Carg21639 (gene) Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATTCGGGTTCTTTGTTGCAGCGGTACCGTCGTGACCGGAAAAAGCTGCTGGCATTCTTGTTGTCCTCGCGTTTTGTCAGAGAGCTGAGGACTCCGGCAGGTCCTGTCACTGATTTCTCCGCCGTCGACCTTGACTCTCTGAGCGCTAGCTATGTTTTGGAGTGCATTAAGTCTGGTAATCTTGCTTCTTTGTGTGTGAGAGATGAGTGTGAGTTGTTGTAGTTTGAATGAAAGATTTGATATCGAATTTGCGGTTTAATCTCGAGTTTTTTTTATTGCCAATGCTCGAGAATGAAGCTGGAAGTCTATTTCATTTTCTTTAGCTTCTTCTCGGTTCTATTAGTTTTTTTTTTCTTCTGTAAAATGGATTTGGTTTCCTTGTTTGGGATCGGAAAGTTTGCGTCAACCGTTCTGCGGCGGAGTGCTCGCTGCTTTCCATGTTTTTATAGCGCGTTCTCTGTTTTTTAGTTGACCGAGTCACGTAACTGTGAACACTTGCGAGGAATTTAATTTCATTGTTATTTTCTTGCGTAGGTGGAGTTATTGACATTTCTACGGCTGCTAAAAAGAAGCAACATGAATCTTCTTACCCGATAATGGTAAGAATATGTTAGTGAGAAGTTATTTGGTTTTGCCATTTTCTCCGCGATTTACATTCTGCTATGCCGTCGCTCTATGGAGAGAAAATAAATCATGCTAATGCTTCCGTGCTTCAGTGCTTCCGTCTGTTTATTCATTTATTATTTTTGAAATTTAAATTCTGAATGGACTGTGAAGTTTATGCACTATCTGAAAATACTGAATTGAAGCTTGAGCTTTCCCAAAGTTTCTGGTGATTTCTTTTGCATGATATTCAGCGGACATTTTTCTCTCGAACTATCTTCATCGCATTTAACAACGCCTTAATCGTCCGTACACCAGAGGGTATGGCCTGAGCATCTTTTACTTAGTCGGGTAGTCAATCAAATGCCTCGCGAAGGTGCAACTTAGACAAATTAACTTTCGACTTGTACCAAAAGTATTTAAATTTCGAACATTTGTTTTAATGAAGATTTAACAGTAATCCATGCCAATTTTCTCTTAGTATTGTAGTTGTAGTAACTTTGTTTTAGAATTTCTTTTCTTCATTAGAGTTTTTGATTTCGGATGTGCAAGCAATAATTTTTTTTTTTTTCATTAGAATTAAAAGAGGTCTGTGTGCATGTTTGCATTACTTACCAATTTGATTTTTGACTGCAGATACAATCTCGACTACGGACTTCTTATTTTCTACTTTCTCATCCAGATTTGTCTGGATCACCTCCTAGCCGTGCGCCACCACCACCTAAAATGGTGGAGAGATCCTCTAGTGACATATCGTGTTCATCTAGGTCGCTTGGGTCATCAGTTGATGACAATATTGCAACCTATAGTGATGACTGTGGTCCTCAGTCTAATGGAACAACAGCCACACCTTCGAAACTTGTGAAGGATCTCAAAGTTCCGGCTTTAGGACTACCTAAGTTGTATACAGGTATTTGATGCTTTTATTCTTCTATTGAAACGAGATTTCATTTTCATTTAAATTCTTAACAAACGGACATGTTTATCCTTTCATATTTTTCCCATTAAAAATAAAAAGAGTTTTCCGAAACAATGCTTAAATTTGTCAGTTAAGATCCCCTCCTCCCAACCATCATTTCTTATATTGTAAATTGATTCATAGTTTTATGATGATCAAAGGACTGACAGATGATGACTTGGATGAAGCAGCATATTTAATCTTGCTTGCATCAATCGCATTTTCTGGGTGCGCTCTTTTCTTATGGAAATGCTAGATTTATTTATTTATTTTTAGTTTGTCCTGCTTAAGTGCTACGTATTGTGCTTCCGGAAACTTGAATTTGAGTTCATGTCTCTTTTTCATTTTTCTTTTCTTGATAGTGATAGGGAACATAAAATATATCCATCTTTTTTATCATTTGTTTGTTCTCTCTCTCTCTCCATCACCAGGGTTGAAATCTATTCATCTGAGGATAAAAAGAAAGAAAATGGTATTACACATACTGTAGGGATGACAAGTATAAGGAATGAAGTAGATGTTCAATCAGAGAATTTTGAAGGACATTTGAATTTTCTTCACGCTATCCGCACCCAGATGCAGGCAAGGCAGACTCTGTCTCTAAGATGATCTTATCGCTATTTCCTTTTTACATTGATGTCATACATCTGAAGCTTAACGATCTATTGTAGCTATTTTGCTGCATATAGTGAGATTTTCTTTTCTCCTAGAGAGGTTAACAGAAGTCTACTAATTCTTATATATTGTTTCAGGTTTCATTTCATATGTTGTTTCATTTTTATCTGCTCAATGAAGTTTAGAATTGCCAGTTGCAATCTCGATGCATTAATACATGTTCCCAATCTATCTTACTGTTCCTCTCCCTCTCTCCCTATCTCTTCCCCCATTAACTTGGTCAATTGCTGATTTGGACTCAGAATTTATATTATTTGACCAGATTTCAGCAGTTTCTGATGCATGCATGAGGAAAAGATTAATGGAATTGGCTGCAAAGAGAAACTGGGGGCAAATTAATGTTCCTCAAGTTTTGTTGGTCCTCTTGCATGGGGTTTTCAGGTCTGATTTTCCTAGTGAGAAAGCTTATATGCAATGGAAGTTCAGACAGGTAATAAATCAATTATGGACAATTGGAGAAAAAATCTTTGCATTTTTTACCGTAGTTAAGTTGGCTGAAAGCTCTTTAGTTATTTTTTATGCGTCACTGTTTATCAATTATGTACAATGCACATCCTGTAGGGTGTAACCAATTGTCTTTATATTGGGCGTTTTTCGATCAAGCAGCTTTCGAGGCTCATTTATGGAACTGCTTTTTGAGAAAAAAGAATGTATGTATATCTTACATCTATAGGAAACCATATATTCAAAAAACAGAGAAAAAGTGAACAACCTTCCAATCTAGGTTTTCACTTATTCCATATATTGTAGTATAGACGGGCTTTTGAAACTCCGAGAAACATGATACTTTCATAGAGATTGACATCTCTGTTGGTCCTGCAACTATAAGAAGTTGGAATGGTGACATTAAAGTGAGGGGCTTAATGGGTACTGTAGTTTTAAATAAAGTACACAATCCTCCCCTCGAACAAAGTACACCATAGAGCATCCCTTGAATCCTCTTCTCTGGAGCTCTTGAACAACCTCCCCTAAATTGAGGCCCGACTCCTTCGCTAGAGCCCTCAAACAAAGTACACACCCTTTGTTCGACACTTGAGTCACTTTGACTGTACCTTCGAGGCTCACAATTTCTTTGTTTGACATTTGAGGATTCTATTGACATGCCTAAGTTAAGGGCATAATACCATGTGAGGAATCATGGACCTCCACCATGGTATGATATTGTCCACTTTGAGTAGAAGTTCTCATGTCTTTACTTTTGGTATCCCTAAAAGACCTCGCATGAATGAAGATAGTATTCCTTATAAATCCATATTTTTTTCCTTAATTAACCAACATGGGACTACTTCTCCCAATAATCCTCAACAGGTGATGACGGTTATATTTGTGATTTTCCTTAAAATAGATGAAGTATGCTTTAATTCAATGTTCCGATCAGAAATTTATTGTTGGTTAATTGCTCGGGAGAAAGATCCTGGCTTCTTTAAAAAATGAACAATTACATTATTGATTATGGAACTCGATAACATACACATCCAGGTCTATTTTTTTCTTTCTGTACTATGAGTTACCTTACATGGACATACAAGTCCTCTCCTTACTTTAACCATGAAGTTTGGCGGCTGCATCTCTAGGTCAATCTTTTGGAAGAATTCTGTTACTCTGCTAATCTTGTAGCTTCTGAACGTCAAATCTGTGAAAGTTCTCTTGTGAAGATCAGAAGTACAAAGGTTCAGTTTTATTTTATTTTATTTTTATTTTTACTTTAATTAGATACAGAGAATTAAATGCTAGTTTAGAGTGGTTCATTCTTCAGATTTCTAAATTCCTTCTGAGATCGATCATATAAAAGAATCTGATTTACTGCATTGTTGAACATGGTAGGAATGGGATATCAATATGGTTCGATCTGAGCGTGCAAAAGTATTGTCAGGTATTGGACAAGTACTGTCGAAGTTGCCAGCTCCCTCTGCTTATCACTTAAACATCAGGTTATATGAGAAATTGATTTTAGTCATATTTGATGTTCTTGACGACAGCCATCCCGTTATGGTATTTGTTCTTCCTTTAATATTTGTTTGATTTAGTTTTGCGTGTGCTGTAAATTAAGGCTCATAACGTATGATGATTAGCCTGTTACCTTTGTATAGGAAGTGGATGACAGTCTCGTCCTTCTCAAATTGACTTGGTCTGCTTTAGGCATCACTCCGGAAGTACACAGTGTGATCTTCGGGTGGGTCCTTTTCCATCAGGTATACTTCTCTATGAAGTGATTAGTAGGGCTCGTTTTCTTTAACAAACTGCATTATTGAATTCTTCATCGTCAAATTGAAAAATTTGGTACTACTTATTTGCTAAGAATTTTTAACTACTTCTTGTACCAGAAACAAATTTTTTTATTAATGAAATGAAACGAGACTAATGCTCACGAAATACAAACTCCCACGAGGGAGTGAAAGGAAAAACTAAAAATTAGGAAACCTTTAATCAAGCAGATTCAACACGATCTAGTCTAAGAAGAAGCCTGCTTGCAAAGATTCTTTGATGCTGTTCCAAACATAACTTGATAAACTCCCGAGGAGGCTACCGCTATCTTGAGATAACAAAACCTCAAAAAGGGCTGTTGGCGTGCCAAACATTCCAACAGAAGTGACAAAACAAAGCATCTATTTCCTTTCTCTTTAACTGAATATGAAAAAAATGATCTATGAAAGGCTTGAGATAGCCCAAAGGCCAAACCATAGAAGAAATTGAGCAAAACCTGCAGGTACAATATTTACTATGGTAGGAGGATAGGTTAGGCATGCTATGTAAT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MDSGSLLQRYRRDRKKLLAFLLSSRFVRELRTPAGPVTDFSAVDLDSLSASYVLECIKSGGVIDISTAAKKKQHESSYPIMIQSRLRTSYFLLSHPDLSGSPPSRAPPPPKMVERSSSDISCSSRSLGSSVDDNIATYSDDCGPQSNGTTATPSKLVKDLKVPALGLPKLYTGLTDDDLDEAAYLILLASIAFSGDREHKIYPSFLSFVCSLSLSITRVEIYSSEDKKKENGITHTVGMTSIRNEISAVSDACMRKRLMELAAKRNWGQINVPQVLLVLLHGVFRSDFPSEKAYMQWKFRQVNLLEEFCYSANLVASERQICESSLVKIRSTKEWDINMVRSERAKVLSGIGQVLSKLPAPSAYHLNIRLYEKLILVIFDVLDDSHPVMEVDDSLVLLKLTWSALGITPEVHSVIFGWVLFHQFVKTGEASFLDEAILELQEVASSKDDGGKEEQYLKSLSCSISCNGNEMKLSLVESAFFLISSWCDIKLQAYHLHFREKTSYFGKVVSLLSTVGVITDCNTVKLTKLDGLKAIGARKLRTYVEKSIEAAYKEAENNENSESKESIHPLALLANRLRLVVEKEITVFFPVLRQLCPDSGIIAAMLLHQYYGEKLKPFLKEVSKLSDDVRSVLPAAYSLDRDLTHLFTAASKESRLSPLLKEDLEHYPDWEPISFQQNLAASVIEVFRIIEETVDQYFDLNLPMDITHLQALLSIVYHSLDGYLSGLLNQLVEKNYLYPPVPPLTRFMETVATGKKKLPECHLDEHVSSKLNGLTISKLCIKLNTLGYIQKQIETLEDRIGKSWALIGGSAKHKRAPEEAIVNGGLRTCSDEVNELFANTFNNIKSFIAKAISKFCDITGIRVIFWDLRDEFLSYLYHGNVEAVRLEDVLVHLDTVLNNVCGRIDDTLRDLVVLSICRASMEAFIWVMLNGGPSRAFSDSDIVLIKEDLGILKDFFVADGEGLPRTLVEKEAKFAEEILGLYSLPTETIIQLLMSSGGDISTELDPCSNNGSLHFNDSQALVRVLCHKKDTEASTFLKRKYNLPASS Homology
BLAST of Carg21639 vs. NCBI nr
Match: KAG7028334.1 (hypothetical protein SDJN02_09515, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 2046.6 bits (5301), Expect = 0.0e+00 Identity = 1047/1047 (100.00%), Postives = 1047/1047 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21639 vs. NCBI nr
Match: XP_022942826.1 (uncharacterized protein LOC111447738 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1948.7 bits (5047), Expect = 0.0e+00 Identity = 1018/1101 (92.46%), Postives = 1021/1101 (92.73%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21639 vs. NCBI nr
Match: XP_023540980.1 (uncharacterized protein LOC111801201 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1939.9 bits (5024), Expect = 0.0e+00 Identity = 1015/1101 (92.19%), Postives = 1018/1101 (92.46%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21639 vs. NCBI nr
Match: XP_023540979.1 (uncharacterized protein LOC111801201 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1939.9 bits (5024), Expect = 0.0e+00 Identity = 1015/1101 (92.19%), Postives = 1018/1101 (92.46%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21639 vs. NCBI nr
Match: XP_023005271.1 (uncharacterized protein LOC111498329 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1914.0 bits (4957), Expect = 0.0e+00 Identity = 1000/1101 (90.83%), Postives = 1009/1101 (91.64%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21639 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RX56 (Protein unc-13 homolog OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PATROL1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 519.6 bits (1337), Expect = 8.1e-146 Identity = 371/1123 (33.04%), Postives = 567/1123 (50.49%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21639 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FPY9 (uncharacterized protein LOC111447738 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447738 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1948.7 bits (5047), Expect = 0.0e+00 Identity = 1018/1101 (92.46%), Postives = 1021/1101 (92.73%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21639 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KUH5 (uncharacterized protein LOC111498329 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111498329 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1914.0 bits (4957), Expect = 0.0e+00 Identity = 1000/1101 (90.83%), Postives = 1009/1101 (91.64%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21639 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FVS9 (uncharacterized protein LOC111447738 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447738 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1798.1 bits (4656), Expect = 0.0e+00 Identity = 938/1020 (91.96%), Postives = 940/1020 (92.16%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21639 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KSN8 (uncharacterized protein LOC111498329 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111498329 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1777.3 bits (4602), Expect = 0.0e+00 Identity = 927/1024 (90.53%), Postives = 935/1024 (91.31%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21639 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L1Q4 (uncharacterized protein LOC111498329 isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111498329 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1776.1 bits (4599), Expect = 0.0e+00 Identity = 929/1026 (90.55%), Postives = 935/1026 (91.13%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21639 vs. TAIR 10
Match: AT4G11670.1 (Protein of unknown function (DUF810) ) HSP 1 Score: 808.5 bits (2087), Expect = 6.2e-234 Identity = 495/1097 (45.12%), Postives = 669/1097 (60.98%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21639 vs. TAIR 10
Match: AT5G06970.1 (Protein of unknown function (DUF810) ) HSP 1 Score: 519.6 bits (1337), Expect = 5.7e-147 Identity = 371/1123 (33.04%), Postives = 567/1123 (50.49%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21639 vs. TAIR 10
Match: AT2G20010.2 (Protein of unknown function (DUF810) ) HSP 1 Score: 264.2 bits (674), Expect = 4.4e-70 Identity = 261/985 (26.50%), Postives = 439/985 (44.57%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21639 vs. TAIR 10
Match: AT2G20010.1 (Protein of unknown function (DUF810) ) HSP 1 Score: 260.4 bits (664), Expect = 6.3e-69 Identity = 237/876 (27.05%), Postives = 399/876 (45.55%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21639 vs. TAIR 10
Match: AT2G25800.1 (Protein of unknown function (DUF810) ) HSP 1 Score: 251.1 bits (640), Expect = 3.8e-66 Identity = 225/881 (25.54%), Postives = 390/881 (44.27%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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