CaUC10G191860 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC10G191860
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCiama_Chr10: 26335863 .. 26341325 (-)
RNA-Seq ExpressionCaUC10G191860
SyntenyCaUC10G191860
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GTTTGAGAGCTATGGCTATGGCTATCCCCTAGTGAAGAAAAAGTTTGGTAAAATTAGAATAGCTAGCCAAGATCATATCATATCATGGGAGTATATGCATGCCTCCTTATTTCCCTCTTATTAATCCTTCAAACTGTATGGATTTCATCCCTTTCCAATGCTTCTAATTCTTTTCAATATGAATCTCTTTCCAATTCCAACCACTCATTCAACTCTCTCCCTCCTCTTCAACCCCATCATCATCATCATCATCAACTACTTTTGGGTGAGATTTTCAAACCTTCTTTCTTTTTCTTTTCTGAAAGTACACAATTTCATATGTTTAATTAAAATTTTAGTAATTGTTGTCTCTCTTTAGAAATAGAGAGTGAATTAGAAGAAAGGAGACATCTTAATTTGCTCTTTAACCCAAAATTTTATATCCAACTTTTTTTTTCTCTTTTCTTCCCTCCATATTGATTAGTTTTTATTTGCATTTTTTTTTTTTAATAAAGTGTGGAACTATATTCACATAATGATGAGTATTATTATGGTTGTTATTTGACTAATTTTCATAAAATTTAATTAGTAGAAGTAAACTTAAGATAAATATTAGGATTAATATTGGACAATATCTAAAATTATAGGGTTGTTTTCAAATATAATAAAATAAAACAAAAAATTTACAATTATAGAAAAATTTCATTGTCCATTTGTGATAAACCGCGTTATATTATCAGATGTGTCTATCATGTAATAGTAATCTATCACAGCAAAACTGTGATATTTTGCTATTATTTGTAAATATTTTTAACAATTTTGTCATTTAAAATAATTTCTCAAAATTATATATAATTCAAAGTACAGAAGTTAAAATAGGTTTTTTTTACCTCATTTAAATAAAAATGATGTTTTTGAAAGACATTTTTTTCTCTGGTAAATCGAAACATGACCTTAGTTTCTTCTAATTCTTTTTATTTGGTTTCCAGTGAACGGGGGAGAAGAGAATAAGACGGCGGAGAGTTGGGTTGTTTTAAAAGCTAAAGGAGGAAGGTCCGGCAGCGCCGGGGCAGGCTCCAACAACCACCGGCCGGGAAAGGCAAATCAGAAGAACGCAGCTTCCAATTTGATGAAGTCTAATAATATAATAATAATTACCACTCTGCTGCTCTCTTCCTATTTATACTTCTTCTAGTCTTCTTTTTCCATTGATTTCCATATGGAATAATATGAAAGGATTATATATATGTAAGCAAAATTTTGTTATCAACCACTTATACACACAGATCTTACAATCATGAGATTTGGTTTTATCAATTAATTGGATTTCAATGTCGTGGCATTTTTATCTCGAAAAAATTTTCATTGATCGCATCAAAATACTTATGGAGTCCACTGACATTGAAAGATGTATTTATAAATACAATTTTCTATTGTGAACAAAAGAAGTATAGTATGTCATATTGATCATGGTACGTAACTAAGGTAATTAATACCTTGTTCAATTTAAGTTATTCCATACTTGTTGCTTGAAAATTATTAGTTTGAGTTTTTGTATTATAATCTTTGTGTTTAGGGTTTATTGTTGATCATTTTGAAGCAATTCAACCGTTTTCTAAGTTATCTATGTTTTTATGATTAATTATTGTGATTGTATTTTCATTGCATAATTAGTATGTGAATAGTGACTTAGTAGAATGTTTATAAAGTCTGAGTTGATGCATAGGTTCATTCAACAATGACCAATGGTTTGCATTTAAAATGTGGCAAGAGGATACTAGAACTTCCATTATACGATATTACCACTTTAGACATAAGTCCTAACATACTTTATTTTGGTCTCAGTCTTTTCTCGAATGAGTGTCCTCTATTTTTAAAGAAGATGGCGAATTCTAGGTGATACTTTTGTTTTGTTGTATACTTTGTTGAGCTTCCAAACAAAAAAAGTTGATAATAAATTTATTTTTATTTCCAACTCTCTTTTTAACATCTTTTTCTTAAGATGTTGAAAAAGATTGGAGGAGTGAGAAAGAAAAATATGGGTAGGATGTGAGTTGCTTTGAATGTTTCCAAGAAAGAGAATCATTTCTTTCGCGAAGAAAAAGGATTTTCTTTCATAAAGAAGCAAAAAGGGTTTTAGGATGAGACACAAACATGATGAAAATTATATATATATATACAAGATAATTGCATTGAATAACACTTTTAGAGATAATAATTAAGTGCCTAACAACATTTAAAAATTACAAATATAGCAAAATCTATTAATGATATACTGAGAGACCACGTTATTAATATGTTCTATCACTAATAGACTTTGAAAGCAAAATCTAAAATTTGCTATATTTGCAATTTTTTTATATTGTACTATATTTACAAATACTTTGAACCTAATTGTTATATTTTCAAATGCCCCTTATACCAAATGATAAGCCAAGTTCAAATGAGAAAGTGGTCCAAGTTTGTTCATCTTAGTATCAAGTTTTGTCTCTTCTCTAAATATATGACCTACATGTGTATCTTATGTTTGAAGATTTGAAAAACTTAATTGGGAGAGTCGTATGAATGACTCAAAATTTGGACCTTAAAGTAAAATATACCCTCTTTCTAGAACTTTTTTTTTTTTTTAAACTATTTTGCTTACATCTTATCAAAGACATGAAATTACTAAAATGGATCATTTTTTTTTTGTCGGAAATTTCTTATGGGCCCTACATGTCCATTAATAAATGAGTTTTATTGTTATTTTGATATCTTAATTAATTAACAAAGAGTTAGATTATTACAAGTCTTTGAAAGGAATATTAACTATGGACAAAACGTATAGAAATTAATAACTTTATTAATTCTAATTTAACAAGGGGATGAATTAGAATTAAATTTATTGTGTTTTGATCGAATTATCATAGATATTAGGTCGTTTTCTCTCATCCCCATTAGAGAGTTTTCCTTTCTCTACAATTATCTACGTTCCCAATGTGCTTATGATATAGCACCAGGTGGACTGTTAGCTAGTGTGTATCATTCCTAAAAAAGGAGGAGAAATTAACGAGAATTATGTATAAGAAGAAAACACGATCTATCTAGACTTGGAAGATTATCATTTACCTAGTATTTCAGCTTTGCAATGGATTCAGGTACGATTCCACTTTTAAACTTTAATTCTCTTGAATTTGACCTAAGAAATAGATTTGTGGTTTTAAGTTTACAAATTATAGTTCCTTAATATTTCCATCATATTTTGCATATGCATTAAGATATCTCGCTCTATCGCTCATTTTTGTATTTAGATTTTTCAGCTCATCGCTCTCTCTATTTTTTCTCGCTCTTGCTCCTCTCACTTCTCTCATTCCTTTGGGTTTAGAATTTTTTTGATCCTCACTCTCATTCCTTTTGAGTATAGAATTTTATGTTCCTCACTCTCTCTATTTCAATTTTCACTCTTGCTAATTCTCTCATTCCTTTGGGTTAAATTTTTCCTCCTCATTCTAGCTATACTCTTTGCTCCATAGTAGCGAGAGTGCACAAAAAATCGTTTTAGTAATTTTAATAGATGACATAAACAAAATGTTAGAAAACATAAAATTTAAAAAGTGGGGCATATTTCATTTTGGACCCAAAATTTAACTACTATGCAATCATCTCTTAAATATTCTTATTGTATATAAGATTAAGCACACAGTTATTTCTCCTCCTGTCGTTCTAAATTGTAAAACTTAATTTGAATGGAGCAAAAATATGCTCCACCAAAATATTTTATAATATATATTAAGAAACTATATCATGAAACCTTGATTATAAGAATCTTTTATGGTGCTATTATGATTTTGTTGTCAAATGATGTTCCAAAGTTTGATTGGTGTAAAATGAATAACTTGAATTTGTATTAATTTGGTATAAGTGTAGTATAACCATTAACCTTGTTTATCTTCTCAATCCTTTAATCCTTTTTTTCTTAGATGTGAACATATTTTGAAGGCTTTTTAGTTCGTTCTCGAATATAAAATTGTCTTAAGAACTTCTTTAATTTTGCTTCAATTATGAATTTATCTCAAATCAACTTAAATTTTTTGGTGAATCGTAAATTGATGTCTTGAAAACTCAACTCTTCAAACATATATATATATTTTTTGTATCTCCAAAGAAGTCTTTTATTTTATTCTTCGAGTCTTTGACTCAAAGAATTTTAAGGAGTTTTCAGTCTCTTGGAAATTTTTATTTAATTTTTTAGGTTCTAAATCTTCTCTTTGAATTCTTCTTTTAAAAGTTTGACCCGTTGAACCCTCAAAATAAAAGATAGACTTTTCAATTTATAGAGTTTTCTTGAGTCTTATTGTGTAGGCTTGAGCTTTGTCAAGTTTGGATCCAACCCGCTAGGCTTGAGATTTGTTGGCTTGAGCCCAACCCTTTAGACTTGGACTTTGTTGGCTTTGATCTAACTTTATCGGCTTGAACTTCAAGCCAAATTGTCATTCATTTTGAGCCTTGTAGACTTGCTCAATCTTAGACTTAGTAGCCATATTACCCAATTCGATCAGGCTAGGTTTACTTGATCAAATGACCATAAGAAGACACATGATATTATTTGGAATTTTTCCACTTCTTGTCTTCAAATTTAATTGTAGACACACATCTCAATTTATAATTTGTCTTATATTTAGCATATAATTTGTCAGTAATTTAAGAATAATGATAAGATAATTTATGATTTGCCAAAAAAAATTTTGATGCATTTTTACATATTGTCATATATTTACATAGAATAATTAAAAGTATAGGAATTCTAACTCATTAGTCATTTTTGTTTGAGTTTTGATTATAGGTTTTAAGATATATACTTTTATCTTTGAGTTTTGAATTGAGTTTTTATTCATTATTAGTCAAAGATCTAAAATGTCAAATCTCAAATTGCAAAGGTTAAGCACTTTCTGTAGTGGATTTTCTATGATTTCATTTCATCCCGTCAAAATACTTTTCTCCGTCATATTGATATTGATCCTATGTGCCCTTTGGGGGCTTTGGAAACAATTGAGCACGCCCTCTTTGAGTGCGTAAGAGCTAAGAGAAGTTCGAAATGTTTGCTCCCAATTTGGGGAAATTTGTCATTCAATCAGTTTTTGAATTAGGGAAGGGTTAATTAATGAGCTTATGATTTTGGTAGATTGAGAGTTTAAGTTGGCTTGTCTGGATGTCTGGGCAATCTAGAGCGACCAAAATAAACTGGTTCATAAGGAAGTTGTCCATTCGGTGGTTTTTCGATTTCAATGAGTGAGAGACTAATTGGTTTCTTTTTTGGGTAACACAGAGATTGGGCTTGATATTGATAGGAAAGAGGAGTTGCTTAGCCCTTTTGGTGGTCCGAATTTCTGGATTATGTATGTCGATGCAGTTTGCCAGGTTAGGGAGGAAATAACAGGTTTTGGAGCAATCTTGTTAGATGAGAAGGCAACGATGAAAGGAGCGGAGTACTGTTTTAGGGAGTAG

mRNA sequence

GTTTGAGAGCTATGGCTATGGCTATCCCCTAGTGAAGAAAAAGTTTGGTAAAATTAGAATAGCTAGCCAAGATCATATCATATCATGGGAGTATATGCATGCCTCCTTATTTCCCTCTTATTAATCCTTCAAACTGTATGGATTTCATCCCTTTCCAATGCTTCTAATTCTTTTCAATATGAATCTCTTTCCAATTCCAACCACTCATTCAACTCTCTCCCTCCTCTTCAACCCCATCATCATCATCATCATCAACTACTTTTGGAGATTGGGCTTGATATTGATAGGAAAGAGGAGTTGCTTAGCCCTTTTGGTGGTCCGAATTTCTGGATTATGTATGTCGATGCAGTTTGCCAGGTTAGGGAGGAAATAACAGGTTTTGGAGCAATCTTGTTAGATGAGAAGGCAACGATGAAAGGAGCGGAGTACTGTTTTAGGGAGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGAGTATATGCATGCCTCCTTATTTCCCTCTTATTAATCCTTCAAACTGTATGGATTTCATCCCTTTCCAATGCTTCTAATTCTTTTCAATATGAATCTCTTTCCAATTCCAACCACTCATTCAACTCTCTCCCTCCTCTTCAACCCCATCATCATCATCATCATCAACTACTTTTGGAGATTGGGCTTGATATTGATAGGAAAGAGGAGTTGCTTAGCCCTTTTGGTGGTCCGAATTTCTGGATTATGTATGTCGATGCAGTTTGCCAGGTTAGGGAGGAAATAACAGGTTTTGGAGCAATCTTGTTAGATGAGAAGGCAACGATGAAAGGAGCGGAGTACTGTTTTAGGGAGTAG

Protein sequence

MGVYACLLISLLLILQTVWISSLSNASNSFQYESLSNSNHSFNSLPPLQPHHHHHHQLLLEIGLDIDRKEELLSPFGGPNFWIMYVDAVCQVREEITGFGAILLDEKATMKGAEYCFRE
Homology
[Close]
BLAST of CaUC10G191860 vs. NCBI nr
Match: KGN58897.2 (hypothetical protein Csa_001334 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 68.6 bits (166), Expect = 4.3e-08
Identity = 44/60 (73.33%), Postives = 44/60 (73.33%), Query Frame = 0 

Query: 1  MGVYACLLISLLLILQTVWISSLSNAS-NSFQYESLSNSNHSFNSLPPLQPHHHHHHQLL 60
          MGVYACLLISLLLILQTVWISSLSNAS NSF YESLSN        PPLQ HH H    L
Sbjct: 1  MGVYACLLISLLLILQTVWISSLSNASNNSFPYESLSN--------PPLQTHHLHQQPRL 52

[Close]
BLAST of CaUC10G191860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LCI5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G710765 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 5.4e-09
Identity = 45/64 (70.31%), Postives = 47/64 (73.44%), Query Frame = 0 

Query: 1  MGVYACLLISLLLILQTVWISSLSNAS-NSFQYESLSNSNHSFNSLPPLQPHHHHHHQLL 60
          MGVYACLLISLLLILQTVWISSLSNAS NSF YESLSN        PPLQ HH H    L
Sbjct: 1  MGVYACLLISLLLILQTVWISSLSNASNNSFPYESLSN--------PPLQTHHLHQQPRL 56

Query: 61 LEIG 64
          ++ G
Sbjct: 61 VKGG 56

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CaUC10G191860 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KGN58897.24.3e-0873.33hypothetical protein Csa_001334 [Cucumis sativus][more]
BLAST of CaUC10G191860 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC10G191860 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0LCI55.4e-0970.31Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G710765 PE=4 SV=1[more]
BLAST of CaUC10G191860 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC10G191860.1CaUC10G191860.1mRNA