTATTGTCTACTTCCAAAGCAGAGTATATGACCGTCATTGAAGCTTTTAAAGAAGCTATTTGAATCCATGATTTAGTTAATGACTTGGGTATTGTTAAAAAACACGTAGATGTGTTTTGTGATAGCTAGAGTGCTATTTGTTTGTTGAAGAACCAAATCTATCATGCTCGTACCAAGCATATTGATGTTCGATTTCATTTTGTTCAAGAAATTATCAAGGAAGGAGACATTCGTTTATGAAAAATTGGAACTGCTGATAATCCTGCGGATATGTTGACAAAGGTGATTGTTCGTGAACAGTTTTAGCATTGCTTGGATTTGATCAATATTAGACGGAAGAAGTAGCATGTTGACTTTGGTTGCAGCTAAACCGGTTATTTGCTTAGGGATCTTCTGACAAGGTGGAGATTGTTGTAAGTTGTCATGAAGAATAGGTTCAATGCATCTCCTATGTATTAACATTTATTTGGTTCATCACTCTCATTTATTTGGTTCATCACTCTCATTTATTTGGTTCACAAGTGTCCTTTATTTGGTTCATCTTTCATTTATTTGGTTCATAACCCTTTTGGTTCATCTTCTATTTTGATACATGAAGCATCTTGATTCATGTATAAAATTAATATTGCTATGCCTATATAAAGGTTTGTTTAGCATTGTTTTGAGATGTGGAGTCATTGTCATTTTGTATTTGCCTGGAGGCAATTGGGAGAAACTTTGTAGTGTGAGAGTAGAGGCAATTGAGAGGAACTTTGTAAGAGAGACTTTGTAATATGAGAGTGTGAGAGATACACTTGTAAACACTTTGGTTATAGTGATTGGCTACCACCTATGGATGTAGGGGAATTTCTTCTCTCTGAACCATGTAATTTTTTGTCTCTTTGTTTAATTTTTGTTTGTGTGTGTGAGTACGATCGATCATGCTCTCACTTCCGTTACAACACTGTAGTGTTTTAATATAAGTTGTTTTTCAAGTTTGTATTGCGTATTTTGAATTATGTGATACAAGTGACGGGTGGGCTGTGCTTCTAAATTGTTATTCATTAACTCCCATTACAAGTGATGAGGTTTTTGTCACACTTTTAATCCGTGATGTTGAAATTAAGACTAATCATTCGTGTACATTGTCGTAGAATCGAAACCATGGATGGATAAGTTACGAGTACTGCACAAGATGGCATCAGAACGGGGTTCGTCTGCCAAGATTTTCAAAGCTATTGCTGATCCACCCACGACGAGTTTGCAGCGATTGAAGGTAATGTACTTTTAGTTATTTCAGATGTGATGTTTATCCTGCTATATCTCAACATCAGAGAGTTCAACTTTTAGCTTTTCATAATGATTTTCGTACGTCTGGTGGCAACTCTCCAGTAGTCGAACATGACTTATTGTTCAAGAATGCGTACATATAAGCCACGTGAAAACTTTGGCTTCCTACTTGGCCCATATTGTTTATACTTCTAACTTACTTGTGTAGTAAACGGTTTTTAATGAAATTATTTTGATGTATTTGTAAACATACTGAAAATTTAACCTTCTCCGTCTTGTTGGCTGGCTTGGCAATAAGTCAAAGTTGCAGCTATTTCTCTCTGTTGTTCTCTTTTCTCCCTTCTTTTGTGGGGTGGGGTTATCAAATCGTAGTTCAGAAGTTGTCTGATTCTGATTTTGTTGTACTTTTTTCAGGGCATTACGACTGGAGGACTTCCAACATTTATTGATGTTGGAAACAGCTTTGGTGCTCCAGCAATTATTGAAGACAACTTGATTCATCAGGTTGATTCTTGCATCTCTGTTAACGCATCTGCCTATTGCTTGTACAGATGCTGATTAACCAATATCTCCATGTGCACCCGTGTTTATTATTTTAAACATCTAAAGTTTATTTGGTTACTTATCAACTTAAATTAATTTACAGCTTGTTCAGAATGGAAAACGTGTGGTGATGATGGGTGATGACACATGGATGCAATTGTTTCCTCATCATTTTAAAAAAGCATTTCCCTATCCCTCGTTTAATGTTAAAGATCTTCATACGGTATGCTTTGTGATGTCTTCTTTCTTACAGTGAATTTGTTTCATTTCAGGATAGACTTCTTCCCTTTAGTTTTCTTTTTCAATGGAAAACTTCGCTTTCATCAAGAATGTTGTCTTAGTTTCAAGGCATAATGAGCTGCTAAAATTTTTGAAGATTTTTGTTTTAGGTAGACAATGGATGCATTGAACATCTTCTTCCATCCTTGTATGAAGATGATTGGGATGTTCTTATCGCACATTTTCTTGGTGTGGTAATAACTTTCTTCCCCTTCTTCTTGTCTGAAGTACATTGTTAATCTTGTTTTGGTTCTTTCTACTTTTCTTGCTTCACATCTAGATCATGCCTTAATTGTGAAGATGGGAAACTTTTCTCCTCCGTCTAAATTCCAACATTTGTTGCTTGGTGTATTATGTGAGAAACAATTAACTGAATGCATGTGATATAGGATCATGCTGGGCATATATTTGGTGTTGATTCAAGTCCAATGATTGAAAAGCTGGAGCAGTATAATTCTATTTTAGAGGTATGCTGTAGCAATCTAACTTGATCTAGCGGTACAGAAGGGAAGAGTCGTTTGTGGTCTTAAGTATTCAT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MKVGNYINIREQEEWMQNYVNVLCINSWQVKRYIDNYTASSVIGFSDEDLLHTGSLYADAMENWSYISKDLLSNSDGIDVVPSLKRQIDAYSNFLASIAELARSKWTEFNLKLMTLGFGIMVASLFVHFLAIKRVGKQCSSSFATEDCGTTLELMLSCFMVAMRACSFLSNSFILEEGKVTSFLLATTGIFMLRYSITKQKHFLNVFIFLLLMIYCRFTIEVGLLKQADTSAFLKAYPSWVLEIASLLPGWTYITKSVPIIALILLAQLLLKNITSSHSKGVWKFVMYGTILCYILIGFHWALENEVLHFASAIEGIGKNCIPRIIYAIGLGQLSLLLFRQLLGEDKLLDCRITLLTKTAAMLAAWSPTIIILAGKQGSLVALASLIGGYCIIGMDNLKHGEDGNGRILTVDCLPVTQWSLFAICLFFSSGHWCAFDGLRYGAAFIGFDEFVLVRQAILLTIDTFGFSVILPIFGLPFIVAKKYSSSQASKGENTLFMRLSQAYLMYGLIMAVPVTASILCVIIQRRHLMVWGLFAPKFVFDVVALILTDVSICLATLYYVPHPDSC Homology
BLAST of Carg22569 vs. NCBI nr
Match: KAG7012558.1 (GPI ethanolamine phosphate transferase 3 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1113.2 bits (2878), Expect = 0.0e+00 Identity = 567/567 (100.00%), Postives = 567/567 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22569 vs. NCBI nr
Match: XP_022954688.1 (GPI ethanolamine phosphate transferase 3 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1104.4 bits (2855), Expect = 0.0e+00 Identity = 561/567 (98.94%), Postives = 563/567 (99.29%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22569 vs. NCBI nr
Match: KAG6573391.1 (GPI ethanolamine phosphate transferase 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1100.9 bits (2846), Expect = 0.0e+00 Identity = 560/567 (98.77%), Postives = 562/567 (99.12%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22569 vs. NCBI nr
Match: XP_023541944.1 (GPI ethanolamine phosphate transferase 3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1091.3 bits (2821), Expect = 0.0e+00 Identity = 554/567 (97.71%), Postives = 560/567 (98.77%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22569 vs. NCBI nr
Match: XP_022994730.1 (GPI ethanolamine phosphate transferase 3 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1085.5 bits (2806), Expect = 0.0e+00 Identity = 551/567 (97.18%), Postives = 559/567 (98.59%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22569 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8TEQ8 (GPI ethanolamine phosphate transferase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIGO PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 62.4 bits (150), Expect = 1.9e-08 Identity = 54/179 (30.17%), Postives = 79/179 (44.13%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22569 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9JJI6 (GPI ethanolamine phosphate transferase 3 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Pigo PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 8.0e-07 Identity = 53/176 (30.11%), Postives = 77/176 (43.75%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22569 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GRT4 (GPI ethanolamine phosphate transferase 3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111456872 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1104.4 bits (2855), Expect = 0.0e+00 Identity = 561/567 (98.94%), Postives = 563/567 (99.29%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22569 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K260 (GPI ethanolamine phosphate transferase 3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111490372 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1085.5 bits (2806), Expect = 0.0e+00 Identity = 551/567 (97.18%), Postives = 559/567 (98.59%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22569 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CEV1 (GPI ethanolamine phosphate transferase 3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010854 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 968.4 bits (2502), Expect = 1.3e-278 Identity = 489/566 (86.40%), Postives = 521/566 (92.05%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22569 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LYK9 (GPI ethanolamine phosphate transferase 3 OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G538790 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 939.5 bits (2427), Expect = 6.6e-270 Identity = 470/565 (83.19%), Postives = 515/565 (91.15%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22569 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BBF9 (GPI ethanolamine phosphate transferase 3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488244 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 927.9 bits (2397), Expect = 2.0e-266 Identity = 469/566 (82.86%), Postives = 507/566 (89.58%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22569 vs. TAIR 10
Match: AT5G17250.1 (Alkaline-phosphatase-like family protein ) HSP 1 Score: 482.3 bits (1240), Expect = 5.5e-136 Identity = 271/566 (47.88%), Postives = 373/566 (65.90%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22569 vs. TAIR 10
Match: AT2G22530.1 (Alkaline-phosphatase-like family protein ) HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 5.2e-09 Identity = 113/516 (21.90%), Postives = 215/516 (41.67%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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