
Carg19123 (gene) Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAGCTCCCCGATCAACTTCCAATTTGCCTCGCTTTTCTTCCCTCTGAGATCAGTCAGTTCGTTGTGAAGTCTTCGACGTGCCTCGAAGAATATGGATGAATCTCTGCTCGGTGTAGAAAGTAGCAGCAGCTCCAGCTCTCGACGTCAGATTCCTCATGTGAAGTTCAAGCGCCGCTCCGACGCCATCGCTTATGGCTCTGCGTACCAAAGAGCTGCTGCACTCGTGGATCTGGTTAGACTCTTTTGCCATATTTGATTCTCGCTCGTGTTCTTTTTTTTTTCTTTCACTGGCGTTGGAAATGTGTTCTGGTTTTTGTCATTTGAGTGAATAATGTGATCCTTGATTCGTTAATTTGACTATAGCTGGCTATTTGAAGTGTGATGGATTGGGATCTGTTTTGGATTGTTTTTGACATCTGGTTCATGGAATCTGAGTCTTGAGCTTCTCCTTTTGAGATATGGTTTTGTGAATTTTGACTCAGTGTCCTGGAAGTTAGTTCAGAGTGATTTTCATTATGATCTTGGTGCTGGAGTGGTTTAGTGGTGAGATTGTTTTGGAACTCTTTGAAGATTTGTTTTCCTGTTTTCCAGCTTGAATATAAAGTCAGCATTCCTTGATATGCTCTCTCCCTCCCTCTGAGCTCCAATCCTGTTTCCAATTCCCGTTACTAACTTTTCTCTCTGAGAATCGATGGTCTTACTTTTCGTTATTCGGAAAACTGAGTATAATTTCTATTTGGCATCTCTATATTTCATTAGTTTAACAGAAGGTATATTCTCTACTTATTTTTCTTGTCAAACATGCCAGGATTTCTCCGAAATAGATCTTCTGCTTTTGGCTACATATGCATTCCTTCAACTCATTAATTCACTATATTTCTTCGAGGACTGATAAATGCTAGAATGGAAAGAGCAAAATAAATGTTTCTCTAAAATGTTGCCCCTACATTTACAGTTTCCCTGACTCTGTTCTTCTTATTTGTTAGTGTTTGTTCTCATCTCTATTTTTATGCCTTGAAACGGTACAATTTTGTGTGAAATATTTATTAATTAAGCTCACTATTGCTGCTAACCATTAACTTCATCTATGAAACAAGGATTCCTTCAGAGATGGGAAAAATGATATAGTTTTACTTTGAACCTTGGCTGACAGAACATTTGGTCACTGCTGATGGAGAATGAATTTTGCAGGCTGAAGATGGCGTTGGTATACCCGAGAAAATCCTTGATCAGTCGAACTTTCAGAGTGCTGCAAAGCTCTACTTCATTTTTATTAAATTTGATTTGATTTGGTCTGTAAATTTCTTTGCGCTGGTAGTCCTAAATTTCTTTGAGGTTTGTTCTTCCATTTTTTTTTTTAACATTCCTTTTGCTTTCAGATGTGAAAAGAAGTTTTCATTCATTTTTTAACATACATAAACATCTGCAGAAACCCTTGTGGTGCTCCAAATACGATACGCATTCTTGTAACGACAGAGAGTATTTCTTTCTTGGGCAGTTGCCTTACTTAACAGCTGTTGAATTTCTTATATATGAGGTAAGAATAATCTAAATAAACTAAGATATTATTATCTCTTTAATCTTCTTACTTTTACTCCAATCGAATTAGACTTCCTCATGTTATGGTTTTGTAGGGATAGGTGGTGGTAGAATTACATTACTGCATTCTCTCAGTAGTTTCAATACCTACACGTCCTTGCAATTGCCACTATGAGTTATATCTATGAACGCTACTGCACATAAGCCGAAGAAAAAACTAAATTATGATATTGGAGAAGAATGAGGTGCTGCTTTATAATAGCAAATATAAATGTGTAGAAAAATACTTCATGCTGTTAACTTTGCTCGTCAACCAGATGCTTTTAATGTAAAGCTCTACTGTTGGCGGAAACTCACTCATTGAAAATGTTATATTTTTTGAGGACCTTCGATACTATAAGTAGCTAAGTGATATTCAATTCCATTACAAGCAAAAGCCGTTATGTTGAGTTTTTTTTATTTTTTATTTTTAAAGTTTCATGTTTTAATTGAACGGGCAATGAAATTTCTTGGTTTGCTCAATCGATATTCAGAAACAGTTCAATGTGTAAAGCTTCTTCAGGTGATGATAGATGTTAATTTTTCAGATTATCTATATCTCTAAGAACCACCATGCATAGGGAACGCAATCTTGTGCAGTTTTTCAGTCTTCTTAATCTCCCACTTTTTCACTTTACTCACTTTCTGTTTCATCGAATTTATGCTTTCAATATGCAGGCTGTGACTCTCATAATACTCATGATACACACTTTTTTCCCAATTTCGTTTGAAGGAGCCCAGCTTTATTGGAAAAATCCCTTGAACCAGTTGAAGGTACTCGCTCAATGTCTCTTTTGTTTGATAGATATCCTCAAAGTAATTTAACCGAACTGGAAGGCTTGATACTTGGTTGTTGGAAAACATTCAATTTTCAATGTTCCGAGTAATTTGAGCCTGCAGACAACTTCCTTATGCCCTTACTGTCTAATCTCAAAAGGGTTCCCATAAATTATTGTCTTCTTATACCCGAATCGAACTTGAGCTTGGCAATTATGCATAGATGAATGTTTTTTAGAAAAGACAAAAAGTTTGTGAAGTGACTAAAATGATTGATCAGAAATGTAACATTTATTGTCTTAACTGAATTATTTAGATAGGCTGAAATTGAACTTTATGGGTCTATATTGATCAGAAATGTAACATTCAGAATTACATTGCTGAAAAGATGAAATGGTGGGTTATCATATTTTATTATCTTTGGATTTCCTTTATTCTTTTGCATTATTAGGTTTGTTTTATGGGTCTATATTTATTATTTATATTTGTAATATTCTTTCCTTAATGGTAGATGATCGTTCTTCTGTGTAAGAAGACCTTGTATTGATTTGAATATAGAAGAAGTACAGTATCTTTATTTCTTTCCTAAATGCAAGTCATTATGAACTGCCACTACTCTATCGGGTTCTCGTGGCTATGATGTTGTGCTTTTTGAGAAATTAATTCTAAATCTTCCTCGTTCTCCAGGTCATATGCTTAATTATTTTGGTGGCCGATTTTCTCATTTATACCCTATATTTGTCACCAGTGGCCTTTGATTATCTTCCATTCAGAGTTGCACCGTATATTAGAGTTGTCTTTTTCATCATGAATATCAGGTATTTCTTGACAGGATTCTTATTTTGCTTGTTTTTTTATGTGACTTCATCGTATGTACTTGAAAATGTTAGTAGCATCCAATTCAAAGGAATTTGTTGCATCTACTCTTATATCAACAAGTAATTTAGTTCCTAGAAACGAGTTTACATGTACTTCTGACAATTGATTGTTTCAGGATAGCTGTTTTTAGTGTGTTAACATGGACTGGTTAGTTCATATTAATTGCCAGGTAATTATACAAGGTGTAAATAAGCACTTAATAGTGTCGGATGTGCTGAGGAGATTGAAAAGAAAGGAGCTTCATACATTTCATTTAAAGATAAAATTTCTGTGTAATATTAATTTTTGTAGTTGTTTGATCTCTTGATATTTGAAATGACCATCAAAATTACTCTCAGTAGGCTTGAGAATATGTATTAATGGGAAAAATCTTAGTTTTGATTGGGTTCTAATATTTTATCTTTATTAATTGCTGATGAAAATTCAGATGTAGTATCTATCTGACGTGGACTTACCTCTTCCCTTGATGTTTGATACTTGTTTCTTATTGGTGGGAGTTGATCCTATTTATGGTGTAGTTATTTACTTTTGAACAACAAATTTACCCATTTCATTTGGTTCTTAGGCATCTACGGGAGAGCATCATCATTCTAGCTGGAATGCTCGGCACATACTTGAATGTCTTGGTTCGTAGATAAATTTGGCATAATAAATATTCTGTTTCTGTAGAATTTATAATATACCTACATGACATCTTTTATTTCTCTTTTACTCAAAATGTTAAGAACTGTGAGTCTAACATTGTATTATGTTAATTATTATACCAACTCTTACTACTTTATTGCCACTTTTCTTGCAGGCTCTATGGTTTTTGTTTCTTCTGTTTTCCAGCTGGTTGGCATACGTTATTTTTGAGGATACACAGCAGGGGAAATTATTATTTACTTCTTTTGGAGCCACATTATATCAAATGTTTATTTTGTTCACAACATCTAATAATCCAAATGTTTGGATACCTGCCTACAAGTAAGTGGGTAATTCAGAATGATACACTGTTCAGGGCTTTTATTGATATACATATACATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATATCTACTTGTTTGACCAGTATTCTTTTTCTTCCTCATACCCTTCAAAGTGTATTTGATAAGCTCTTTTCAAGATTGTAAATTTTGAAAATGGTTATTAACTTGTCATACTGCTATATAATCCAAGATACAAGTTTAGGATACTATGTTCTGCGAGGCAGCAAGCAGGCACTAAAAAGAGCTTTGTGGAAGGATATCCTAGTTTTGTGTTGAGATCTTGTGTAATGGAAAATTATTCTCTCTTTTTAATCACTATCCCATTCCTGCATTTTGTACTGGTTGGGAGGAGAACGTTGATGTAGCATATACTACTAAAGCATGTTTTGGTCCGGGAAGCCCATTAAGACTTGAGATCTGGGTTTTTGTTCATAAAGTTTGTGATATTCGAGTGGTATCTAATCATTTGAACATTCAATTTGATCCCTAAAATTGCGCAAGACCACAAGTTTACCATACTTGTTCTAGAGATAGAATTACTTGATTTTGATAGAATTCATGACCTTGAGATGTTGAATCATATTCTGGAGGTTACATGATTAATTTTCGTGTGGTATGAAGTATCGTCATTATTGCTGCCAAATGCAAAAGAATTATACCAATGATTGTTGAAGTTATTAATTGAACAATGTATCATAAAAAACGTTGCTCCAACATTCTATAGTAAGCATTACATTGACTTATATTGTCTTTTACAGGGCATCTCGT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ATGGATGAATCTCTGCTCGGTGTAGAAAGTAGCAGCAGCTCCAGCTCTCGACGTCAGATTCCTCATGTGAAGTTCAAGCGCCGCTCCGACGCCATCGCTTATGGCTCTGCGTACCAAAGAGCTGCTGCACTCGTGGATCTGGCTGAAGATGGCGTTGGTATACCCGAGAAAATCCTTGATCAGTCGAACTTTCAGAGTGCTGCAAAGCTCTACTTCATTTTTATTAAATTTGATTTGATTTGGTCTGTAAATTTCTTTGCGCTGGTAGTCCTAAATTTCTTTGAGAAACCCTTGTGGTGCTCCAAATACGATACGCATTCTTGTAACGACAGAGAGTATTTCTTTCTTGGGCAGTTGCCTTACTTAACAGCTGTTGAATTTCTTATATATGAGGCTGTGACTCTCATAATACTCATGATACACACTTTTTTCCCAATTTCGTTTGAAGGAGCCCAGCTTTATTGGAAAAATCCCTTGAACCAGTTGAAGGTCATATGCTTAATTATTTTGGTGGCCGATTTTCTCATTTATACCCTATATTTGTCACCAGTGGCCTTTGATTATCTTCCATTCAGAGTTGCACCGTATATTAGAGTTGTCTTTTTCATCATGAATATCAGGCATCTACGGGAGAGCATCATCATTCTAGCTGGAATGCTCGGCACATACTTGAATGTCTTGGCTCTATGGTTTTTGTTTCTTCTGTTTTCCAGCTGGTTGGCATACGTTATTTTTGAGGATACACAGCAGGGGAAATTATTATTTACTTCTTTTGGAGCCACATTATATCAAATGTTTATTTTGTTCACAACATCTAATAATCCAAATGTTTGGATACCTGCCTACAAGGCATCTCGTTGGTATTGCTTGTTTTTTGTTCTGTACGTGCTGTTGGGAGTTTACTTCGTTACAAACTTGATTCTTGCTGTTGTATACGATAGCTTTAAGAGCCAGCTGGCTAAACAAATTTCTGAGATGGACCGCTTGAGGAAAAGTATATTGGCCAAAGCATTTAGTCTTATGGATACTGATAACGTTGGGTTTATCAATAAACAGCAGTGCCTTATACTTCTTGAAGAACTTAACAGATACAGGACTTTGCCAAAGATATCAAGGGATGATTATGAGTTAATATTTGATGAGCTGGATGACAGTCGTGATTTTAAGATCAATATGAATGAGTTTGCTGATCTTTGCAATGCTATAGCCTTGAAGTTTCAGAAGGAGGACATTCCTTCAGTGTTTGAAGCGTATCCTTCGATCTACAATTCAGTTTCTTCAAAAAAGTTGAAAGCATTTGTGCGGAGCCCCTCATTTGGATATGCTATATCCTTTATCCTCATACTGAACCTGGTTGCTGTTATTATTGAAACAACACTCGATATAGAAAATAATGTTGGACAGAAAGCATGGCAAGAACTCGAGTTTGTATTTGGTTGGATATATGTGGTTGAAATGGCTCTAAAAATCTACGCGTTTGGATTTATGAATTATTGGAGAGATGGCCAAAATCAGTTTGATTTCCTTGTTACATGGATTATAGTGATTGGAGAAACCATGACTTTTGTGGCACCTAGTGGACTAACTTTTCTTTCAAATGGAGAATGGATTCGCTACCTTCTGATAGCAAGAATGTTACGCCTGATAAGGCTCCTAATGCATGTCCGGCAATATCGAGCATTTCTTGCTACCTTTTTAACTCTCATCCCTAGCTTGATGCCATATCTAGGAACTATTTTCTGTGTCCTCTGCCTTTATTGCACTCTTGGTGTGCAGGTCTTTGGAGGACTTGTTAACGCTGGAAATCCTGCTTTGTCTAAGACTGATCTGGATGATGATGACTACCTACTTTTCAATTTCAACGACTATCCTAATGGCATGGTGACACTGTTCAATTTGCTAGTTATGGGCAACTGGCAAGACTGGATGCAGAGCTACAAGGAGTTAACAGGAAGTATTTGGAGCCACGTTTATTTCATCAGTTTCTACCTAATAACCGTTTTGCTGCTCTTGAATTTGGTTGTAGCTTTTGTCTTGGAGGCTTTCTTTGCTGAATTGGATATTGAATCTTCAGAAAATGGCGAAGAACAGGAACAGGATGCAGATAGTAGAAAGGATCGTCGACGTTTCGTCGGCACAAAAACTAGCAGCCGCAAAGTTGACATTCTTCTCCATCATATGTTGAGTGCAGAATTGGATGTAAAGGATTCCGATTAG MDESLLGVESSSSSSSRRQIPHVKFKRRSDAIAYGSAYQRAAALVDLAEDGVGIPEKILDQSNFQSAAKLYFIFIKFDLIWSVNFFALVVLNFFEKPLWCSKYDTHSCNDREYFFLGQLPYLTAVEFLIYEAVTLIILMIHTFFPISFEGAQLYWKNPLNQLKVICLIILVADFLIYTLYLSPVAFDYLPFRVAPYIRVVFFIMNIRHLRESIIILAGMLGTYLNVLALWFLFLLFSSWLAYVIFEDTQQGKLLFTSFGATLYQMFILFTTSNNPNVWIPAYKASRWYCLFFVLYVLLGVYFVTNLILAVVYDSFKSQLAKQISEMDRLRKSILAKAFSLMDTDNVGFINKQQCLILLEELNRYRTLPKISRDDYELIFDELDDSRDFKINMNEFADLCNAIALKFQKEDIPSVFEAYPSIYNSVSSKKLKAFVRSPSFGYAISFILILNLVAVIIETTLDIENNVGQKAWQELEFVFGWIYVVEMALKIYAFGFMNYWRDGQNQFDFLVTWIIVIGETMTFVAPSGLTFLSNGEWIRYLLIARMLRLIRLLMHVRQYRAFLATFLTLIPSLMPYLGTIFCVLCLYCTLGVQVFGGLVNAGNPALSKTDLDDDDYLLFNFNDYPNGMVTLFNLLVMGNWQDWMQSYKELTGSIWSHVYFISFYLITVLLLLNLVVAFVLEAFFAELDIESSENGEEQEQDADSRKDRRRFVGTKTSSRKVDILLHHMLSAELDVKDSD Homology
BLAST of Carg19123 vs. NCBI nr
Match: KAG7022920.1 (Two pore calcium channel protein 1A [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1429.5 bits (3699), Expect = 0.0e+00 Identity = 738/738 (100.00%), Postives = 738/738 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg19123 vs. NCBI nr
Match: KAG6589220.1 (Two pore calcium channel protein 1A, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1426.4 bits (3691), Expect = 0.0e+00 Identity = 737/738 (99.86%), Postives = 737/738 (99.86%), Query Frame = 0
BLAST of Carg19123 vs. NCBI nr
Match: XP_023531925.1 (two pore calcium channel protein 1A-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1422.1 bits (3680), Expect = 0.0e+00 Identity = 734/738 (99.46%), Postives = 737/738 (99.86%), Query Frame = 0
BLAST of Carg19123 vs. NCBI nr
Match: XP_022930707.1 (two pore calcium channel protein 1A-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1421.8 bits (3679), Expect = 0.0e+00 Identity = 735/738 (99.59%), Postives = 735/738 (99.59%), Query Frame = 0
BLAST of Carg19123 vs. NCBI nr
Match: XP_022988697.1 (two pore calcium channel protein 1A-like isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1413.3 bits (3657), Expect = 0.0e+00 Identity = 729/738 (98.78%), Postives = 733/738 (99.32%), Query Frame = 0
BLAST of Carg19123 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q75VR1 (Two pore calcium channel protein 1A OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=TPC1A PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1019.2 bits (2634), Expect = 2.3e-296 Identity = 511/732 (69.81%), Postives = 626/732 (85.52%), Query Frame = 0
BLAST of Carg19123 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q75VR0 (Two pore calcium channel protein 1B OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=TPC1B PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1016.1 bits (2626), Expect = 1.9e-295 Identity = 511/738 (69.24%), Postives = 627/738 (84.96%), Query Frame = 0
BLAST of Carg19123 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94KI8 (Two pore calcium channel protein 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TPC1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1003.4 bits (2593), Expect = 1.3e-291 Identity = 492/732 (67.21%), Postives = 621/732 (84.84%), Query Frame = 0
BLAST of Carg19123 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5QM84 (Two pore calcium channel protein 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=TPC1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 931.0 bits (2405), Expect = 8.2e-270 Identity = 460/710 (64.79%), Postives = 573/710 (80.70%), Query Frame = 0
BLAST of Carg19123 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6S5H8 (Two pore calcium channel protein 1 OS=Hordeum vulgare OX=4513 GN=TPC1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 887.1 bits (2291), Expect = 1.4e-256 Identity = 440/710 (61.97%), Postives = 562/710 (79.15%), Query Frame = 0
BLAST of Carg19123 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ERC4 (two pore calcium channel protein 1A-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111437105 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1421.8 bits (3679), Expect = 0.0e+00 Identity = 735/738 (99.59%), Postives = 735/738 (99.59%), Query Frame = 0
BLAST of Carg19123 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JDS0 (two pore calcium channel protein 1A-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111485952 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1413.3 bits (3657), Expect = 0.0e+00 Identity = 729/738 (98.78%), Postives = 733/738 (99.32%), Query Frame = 0
BLAST of Carg19123 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C1V7 (two pore calcium channel protein 1B isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495512 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1348.2 bits (3488), Expect = 0.0e+00 Identity = 693/743 (93.27%), Postives = 716/743 (96.37%), Query Frame = 0
BLAST of Carg19123 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K5Q7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G048010 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1341.6 bits (3471), Expect = 0.0e+00 Identity = 687/738 (93.09%), Postives = 712/738 (96.48%), Query Frame = 0
BLAST of Carg19123 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HWG3 (two pore calcium channel protein 1A-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111468128 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1333.2 bits (3449), Expect = 0.0e+00 Identity = 682/738 (92.41%), Postives = 714/738 (96.75%), Query Frame = 0
BLAST of Carg19123 vs. TAIR 10
Match: AT4G03560.1 (two-pore channel 1 ) HSP 1 Score: 1003.4 bits (2593), Expect = 9.3e-293 Identity = 492/732 (67.21%), Postives = 621/732 (84.84%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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