CaUC05G083940 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCTTGTGGAGTTCCATTCATGTAAGACATGTCGTTGGGTATTACATTTATGTGGTGATGTGGATATATCTATTCATAGTTTTATATGTCTACCGATTTGACTCCTGATATGAAGGGCTGGTTTGGATTAAATAAATTAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAAAGATATTATTATTTAAATTCTTTTATTAAAAAAATTGTCTAGTATCTACTTTAAAAATCTATTTTGAGTGGTTTTCAAATAATTTAATTTTGAAACACTTGCAACAAGGGCAAAACAAAATACATTAATTAGGCTCATGGCCCACATGTTTATTGTTTGCAAAAATGACATAAGCTCACACATAAAAAAATGTAAAATGTTGCAAATGCTCCCAATATTGATATGCACTTGATTGATATATTTGATATACTTGATAATGATGTGTTTGACTGATATACTTAATATACTTGATAATGATGTACCTGACCAATAAACTGTTGATAAATTTGTTAATAATTTGCTCGTTTATACTGCTGATAAACTTGATACACTTGACCGATCTACTATTAATAAACTTGATAATGATGTACTCTTTTATGATAATACACTTGATTGATATGTTGTTGATACAATTGATTAAGATATTGTTGATAAACTTGATAATGATGCACTTGACTGAGTTGATATACTTTTATAATGATACACTTGGATTTTAAATAATAATAAAAGAAATTGAACTTTTCTCTTTCACCAACCAACACTCCTCCACTCCGTCTTTTGTTAGCCACTACTCCACCTCCATGTCGCTTACTTCCATCGATCACTGCACGACTGATCGCCAATCCACATTTTTCTCTTGCCCTCTCTATCTTTCTTTCTCCCAACATCTCTCTTTCACTAACTAGCACTGTTTCACACCATTTATCGCCTTCCACCGCTTACTTCCATCGACTGTCGCACGCCAGTTACTGATTGCCATTTTCCTCTCTCTTTATCAATTGATTGTTTAGAGCAAATATGGGAAAAAATAATAATTAAAAATCCAAATTTGAAGTTTTTGCCCTACTTGCAAAATATCAAATGTGGGTGACATACCTACAAAATAGCATATTTAGATTGCTACCTATTGAACTTTCCCTCAATTTTTTCTAAAATTACTTATTTTCAGAATTAAACACTTTATTATACGATAAACTCATCCAAAGAGTAAATTGAATTTTTTTTTTATATGATAAGCACATTTATGATACTTAAAAAATAGGCACCAAAATGTATAAATAATAAATATTTCAACTTGTTTAAAGAATATAAAATATTTGTTTATTTGTTAATATAGCTTTTAAAATTTGTTGTTCTGTATAATATTTGTCATAAATTTTTTATCGACCTTGACCTTTTAAATCTTGAATCTAGTCTCACTTGTTTTTGTTAACTAGATAAAATAAACACAATTTTGAAACTTTAATTATAATTCTATTAGATACAACTTTAAAATAGATATTTGATCAATTAATTTTTTAGTTTGAATAAGTAAAATTTATATGACATAGATTGAGATTGGGATTGCAGAGACTTATTAAATATTTTTTAGAAGTTTATAATCTAAAATGAACATAAATTTGGAAATTTAAAAGTTGATTAGGGACAATTTTCAAAATTCAACAACTAAAACGAGATAACTGCAAAAGCAATTATTAACCAAGGAGTGAGGCAGATTATTTTGGGATAAGACCCCTATCAACCGCCAAACATGAACAATTTAGGTTAAATACAATTTTAATGTTTATATTTTAAATCTATTTTATTTTAATTTTTAACAGTTTAATTAAAATTGTTTTTTAAACATTTAATTAAGATTGTTGATACAGTATAATTAGTTTAATTATTTATAAATATAAAAAAATTTTATTGTCTATTAGCAATAGATTGCAATAAACTTCTATCACTATAGTCATTTTTTTTTTCTATTTACAAATAATTTTTCTATATTTTTACTGTTCAGTTTTAGTAGAAAACATTATTAAAAAATCGATTAATTTTAAAGTTTCGAATAATAATATATGAATTTTGAAAAATGAAATTCTCTAAAACAAGTTGACGCTTATAGGAAGATGCTTTAACATAATGTTTTCTTGTTTGAGAAGGCAAAACTGTAAATAAAAAAAAACAAAGCACGTTTTCTAAAATAAGTCATAAATGACGTAGAAAATAACCAAACCAAACCTTTTTCTTTTTCTTTTTATTTATTTATTATTATTATTTTTATTTTTATTTTTATGGAAAATCAAACCAAAATTTAAAATACAAGAAAGAAGCTTATTTAAATCAATTTAGGTAATCATTTAGGCTTCGTTTGGTAATTATTTTCCTTTTTTGTTTTGATTTTTGAAAATTAAATCTATTTCCTCTACATTTTTTACAATAATTTGCATCTTTCTTAAGTACAATGGTTTAATTCTTAGTCAAATTCCAAACACATAATAGTAAGATGCTCTAACACTCTTCAATAGACTCAGGTTTGAATCATTCTACATGTCATTCCTTTAAATTATACTTTCAATTTTGTGTCCACTAAATTAATAATAGATATTAGGATTCAAAATATATATATTAAATTCATATATATACCAAAAACAAAATTAAAAATTTACCCCTCATTATATAAATTCTAATTGGTCAATTAATTTTTAAAAAATATTATATGTCAACAACATATTAAACATAAATTGAAAGTTTAAAAGTCTATTAGATGTTTTTTTTAAGTTCAACGCTGTATAAGACACCAATTCAACAATTAATGAACAAATTTGTAATTAAAATTTTGTTTACTCGTTGTAATATTTTTGTGAGAAGTTTCAAAGTAAACCTCCAAAGACAAAACTTCTAGATCAATCACTCAGTTTCGTCGTTTACTCTTAATTTTTTTTTATTTTAATAAATTAATAACAAAGTAACCACGCACAATAATATCGAATCTTTGGTAAGTATGATAAATATTAAAAAATATAAATAAATTATATGTCTATGCTTAGGGTCTAAAAGACCGTGTATCTCATAATCTTGCCATGTATTTCCATAAAAAATTGAGAGATTTTTAAATTTTCATAAAATTCAATTTATTTTATTTTAATATTATAATTCTTTGGTATTCGTGTTCTCGTTTTTATGTTATTTTGCTCCTCAATCAAATTTTACTAAAAAATGTATTATTAAAAAAGACAAAGCTTGTTTATTTATTTATTTTTATTTTTTAAAGTTGAAGATCTAGGAGAGACATTATTAAGTCATGCTCAACTCATGTACAATTATGCTAATAACTATGAGGTTCGTAATTCAAATTTCTATTTCCAATTGTACTAAAAAATTTAAAAGATACATTATTAGAGTTGAAGTACTAAAATTTGGGTGTTTCTTGGGCTACACGATCTTTTTACAGTCCACGCAATTCTACATTTCTATATTTGTAATGACAAAATTCTGAAAGTATAAGAATTCAAATCGAACAAGTTCTATAATATAGGAATAAAATGGTAGGTGGTATATTGACTAAAATTTAAAGTAAAATTACAAATTTAGTGATTGAACTTTAAAGTTTATATTTATTTGGCTTCTAAATTTTTAAAATCACAAACTTAGTTTATGAACTTGACATCAAACTAAAAGTGAAATTGAAATTTATATTTAATACATCGATTTATTTTATAAAAAATTGACCATTTTAAAGATACATTAAAAATATAATTTGAAGCCTAGAAATTTGTGGGGGTAATTTAACCTAAATTTTAAAGATGAAAACAAATCTTTTGAAAATGGCGAGATCAAAACTGAATGAATAAATTAGTTCGCAACTAAAGTATGTTGTGTAAAAGGTTTTTGATTTCCAAAGAAATTTAAAATCGATTAGATTGTTTAAAATTTGAATTTTGGGAGGCCGGGGTGGCTGTGCGTTGGATTTCATAATTTACACACTGGAAATTCCCATTCTGTGGGTCTCCCATTTATAAAGGCACCCTGAGCATACAAATTCATCGTCCACCAGGAGCCGAAGGAGTTGCCGATCCACATCCGCCCCGAATTTAGCTTTCTCCATTCTTCAACCTCGGACTAACATTAAGAAATATGGGCTTCTTCTCCTTCCTTGGACGCCTCCTCTTTGCCTCCATCTTCATCCTCTCCGCCTGGCAGATGTAACTTCTCTCATATTCCTCTCTCAATCTTTAGATTCATCGGATCTTTAATCAATCCATTTCAATCTATATGTTTCTTCCACTTCGACTCTTCTATTGTTCTACGCTTTTCTTGCTTTCATTCCCGAAATGGGTCTTTGGGTTTTCTAATTTTATTTTGTTAGTTTCTTCTTACTGTTTGTAAATGCCCAGTGATTGTGTTCTGTTATGGAATTATGTTTGGCTGAACTTTCTACTTCAAATGGGAGAGATTTATTAGGGCCCCATTCATTTTCCTTCGATTTGTTGTTTGCGATGAGTTGGTGTTTAAGAATGATTTCTACATTATTAGTTTCTCATTTTCATTGAGATTATGGACCATTTTATATCTGAAATTTACATTTTCTGGCTTTGGTTGAGAGTGGAGCGCTGAAAGCGTTTTCACGAGAAGCCATTATTGCTATTAGGAGATTTTATTAGTTCTATGCGTTGGTTTTGATACGAAGAAAGTTATACTTATAGGGCATATTTATTTCTGTAGGGGTTTAAGTATTGATTTTATCTTTTCAAACTTGAATGAACTATGTTAAATGAGGGGTTAGAAGACAATTGCATTGAAGATCTCCCATTTTACAATTTTATGTTTCAAGTCATTCTACTTATGTTTCTCATGCTGGTCCTATCTTGGTTCTTACTTCTGAATTTGAGGGTGAAATTTTCCATTAGCTGATTATGTAGACATTTATATCAAATTTATAGTAATAAACTGGACATTTGATGATATCGAGCAGAAATGCTGTGGTAATGAACTCCCCTTGGGTACTGATATTGTTGTCCATTT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MSCGVPFMHPEHTNSSSTRSRRSCRSTSAPNLAFSILQPRTNIKKYGLLLLPWTPPLCLHLHPLRLADKCCGNELPLGTDIVVHLRFNEFGNNGGPAAAELSSKVAVLRRNLSSKLGVAIPDIDVRHLVAISLSLKGIGGLLFVFGSRVGAYLLLLQLVIVTPVLFDFFNYSPQKPTFGIPLPDFLQDYLKSVVPSQLISERGSNLVVINPGSANVRIGLASQDAPFNVPHCIARYTDQVPKRNVQDQMLNSQVTTAQHMERERAYDVIASLLKIPFLDEEVANSSFPRKMGRVDGHNMHNGKKDSVFSWTDVHERDPTSPMAAESSSSKDVNHEPLDQHVDTDSKELSSSVIKYRQFICGEDALKISPSEPYCLHRPIRRGHLNISQHYPTQQVLEDLHAIWDWVLIEKLHIPHSERNLYSAILVVPETFDNREIKEMLTIVLRDLRFGSAVVHQEGLAAVFGNGLSSACVVNMGAQVTTIICIEDGVALPATAKTLPFGGEDLSRCLLWTQRHHQTWPPIRTDILSKPVDLLMLNRLKESYCEIREGEVDAVAVVHSYEEGTPAGSHKTRLTALNVPPMGLFFPMLLVPDVYPPPPRAWFHDYEDMLEETWQTEYSRRPDVPDNVYPGVNVNFPMWDSYPVYATKPKKEEKVGLAEAIASSILLTGRIDLQRKLFLSIQLVGGVALTRGLIPAMEERVLHAIPSNEAIDTVEVSFGLDSSKYLKCDWPRKTGWLTIIGVLDFGRDAWIHREDWINSGIFTGSGRKYKDSYYLQAQAMCYMNS Homology
BLAST of CaUC05G083940 vs. NCBI nr
Match: XP_004134078.2 (actin-related protein 9 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN56880.1 hypothetical protein Csa_011036 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1133.2 bits (2930), Expect = 0.0e+00 Identity = 557/597 (93.30%), Postives = 573/597 (95.98%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC05G083940 vs. NCBI nr
Match: XP_038877353.1 (actin-related protein 9 [Benincasa hispida] >XP_038877354.1 actin-related protein 9 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1132.1 bits (2927), Expect = 0.0e+00 Identity = 560/597 (93.80%), Postives = 572/597 (95.81%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC05G083940 vs. NCBI nr
Match: XP_008438553.1 (PREDICTED: actin-related protein 9 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1128.6 bits (2918), Expect = 0.0e+00 Identity = 556/597 (93.13%), Postives = 573/597 (95.98%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC05G083940 vs. NCBI nr
Match: XP_022147444.1 (actin-related protein 9 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1097.0 bits (2836), Expect = 0.0e+00 Identity = 537/597 (89.95%), Postives = 565/597 (94.64%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC05G083940 vs. NCBI nr
Match: KAG7028838.1 (Actin-related protein 9, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1080.5 bits (2793), Expect = 0.0e+00 Identity = 534/597 (89.45%), Postives = 560/597 (93.80%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC05G083940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LSW2 (Actin-related protein 9 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARP9 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 735.7 bits (1898), Expect = 5.4e-211 Identity = 367/600 (61.17%), Postives = 457/600 (76.17%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC05G083940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2XQX0 (Actin-related protein 9 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=ARP9 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 727.6 bits (1877), Expect = 1.5e-208 Identity = 370/604 (61.26%), Postives = 450/604 (74.50%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC05G083940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0JF03 (Actin-related protein 9 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=ARP9 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 726.1 bits (1873), Expect = 4.3e-208 Identity = 370/604 (61.26%), Postives = 449/604 (74.34%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC05G083940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B5X2S3 (Actin-related protein 8 OS=Salmo salar OX=8030 GN=actr8 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 185.3 bits (469), Expect = 2.7e-45 Identity = 168/630 (26.67%), Postives = 279/630 (44.29%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC05G083940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: D2I1E3 (Actin-related protein 8 OS=Ailuropoda melanoleuca OX=9646 GN=ACTR8 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 179.9 bits (455), Expect = 1.1e-43 Identity = 159/629 (25.28%), Postives = 276/629 (43.88%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC05G083940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L4G5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G141760 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1133.2 bits (2930), Expect = 0.0e+00 Identity = 557/597 (93.30%), Postives = 573/597 (95.98%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC05G083940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AWS4 (actin-related protein 9 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103483619 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1128.6 bits (2918), Expect = 0.0e+00 Identity = 556/597 (93.13%), Postives = 573/597 (95.98%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC05G083940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D110 (actin-related protein 9 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016365 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1097.0 bits (2836), Expect = 0.0e+00 Identity = 537/597 (89.95%), Postives = 565/597 (94.64%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC05G083940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FPT1 (actin-related protein 9 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447353 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1078.2 bits (2787), Expect = 0.0e+00 Identity = 533/597 (89.28%), Postives = 559/597 (93.63%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC05G083940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IBZ5 (actin-related protein 9 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111474027 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1077.8 bits (2786), Expect = 0.0e+00 Identity = 531/599 (88.65%), Postives = 561/599 (93.66%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC05G083940 vs. TAIR 10
Match: AT5G43500.1 (actin-related protein 9 ) HSP 1 Score: 735.7 bits (1898), Expect = 3.8e-212 Identity = 367/600 (61.17%), Postives = 457/600 (76.17%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC05G083940 vs. TAIR 10
Match: AT5G43500.2 (actin-related protein 9 ) HSP 1 Score: 733.4 bits (1892), Expect = 1.9e-211 Identity = 366/599 (61.10%), Postives = 456/599 (76.13%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC05G083940 vs. TAIR 10
Match: AT1G04340.1 (HR-like lesion-inducing protein-related ) HSP 1 Score: 109.0 bits (271), Expect = 1.8e-23 Identity = 51/101 (50.50%), Postives = 78/101 (77.23%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC05G083940 vs. TAIR 10
Match: AT5G43460.1 (HR-like lesion-inducing protein-related ) HSP 1 Score: 105.9 bits (263), Expect = 1.5e-22 Identity = 51/96 (53.12%), Postives = 73/96 (76.04%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC05G083940 vs. TAIR 10
Match: AT4G14420.1 (HR-like lesion-inducing protein-related ) HSP 1 Score: 94.7 bits (234), Expect = 3.4e-19 Identity = 46/101 (45.54%), Postives = 66/101 (65.35%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL246-FR2) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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