CaUC10G187740 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAAGTTGTTTCATTGAAAAAAAAAAAGAAAAGAAGTCTTGGTTGGTGAAAAATAAGCAGTATGAATAACTTCTGAATTCTTTTCTTAAAAAAAAAAAATTCTGAATTCTTACAACTGAGAAAGAGTTGCTTTTGAATGAGTTATCAATGGAGCATTTCAATAATGTCTTGTGGTAAAGAGTGTGGCGCCATGATTGAGGTGGGGACTTGAATCCCCCATTTGGGATAAAAGAAAAGTTGTGGTAATCTTCTTTTCCATATTGTGAGGTATTTGACTCGAGAGAAATAACAGAATAGGGAGGTCAGGAGATTTAGGAGGAGGTTTTAGTTAGTGAATGAAAGTTTGGTTTTGACCCAAAAATTAAATAAAATAAAAAATGAAGCATTTCAAAATAAGTTTTGGGTCTCTACCTTCATTTGCAGTTCTGCATTTTCCTTACGAATCATATCTAATTTCTTGTAGAGTTCCAGATTTTCTTGATGCATATGATTTCCCTGCAACATAATTATTGCAAATTAGCTGTTGTTTCAGTACTTCTTGATATAATGAGATACATGGATGTTTACAGTGGGGAAAACCTTCTGTCTTAGTTCAGTAATTTCGTCGCTTAAAATCTTTTCCTGCAAGAAAAATACAAGAACGCATAAACATCCGCACACAATATGCTTTATCAGGTGTATGCTTTTATTGAGGTCTCTTCATAGTTTATACCTTCTTCACACGGACACCTTTCAAACTCATTTCCAACTGGCTTTCCAGATTTTGTAGATCTTTGACACTCAGGCCAGATAGTTCTTCACCCATCAATTGTCTGCAAATATAGAAGTGTGGATATATTATGAACTTCTTTGCATATTTGCATAAACTTCTTTGCATATTTGCATAAACTATTGAATTATATTACTATTCCTCATCGATTCAGACTTAAATTGTTTTAATTTATCTCAGTGGTGAGCATGCCTTAATTATGGTATAGAGCATGAATGGCAACTTAAGGTGTTAGTAAAGTGTCAAGTACTCCACCTGTTATCATGATAATCAAATTATCAGTCTAATTTAAAAGAACCGAGGGATGTGTGATTTCTACGACTCATGCTTAAATTATATTTTGAAGTCACCACTTACCATATAGAGTTATTCTAGCACTGACGATTGAAAGGGGATTTAGAGCCCTCTAAAACTGGTAGGCCAGTGTTTACAGTTGGACGTTTGCTCATGAAGGCTGGCAGAAAAAAGGGTGAAATAATAGAGTTTGACTGAAATTAAACTTAACAAATGGTTTTCTGTAGAGAAAATTCACGAGGTCGAGTATTGAGGAAGAACTAATCAGACTTTTCATGAACTACAGTCGGGGTTATCCATGGTTGTCTGGATGCTGGCTCAAAGATAAGGCCAGAATCTTGTGGAGTAATTCCTGTAGAGCTTTCCTCTAGGCTCCTTGGAAGGAAAGAACTTGAAGATTGTTCTTAGATAAGACCTTTATGATCAATGTTTTTTTGTGAAAATGTAGAACACTGCCTCCTCTTGGAGGGCTCTATATGGTTCTTTTTGAACACACAGCGTGCTCCCATTCTTTTAGATTGGAGGCACTTACTCTTTTGATCCTCCAGTTTTAAGGCCTTTTGGCCGTGGTTCTCTCTCTTCTGTTTAATATAAAGTTTCTCCATTTCTTATAAAGAGAAAAAAAATCCAAGAACATTCTGAATTTGCTACTTCCAGTTGAAATACAAGCTCCAAGCTATGGACTGCCCAGGAAGTCTGAGAGTCCGGAGCTTCCTCTCCACTCTCTTCAGCTCTTTGCCTGTGTTGATCTCAACAGAAAAGTGACAAACTAGATTAAAGACACTCCTACACCTGTCAGCTTATTTCTTCCTGCACCCAAACGTAATTGCTTATTTTCGTTTTCAATCAAGTATTGATTCATCATCACTCTGTTCTGAACCATTGTTCTACCATTCATTCTACTCTTGGGTTAAATTGTCTATCAATGTTTATGTGTGCACGCATAAAATTATATAATGTGAATGTGATAGCCTACATGTTTGATCATTTGCTCTTCACTTGGCTTTTTGGCTTGTGGTGGCAATTCAAACTCACAATGAGATCCTTTCAAAGTTATCGATCTTGTTTGTCTTGTTTCAACTTTCCTACATGCTATATTTGTATATGTCTATAATGAGAAACCATTCATTCATTCAGGAAAAATGAAAAAGTACTGGGGTAATACAACAAAACTCAACCCACACAAGGAGCCAAACAAAAATAACATGGGGCTCCAATCAAGCAAAATAAGAGTTAGAAGACTATTACAAAAAACACATTCACCAAGGCTCGTAGCGCGGTATGAACATAACAAGTGACCAAACTTCATCCAAGTTCCCTTAAATTTTCTAAAAATTCTATTGTGACACTTACATTCTGAATACTAAAAATTCTATTGTTCCTCATACATTCTGAATATAAAATAATTCTCATGTACTTAAGGTGTGCTCTATTAAAAGAAAAAAAGGAAAAAAAGAGGTGTGTGCTCTATTTCTAGTTGGAATGTACTTCAGTTGTGCTCTATGTCTAATTGAAATGACACATGCAATCATTGATGTCTATGGTGCATGTTTTTAATCATATACTCGATTCTTTGAATTTGAATAATTTGAGCCTTACAACCTTACTTGAACAAGATCTATTCTATAGGTTGTACAACTTGTGTCCTGGGGTTCTAAGGAATGATTTGAGCCTTAGGAAAAAAAACCGTCTATTTCTTTAGCTCCTTTTTCCTTTCCCCTTTTTGGTAATTCTTTTTAGTCTCCTAAATTAACTCTTACATTTTTCTTTTTCCTCATCTAATATTTCGGCATTGGATTGTGAAGAAAATTTGGTTTCTTGTGAATGATCTGTGAAAATAGAGGAACATTTGGGTTTTGCTTGCTAGTTGATATAATAGCAAGTGTCCAGGCTGAAACCTCAGCAATAGGATTCCTTTGAAAAATTACTAACGTTTGATTATAGTTTTTAAAAGGCGTATCAATATTGCTAAATTTTTGTTTTCAGAATGGTTTGCTTTAGGACCTGTAATCAAAGTTTAATTGATTATCATCTTACAAAACAAGTTAATAGAACACCGAATTCTTAAGTCACTTGTGTTATGTGGAACTTTGTTTTCTCACAAAATTCATTTTCCAGGACTTTTGCTAATTTCTTCTCAAGCACTGAGGACTTGGATGCAGCAATTGTTAAACATACATTTGAATATTTACTCTCCCCTAAACATATTTGGATGATTTTTTTCTCCTTGTATAGAATAAAGTACAGGAGGAATTAGAGTACCTGTGACATTCTTGCAAGTAATGCAGTTGTTGCTTCAAAGCAGCTGCCTCTCTTTTCCAAAACTAGCAATCGCAGAATAGATGGTCAGCATTACAGTATTACTTGTGGCATAGGTGAGTTCAACATTCAAATGATTTTAACTTATTTATTTGAAAGGTCTGACTTTACTTCACTTTTGAATAAAAAGGGATAGATTTCAAAAAAACGTAAGAAAATGTATATATATTTGTAAAGGCATAAGAAACTATTATTTCTGTGCTTTAATTACTGATTGGAGTAAATGCCTTTTTTTTTTTTCCTGTCATTCCTCTTCTAGGCTATTGTCTAGATCCATGATTTTAAATAAATCTTGCAGTGGTACCTAAAATCTCAATGCTGATTGCTGAGTATACACACATTATTATGTGAAGTTTCTTTTCTTTTAGGAGATTTATTGGTGCCTCCAAGGTTGATAAAGTTACAGTATAGGGGTTCTATTATGTTACATTATTTCATTCTTTTATAGATTAAAGTATAAGATAAGGCAAAACCCTTGATATCTCAAGAGTTTGAGCCTTGGGGTTCATGCGGATTTGCAGACTTAAAAGAAGTAAAATAAACGCAAACCAGCCCACCCAAAACACAGGGATCACAAAATAAACAAGCAAACTGGGTATTTATATACAAGTAGTTCTAACTGCTAACCATCAAGAAAAAGGGCAAGTCAGGAAAAAGAAACAAATCTGTCTATTAAATCATAACTAACACTGAACTCCAAAAAGCTTAGGCAAGATTAATATATATCTGATTTTTCATATGTATTCTCAACACTCTCCTTATGTGTCAGCTTAAATACCAGTGTGACTCATGAAGGAACATATGCCCAATTGATATCAATTAGGGATTCAAACACTATCTTCTTACTCTTAAGACCATATTGAACTCTAAAACTTAGGTCGATGGGTTATAATATATTTAGTACTTTATATATATATTCTCAACCACCTAGGTTGACCTAGTGGTCAATAAGTACCAATGTATATAGCAATGAAACTAGAGGAAATGAGTTTAACTTATGGTGGCCACTTTTCTAAGATTTAATATCCTACAAGTTGTCTTGACAACCAATGTGCAAACTAACTCAAACACTCATGGATATCAGAAAAATAAAATCTCAACATTATTGATGCTTGAGAAGGTTCTCACGTCTTTCTCCAATCAAATATCTCATGGGACTAAAAAAATAAAACCAGCCTGTGAAATAAGTGATTTCTATCCTTCAATGGACTGAAGACAGCTCATTGTTCCTATACTTGAGCTCAGAACTGAGAACATGCCATTATTCTCCAAAAGAATACCTTACCTTTAAAGCAAAAAGGAGAAGCCCCAAAGGTACTTCAAGTCCTTCATAGTTCATTTTCACAAAATACACTAAATTGGGGCCAAGGCCATAAGTAAAGGTTCTGTATATAAAGTCTAAATAATAAAGCTCCCCAAACCTATGAGCTAGGAGTAGAATCCAATTTTTTCTTGAGATGTTTTGCTTCCAAAGTTTAGAGAAGAAAGAAGAGGATTGGAGAAGGATAATAAGCTAAATGTTTGTACAAAGGACTGTTGGTGAAGACACCAAAAGGATTAATGTTCCCCACCGGACGATTATTGTGGCCAGGAGGCCCAAAACTAAGATT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MKRKFTRSSIEEELIRLFMNYSRGYPWLSGCWLKDKARILWIEIQAPSYGLPRKSESPELPLHSLQLFACVDLNRKSTCDILASNAVVASKQLPLFSKTSNRRIDGQHYSITCGIDKAKPLISQEFEPWGSCGFADLKETLQRHIGRIYIVGKEVGYVLVSLNGLQGNKRGHTINFTSWTHSSNEGLDAWTLYTRQGVGRMASNSNHRHPKESSKRPTGSTLRPRGLSASNRVLCCVQGSCPVSGSCVQRGGAGNLVPDLVRSISYGMVRGSTSLASNPLEVKKVTRVGV Homology
BLAST of CaUC10G187740 vs. NCBI nr
Match: KAG7014909.1 (hypothetical protein SDJN02_22540 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 74.7 bits (182), Expect = 1.5e-09 Identity = 35/46 (76.09%), Postives = 37/46 (80.43%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC10G187740 vs. NCBI nr
Match: KAG6600252.1 (hypothetical protein SDJN03_05485, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 4.4e-06 Identity = 31/39 (79.49%), Postives = 32/39 (82.05%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL246-FR2) v1
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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