CaUC03G056580 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC03G056580
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCiama_Chr03: 7295800 .. 7302885 (+)
RNA-Seq ExpressionCaUC03G056580
SyntenyCaUC03G056580
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
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ATGTCACTGTCCCCACTTTGTGTGGTAATTTCTCTTATTTGCATATTATTTTTGAGGAGACTATTGTTTTGTAGTTGTGTTATGCTTCAAGTCTTGTAAGTATGGTTTTGATAAACAAACTTATATTTCACAACCTCAAATATGTTTCTCCTTACCCTTTCTAAAGTGTAATTATAGGCCACACCAAAGAGTAAATTTATGGTGCTTTCGAGCAACCTTTGAGAAAATTTGTGTTCAACTTCAAGCTGGTAAAAAAAACCTTGTTTGCGCTGCATGAAAATTTCGTACCACAGTTTCGCTCCATGACAAGTGTGTGCATATATGTCTCTTGTTATGTTATTTGTTTGTTATTTTATCATTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTTTATTATTTTATTTATTTATTTATATTTTTTTCTTTTCTCTCCCCTTTTTTTTTTATTTCTTCCCTATTTTGTTTTCTTTTATTTTTAGTTTCACTATTTATTTATTTATTTTATTATTTACTTATTATTTATTATTATTTTTTCTTTTATTCCCCATTTGATTTTTTCCTCAAACTTCTTCCTCCATTTCCTCTCTTCCCCCATTTGATTTTTTCTTCAAACTTCTTCCTTCATTTCCTCCATTTGAATTCCCTAACAAATCTCAACTCCAAACCTTCCGCTCTCCCTATAACTTGATGAAAAGATTTCAATGAGGAAGAGGAGAAAAGGAAATTAGAGTGACAAATTAAAAAAATATACATAGTGAGAGACAAAATACATAGAGTGGGAGGAGAAAAAGAAAGTTTGTGAGGTTGAAAAAAAGAAGCTGTGGGATTGAATAAAAAAGAAGTTGTGAGGTTGAGGAAGAAGGAAATTGTGACGGAGAAAAAAGAAGTTGTGAGATTGAAGAAGAAGGAGAATAATAAGTGAAAAGGAAAACTTGAAGGGGAGAAAGAAAAAGAATAAGGAATTAGTAAAGGTGGAGGTGAATCTAACTTATTCTTTTATTTTATTTTATTATTATTTTTCTGTTTTATCTTATTTATTTAAATTTAATTTTTATTTATTATGATTTTTACTATTATTTCCTCCCTCCTTAATTTGCATCATTTTTATTATTTTCTTATCCTATTATTTGATTTCCACCAATTTTTTCTTTTCATTATTATTTATTTTCTCTTTCTTCTCCTCATTTCAACTATTTTTCTCATTTATCAAATTTATGTTCTTATTTTCTTAAAGATGACTTCAAATATTTTTTTAAAACTTGTTTTATCTTATGTTTCATTTTGTGAGTTTTTATTAATTATTGATTCTCAATCTCAATTCATTAGATTCTAATCGAGGATTTTTTTTTTCAAATATGAAATTTCTATTAAATGATTTTGAGTTAAACTAAAGGATTAAAACCTAGAATCTTTTTAAGCCATTTAATCAATGGATAATATATAGTTTTTAATTTGGTACCATTAAATATGCTATAGTTTTTATGGTTGAAATGCCTTACTAGTATTTCAAATTTCTTGGATTTCAGACTTCACATTTTTTTATTACTACATTAAAATTTAGATTGACAAATGAATTTCAAACCTCGTCATGACTCCTAAATGAACTTCAAATTAATTATTATTTGGTTTCCAGAATAAAACTATACTTCATTTAAATTTTAAATTTCAATTGAGTTTCAAACATTTTATGAGATTCTCCATAAATCCCATGACGGAGTTACATTGCTCTGGAAGAATATTACATAAAATAACTCAAACATAAATGGATAGACAATGTCGCTCATGAAACTCAAGTATACTTTATTCTTAAAGTTATAGTAAATCTTAGTGAAACATTTCTTTTAAAGTTTACCAAATATTAATGTTTTAAAATATAATGGACTAGGTTAATAATTATGTCTAGGCTAGGTACTTAGGTTGACTGTAAGGGAACACCTCTACTTGGGAGTTATTTGATTAAACTTGTTAGCTTGCATTTTACTTTTTTTTTTTTTTTTACAAATTTTGGATAATAGAATAAAATGTTTTCAAAATGGGTGTTGTAGGGTGCTAGTACCTTCCCTACACTCAACAACCCCCAAACCCATCTTTGGAAAAGTTGACCATTTTTTTTTTTAAATAGGTGACCAATCACAGTTGGTGGCGACTCCAAACCTTTTACCTCAAAAGAAACCTTTAGGGAGGGACGTCGGCCCGCTCCGCGTCGCGATGACGTTGTAACATGCATATCTTGCATATGAAATATATTTGGCTTCTAACCATAATATACATTATCAAAGGTTTGGGACAAACTATTAGCATTTTCAAAACAAATTTTTTTAATTTCACAATCATAAAATTTGTGCCCTTATTTTAACTGTTTGAACAACTAACCCCGCACTACAACAAAAAAGTCTTTCTATAGCCTTTGAGTATAGGGGCTTTTCAAAATAGGCTATGGAACTGAAAAAAACAAAATACTAAATTTTTTGAAAAGGCGCACGGCAAAAAAAGAGGTGGAGGGCATAGGATCTAAAAAGTGTATCCTCCTATTTTCTTTTTCATTCTACTTTCTTTTCTCTCTTATCCTTTGATTTTCTGTCCCTCTTCTCCACTTTTGTCTCTTTCTTTAGCTCTCTCACTCTCTTCTTACAAACCTAAAAATCGAAGACAGGGCCCCTATGTGTGTAAAGACGGGATCCCACGCCTTTCGCATAAAATTTTGGGTACTTTTTTAAACAATGAGCAGTGAAGATCCACAAAATGGTGGGTCTAATACCAGAGACGGAGGGAGGGCAAGGATTGGTGACAGATCTAATCTGGTGGTGGCAGATTCTCAGTGACAGAAGATAAGTGTAGATTTGATAGAGGCTCAATGGATGAGGTGATGAGCGGCGGAGCAGAGTGGGTCTGTGCAAAAAGTCTCGTACTAACGGAGCAGTTCTAAGTGGTGGAGATCCTTCTTCGAGCAGAGTGGTCTGGGCAATAGAGGTTTTTCTTTGAGGTAGGTTTTATAAGACCTAAGTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATTATTTTTTTAATTGTTACTTTGCATTTCTCTTATTTTTTTCCCTTTTCGCTCTCAAAGATATTGCCATTTTTTCTTGTATTTTTCAAGCACAGTGTACTTGTAAACCATATTTGGCACGCGTACAACAAAAAATTTGAAGCCTTACCTGTTGCCGAAGATGATGATTCGATAAACCCATCTATTTTTTGCTTGTTCTAAAAAAATGTAATGACCTGACCCCTACATAACAAGATCAGACCGCTACGACATGCATACCTAAACTTTTCTATCTTGAGATAAGTTTTGGTCATAATTTTTAAAAGTAAATATCAAAACTTCCATTAGTTAAGTAAAAACTTTACAAAAAGTTTCTTTTAAAAAACACCAAGATCCATAAAACATTAGCGTAGTGGAACAAAATGCATATATGAACAAAATGATGAGTTTGATGGTTAGCCCTCTGAGTGACATCCCGTCATGTCTTCTACGTTGTGCCCTCACCTACAAAGTTTATGGAATAGGATGAGTATATAATGTACTCCGTAAGTAGCTCTCACCTAAGGTAGTGCCCCAATCACATGCAACATGTCATGAAAACATAAGTAGAATCAGAGTCACTTCCAACATCAACCTTTAACATTTCGCCCTGATAGGAAGATGTGGACTTTAAGCGAAACTAAATCATATGATGATTAGCATGTCATGCAGTCAGTAGAGGCAAAACATCATCCTTTAACATAAACGTAAGATTAGACTAGAGGGGTGCAACCATACATACCCTACTAGCGCCTAACACAAACATAACGTAAAGATTGGGTCTAGAGAGGTGCAACCATACATACCTTGCTAGCCCTGGAAGCATAACCTATATCCAAATAAAACTTGATCTTAACATAATCATGAGCATACATAATGCATGGGGTCCCTTATAGATAAAGGTATTTTAAACATATAATGCAACATAACATAATAATGCAATATAACAAGGGCACTCTACCATAAGAACACTTAAAGAGAGGGTGAGATAAGCTACTTACCTCTTAGGTTGCTTCTATATTTTTCTTATCCTTGGCTTGGAATGATGTGAGAAGACTTCAATAGAAAGTTTATGGAAGAAAAGTTGGGGGATTTTTTATGAGGGCTTATGGGTGAGAGATTTGGGTGGTTCTTTCCAACCTTGTGTTACAAATGAGCCCACATGGGGTATTTATAGTCATCCACCTCCTTAATGGATGGTGAGGATTGATTTGATCCAATGGCTAGGATCTTCCCTCTACATTATTCTATATCTTTCTATACAAGTCCATACTTCTCTATATATTTTTAGATTTCTCCATACAATTCTAGCTTTACCTGGAACTTTCTAGACTATGCTAGCTCTTCCTAGACTTCTATAGAATTCTCTAGAAACATCTAGTATATTCATACATCTTCTAGAACATTCTAGAGGTATCTAGGATATTCACACACAACTTTCTAAAGATATTTATGAGATTCATGGATGTTCTAGAACTTTCTAGAACTTCCTAGCACTTTCTAGAATCTTGTAAAATTTTTTGGAAGCTTCTAAATCTTTTGCACATTTTGATGGTCTTGAGCATTGTGGTGCTCTTGGTTTGGGTCATCTCCTCTTGGGCGTCTAGAATCGAGTTAGGCCGAGCCTTATGAACAATTAAATTTAAGAATTCACCATATAATTTCATATAATATTTCCATACAAACTTGGGATGTTATAAAAAATTAGTTAATATTCATTTTCTAATTAACATGATTTCATTACAAAAACTTCCTTTGCTAGCCCATTAAAGCCTTAACCTTCATATGTTACCAATTTGAAGGTGAGTATTTTGATTCTTTTCTATGTGCTTTGATACCTATATATCATTGTTTAATGCCTATTTTTATCTTGTTATTACTTTTCTAGTGAGCAAAGATTTGATGTTTGTGAAATCTTGTTTAACATTAATATGATTTATAACATTTAGTATATCCATCCATTTAACAAATGATATTGTTGCTTCGTTAGCTATTGATTTTTCGCTATAAGAAATATACCTTTTAGCTATTGATTCTTTCTTTGTGCCTGGATGATCACGATTGAGAATGAGCCAATTAAGTTGCAGGTTTATGCTGTTTCTTGTTGCTTAATTTGATTTGCATCTAATTTAATGGAAGAGCATTTCATTCTGTCAGAGTGTGGAGCACGCTTCAGATTTTAATTTGCTTATGCTCATTTCATTTACTTTTAAGTCGGTTTTTTATTATTGTCTACTTATTCAATGAATTATAATAGCTATGGCTTATTGTTTATCTTTTCCAAAGTCATCTTTGATTGGGATGTGCATTAGAAGAGAGAATGAGTTTCGATATTGTATATAATTTGATTTGTTCCTTTTACTTCTAATGAAGTAGGAACGGTTTTGTGTTAACAAGACATATTCAATTTAGCTAATCCAGACGTTCTTTAGATGGCTGGAAATGCTGATACTGATGGCGAAATTTTGCTCTGTAAAATCATTAATGAGTTGACTTACCTTAAACACATGTATTGGGTCTTTTTTAATACTTTTTAACATTTTATTTCTACTAATAGGTATAAGAATCATTGGTGTGATCACAAAGGTGATATACCATTTGCTCAGTCGGATAATTTTTTACATTAATACTTTCAAGACAAAATTCACATGATTATGATTCTATTTGCTCTATTTTACATAGTGAAACTACAACTCGATATAATGGATAGAGGTATAGATGCACGAAATCTTTTACTAGGAAAAGTGACTCCTCACCCATCCCACATGATCTACTTATATCAAAGCTCAACATAAGTTCTTTACTTGTTATTGAATTGTACAGGTATATAATGGTCTAGCTGATCATTGTGCCATTGCTCAATTGGCAAAATAGTTGAACCAGGTATGTTTTGTTTGTGTATGTATGTTTGTTTGTGCAATTGTATGAAGGCTTTGGCTCACTATAGGAAGTTGATGATTAAAGCTGTAATATTATTTTCCAATGTTATTTATTGGTTCTAATACAACATATTACAGTTGTATTTCCTAGGTTGAAGTTGCGAATAAGTGTTTCTTTTGTTTCCGTTGCAAAAGAGGATGTCAGTTATGGAGAAATAATAGAATCAAAGGTTCTCAAAATTTCTATTGTCCATTCATAATCCTATTGATCTAGGTCAATTGTGTGGTATGGTGACTTGCTCATTCAATGATCATATATGCTCTTGTCATAATTTATTATACGAAATGGATATCACATAATAACACATTGCTCTACTTGTAAAATGATGTAGAAAGCTATTGGCATTTAATCTATATGTCTTGTGCTTGAGATGCATGAATATGATATAGTTAACTCATGACTTTCTTTTTTTTAACTATGAACTTTTATTAGATATGAGTCATATATGATGACTTATTATATTCATCTTTTGATCATGGATAGACTGATCAGGGCGTTCTTCTTCTTAATATTCTTTCAAAATACTATGAAGGTAATAATGATCTTCTTTTGTGTATGTAATTTCTCTCTCTTTGGTTTTTACATCTGGGATGGGATAAGGGTGGGAATGGGATACATAAATTTGGAAGTCGTGCTCAAGAATTTGTCTTTGATTGCTATATTTTTGGATGCATATTATACACGTAGCATAAGTGAAATTTGTTTGAAATGATTATTAATCTCTTTGTAATGTTACTGTGTATGAAATGCAATGACTTTTATGAACATTAGTTTGACGTTAATGTTGTTTAATGATTCTTGCATATTGTTCCCAAAATGACATTATTCTTCTTTCCTTGACATCTAGTGCTTCGGTGTTTCATTGGTTTGTTTTCATTTTATTGTTTAACTTTGAAGATCTTTAAGTATAGTGATTTTAATGAAATTTTTCTTTGTAACGTTTAGGAAAATTTTCACCTCAAGCTACAACTTCAACACCCAATTTGCTCCCATTATTTGACTCAATTCAATTCACGGTCCAACTTGCACTTGATCCAACTCGACAACGTCAAGCACTTAAATCTAATGGATGAAATGATACCATGGTGTCATAATCTTGACCCC

mRNA sequence

ATGTCACTGCCACACCAAAGAGTAAATTTATGGTGCTTTCGAGCAACCTTTGAGAAAATTTGTGTTCAACTTCAAGCTGTGAAGATCCACAAAATGGTGGGTCTAATACCAGAGACGGAGGGAGGGCAAGGATTGGTGACAGATCTAATCTGGTGGTGGCAGATTCTCAGTGATGAGCGGCGGAGCAGAGTGGGTCTGTGCAAAAAGTCTCGTACTAACGGAGCAGTTCTAAGTGGTGGAGATCCTTCTTCGAGCAGAGTGGTCTGGGCAATAGAGACTGATCAGGGCGTTCTTCTTCTTAATATTCTTTCAAAATACTATGAAGGAAAATTTTCACCTCAAGCTACAACTTCAACACCCAATTTGCTCCCATTATTTGACTCAATTCAATTCACGGTCCAACTTGCACTTGATCCAACTCGACAACGTCAAGCACTTAAATCTAATGGATGAAATGATACCATGGTGTCATAATCTTGACCCC

Coding sequence (CDS)

ATGTCACTGCCACACCAAAGAGTAAATTTATGGTGCTTTCGAGCAACCTTTGAGAAAATTTGTGTTCAACTTCAAGCTGTGAAGATCCACAAAATGGTGGGTCTAATACCAGAGACGGAGGGAGGGCAAGGATTGGTGACAGATCTAATCTGGTGGTGGCAGATTCTCAGTGATGAGCGGCGGAGCAGAGTGGGTCTGTGCAAAAAGTCTCGTACTAACGGAGCAGTTCTAAGTGGTGGAGATCCTTCTTCGAGCAGAGTGGTCTGGGCAATAGAGACTGATCAGGGCGTTCTTCTTCTTAATATTCTTTCAAAATACTATGAAGGAAAATTTTCACCTCAAGCTACAACTTCAACACCCAATTTGCTCCCATTATTTGACTCAATTCAATTCACGGTCCAACTTGCACTTGATCCAACTCGACAACGTCAAGCACTTAAATCTAATGGATGA

Protein sequence

MSLPHQRVNLWCFRATFEKICVQLQAVKIHKMVGLIPETEGGQGLVTDLIWWWQILSDERRSRVGLCKKSRTNGAVLSGGDPSSSRVVWAIETDQGVLLLNILSKYYEGKFSPQATTSTPNLLPLFDSIQFTVQLALDPTRQRQALKSNG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CaUC03G056580 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC03G056580 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC03G056580 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC03G056580 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC03G056580.1CaUC03G056580.1mRNA