CSPI03G36880 (gene) Cucumber (PI 183967) v1

Overview


Name	CSPI03G36880
Type	gene
Organism	Cucumis sativus var. hardwickii cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description	Unknown protein
Location	Chr3: 31985260 .. 31989962 (+)
RNA-Seq Expression	CSPI03G36880
Synteny	CSPI03G36880

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGGGTTGATTCTTGGTGGCCTTCAAGGGTTCATCCTTCTGGTAGTAATCTAATGGCCATCGTTGATGGGGTTTAAGCAGCCAAAACCGCTCCATGAAACTAATGGATGACACATTTAGAGGTGGAAACCGATTCATTGGAGGTTTCTAAATTGCTCAATGAGTAGGGACAATATCTCATCGAAATTACGAGTTTCATTGCTGCCGCCCCGTCCTTGGGAAACGAAATCGGAGTAGTTTCAGCTCTTCATCACTCCGGCGGTGAAATCAGGTGGCTTCCCCGTCGCATCGCCGCCGTCCATTTCATTTCCCGCGACATTCTCCATGAACCCACAGGATCGGTTTCTCGCCGTTTTTTTCGTTATTTCACAATTTTTTTAATTTTTTTTTAAAAAGACAAATAGAAACTAAATGAAATCTCTTAAAATAAATGAAATATTTTGCATTCAATGATAATCAATCAAAACAAAGTCAAAACATGCCAATGAAGAAATAATTACATATTATGGAAATTTACTAACAAGAGATGATTCAATTATTGATATTAAAGAAGAAAATTCATCAAAACATTCACTAAACATTGAAAAATTATGTGTAGTAGATTTTTATTTTTTAATAGTTTATTGTTTTTTTAAAAAAAACTAAAAACCTCATGCAATTAGTAGTATATATGAAAGCAATACATTTTTTTTATAAATATTATGAAGTTAAAATACGAGATAATATCAAACGTTCAAAATGTTTGTTAAATTCTACTTCAAAATTTAAAATTTAAAATTGATATTTTTCTTTTAAAATTTTTATAACAAACTCTTAATTAATTCATTTCTGCAAAATCATCTCAATTCAATTGATACAATTCTTTTTAGTTTCTCCTACCTTTCATACATTTATATTTATATTTATATTTTAATATCTAAAATGATAAATTTATTAAAATATTTACAAATACATTTGTCATAATCAATTATCCGCAAATATGAAAGTTTTCTTGTATTTATAATTATTTTTTTTCACTGTTATTTTAAAACAACTTTTAAATAATATTCTTATTTGTACAGTAAATTATATTAATTTTTTAAAATAACTTTTATATTAAAAAAAAGTGTAATTATACAAAAGTATTCATTCCATGTTTAATATTTATAATCAAATTTGAAATGGGAAAATTTTGGTTAACTTTGATTTTATTTTAGAAAGAAAAACACTTGATTGAGAAAAAAGTCTTTGAGTAGCACTTTATGATAAGAAACAATAAGTTGCCCAACCAAGCAGGAGAAATAGTAGTCTACAATTTTAAATAATAAGCCTCATGGCATAGGGTATGACCAAATTTATGAGTTACTTCGTTACAATAACTAAGGTCGGTTTAGAGATTACGCTTAATAATAAATATAAAAGTTGGGTTATTTAAAGTCAATCCAAGTCTATAAAGAAGCTCTAAAAACGGTACAAATAGAGATGTCACACCTTTCGCTTAGGAAATTAAGTCAGTGATTGAATAAGTCAACATTCATCGTTCAAACATCCATTAAGAAAAATCGATAAATAATGATTTATTCACAACCTATAAGTTGACGAGAATCTTTAAACTCGCGAAAAAGATCACAATGAGTATATCAATATGTCAGCTACAAACTAATTTAAGTCGATCAACAAAGTCAGAGGCTAATCCAAGTTGATTAACAAGCAAGAGTTCGATCTAAGCCCAAAGGTTGGAGGTCACGAAGCTTTGAATAAAATTAGGGGTTGTAGTGCTACAAAGGGTAATTGTAATTAATGGCCATTTGAGAAATAATAATTAAAAATATAGCAACATTTTTAAAAAATTGCAAATATAGCAAAACTATGACTGATAGACTCGTATAATATACTATCACCGATAGAATTTAACAAATTTTGTTATATTTGTAATTTTTTAAAAATGTTGCTATGTACTTAATTATTTTGAATCTAATTGCTAAATTTGCAACTATTTCATAAATAAAATCGAATTAATTTATACAAATAAAATCTTCCTTGTCGAAATTTTGTGCAAATAGAAACATCTTCATGACTTATTGCTAACAAACCTTACATTTAAGACGTCTAAATTTCAACACAATTTGATTTTACAATCTACTATCACGTCACGTTTAAAGATAAGTGAGTTCATGTTAATTTATACACAAAGAATACTCTCAACTTCACAACATACGATTTATGTGATTTGACGATTCCTCTTCGCTGGAAACTTTCTCAAGTAAGGCTTACCTTAGTAGTTGTCGGACATCCACTGGAATTTCCCCTCAAATGACATGTGCACATATATGCCTCCGACTCCCATAACAAGCTCAAATTACAAAATTAAAAACATCCATGAACTACCTATGATGTGAGAATGATATAATTGAAGTATGTATATTCAAACTTTTAGTACAAATGTAAGTGGCAGATTTGAATCACATATCTCTTATGCCAGTTTTGTTGGCACGTGTATTCAAACTTAGATCAATGATAATATTTATAATTCTTTTATTTCATTGGTAAAAACAAAATTTCAAATACAAAAAGTCAACCAATAAATTCTCATAAAAACCCAAAAGAACGTGCAAGGTAACACATTAATATAATTGTCAAATTGATACATAGTCATATGAAAAATAAATGACAATAACTATGTTTCCCTTAAAAAGAAAAGTACCATATAAACATCCAAAATTAAATTTGAATTTTAGTTTATGAAAATTTAGGGGTGTAATTATTTAACAATTGTCTTAATTTCGAGATTTTTTCCATTAATATGATTTTGCACATTTTCTTGAACGAACTTTACCATCATTTTTTTAAAATATATTATTACCGATTCCATTATATTTAATTATAATTAATACTAATTTTTTAATTTGTTTGATTTCATTTAATATATATCCTAACTAAATATAAAATATACCATCATTTAATTTTTTCTTCGAATTTTTCTGCCAGTTTACAATTTTTTCTTACATTTAATATTTATTTCTTTTACAATAGAAAAAAAGGATAGTTGCAAATTTAGCAATTAAATTCAAATTAATTAAGTATATAACACAATTTTACAAAAGTTGTAAATATAACAAAATTTGTCAAATTCTATCAATGATATAAGTCTATCACTGATAGACCATGTTGCAAATATTGGTCTATCACTAATATACCATATAAAGTCTACCAGTGATAGTTTTGCTATATTTGTAATTTTTTTAAAATGTTGTTATATCCTTAATTATTATTGCTAAAATAGTCATTCATTGTAATTTTCCATAAAAAAAAACAATAAATATGTACAACAACACTTTAAATAAATTGAATCTCATATAATTTAAAAACACGTATTATTTACGTTCAATACATCAAACTAAAATAAATAATAAACATGTCAAAGTCAAATTTGAAATTAACTCAATAAGAAAATTATTTTAAATTTTTTTCATATGTGTTACTACATGAAGATATTAAGATGATTTGGACTCGAGTTTTGTGTAAAATAGAATCTGATTGTTAAAAGACTATATATTAATTTTCTTTTTGGTAATTTGGCCTATATAGGGATAAACTCCTTAAATAAATCCACGTTATATGATAAACATTAAAAAAAAAATAGTAATGATAATAAACCTAATTATATTAATGTGTAACCAATAATGGATTGAATTTGTTTTTGTTTTGAGTTTAGTACAACGAATCATTTTTCTAATTTAAGAAATAAATTTATTAAATTTACAAATAGGTTGAAATTAACCTAATCATTTCAACATTCTAGACTCTAATTTCTCCTAACTATATTAACATTGTTTTAATAAAATTAAACAACTAACCATTAAAAGAAAACACAAACAAATAAATAAATGGTAACAAAATGATAAGAGTATGGTTTAGATATTAAGAGGTAATTAGAAAAGAAAGTCCCGGAAGGCGGAAAGGACAAATCCAACTGCCCAACGGTCAATGGGCTTACGCATCTCTATGATTTTCAACCAAATAAACAAACATAAAATGTCATTTTCTAATTAAGAAATTAACAAACTAATCTTTAAGAACAGTGTTTTAATTTTTACCGTCGGCGTCATTAATGCCTATTCAAACTTTCGTCTTCACGGCCACCCTTTGGCGGTTTCTTATTTGTGTGTCAGATTCTCCTTCTTTTTTCTATTCATTTGTTCATTCTTTATATAATGGCTGAATTTGTTGTATATGGGTTTGCCAGCAAAAGCCCAGAATCGCACGATGTTATTTAATTGCAACTCTGTCACCAGGGAAATCTCGATCTGTCGTTGATTTTTCCTTATTGGCGTTTTCTAATTCCGACCCTCTGCTTCGGGTACTCTTCCTTTGTTCCTATACTCTTCCATTTTTCCAATTATGAAATTAATGCTGTAAGCTGGTCAACTCATACTGGTATTTGTCATGATTTGGTATGTGGGGTAGCGAAAATATTTGGGGATTGATTTTGTTGTTGTGTTTTGTTTGTTGGGTTTTGATTTTTATGGCCTGTGTAAGGTTTGTTTCATGGTAGAATTTAGATTTTGATGTTGATGCTTATAGCTGAACTTTGAAGTTCTTGGTATTGGACTTTGGAAATAGGGGTTTAACTTTAATCCATGTTGCTGGCTGTTCTTTTCTTTTAGGTTCTTGGGAACTTGATTCAGGGTGGAAATGTTGTTTTGATTTCATGTGAATTGTAG

mRNA sequence

ATGGGGTTGATTCTTGGTGGCCTTCAAGGGTTCATCCTTCTGGGACAATATCTCATCGAAATTACGAGTTTCATTGCTGCCGCCCCGTCCTTGGGAAACGAAATCGGAGTAGTTTCAGCTCTTCATCACTCCGGCGGTGAAATCAGGTGGCTTCCCCGTCGCATCGCCGCCGTCCATTTCATTTCCCGCGACATTCTCCATGAACCCACAGGATCGCAAAAGCCCAGAATCGCACGATGTTATTTAATTGCAACTCTGTCACCAGGGAAATCTCGATCTGTCGTTGATTTTTCCTTATTGGCGTTTTCTAATTCCGACCCTCTGCTTCGGGTTCTTGGGAACTTGATTCAGGGTGGAAATGTTGTTTTGATTTCATGTGAATTGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGGTTGATTCTTGGTGGCCTTCAAGGGTTCATCCTTCTGGGACAATATCTCATCGAAATTACGAGTTTCATTGCTGCCGCCCCGTCCTTGGGAAACGAAATCGGAGTAGTTTCAGCTCTTCATCACTCCGGCGGTGAAATCAGGTGGCTTCCCCGTCGCATCGCCGCCGTCCATTTCATTTCCCGCGACATTCTCCATGAACCCACAGGATCGCAAAAGCCCAGAATCGCACGATGTTATTTAATTGCAACTCTGTCACCAGGGAAATCTCGATCTGTCGTTGATTTTTCCTTATTGGCGTTTTCTAATTCCGACCCTCTGCTTCGGGTTCTTGGGAACTTGATTCAGGGTGGAAATGTTGTTTTGATTTCATGTGAATTGTAG

Protein sequence

MGLILGGLQGFILLGQYLIEITSFIAAAPSLGNEIGVVSALHHSGGEIRWLPRRIAAVHFISRDILHEPTGSQKPRIARCYLIATLSPGKSRSVVDFSLLAFSNSDPLLRVLGNLIQGGNVVLISCEL*

Homology

[Close]

BLAST of CSPI03G36880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LH14 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G812130 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 253.1 bits (645), Expect = 6.4e-64
Identity = 128/128 (100.00%), Postives = 128/128 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 1   MGLILGGLQGFILLGQYLIEITSFIAAAPSLGNEIGVVSALHHSGGEIRWLPRRIAAVHF 60
           MGLILGGLQGFILLGQYLIEITSFIAAAPSLGNEIGVVSALHHSGGEIRWLPRRIAAVHF
Sbjct: 1   MGLILGGLQGFILLGQYLIEITSFIAAAPSLGNEIGVVSALHHSGGEIRWLPRRIAAVHF 60

Query: 61  ISRDILHEPTGSQKPRIARCYLIATLSPGKSRSVVDFSLLAFSNSDPLLRVLGNLIQGGN 120
           ISRDILHEPTGSQKPRIARCYLIATLSPGKSRSVVDFSLLAFSNSDPLLRVLGNLIQGGN
Sbjct: 61  ISRDILHEPTGSQKPRIARCYLIATLSPGKSRSVVDFSLLAFSNSDPLLRVLGNLIQGGN 120

Query: 121 VVLISCEL 129
           VVLISCEL
Sbjct: 121 VVLISCEL 128

[Close]

BLAST of CSPI03G36880 vs. NCBI nr
Match: KAE8651149.1 (hypothetical protein Csa_000737, partial [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 112.8 bits (281), Expect = 2.1e-21
Identity = 56/56 (100.00%), Postives = 56/56 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 73  QKPRIARCYLIATLSPGKSRSVVDFSLLAFSNSDPLLRVLGNLIQGGNVVLISCEL 129
           QKPRIARCYLIATLSPGKSRSVVDFSLLAFSNSDPLLRVLGNLIQGGNVVLISCEL
Sbjct: 1   QKPRIARCYLIATLSPGKSRSVVDFSLLAFSNSDPLLRVLGNLIQGGNVVLISCEL 56

[Close]

BLAST of CSPI03G36880 vs. NCBI nr
Match: KAG6580828.1 (1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 6.9e-04
Identity = 28/35 (80.00%), Postives = 29/35 (82.86%), Query Frame = 0


Query: 73  QKPRIARCYLIATLSPGKSRSVVDFSLLAFSNSDP 108
           QKP IARCYLIATLSP KSRSVV+  LLA SNS P
Sbjct: 952 QKPGIARCYLIATLSPWKSRSVVELFLLASSNSAP 986

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CSPI03G36880 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CSPI03G36880 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A0A0LH14	6.4e-64	100.00	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G812130 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of CSPI03G36880 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
KAE8651149.1	2.1e-21	100.00	hypothetical protein Csa_000737, partial [Cucumis sativus]	[more]
KAG6580828.1	6.9e-04	80.00	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 2, partial [Cucurbita argyrosperm...	[more]

BLAST of CSPI03G36880 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
CSPI03G36880.1	CSPI03G36880.1	mRNA