CSPI06G23540 (gene) Cucumber (PI 183967) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGCTCGGTGGGTGGTGGGGTCTTAGTTTTCCAAATGTATTTATTTATTTAAGACAAAAAGGAGCGCACATGGAGGAAGCAGGAAATTTTTTGGGATCTTCGCCGGAGAAAGCTTGTCGGAGAAATAAGAACCATCGGAGCAACGGTGGAGATTTGAAGCTGATGATGATCGTTGATGAAGTTTAGTTTTGTCTATAGTGAAAAAATAGGGATTGGCACTTTGGTGAAATCGGGGGCCAAATCTCCTTATTCCAATTACTGCTGAGTTGGTGCGGAAAGTTTGGTATCTTCTTCCTCGCGAAAACCCTAAACCCTTCTTTCTCTCTTAGCTCTTCCCCATGGCGTCGTCCTCTTATCTTCCTTTGGTTTCTGGTAATTCCATCTAATACTCTGGGCGCTTTGATTTTTATGCTTTTGTTGATTCTGTTTGAGTGCTTGAAGGGATTTTAGGATATTTGTACGGTTGGGTTAGTTCTTGTATCACTGGTTGTGTTAATGCTGACTTGTTTGTATGGGAAAATGGTTTTCATGGAATATTCTCTAATGCTACTAGGTTGGGGTTGAACTACGTCTACTCGTAATAGCCAAACTGACATTAAAATGAGTTCGAACTATATATCTCATTTGTCTCGTATGTGTATATGTGTGTGTATATATATGTTTATATGTGCATATGTATCTGTATGTATGTATATGTGTATATATAGATGTATGTATGTCTATGTATGTGTAGATATCTATGTATATGTATGTGTATATATATGCATATCTACGAGTATATGTATATCTATGTGTATTTATATGTATATTGAGGAACTTCACCATGATCCTAATATTTAGCGGACAAAAAGGCAAGCGGAGAGTTCTAACGAGAAATGAAAAGACACTGTGCATAAAATTTGTTTCTTTATTTGGAATTCCATCAATATCTTTTTCAACAGTAATTTGTTGAAGAAGAGAAGCACAGCTCCAATGGAGGCAACGCCAAACGAAAGCGAAGACAAGGGAATCGGATCCTCAATTTCATTATACTCCTTTCATTTATGGAACCAAATTGTATCATTTTTGCCATCTCGTCATGATTCCAATTTTCTTTGGAAGCTTTCGAGTCTCCTTCGTCGAAAGAGACGCAAGACTGGTCTTCCTCTTCCTCTACCTTTGAACTCGATAAACTCTTCTGTGTAAGTCGCTTCAGTTCTACACTTTTTATTTATTTTCCTTTATTTTTTGTTCCATTTTATTCTACATAGCATATTTATTTTTCTGGAAGTCTATATTTGTCTCGTAGTTTACAGTCTACACAACTGCAACTGTTTTAGTGGCAGAAGTTATCGTCTGGTTGTGCCGTGTGAAATGGATATAGAGATATCCTTAATTTGAAGTTTCATGAAAGGCTGAGGCTATGATGTTGTATGAAATGGAATGAAATTCACAATGCCACCACAACTAGATATGAATTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTGTCCTCTGGGTTGTCTTCCTTGGATCATTGTAGTCCTCTCACCGATCATGAGTCTTTGGAGATAGCGAGTCTTATTTCCATTATTTTCAATAAGAGGATTTTTGTTGGGAGAACGGAGAAGGGATGTTTGTTTTTGGATTCCTAATCCGTCCAAACGTTTCTCATATCACTATTTTCTATTTGTTTTTGTTCCCTTTCTCCCATTTAAGAAAACTCAAAATTTTCTCTTTATGGAAGGTGAAAGTTCCTAAGAAAGTGAAATTATTTGCTTGCTAGTCTTACATGGAAGAGTGAACACTCGAGATCATTTGCAACGACATTCTTCCTTCGCTCTATGTTTGCATTGGTGTGGGGGAGTGTCATGAAAGAGAAGCATGGCCTGTGAGTTGGTGGGGCATGGCTCCCATCTGCTTAGTTGGGAGTTGGTAGGGCATCTTGTGAGTTAGGGAGGGTTAGGGATTGGTAACATTAGAATCCAGAACAAACCTTTGTTGGCAAAGTGGCTTTGGAGTTTCTATCTGGAATCCGATTCTCTTTGGCATAAGATTGTTGTGAGCAAGCATGGCTCTCATCCTTTTGAATGGATGGCTTTTGGGGTTAAAGACACTTTTTTAAATCCTTGGAAGGATCTCTTTCGAGCTCCCTTCTTTTTTTGAGTTTTCTAGTTGTTTTGTGGGGGATGGTAAGGACACTTATTTTTGGGAGGATCAGTGGGTAGGGGAGAACTTCCTATGTTCGATTTTTTTGCATCTGTATCATTTATCCTCTTCCAAAAATTGCACTACCTCGAATCTTTTGGTGAGATATGAGAATTCCATGTCTTTCTCTTTTGGATTCCGTCGTAATTTGACCAATAAGGAGATGACGGAGGTGACTTCTCTTTTATCCTTACTTGAGGGATGCTTTTTTAGAGAGGGGAGAAGGGATATTCGTGTTTGGAATCTTAATCTTAGTCGAGGTTTCTCTTGTAAGTCTATGTTAAGTCTGTTGTTGGATCCCGCACTCCCTAAAGAGTTGGTTTTTGATGTGGTGTGGAGGACTAAGGTGCCTAAGAAAGTTAGGTCTTTATCTGGCACGTCTTTCTTGGTTGGGTTAATATCGTTGATAGGAGAAGAATTTTGCTTGTTGGGCCTTTTTGTTGCATGTTGTGTTGGAAGGCGGAGGATGATCTTGTTCATCTTTTTTGGGATTGCCAGTTTGCGAGGGCCATGTGGAGCTCCTTCCTTAAGGTGTTCGGTGTTAGCTTTGCTGGTTTACGTAGCATCAAAGTGATGATTGAGGAGTTCCTCCTCCATCTACCTTTAAGAGATAAATGGTTGTTTTTAATGGCTTGTCGGGGTGTGCATGGTTATTTGAGACATTTGGGGTGAGAGGAACGATAGGGTGTTTCGGGGGAGATGGAGAGGGATCTTAGTGAGATTTGGTCCTTAATTAGATTCCATGTGTCTTTTTGGACTTCGATTTCGAAGAACTTTTGTAACTTCTCCATAGATAATATTTTACTTAGTTGGTCCCCCATTTTATAAGTGGGGTGGCTTGGTGGGATGTTTTTTTTGTATGCCCTTGTATTTTTTTCATTTTTTTCTCAATGAAAGCTGTGTGATTTCATAAAAAAAATGTCTGCATTGGTGTGCCCTGTGTCATTGGAAGGAAGAGGATCTTGATTCTTGACCACCTTCATATGGGATTTCTATTGCCAGTTTGCTTATTCTCCTGTGAAGTCATTCGTTTCGGATGTTTATGGGAAGTGTGGATGGAGAAGAATAGTCGCTTTTGTTGACCAGTCTTTTTATAATTATCAGCCTGGTGTTATTCTTTTAGCTTGGAGTCCTTTCTTGTTTAGCAATGGACTTCTTTTGTAGACTTGTCTTTGTATGCCCTTGTAAATATTTCATATCTCCTAAATGAAAGCTCCTTTTCTTCTTAAAAAAAATAAAAGTCAACCACAATGTCAATGACACAAGTTCCTATTGAGGAACCACATGATTTCTAGAATTTACAGAGCGTGGTGTTTGTATATTTTTTTTTTTGCATAAATTTTATCACCGGTCTCTTATCTATGACTTGCTTTGAGCACTGTGAACATTTTTATGCTTGCCCTTTGCACTCTCTACTACATGGGTGAATTATTTTGAACAAAACAACTTGGGAGCTTGGTTTGTCTGGGTCTTCTTATGCCAAATCTTAATTGGTTGTTGGATGCTCTTAATTCTTCTCAAGTTGCACACTCAGGCCATCTGGCCATTGAAGACGATCAATGAGGTTTGCCTCTGTAATTGTTTGCTAGTTATTGTGGAAGTGAATACCAAGGAGTGTACACAAATTAGATACAAATATTGTGAGTTTGTTCATTTTATGGCATTTCGACTGTGCCCTTCAGGCCTTCACAAAGCATTGTTCGGTGACTACCCTGTTTTTGTTCAGCAGCTTGATTGGCAGGTTCTGTTTGCAATGGGTTTCCTTCGTGGGGTTTCAAAACCCCTTTCACTAGGTTGTTTTATTTATTTATTCAATTTGATATGAATATACGATTTCTCAAGAAAAAAAGTAGATACAGGTGTTAATGGTCCCCCCTCCCTCCCCCAATGCTATTGGCTTAACGTTCAATGAAAGGTTACTTTTTATTTGCCAGAAGGCAAGTAGGATCATTCGTAAATCTGGCCCGCTTTATTTATAACCTGATTTTCAACTGTTTGGTATTGCTTGAGCTTTTCTTTCAAGTCATAATGCCAGTTACCCGAAACCCATCTTAGTAGTAACATTTGGTAAATTTTTATGATATTCAGATTGTATGCTTATCTGATCTGTTCATGGAAACTGTGAACAGTTTAACAGTAACTGGCTGGGAACCAGCAGAGGCTTCTAGACTGTACGATGTTCTGGGAGATCTCTTAGAGCACTGTTTCTCAAATTTACATAGCATTTGGAAGAACCTGCAATTCTGGCAATCTCGTGCGGAGGCAAGTCCTTTTGTTCCCTTGTGTTTTTAACCAATCTATTTTATGCATATATCAAAGATGCGTGGAAGAAAATATAGGTCCAATATAACTGTTTTTGTGTCTTCAAAAGAGCCGCTATCCAGCGACATCCTTCTTTCAAAATGCAAAATTAGATTATCTCAACGTTACAACCAAGATTAGACTGATCAGTCGTACTCCAGGTGTTCCTTTAAGTTTCTATCTTCTTCCGCAAACATCCAATGAGTGTAGATGGGCTTTAGTTTACCCAAAGTACCAAAAAATTGTTAAAACTGAGAACAACGTGTCCCCCCCAAGAGTAGTCAGGAACAATGATGAAAGCTTCCCCTCTTTTTCCACACACTTTCATGGAGACAAATAATAGAGGAATCTTTTCCTGCAACATATGTTCAGTAACAATCTTTTTCTGAGCGATGCTCAAGGGGGGTTAAATTGATTGAAATCTAAGTAATGTATTTTTATAAGAAATCTAAATCAATTTTTTGTAATCTAAAGTAAAGAACATGAAGAAGGAACTACAAGG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ATGGAGGCAACGCCAAACGAAAGCGAAGACAAGGGAATCGGATCCTCAATTTCATTATACTCCTTTCATTTATGGAACCAAATTGTATCATTTTTGCCATCTCGTCATGATTCCAATTTTCTTTGGAAGCTTTCGAGTCTCCTTCGTCGAAAGAGACGCAAGACTGGTCTTCCTCTTCCTCTACCTTTGAACTCGATAAACTCTTCTGTTTTAACAGTAACTGGCTGGGAACCAGCAGAGGCTTCTAGACTGTACGATGTTCTGGGAGATCTCTTAGAGCACTGTTTCTCAAATTTACATAGCATTTGGAAGAACCTGCAATTCTGGCAATCTCGTGCGGAGGGTACAAATGCTCAAAAGGTTTACTTTTTGATTTGTGAGAGAGGTCCAAGGGCGTTTTTCAGTGGAACAGTGCAGTTAATGCGCCAAAGTCTTAGGGATGGTTTTTCCTTGCAACATGTCGCTCGTGAGGCATCTCTTTACATAGCTCACCGGATAAGTATATTGAGCAACCTAAGATGTCATCTTGCAGTTTTTGTGGCTCAGGTCTTTATGGAAATTGACAAAATAGGGGCAGATGCAGTGGATGGTCAAGAAAATTCCTTACCTTCATTGTTGGTTACATTGAATGGCTTATTTCTCGATCTAGAGGCATCCATTTGTCAACTGCATGCAACACCTCATATGGATTTTATTGATGACAGCGTTTCATTTCCTCTATTTGAAAAAGTACCAGATGTGAACAAGGAGGGATCTCAGTGGACAAGTTGTGAAATTGGTGATGCTATCAACTTGCTTTATCAGAACCTTCATAAGTTGGACTCTTTCATCTCCAATCTTGTTTGTAAACATCGAAAGCCGAGGAAACTAACTCAATACTGGCTTGGATATTCTTGTGGTGCAATTGGTCTTTCAATCTGTTCTGCTTGGCTTGTTCAACATAGTAGTTTAATGGGGAGCAATGACATTGATAATTGGGTTCGCGAAGCACATAATTCAGCAGCTAGTTTTTTTAAGGATCATGTAGAACAACCGCTTATTTCAATTAGAGATGAACTTTTTGATACATTTAGAAAGAGGCATAAAGGTGTGATGGAGGTTCAGGAGGTTCAGTTAACTGCTATCTCGCTGCACAGAATGTTACTTGCTTTCAGTGAGCACACAAAAGGCCAGAAGTTTCCAGACGATGCATCGGATCAAGAAATGCTTGCAATAGTTATGACCAGGTATGAGAAAGAACTGATGCATCCCATTCAAAATCTTCTTAGCGGAGAGCTGGCCCGTGCTTTGCTTATCCAGGTGCAGAAGCTAAAATTAGATATTGAGACGGCTATGCTTGAGCTTGACCAGATTCTCAAGGCAAATGAAATCAACTTTGCTGTTCTAGCTGCATTGCCCGCATTCTTTCTCTCACTTCTTTTGCTGATGCTTTTGCGTACGTGGTATAAACAGGATACTAGAGCTGAAGGGAAGGGAAGAGCTGCTCGGCTTCAGAGAAGACTACTAGTTGTGGAGGTGGAGAAAGCAATAATGCAATACCAGAGTTTTGTTGACCAAGGACGTGTAACAGATGCTGAATGTAGATTTGGGTTACTGTTGTATAGTTTGGGTCGGTTGTACCATGCTTCCGAGAAGCATGCCAAAGCAACTGGTGAATGGCTACATTTGAGGCAGGATATTTTGGACCTGGGAAAGCCCAGTCTTCCAACAAGAGATAAGCTCAGAATTACGTGGCGCATGGAACGGGTATACGATTGTTTACTTCCTGCACTGAAACGTTCATAA MEATPNESEDKGIGSSISLYSFHLWNQIVSFLPSRHDSNFLWKLSSLLRRKRRKTGLPLPLPLNSINSSVLTVTGWEPAEASRLYDVLGDLLEHCFSNLHSIWKNLQFWQSRAEGTNAQKVYFLICERGPRAFFSGTVQLMRQSLRDGFSLQHVAREASLYIAHRISILSNLRCHLAVFVAQVFMEIDKIGADAVDGQENSLPSLLVTLNGLFLDLEASICQLHATPHMDFIDDSVSFPLFEKVPDVNKEGSQWTSCEIGDAINLLYQNLHKLDSFISNLVCKHRKPRKLTQYWLGYSCGAIGLSICSAWLVQHSSLMGSNDIDNWVREAHNSAASFFKDHVEQPLISIRDELFDTFRKRHKGVMEVQEVQLTAISLHRMLLAFSEHTKGQKFPDDASDQEMLAIVMTRYEKELMHPIQNLLSGELARALLIQVQKLKLDIETAMLELDQILKANEINFAVLAALPAFFLSLLLLMLLRTWYKQDTRAEGKGRAARLQRRLLVVEVEKAIMQYQSFVDQGRVTDAECRFGLLLYSLGRLYHASEKHAKATGEWLHLRQDILDLGKPSLPTRDKLRITWRMERVYDCLLPALKRS* Homology
BLAST of CSPI06G23540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GUK1 (Protein DGS1, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DGS1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 665.6 bits (1716), Expect = 5.2e-190 Identity = 338/595 (56.81%), Postives = 444/595 (74.62%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI06G23540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O74963 (Nuclear control of ATPase protein 2 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=nca2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 94.0 bits (232), Expect = 6.2e-18 Identity = 77/330 (23.33%), Postives = 150/330 (45.45%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI06G23540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q55GJ3 (Nuclear control of ATPase protein 2 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=nca2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 81.6 bits (200), Expect = 3.2e-14 Identity = 48/157 (30.57%), Postives = 97/157 (61.78%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI06G23540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q753J1 (Nuclear control of ATPase protein 2 OS=Ashbya gossypii (strain ATCC 10895 / CBS 109.51 / FGSC 9923 / NRRL Y-1056) OX=284811 GN=NCA2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 66.6 bits (161), Expect = 1.1e-09 Identity = 80/312 (25.64%), Postives = 134/312 (42.95%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI06G23540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q12374 (Nuclear control of ATPase protein 2 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=NCA2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 1.0e-07 Identity = 52/181 (28.73%), Postives = 89/181 (49.17%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI06G23540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BN30 (protein DGS1, mitochondrial OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491445 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1169.1 bits (3023), Expect = 0.0e+00 Identity = 583/594 (98.15%), Postives = 589/594 (99.16%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI06G23540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FT53 (protein DGS1, mitochondrial-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448535 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1090.9 bits (2820), Expect = 0.0e+00 Identity = 543/594 (91.41%), Postives = 561/594 (94.44%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI06G23540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BC94 (Protein DGS1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold182G00440 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1085.5 bits (2806), Expect = 0.0e+00 Identity = 543/554 (98.01%), Postives = 549/554 (99.10%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI06G23540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JC27 (protein DGS1, mitochondrial-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483680 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1083.9 bits (2802), Expect = 0.0e+00 Identity = 540/594 (90.91%), Postives = 558/594 (93.94%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI06G23540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FYE1 (protein DGS1, mitochondrial-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448535 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1082.0 bits (2797), Expect = 0.0e+00 Identity = 543/606 (89.60%), Postives = 561/606 (92.57%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI06G23540 vs. NCBI nr
Match: XP_031743318.1 (protein DGS1, mitochondrial [Cucumis sativus] >XP_031743319.1 protein DGS1, mitochondrial [Cucumis sativus] >KGN48340.2 hypothetical protein Csa_003799 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1184.9 bits (3064), Expect = 0.0e+00 Identity = 591/594 (99.49%), Postives = 593/594 (99.83%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI06G23540 vs. NCBI nr
Match: XP_008449612.1 (PREDICTED: protein DGS1, mitochondrial [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1169.1 bits (3023), Expect = 0.0e+00 Identity = 583/594 (98.15%), Postives = 589/594 (99.16%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI06G23540 vs. NCBI nr
Match: XP_038902646.1 (protein DGS1, mitochondrial isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1092.4 bits (2824), Expect = 0.0e+00 Identity = 549/594 (92.42%), Postives = 561/594 (94.44%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI06G23540 vs. NCBI nr
Match: XP_022943966.1 (protein DGS1, mitochondrial-like isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1090.9 bits (2820), Expect = 0.0e+00 Identity = 543/594 (91.41%), Postives = 561/594 (94.44%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI06G23540 vs. NCBI nr
Match: KAG6570453.1 (Protein DGS1, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1088.9 bits (2815), Expect = 0.0e+00 Identity = 542/593 (91.40%), Postives = 560/593 (94.44%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI06G23540 vs. TAIR 10
Match: AT5G12290.1 (dgd1 suppressor 1 ) HSP 1 Score: 665.6 bits (1716), Expect = 3.7e-191 Identity = 338/595 (56.81%), Postives = 444/595 (74.62%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (PI 183967) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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