
Carg12994 (gene) Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGGCGCACAATAATTTTCTGATCATAATTTTCAACTGTGTTCTTATCCTCCAAAACGCACCGTTTTTGGCAGTGGCTTTACCGGAGGCCATCTCGGCGAAGCTCAGAAATGATTCCCAGACGATTAAATTGGCTTCCACGGATTATGGCCGGATTATTGAAGAGAAACCTTACGGCGTTTTCTTTCCGGTGAACGGCAGCGACATCGCCGGGCTGATACAGTTCATGTATGGGAGTCCGACGCCGATGGATATTGCTGCCCGCGGTCATGGGCATTCCGTCCAGGGGCAGTCATTGGTGGAGAACGGGATTGTGGTGAATATGACGTCGCTCGGCGGTTTGGACGGCAGAATTGTGGTGTCTGATGGAAGTCCCACATCGACTAATTTAGGGTGTGATCATGAGTTTATAAGTGAGGAATACTACCTCCATTGGTATGAGGCCTTTTGGGGAAGCCCAAAGCAAAGCCATGAGAGCTTATGCTCAAAGGGACTTATCATAACCATTTGGAGAGTCGTGACGTCTAACATGGTATTTGCCATGCCCTAAACTTAGTCGTGCCAATAGATTGGTAAATCCTCAAATATCCGAACAAAGAACTCTTAAAGAAAAGGAGCCAGACCTCCTCGAGGGTCAAAATGGGACTCAAAGGATCGAGCCTCGATTTCTTGAGGCGCACTTTGTTCGACGTAGTAACTGGATGATGGAAGTTCCTAACATCGACTAATTTAGGGTGTGATCATGAGTTTATAAGTGAGAAATACTACCTCCATTGGTATGAAATTTTGAAGCCCAAGCAAAGCATGAGAGCTATGCTCAAAGTGGACAATATCATACCATTGTGGAGAGTCGTGTTCGTCTAACAGTGTCGACTACGACGGCGTTGGGTCCGTATGCTGACGTGGGCGGCGAGCAGCTGTGGATTGATGTGTTGCATGCGACGATGGCGAAGGGGCTTAGCCCGTTGTCGTGGACGGATTATTTGCGTCTCACCGTCGGAGGGACGCTGTCCAACGCCGGAATTGGTGGTCAGACGTTTCGGTTTGGGCCTCAGATCAGCAATGTTCTTGAACTTGACGTAGTAACTGGTATCTCTCTAAATCTTTGTTTCGGTATGGATCTTGTATCTAGTAGACGCGTTTTAAAATTTTGAGGGCAACCCTTGAAGGGAATCTCCAAACAGGACAATATATACTAGCGGTGAGCTTAATGATACTAGAGCTAGACGCCGAGTGGTATGCGTGCGAGGACGCTAGCCCTAAAGGGGTGGATTGTGAGATCCCATTGTAGAGGTGAATGAAACATTGGTCATAAGAGCGTGGATACCTCTGACTAATGCACACCATTTAAAACATTGACAAAAAGCAGGAAAACCAATTTTTTCTAATAAATATATTATTTGTTTAAAATATGTTTTTTTTTAAATATTTAATAAATTTTTAGTGAAATTTGGAAAACAAAAATGTTGACTTGATTTGGTTTTTAAAAATATTGTAAGAGATTAATAATAAAATAAAGAAATTCATAGGTAAAAGTATCGTTGACCTAATTATCTTTCTTACCATACTATTACCGAGCTTTAATTACCTTATAATAAAACTTTTACCATACCATTATCAAACCATAATTACCATATAAATCTTCTTACCATGTCGTTACTAAGCCTTAATTACCTTATAAGCCTTCTTACCATGCCATGCATGGAAAGAGTAATGATTTTCGATTTGAATTATTTTAATTTTAGAGAATAAAAACGCTCTCTTTTATTATCATAATTATTTGGAAATTATGCATTAATTACACAATTAATGGGTTTGGAAAAATAGTATATTATTTAATTAAAAAAAAAACATATTTTCTTTTTGTTCGAACACCTTACTCGATTTAGAGGTTCGAATCTCTGAATTTAAAAAAGAAAGTATATCTTAAATTATAGTTAATAGTTTCTTTCGTTTGAACGACAGGAAAAGGAGAATTGTTGACGTGCTCTCCTACCAACAATCCCGAGCTTTTTTACGGCGCCCTTGGTGGTTTGGGTCAGTTCGGTGTGATTACTCGAGCTAGAATCCCCCTTGGCCCGGCGCCCACGAGGGTCTCTCCCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCGACCTTTTTTTAATAATTTTTTAAAAATGTGGATTAAGGTTAATAAGATTGTATTTTCTTTCTTAAAGGCTAAATGGGTTCGGATGCTTTACACCAACTTCTCTGCATTTACAAGTGATCAAGAACTTTTGATATCCAACAATGGAAAAGAGAAATCCAACGGCCTTAATTACCTTGAAGGTTTGCTTTTGCTAGAACTAAAAGCACCTGATAATTCCTCCTTCTACCCTCTACCCGACCAGCCCAAGATATCCACCCTTATCTCTCAATACGGCATCGTTTACGTCCTTGAAGTCGTCAAGTATTATGATCAACAATCAGCTGGTTCTGTTGACCAGGTTTGACTCGTAGCCGTCATAATTTGACCATATAAAATTGTCAGTCACATTATTTTAATTTTTTTAATAATATATTTATGTGTAGGACCTCGAGAAATTGTTGACGGGGTTGAGATTTGAGGCCGGATTGAAGTTCATTAAAGATGTTTCGTACGAAGAGTTTCTAGATCGAGTTCACACCGACGAACTAGCATTAAGATCTCTCGGGTTATGGGACGTTCCTCATCCGTGGCTAAATCTTTTCATTCCAAAGTCGAAACTTTTCGAATTTGAATGGGGTGTTTATAGAAGCATTATTCAAAAGCGTAAACTCAGTTCAGGCGTCCTCCTCTTCTACCCGATGTTCAAAAACAAGTAAGTTTAATCATTTATTCATTCATTCATATTCTTAACAAAACGTTACGATAAAAAGCTTGACAAAGCACGATCGTTTTACAGATGGGATGAGAAGACCTCCGCCGTGATACCCGACGAGGACGTGTTCTACACGGCCGGGTTTCTTTTCTCGAGCGGATTCAATAATTGGCAAACGTTTGAGGAACATAATAGAGACATATTGAAGTTCTGTGCTGAAGCTGGAATTGGAGCCAAGCTGTATCTTCCACATTTTGAAAGTCAAAAGGAATGGGTTGACCATTTTGGTCGGAAATGGCCTGTTTTCCAGCGGAGGAAGGCCTTGTTTGACCCTAAACACTTGCTGTCTCCGGGACAGAAAATTTTCTAATTTCTTTTAATTTCTACTTTAAATAAATTAAATGTATTACATTTAATATTAAAAAAAAAAATTATAAAACAAAATGTGGTCAACTTTGAACATGGGCTTCTAGTTAGTGGGCTGGGCCCAAACTACTGCAAACGTAGCCCATGTCTTTTTTTTTTTAATTTTAAAATAATTTTAATCAATAATGAATTTGAGGATTAAATTTCAAATGTATGAGGGGAGAATTACAAAAATAACCTTGGAATATAAATATTAAAATATACCGTGACTAAGATGGTTGATCAAAGTCAAGAACGTGTAATAATGTGAAAGCATCAGAAGAATTGAAAATTTATCAACTTTGTCTTGAAAAGACGATACAGGTGAATCATAATCTAAAGAATAAGCTAAATATTCTTCCTTATCTATTAGCTCAAAAAAGTGATACTCAGGATCGACGCAAGGACCTACCTTCCGATCGGTTTAGGTAAATTTCTAATGTGATGAGAGACATCGTTTTTTGAAGGAAGAAAACGGAGAAAATAGACGACTACTTCTTGAGTCGGACAAATGACTTTGTTTTTAAGGGAACATAGACTTTTTGAAGCTGATCTATCCACGTACTTTCTCGAAATATCTTCATCACATGAATTGACCGTTTCTTGAATACGAGAATTAATCTGACGTGTATCGAAAGATTGAACATTAATATTATATTTGATTCCAAAAAGGTTGATTTTGCAAACCTTAATGGATTTTTATGAGAATCATAGAGATTTTTGGGTATCAATAATTAAGATTTTTTGCCGGCTTTATTCCTTAACCTTTTTTACTGTCATCCACACAATCATCTATAATCATCATTAACACCCTAAATATATTTATTTATTTTTATTTAATGCATTTATTATTTTACTAAATTAATTAATTATATACACGTAGATTCTTGTACACGTTCACGTATAGAGAATATGATGATTGCATCTCAGTTGTGATCCAGTTATGTCAATTATTTTATGATAAACCAACTCGATCACAATCAATTTGGTTCAATTCCTCGCACTCTTATTGTATGATAAACGTGTGATGGGGAAGAGATGAAACATTATTATATGTAAATTCAGATACATGGAACATATCGGTGTTCCAATGCATTTCTCCTTCTGAGTCAGAATAAATATGTTTTCGAATCTTCTCTTTTAAATTAAGAGTATACGTTTTGAATCTAGGTCAATTCAACATCTTTTACTTAATTTCTCGTGGGTCAGATTCTGATTGTACGATGATGTTACTTATCAGTTCATAGCATTTGTGTCAAAATTTGATCCATCATTCCATTTTTTTCTCACAAGATTCAACGTTTGATCACTGAATTAGTCTCTTGATTCGATTAATAGTTCCCACAAATCTAAACTCGTAATTGACAATGTATTATGTTAAACACGATCTAATTTAAGACATTCCGACTTCACGTGATACTCAAAGATGACAAGAAATTAAAAGCATGGTGAGAATTTGGGAGGTAGGTAGGACAGTACTTGAGTTTGCAGCCAGCCCTGCTTTATGCTACTAATGTTGTGATATCATCACCATCCATCAACATCAAAACAAACAAAGAGGGACCCATGAACCAAACCCTAATTTTGTTTAATCCTCGAACTTCGATTAGGTTTATAATTCAACTAAACTTGTCGTGTAGGTCAAGTTGAGTTCATCGATTTTTCCATATAGTTGGGCAACAATTTTTTTTTTTTTGAAAAAAGAGAAAAATTAGCCTTTTCCCTTTCTTTTGATACGTCCTATCAAACCCAATATTGGAAAGTACTTTAGGC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MAAHNNFLIIIFNCVLILQNAPFLAVALPEAISAKLRNDSQTIKLASTDYGRIIEEKPYGVFFPVNGSDIAGLIQFMYGSPTPMDIAARGHGHSGLSPLSWTDYLRLTVGGTLSNAGIGGKGELLTCSPTNNPELFYGALGGLGQFGVITRARIPLGPAPTRAKWVRMLYTNFSAFTSDQELLISNNGKEKSNGLNYLEGLLLLELKAPDNSSFYPLPDQPKISTLISQYGIVYVLEVVKYYDQQSAGSVDQDLEKLLTGLRFEAGLKFIKDVSYEEFLDRVHTDELALRSLGLWDVPHPWLNLFIPKSKLFEFEWGVYRSIIQKRKLSSGVLLFYPMFKNKWDEKTSAVIPDEDVFYTAGFLFSSGFNNWQTFEEHNRDILKFCAEAGIGAKLYLPHFESQKEWVDHFAYFGYMLSITRLKSFIPKSLFPDDDITAVATNLRHDSAALNSAATDFGHMVTDPPAAVLFPSSINDIISLIKLANSRPVPFNIAAKGCGHSVRGQAMARNGVVVEMASLNNPTRISVSGNASDGFFADVGGEQMWIDVLNATLKHGLAPTSWTDYLYLTVGGTLSNAGISGQTFRYGPQITNVVELDVITERNWELFHSVLGGLGQFGIIVRARIPLFPAPNRVKWVRMLYTNFSEFAEDQERLISINGSKQNGALDYLEGLLLMHDGPPDNWRSSFFPPSHHSTIISLVNQHSIIYCLEVAKYYDHTSRHTLDKELDDSLDGLRFLSGYKFEKDVSYVEFLNRVRSGELSLKSQGLWDVPHPWLNLFVPKSRIAEFNFGVFKDIVLKRKMNNGPILVYPMNRSKWDDRMTAVIPDEEVFYTIGFLNSSGFNDWEAMDEVNKEILRFCNSVDMKIKQYLPHYRTQADWANHFGHKWKRIQDTKKQFDPNMILSPGHKIFNS Homology
BLAST of Carg12994 vs. NCBI nr
Match: KAG7023663.1 (Cytokinin dehydrogenase 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1879.4 bits (4867), Expect = 0.0e+00 Identity = 910/910 (100.00%), Postives = 910/910 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg12994 vs. NCBI nr
Match: KAG7021938.1 (Cytokinin dehydrogenase 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1228.0 bits (3176), Expect = 0.0e+00 Identity = 633/1010 (62.67%), Postives = 706/1010 (69.90%), Query Frame = 0
BLAST of Carg12994 vs. NCBI nr
Match: XP_022960993.1 (cytokinin dehydrogenase 3-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1021.1 bits (2639), Expect = 5.7e-294 Identity = 495/511 (96.87%), Postives = 499/511 (97.65%), Query Frame = 0
BLAST of Carg12994 vs. NCBI nr
Match: KAG6590000.1 (Cytokinin dehydrogenase 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1013.8 bits (2620), Expect = 9.1e-292 Identity = 492/506 (97.23%), Postives = 495/506 (97.83%), Query Frame = 0
BLAST of Carg12994 vs. NCBI nr
Match: XP_023516089.1 (cytokinin dehydrogenase 3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1011.9 bits (2615), Expect = 3.4e-291 Identity = 489/511 (95.69%), Postives = 496/511 (97.06%), Query Frame = 0
BLAST of Carg12994 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LTS3 (Cytokinin dehydrogenase 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CKX3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 566.6 bits (1459), Expect = 5.0e-160 Identity = 269/481 (55.93%), Postives = 353/481 (73.39%), Query Frame = 0
BLAST of Carg12994 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q67YU0 (Cytokinin dehydrogenase 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CKX5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 473.0 bits (1216), Expect = 7.5e-132 Identity = 237/479 (49.48%), Postives = 316/479 (65.97%), Query Frame = 0
BLAST of Carg12994 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FUJ2 (Cytokinin dehydrogenase 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CKX4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 469.2 bits (1206), Expect = 1.1e-130 Identity = 246/518 (47.49%), Postives = 329/518 (63.51%), Query Frame = 0
BLAST of Carg12994 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FUJ3 (Cytokinin dehydrogenase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CKX2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 456.4 bits (1173), Expect = 7.3e-127 Identity = 241/500 (48.20%), Postives = 317/500 (63.40%), Query Frame = 0
BLAST of Carg12994 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZAY9 (Cytokinin dehydrogenase 5 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=CKX5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 455.7 bits (1171), Expect = 1.2e-126 Identity = 231/480 (48.12%), Postives = 309/480 (64.38%), Query Frame = 0
BLAST of Carg12994 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HAL6 (Cytokinin dehydrogenase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111461626 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1021.1 bits (2639), Expect = 2.7e-294 Identity = 495/511 (96.87%), Postives = 499/511 (97.65%), Query Frame = 0
BLAST of Carg12994 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JJK1 (Cytokinin dehydrogenase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111485168 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1010.0 bits (2610), Expect = 6.3e-291 Identity = 490/510 (96.08%), Postives = 496/510 (97.25%), Query Frame = 0
BLAST of Carg12994 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BQ60 (Cytokinin dehydrogenase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492330 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 839.7 bits (2168), Expect = 1.1e-239 Identity = 404/511 (79.06%), Postives = 451/511 (88.26%), Query Frame = 0
BLAST of Carg12994 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KSZ1 (Cytokinin dehydrogenase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111496957 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 820.1 bits (2117), Expect = 9.3e-234 Identity = 390/501 (77.84%), Postives = 436/501 (87.03%), Query Frame = 0
BLAST of Carg12994 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EHB3 (Cytokinin dehydrogenase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434108 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 814.7 bits (2103), Expect = 3.9e-232 Identity = 387/506 (76.48%), Postives = 435/506 (85.97%), Query Frame = 0
BLAST of Carg12994 vs. TAIR 10
Match: AT5G56970.1 (cytokinin oxidase 3 ) HSP 1 Score: 566.6 bits (1459), Expect = 3.6e-161 Identity = 269/481 (55.93%), Postives = 353/481 (73.39%), Query Frame = 0
BLAST of Carg12994 vs. TAIR 10
Match: AT1G75450.1 (cytokinin oxidase 5 ) HSP 1 Score: 473.0 bits (1216), Expect = 5.4e-133 Identity = 237/479 (49.48%), Postives = 316/479 (65.97%), Query Frame = 0
BLAST of Carg12994 vs. TAIR 10
Match: AT1G75450.2 (cytokinin oxidase 5 ) HSP 1 Score: 472.6 bits (1215), Expect = 7.0e-133 Identity = 237/480 (49.38%), Postives = 316/480 (65.83%), Query Frame = 0
BLAST of Carg12994 vs. TAIR 10
Match: AT4G29740.2 (cytokinin oxidase 4 ) HSP 1 Score: 469.2 bits (1206), Expect = 7.7e-132 Identity = 246/518 (47.49%), Postives = 329/518 (63.51%), Query Frame = 0
BLAST of Carg12994 vs. TAIR 10
Match: AT2G19500.1 (cytokinin oxidase 2 ) HSP 1 Score: 456.4 bits (1173), Expect = 5.2e-128 Identity = 241/500 (48.20%), Postives = 317/500 (63.40%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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