CaUC08G142200 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC08G142200
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCiama_Chr08: 2728433 .. 2735825 (+)
RNA-Seq ExpressionCaUC08G142200
SyntenyCaUC08G142200
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATCCGTTGTTCGTCTAAAGCAAAGGAGACCGTCGTTCGTCTGAAACTGGGGAGGAAGCTACGCAAGTTCCTTCGAAGATATGTAGATGAAGGGCCCCCTTCTTCCTTCTCTCTGAATCAATCGTTCTCAGGACCGACTTTACCTTCATCAACAACATCATCTTCTTCTCAAACCTCGTCCATGGCAGTAAGAAATAATCCACTAACACACTTCATTTTCTTCTCGCTAATCTCTCTTAAGCTTCCCCAAATTTTGATTTAAGGCTTGTTTGTTTTTGGGTTTCAATTTTTTTATTTGATTGTTAATTTATTTCCTTATCCATGTCTTTTTCCTTTGGATATTCTTCTTCCTGTCAAATGGGTGTTGAAAAACAAATAGAGGGTTTCATAGTGGCTATTTTTCATCATTCTTTCCCTTTCAGCCGATAAGCCCAAACCTGGAAACAGAACGTTGGTGATTATCAATTTGGGTGTTGGTTTGGCATGCCATTAAGGAAAAAATATATCTGTTGATCTAGTAGGAGAGACAATGTACATAAGCTTTCAAATATATATATATATATGAAGTAAAAGGTATAATAAGGAATTATCCCGAAGGAGTGAAATGAATCCCTCTGTGAGCTTTTAGCCCATTTTTGCATAGTTTTGTTAGTTTGCTAATCTTTGAAATTATGAAATTATTGAAGAATGTTGAGTTAGGTAGGTTCATTTACATCTTAGAAATGCTTTGAGAAGGTTGAGTTTATTATGTATTTAAATTGTAGTTTGGAGAATGGTTGTGTAAAATTATATCGGTTTGAAGTGAGTTTTGGAGGTTCCTTTGTGTGTTCAAAGTGTAGATTGGAACTCATTGTGTGATTAAAGTTTGTGTAATCTACTATTTTGTCTATTGAACATTAGAAAAAAATTGATTTTGAGAATATTTGTCTATTAAAGTGTGGTATGGATGCTATTTGTGTTGTTGCATTTTGTTTTGAGAGTCATTGTTTGACTAAAGCATGATTTATTGTTGTGTTCAAATTTTGTTTTGAAGTTTGTTTGTGTGAACAAATCTTTTTTGGAGCTTATTGTGTGATTAGAATTTGTTTATTTTGAGTGTATTTTGTGTATTGGAAGTCATTGTGCGATTTGGAAATGAATTTGTTTATTTTGATGTGACGTTATTTTTTTATGTCACTTAAGGGTTTTTGTGACAATTTCATGGCTTTAGCGACATTTTATTTTCGTCTCTAAAAACAATGTTTCTTGTAGTGTCTATACCAAGTTTTAGAGATTTGAACCACATAAAATATAGCATGTGAATACAAATTTATACATTGAGTTTGAGATTATGTTTGAGATTGGTATATGTTATAATGTTAATAAATTTAAGCTTAAGTTTTATATTGAATTTGAGATTAATATGTGAATAAATGTCTAGCTATGTTTAAGTTTTATATTATTGTTGCTATTAGTGTATGGGTAAATACATAATGTTTAAGTTTGAGTTAAAATTTATATCATAGTTCATATACTTATATAAATTTGTATTTTGTAGGTAGCTTAAAGGACCAGCTTCAAGAAGGATCTCTTAGAAAGCAAAATTAGGTTGTAGATTTGTATTTTGTAGATCTGTAATGTTATTTTGGTGTTAATGTTTTATGGATAATATGTAATGTTTAAGACAAAGATAATATGTAATGTTGAAGATAATCTTAAATGTCATTTTGGTGTTTGTGTTTCAATCATGTAATTTGTAAGATAATATGTATTGTTATTTTGGTGTTAATGTTATGGAAGAAAATTAATTAAATGTTGAATATTAGTTTATTTAACTATATTTGTAAAATTTAAACAAGTTTGATATTTAATCAATTATAAAAATTTAAAATGAAAAAAATACCTCTCTCGACACCAAATTTAAAGGTGGTGTCGAAAAACACAACATTCATAACATTTTGTTAAGACTTTTCCTGACACCACATTCACTTTTCCTGACACCACATTCACCTCTCCCAACACCCCTTCGTATGGCGTTAGGAGAAAGGCTTTCTCCCGACGCCCAACCACATTGCTTGAATTTGGATTTCCATTGTCTAATTAATTGCTTGAATTTGGATTTCACCTAGATTAGTTAGAAGAATATAATGCTTTTCGATTGGAGTCCCTAATCAACTTCACAACCTACCTTAACCTTTTGCTTCTTAGCGATTATTTCCCTAACGATTATGTATTAGGTAGTAATCTTAAGCTATCAATCAATTGAACATGACTAATTTGTCAAATAATCCCATACAAAAAGGATTGAGATTAAAAATAATCATAGATAAATTCCATTAAGAAATACGAAAATTACATAAAAGGTCCAGCCCAAAAATCTCATAAGTCAACAATGGAGTAGAAAGAAACCAAACAACCCAAGCTAGAAGCTCGCTTTAGCCTCTAATCATGCTTCAAAATGAAAAAAATTACAAGAATCAAGTCTCCAATGGTGAAGAGAAGTTATAGAGAAAAGTGCCCAAAATGGATGCTCTAAACAGTGAAAATGGTTGCTTTCCGAAGTTGACCTAATTTTGAAAAGAAAGCAGAACTTATACAAATTTGCGATGGCACCGTGACTCTGCTTCGAAATTGTCCCTCTGGAAAAGACGTCGTGCCGCAACGCTATGGCACTCTCGTGTGCAACTCCCGAATGTCCATCAAAATACGTAGCACCGTGGTGCTAGGTGCTTCCTTGCATCTAGCAAAGAAAGCTTCCTAGAAAAAGTGCAGCAGATGCGCCTAGGCAATAAGCGTTGCACTGGACCTTCAGGGACAATTCTATAATTTTACCCATCTTTCTTCTTTGATGCATTTTTTGTCCAATTTGCTCCATTTTCGCACCGTTTTGTGTCTAAGGCTCTGTTTTACCCTTAGGATGCTCAATACCTATAAAATAGCACTTTAAACTCATTAGATAGCATAACGGCCTCGAATTAAGCTAAGGAAGATAGCACATTTCATGTGCTATCACCTTGCTATTGAAGTACTCAAGGAAAGTTTGAGATCGAGCAAAATTTCCTTTAACATGAGGTGGTTTAATATAATTTGAGATCGAGCAAAATTTCCTTTAACTTTGCATAAGGTTTTTAACTTCATTTTTGAAATGCCAACATGAGCACAACTCAATTGGCATAAACTTGTGCTATAACCTCGAGTGCGTTTGTGGGAGATCTTTGTATGCTTCATCTCTAGGATCGTTATGGCAACCCTAGAGGGGGGTGAATAGGGTTTATTAAAATTAATTTAAAATTTTTACTAATGTGGGCCCAATTAAGCGAATTAATAAACTCTTTGCAAATAAGTAGTTTAAACAACATTTTTTATGCAAACAAATTCACTTTGAATTAAACAAGAAATTAACAATCACACTTTAAAGCACCCTGTTTAATTCTAATAAAAAAGATTGGTAATGAATATAGAAATTTAAGAACAACTAATATGAGCAATTAATTTCAAGAATTAAAAATTGCAATTAATTTCATGCAATAAAATATAGTAACAAAAATTAATTGCAAAAATAAATTAGGAGAGGGATAGAGAAAATGACACCGTGAATTTTATAGTGGTCTGACAAAACCGGCCTACGTCCACTTCAAGCTCCTCTTGGGTACTTCACTAGAAGTCTTTGACTCTTTCCACGGCTTAGAGTCGAACCGCTACAACGTTCTTTTTTCGGGCGCAAGAACAAACTCGATCCTTTCCATGGTTAAGGATCAAACCGTTACAACAGCTCTTTTTCTCGGGATCAAGAGCCAACCCATACAAAAATTTGGAAAAACAAAGAGCACACTTGACAAACTCTCTAAATAGAGTGGATTTACAAGTTTAAGCACTCCACAAATAAATACTCACAATACAATATATCTCTTTCAAGAATAAAATGAAAAGAAGAAAACTGAAGTTTGGAGAGAGAGAAACAATGGTGGTTTGGTGAATTATGGAGGATTTAAAATAATAAGAGTTGTAGAATTTTGGAGAAGATGAAGTGTTTAAAAAGAAATGAAAGTGGGTGAAAACCAAATTAATTTGGACCATTAGATCTTTGTAAAAGAAAATTGAATGGTGGAGATTTAAATTCAATTAGCCGTTAGTCACAAACATATAATAATATTAAATTAATCTTTTTAAAAAGCAATTAGCCGTTAGACACAAACATATATAATAATATTAAATTCATTTTCTTTTTTTAAATTCATTTTCTTTTTAAAATCATTTTCTTTTTAACATCAATCCAAAAATAAAAAACCTACCAATAGTCACTTCTCCATTGCTCCAAGTGGCACCTTTCAATTAGTCCACTTTGATTAAAAAAATCTACCACGTCATTAGCTCGGAATTTTTCCATTAAGCTTGTTTCGGTCATATCTTCTTCGTTTGAACTCCGATTTGAGTTATTCAAATTGCATTGGAACCGTTGTTCCAAGCTCCACACAATAAGCACTTCAAAACACTCAAATAGTTAATAAATAAAATCAGGTTTGTTATCATCAAAACATTAATTAATCAATCCATTAAAACTAATTAATTTGAGATTAAGAGCCAAAAAGCCAACATCATCGATGTCATAACTCCACAGGCTTGTGATCAATTTTCATCTATAGTTTCTTCTCCTTTTTCAAAGGTTCTTTTCATTCCTCCCTAAGCTATCTTATATGGGAGTTAGTTTTGATTTGTGGGTTTCACAATTCTACCCCTCTTAAAAGAATTTTGTCCTCGAAATTTTAACTAAGCCAAACAAGAAATTCTTAAAAGATTACAACTTTATTGATGATAATCCTTTATTTATTTAACATCAACTACAACAACAACAACATATTCACAGCAAAACAAACAATAACAATAATAACAACAACAGTAATATTTTTCCAGAAAGGAGATTTCTTCTAATACCTGTAGTCTTTCCATCAGTCTTTACGGACACCTTGAGCATTCAACGGGCAATTTTTACAGTAGTGTCCAACTTGTTCACATCTGTAACAA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mRNA sequence

ATCCGTTGTTCGTCTAAAGCAAAGGAGACCGTCGTTCGTCTGAAACTGGGGAGGAAGCTACGCAAGTTCCTTCGAAGATATGTAGATGAAGGGCCCCCTTCTTCCTTCTCTCTGAATCAATCGTTCTCAGGACCGACTTTACCTTCATCAACAACATCATCTTCTTCTCAAACCTCGTCCATGGCAATCGAAGCTCTGCCGGTCATCGCTCGAGCCACCCTATCAACAGTAGGTTGCTGCTGTCGTTCGCATGAAGCTTCAGACCAGCGGGTTGTCGTCGCCATTTCGTTCGTCCGCTGCCAGTCTGCTTATGCCACAGCCCAACCACCCACATTTGGTGCCATCCGTAGTCGTCGTCCACCGCCTCCTCCGTTTCTGTCACTTTGCCATCGGACGTCTAGCCGCTGCCGGTCGGTTTCGCTTCTCAATCTTTCTTTTCAAGATGTTTTGGTTTAG

Coding sequence (CDS)

ATCCGTTGTTCGTCTAAAGCAAAGGAGACCGTCGTTCGTCTGAAACTGGGGAGGAAGCTACGCAAGTTCCTTCGAAGATATGTAGATGAAGGGCCCCCTTCTTCCTTCTCTCTGAATCAATCGTTCTCAGGACCGACTTTACCTTCATCAACAACATCATCTTCTTCTCAAACCTCGTCCATGGCAATCGAAGCTCTGCCGGTCATCGCTCGAGCCACCCTATCAACAGTAGGTTGCTGCTGTCGTTCGCATGAAGCTTCAGACCAGCGGGTTGTCGTCGCCATTTCGTTCGTCCGCTGCCAGTCTGCTTATGCCACAGCCCAACCACCCACATTTGGTGCCATCCGTAGTCGTCGTCCACCGCCTCCTCCGTTTCTGTCACTTTGCCATCGGACGTCTAGCCGCTGCCGGTCGGTTTCGCTTCTCAATCTTTCTTTTCAAGATGTTTTGGTTTAG

Protein sequence

IRCSSKAKETVVRLKLGRKLRKFLRRYVDEGPPSSFSLNQSFSGPTLPSSTTSSSSQTSSMAIEALPVIARATLSTVGCCCRSHEASDQRVVVAISFVRCQSAYATAQPPTFGAIRSRRPPPPPFLSLCHRTSSRCRSVSLLNLSFQDVLV
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC08G142200.1CaUC08G142200.1mRNA