CSPI05G28050 (gene) Cucumber (PI 183967) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCTGCGAAGGCCGCCCCTCTCGGTGTACCCAAGTCCGGTGCAATTTCTAAGGGCTACAATTTTGCTTCTACCTGGGAGCAGGTACCTTCATCTTTTCCATTTTACTCCTTAATTCTTTCCCTTTTCCAATTTGAATCCTGAAATTTGCTTCTATCTGTTCGATCTCGCTTTCGATGTGATTTTATGCGATGAGATCTGTTTGCGCCACTTCTTCATTCTCGATGCTTACAGTTTTGTTTTGTTTTCTGGAATTTTGTTATCTCCCAATCCTCCAGAATGCTCCTCTAACGGAGCAACAGCAAGCGGCTATTGCCACACTCGGTCATGCCGTTTCTGAGCGACCTTTTCCCGTTGATTTGGTGAGACTTTTGTTCTGCTCTTCATTCATTTTCAACTCGTTTCTTCTTCGTGTTCTCTAATTCTTCATTTGAATTCAACTAGTGCTGACTGCCACTTCGTACGTTTGTTTTAGAGACGAAATGTTTCATAACTACAGCTTCATGTTAAATATTATTTTAGGCACAGGACAGGATAGGGGGTAAAGAAAATGCATTGTCTATTTCGGTTAAGAATACCACCAACGATGATTCCGATGCTGTTGAAGCCGTTTTGGTCAATACCAATCAGGTAGCCTATACTGTACGGTGGATTCAATGTCTTCAGCCTTCTTCATTATTTTTAATTTTTTTATTACAGTATTTGTGATGGTAACAATCATAATCTTCAAGATTTTAACTCTGGTACATGATTTAATTTGTTGATGTCCTGCCTTGTGATAGACCACCAATTGTAATACAATATAGGAGAAGAAAGACAAGTGGAACTGCACGTGAAGTGGAGGAAATGGAAACCACCTTAGTGGGGACCACAGTTAGTTACATGGGGGAGGTTAAAAGGGAGAGATGGAAGGAAAGATGGGGTGGTTAATCAGTTTCTGGAAGTGGAGGGGCTGTAGTTACTGGAGAGCAAAATTACAGAAGTTGTTCAGTTACTTTAATCATAGAAAGTGTTTTCCATTATCGTAAATTACTTTTGGTGTTTGAATGTTTTATTTTGATCTTGGTTATTGTCTGTAATAGTACTTGTTTGTTCTGTGTTTTCAAGACTGGTTTGAGTATTGTATTCTGTAATAGTTAGGTTGCTTAATGAACCAATAGAATCATTACTTGGTGTTCTATCACCTTGTTATTTTCTTTAGCAAAATCTATTTTCACTTTATGTTGTCTGGTATTGTTGAAGTCATATCACTATAACTTTTGCTTTTCCTAATGAATCTCTTGCAGTTCTACAAATGGTTTTCTGATCTAGAATCAGCCATGAAATCTGAGGTTAGTACAATTGGGTTTCTTCTCTAATTTTTCTTCCGTTGCAAGCCGAGAAGATTCTCTATGAGCATTCTATTCCTTATTGTAGACAGAGGAGAAATACCACCACTACTTGAATTCTTTAACAGATCGCATAAGAACATGTGATGTTATACTTCGTCAGGTAATGTGTTATTACTTTTTCCTTAATCAACATGAAAGAACTTTTTGGGTTGTGTTTATATTTAATTAACTAATATATACTTTTAATCACTGAGAATAAGAAAAACTCAATTGATCATGGAAATGTTTAGACATTTAGCATTATACTTAGATGCAAGATTCTATTTAGATGCATTCTACTTAGATGCAAGATTCTTAGACATTTAGCATTCTACTTAGATGCAAGATTCTTAATTTTTCCTTTTGTTAGTTTCTTTCTTTTCAAAGGAGACAAAAGGAACGCTATCACTATGTTAGACTAGACCACAAGATCCTAACTTTGTTTCTAAATCACCAACAACCATTCTACGAGGCTGTCTTCCACCATGTCAAGACTTATCAAGAGGGCACCAATATCCTCTGGCACACTCCTACACAAGATAAAACAGATGCAGACCATCAAATTACCTCCCCACCCTATCCTAGGTGCTAATTTTTTTTGACAAGAGACAACTTTTCGTTGATGAATTGAAAAGACTTTCTGTATGCTTGTATTTAGAGCTTTAGAATCTTTTCATTTCATCAATTGAAACCTCTATGTCCTTTAAAAAAATATAGAACCAGGTTTAGCTTTTGGAAGAACTTCAAGGAGAGCTTCGAAATCTGCAATTTCATCTTAACCAATCTTCAAAATACAATATTCCAAGCAGAGCAATTTGAATACCTAAAATTAAAACCCATCTCATTTGGTGTGGAAGAAGTGCAGAAAAGTCAATGAAACCAGCCTCTAATGTTGATGGACCGATCCAGTGATGATAATGCCAAGAATGGATTATGGATCCACAACCCAAAGAAAAAGAAGCATACAATTCCACTGATTTCCTAGCTCTAGAAATATTGAGCCATAGATTGTGAAGACAATAAAGTTGTTTCCCAAGTATGTGCCAGTTAAAATCTTCCAAACCATGAATGCTAGAAACCACTCTCTTCCAAAGAGAGTCTGGCTCACTAAAAAATATCCAGCCCCACTTTGCAAGCAAAACCAAATTTTTCTTAGATAAGCCACCAATGCCCAAACCTCATCAAGTTGGAACTTTAATCAATGTAACTGGTTGTTGTTGTGGGACTTAGTGGTTTTGCATTTGCATAGTGCAATCGCAATATATCATGAAGCAGGTTCATTGCATGTAAGATGCTCACCATATCTTTCTGTATTGCGTGCTTAATTTTATATGATAAGTCATGGGTCATGATCATATCATGCGAGATGCTCACTATGATGGATCTCTCTACCTTGGACCAACGATACAAGGAAAGAGTGAGATGCACGTTTGTTGCATACCCGATACGTGAAAACAAATGTCACAACTCAGGAGTTCTTGCCTCATCAAAAGGGTGATCTAACGATCATATATGATGTAACAAGGACATATGATTCAAGCTGCTGGGCACAATTTACAATTTCTAACCATAATCCTCTTGGTCGTCTTGACTATTGAAAATTGTGTTGGAATTTGATGAAGGATGAGTTTATCTATTCAATGAGCTTATGAGCCCCCTCTCTGATGCATATTTGATATTATTCCAGCTTTCTTGTAGATTTCATGGAAGGAGAGAAACAACCACCTCTTGAACGGAAAGAGGAAGCTCTTTGACTATGATTTTGAACTTACAATACTTGTTGCTATGTTCTGGTTCAAGTGTACATATTTCTATAGTTCTTATAACTTTACATTTGTTTTTGACAATTTGGAGAAGCCTCTTTGATATGAATCAAGAAATCATAATTGAATCAAATGAAGTTGAAGAGATGCAATGCTTGAAAGTTGAAGAGTTATTTGGACAACTCAAAAGTCATATTTATTAAGAAATTATGTATTTATTTACTGTTATGTGGTTTCATTTATTATAGTAATTGAAAGGGCATAAAATTAAAAATGATATGAAATCCCTGGGCATTGGATATAAGAACCATGTTAAACAAGACTTAAAAGAACACAACCCCAACAGTCACAAAATTAATTTGATTTCAACCCCTAAGATAGGCTTGATTCAAGTTACTTAGGTGATCTAAGAAACCAAGGGTCGAACAAAGTTAGAAACTCCCATCAGTCCTCGATCTTCAAACCACTTCACAGTCCACAAGCAAGATAGATCAATTCTCATTTGAATAATCCAAATATTCGTGCATTCTATCACAAGAACACACAATTACAAAATTCTACATTCTAGAATTTTTAGATTTCATTCATCCAAATTCTCCTTTTTAAAGTGGAAATTAAACCCTATTTATACTAGTTAAAATATGAAATGAAAGGTCACAACATTTTTCAACTACCGTAATAAATGAAAACACGTAAATACATAATTCTTTAAACATTTAATTTTATGACTTTTGGGTTGTCCAAATAACTGTTCAACTTCCAAGCATTGCATCTCTTCAACTTCTTCATTTGATTCAATTCTGATTTCTTGATTCATATATCACTCTTGTAACTCATTTGGCTTGATCTTTTGCCCTTTTATAAATTCCAGAATGAAATTTGTGGATGCAAGGCTCGATGTCACCTGTAATAAACAAAAGAACAACACAAGAACAGGGCAACACCCAAGGAATTTGCAGTACTATATTAATAATAACCAAGTAGCACACAGCCAAATAAGAGGGCTGCTCTCTCCAAAGTGAACTATTGTTCAACTCAAAACACATAAACCAAGATAACTAACCCTAACACAAAACTACAATACAATACCAACATTCCCTTGCCACCTCAGCCCTCGTGTCCACAGCCAACTACCCCTTTTTCAGGGGGTTAATTTCCTTTTTGCCCCTTCTCTTATATACTTGCTTAATGGGAGGTCTAACAGTGGATAACCTGCTAGACAAAATACTAACTTCTTGGTAATTTCCACCTTCCATGAGGAAGCAAATTGGGAATCACTCAAGGGAGGAAAAACATGTTATCGAGTGTAAGGTTATTTTAGCCAGATGATTATTCTGGTCAAGTTGGGTTAATGCATCATTATCCATTTTTTTCACTTTCTTCTGGAAAGATGCTGAAAGCTAAGGTTAAAAGTAGTCAAATAAGATATTAGCTACTAAAAATTGTTAAAATCTTTTAATTTGTGGAAGAATAATAAAAAATAACGTGTGAAACATAACAATTATAGTCTAATTTATTTGTATTTTATTTGAATTTTGAAGAATGTTTTTTTAGAACTATTTTTATATTTGCATGATAATGAATAGGTTCAATGTAGTAATGGTAGTTACAACTTATTATGCTTTATTTCTCATTCAGGTAGATGATACACTGGGCTTATTTAACGAACTTCAATTGCAACATCAGGCTGTAGCAACAAAGACTAGAACGCTTCATGATGCATGTGATAGACTGGTATGACATTTGATCTCTACTGTCTTATGATGTACTAGTGTTCAATTGCCAAACTTTTTTGCCAATATATTTTAGCATCATGTTAATAGGGCTTAGAACAAAATGTTGATGAAATGGTTGGCTTTCA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ATGGCTGCGAAGGCCGCCCCTCTCGGTGTACCCAAGTCCGGTGCAATTTCTAAGGGCTACAATTTTGCTTCTACCTGGGAGCAGAATGCTCCTCTAACGGAGCAACAGCAAGCGGCTATTGCCACACTCGGTCATGCCGTTTCTGAGCGACCTTTTCCCGTTGATTTGGCACAGGACAGGATAGGGGGTAAAGAAAATGCATTGTCTATTTCGGTTAAGAATACCACCAACGATGATTCCGATGCTGTTGAAGCCGTTTTGGTCAATACCAATCAGTTCTACAAATGGTTTTCTGATCTAGAATCAGCCATGAAATCTGAGACAGAGGAGAAATACCACCACTACTTGAATTCTTTAACAGATCGCATAAGAACATGTGATGTTATACTTCGTCAGGTAGATGATACACTGGGCTTATTTAACGAACTTCAATTGCAACATCAGGCTGTAGCAACAAAGACTAGAACGCTTCATGATGCATGTGATAGACTGGTAATGGAGAAGCAAAGGCTAATTGAATTTGCTGAAGCACTTCGCACTAAGCTTAACTACTTCGATGAGTTGGAGAATATTACTACCATTTTTTATTCCCCCAACATGAGTGTTGGAAACGAGAACTTTCTTCCCATGCTGAAAAGGCTTGATGATTGCATATTATTTTCTGAAAGTAATCCCCAATATGCTGAATCCAGCGTCTATTTGCTCAAATTTCGACAACTTCAGTCTCGGGCACTTGGTATGATTCGGTTTCATGTTGTATCTGTTCTCAAAAGTGCTTCTTCTCAGGTTCAGGCAGCAATGCGTAGTAGTAGTGGCAGCAATTCTGCTGTTTCTGAGGGTGTAGAAGCATCTTTTATCTATGTGCGATTTGAGGCAGCTGCAGATGAGCTGAAACCTGTACTGGAAGAAATTGAGAGCAGATCAACAAGGAAAGAATATACTGAGATCCTTGCAGAATGCCATAGACTCTACTGTGAGCAACGACTTTCCCTGATAAAAAACATAGTGCATCAACGGATATCTGAGTTTTCCAAGAAGGAGGCTCTCCCATCATTGACTAGATCTGGATGTGGGTATCTGATGCAGGTGTGTCAGCTTGAGCACCAGCTCTTTCATCATTTCTTTCCGTCTTCCTCAGACAATGTTTCAAGTTTGGCATCTTTAATAGATCCATTATCTACTTACCTGTACGATACATTGCGTCCTCGACTTGTTCATGAAACAAGTTTGGACTTTCTGTGTGAACTAGTTGATATTCTTAAAGTTGAAGTTTTGGGAGAAAGACTCATTCAACAGCGAGAGTCGTTAGTTGGATTACGTCCCACACTCGAGAGAATTTTAGCTGATGTTCATGAGCGACTAACATTTCGTGCTCGAACACACATTCGTGATGAGATTGGAAATTATTTTCCTTCCAACGAAGACTTGGAGTATCCAGAAAAGCTTGAGAAAACTGCAGTGGAATCGGCAGAAAATACTTCTGTAAATCTTCTTACCCTAAATTTGAACCCCTTCCAACCCCTCTGGCCACCACCAGCTCTCTCAGAATGGAGGTCTTCAGCTGCAAGATCAACCATTCTCATTACTGCATTTGGAAGAAAATCGACTGCTGCATCATTGAAGACGTGCAAGCCCACAGGACTCTATCCCTTTCCGATGACCAAATTCGATGGCTCTAGGAAGCCATTGTCGAACTCATCAACTTTCCCGCTGATGAGCCCGGCTAAAAGTCTAAGTTCCAAGCAAACTCCAGACGAATTCTTAGCTGTGACTTCTCACCGTATTGAGGAGGGCATTCCAACATTAGAGTTTGTTCTAGTGAAAATTTGCAAGGATGGTGGTCCTTTTGTAATGTCTCAAAGTCCTTCCCACAGCTTCTGGCAAACAGGCCTATTTATGTGGAGATGGTCAAGTCTACCAGCTCTTCCAATCCAGCAGCAAAATCCGAGAATAAGGACCAATCCAATTAGAACTCATCCAGCTCCTGTTCGTCTTCCTCCTCCTAAACACAAGCAAGCAGTGGCTAATAAAGAATTATGA MAAKAAPLGVPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATLGHAVSERPFPVDLAQDRIGGKENALSISVKNTTNDDSDAVEAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLTDRIRTCDVILRQVDDTLGLFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALRTKLNYFDELENITTIFYSPNMSVGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQLQSRALGMIRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSSSGSNSAVSEGVEASFIYVRFEAAADELKPVLEEIESRSTRKEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALPSLTRSGCGYLMQVCQLEHQLFHHFFPSSSDNVSSLASLIDPLSTYLYDTLRPRLVHETSLDFLCELVDILKVEVLGERLIQQRESLVGLRPTLERILADVHERLTFRARTHIRDEIGNYFPSNEDLEYPEKLEKTAVESAENTSVNLLTLNLNPFQPLWPPPALSEWRSSAARSTILITAFGRKSTAASLKTCKPTGLYPFPMTKFDGSRKPLSNSSTFPLMSPAKSLSSKQTPDEFLAVTSHRIEEGIPTLEFVLVKICKDGGPFVMSQSPSHSFWQTGLFMWRWSSLPALPIQQQNPRIRTNPIRTHPAPVRLPPPKHKQAVANKEL* Homology
BLAST of CSPI05G28050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4HQ84 (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=COG3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 727.6 bits (1877), Expect = 1.3e-208 Identity = 369/512 (72.07%), Postives = 439/512 (85.74%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G28050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96JB2 (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COG3 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 262.3 bits (669), Expect = 1.5e-68 Identity = 163/499 (32.67%), Postives = 272/499 (54.51%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G28050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8CI04 (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Cog3 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 260.0 bits (663), Expect = 7.5e-68 Identity = 159/468 (33.97%), Postives = 256/468 (54.70%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G28050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q16ZN9 (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Aedes aegypti OX=7159 GN=Cog3 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 243.0 bits (619), Expect = 9.5e-63 Identity = 156/467 (33.40%), Postives = 258/467 (55.25%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G28050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q29N70 (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Drosophila pseudoobscura pseudoobscura OX=46245 GN=Cog3 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 233.0 bits (593), Expect = 9.8e-60 Identity = 137/413 (33.17%), Postives = 237/413 (57.38%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G28050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CCR3 (Component of oligomeric Golgi complex 3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499355 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 937.6 bits (2422), Expect = 3.0e-269 Identity = 484/497 (97.38%), Postives = 492/497 (98.99%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G28050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FRH7 (Component of oligomeric Golgi complex 3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446258 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 890.2 bits (2299), Expect = 5.5e-255 Identity = 464/513 (90.45%), Postives = 480/513 (93.57%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G28050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I362 (Component of oligomeric Golgi complex 3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470121 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 886.7 bits (2290), Expect = 6.0e-254 Identity = 462/513 (90.06%), Postives = 478/513 (93.18%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G28050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DZ07 (Component of oligomeric Golgi complex 3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025573 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 882.5 bits (2279), Expect = 1.1e-252 Identity = 455/507 (89.74%), Postives = 477/507 (94.08%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G28050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KTV8 (Component of oligomeric Golgi complex 3 OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G630720 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 875.9 bits (2262), Expect = 1.1e-250 Identity = 462/494 (93.52%), Postives = 462/494 (93.52%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G28050 vs. NCBI nr
Match: XP_004142363.1 (conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8648885.1 hypothetical protein Csa_008671 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 959.1 bits (2478), Expect = 2.0e-275 Identity = 495/497 (99.60%), Postives = 496/497 (99.80%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G28050 vs. NCBI nr
Match: XP_008460560.1 (PREDICTED: conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 937.6 bits (2422), Expect = 6.2e-269 Identity = 484/497 (97.38%), Postives = 492/497 (98.99%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G28050 vs. NCBI nr
Match: XP_038892000.1 (conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 915.6 bits (2365), Expect = 2.5e-262 Identity = 475/513 (92.59%), Postives = 489/513 (95.32%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G28050 vs. NCBI nr
Match: KAG6596156.1 (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 892.9 bits (2306), Expect = 1.7e-255 Identity = 465/513 (90.64%), Postives = 481/513 (93.76%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G28050 vs. NCBI nr
Match: XP_023539647.1 (conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 891.7 bits (2303), Expect = 3.9e-255 Identity = 464/513 (90.45%), Postives = 481/513 (93.76%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G28050 vs. TAIR 10
Match: AT1G73430.1 (sec34-like family protein ) HSP 1 Score: 727.6 bits (1877), Expect = 9.0e-210 Identity = 369/512 (72.07%), Postives = 439/512 (85.74%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G28050 vs. TAIR 10
Match: AT1G73430.2 (sec34-like family protein ) HSP 1 Score: 727.6 bits (1877), Expect = 9.0e-210 Identity = 369/512 (72.07%), Postives = 439/512 (85.74%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (PI 183967) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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