
CSPI03G02240 (gene) Cucumber (PI 183967) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCTCGCAACAAAATTTTTTCTATGGCCTCTGTTTTCAGTTCACTATCAGAAAGCTTCCGTAGAGTGCCTCCAATGGCAGTTCCAGCTATTTTGGATTGCCTTTTTGCTTCTACTGGGTTATCCCCATCTGAGCTTTTCGACTCGCTTCTTGAAACTTTCCCCAAAACCATTGATGTACTACTCTGAAAAATCCCACTTTGTCAATTATAATATAATTTTGGGTTGTAGTTAAAAAATGCAGGCAAATACATATTTACCCATGTGGGGAAAATAGCTTTTCATGTTTGTGTGCATGTATGAAACTCATCATAGAAACTATGTTATGTATCATTTATCTACGTATGTTGCATCTACGGATGTTGTTTGGCTGTCATTTCATAATTTCTTCTTAAAATCTGTTTGATAATGGTGGAATGGGGTGAAGGATAATTGAAGTTGTTGTTCAAGCTGGGATGTAATTGTTTTGGATAGGATGCTACCACGAAGGAGGGAAAGCTTGATGCTGATCAATGTAATTACATCACATCTTTGGTCTGCGCCCTGTGCCACATACTAAAAAAAGATGGTCAGTCATCATCTGCACCCATATTTTTCCAACTGATTATCCTTTTAATCTTCACAGAGGGTTGTGTAATATTTTTTTAGCAAGAAACAACATTTTTCATCAATGATAGTACCTTATACTCCACAACTGACAACACTTTACTGTCAAAATCAAGTTGATTTGTTTGTCTGATTAGTCGAAGTACTTGTAAAGTGGCCTAAACACTTACTGGAATATAAAAAAAGAAAAAAAAGGGAAAGGAACAGACTTTTACATGTCTCTGTACTCTTTTAGAGTGAGGTTTTTCATTGTGTGCTATATTACTGCGGCTATTCTTATTAGGGGGAGGATAGAACGTTTTAGGCTATAATGTGTTGTAAATCATATGGTCAATTGATTTAATCCTTAGGTGCCGATCCTACTGCTTTGAAGTCATTCATATGGAAAAGTTTCGTTCCTTTGATAAATAAGACAGCTACATTGAATCGGGAAATGCTAAACCAGGTACTATTTTTTAAAAGCTTGTTTGATTTGATGATAACTGGAACTTCAGTTTCCAAATATGTTGTTGCTTCATGATAACTATCTTGTTGACTTCATTTATTGGTATTAGGTTTTTGAATCATTCATTGATGTTGTAACTGAGACGAACTCATGGCCAATTGTTGAAGCAACCCTAGTTCCATTTTGTATAAGTTCAGCTCTTTATTCCACGAGTGTGCTGCAACATGTTGAGTTGGACACCTTTGAGGTTGACAGACGTTCTTTCATTTTGGGCTCAAATGTCCCCGTGCACGAACCTAGAATGGATAATCAGACGATGAAAGACTATGGATTCCTTCAATTACCATTAGCATGCCATGTTTTAGCTATAATGTTAGATGCCGTCCTTTGTAATAGACAAGTACCACAAACATCAGACAAAGTGGTGTCAAATGGGTACCAAAAAGCTGAAGAGTTTACTGTTAAACTAATTTGGGATATTTGTAATTTATCTGAACAAATGCTCTTACAAAGCTCAGACCATCGATCCTGTGCCATTTGCCATCTTCTTCCAGTAATCTTTGAAGCACTTATTTCTCACCATTCTTTAGAGATCTCCATTCAAGGTCATGCATGTAATCTTTCCAGGTTAGGCTTACAAGTTCTTTGAACTTTATGGTTCAAACATGTAGCATGTCCTAGATTTAAGAATTTGGTTTCACCTCATTATTCTCTTAATGCATATGATTGTCTTACAGGAGCTGTTTCCTCATGAAAATATGGAAATGTTGCAAAAAACTATTTTCATTTGGAACTTTGGAGAGAAGAGATGCCTATAGGATTTTGTCTCTTTATTTTTGTTTTTTCCCTCACAATGAAGAGCTTGGAGGTGCTGGAATGTGTGATGATGGAGAAGAATTTGACATAAAGGCTGATAAAATTTTTTGGGATGAAATTAAAAGAGGCTTGGTATTCAAGTATTCCTTTGATTGAGATTCATTTACTTGTACAATCAAAGATTAGCGAATGATTTAGAACTATTTTATTTCATGTTTCTTTCTAAAATATTTATTTCATATATGTGGTTGGGTTGATTATGTTTGTTTGGTGAGCCTGTTTAGGTGGATAAGGAGAGCTCGGTGAGGAAGCAATCCCTACATATATTGAAGAAAGCACTATCTAAAAATGGAAGAGGCAGCCCAACTACGGTTTCAAAAACTATTTCAAGTGGAAAAGATAGTAATGTTCAAGGAATTACCAAAAGGGAAAGATGGGCCAATAAGGAAGCAAAATCACTGGGTGTTGGGCAAATTTGCAGCCAAAATAAAATTGCTACAAATAGCCGGCAGCAAAAGTGGGAAGCATTCATACTTCTTTATGAAATGCTCGAAGAATATGGTTCACACTTGGTTGAAGCTGCTTGGAGTCACCAGGTTCATTAACATTTAATGTTTTTTCAATGTTCATTATCCGTTCTCTTTTATATAATTTAAAACTGGACCCCTCAGTCATTTTTGTTGACATTTAGTCTTAGATGGATGCCTAGTTGTTCAATTTTTACATGGTACATTGTACTTTGTGTTGTGTATATAATTGTTTCATGTATTTTATATGTATGGCAGTGAAGTTTCACTTTGACAAAAACACCGTTTAGATGAGCTAATGTGAAGGAAACAGATTTATTGTGTCAGTACAAAAGTTGGGCAACATTAGATTTAATTTTTTGGTCCAAGTTTGAATGACGGAAAAAATTTTCATAAGGTAAGTGTATGTAATTTCTTGACATGTGGATGATGAAGATTCATAACCTCCTCTTTTTGTGGAAGGCGAATACTTTAAGATAATGTTAGTAGCTTTAGGGCTTGAGGCAGCCTTTGTCAGATAATAAGATAAACAATTTATTTGGAGGTTCATTGAAATTAAAAGTATTGAAAGAAGAAAAAGAGAAACAAACTATTTTACGTGGAAACCCTAGAACAGGGAGAAAAACCACAATGCTATTTTCTTATTATTTTCTATATCTCATAATGATACAGGAAACCTTTATTTATAGACTGTAGCCGCCAAAATAAAAATAATAAAAGATAATTAGGGCACTATAAAATCTTAGTAAACTTTCGGGCTTTCAACATACAACAAGGCTGCCAATTCTAACACTCCCCCTTAAGTTGAGCCATAAATGTCAAAAAGACCCAACTTGCTAACACAAGACTCGAAGCTTTGTCTGAGAAGCCCTTTTGTGAGAATATCAACAATTTGTTGGTTTGAAGGTATGTAAGAATTGCAGATGCTACCACTGTCCAATCTCTCTTTGGTAAGGAGTCTGTCAATCAATACATGTTTAGTTCTGTCATGTTGGACCGGGTTATTAGCAATGCTGATAGCCACCTTATTATCACAGAGAAGTTTCATAGGCACCTCATAGTCCTGGTGAAGATCAAATAACACCTTTTGAAGCCAAATTTCCTAACAGATTCCCAAACTCATGGCCATGTATTCAGCTTCAGCACCACTTTTGGCAACAACCCCTTGCTTCTCCAAGTAACGAGATTGCCCCATCAAAAGTACAGTACCCAAAGGTAGATTTTCTATCAACAATAGACCCTGCCCAGTCAGAATATGTATTTGCCTCAATACACCTTTTGTCAGTTTTTTTGAATCTCAATCCCTTACCAAGAGTTGTTTTTAAATATCTCACAATTCTGTTTACTGCCTCCATGTGTTCTTCGTAAGGAGTGTGCATGACTAATAGTACTCACAAGCATATGAGATGTTGGGCCTAGTCTGAGATAAATAAATCAGTTTGCCCACTAGGCGTTGATCTTTTTCCTTGTCAATTGGAACTTGTCACATGTATCTCTGAGTTTGGCATTGGGCTCAATAGGTGTATTAGCAGGATGACATCCTAGCATATCTGTCTCAGTTAACAAATCAAGGGTGTATTTCCTCTGGGATACAAAGATGCCCACCCTAGTTCTAGCAATTTTCATTCGTCCATGGCAGCATTGATCCGAGCATCGACGACTGCAGCACTAAAACCGGCGGCTGTCTCCTCTGTTTGATTTCCATTGCTAGTTATGTTGTTTAGGGTTTGTTCAATGTCCCGCTTTGATACCATAGTTAAAGTAGAGACAAAGAACACACAAATTTACGTGGAAACCCGAGTATTGGAAGAAAAACCACGATATTTTTCTTATTATTTTCTGATTATAAAAAAGGTACAAAAGGGGAATATTTATAGGCAACATGAGCCTAATAAAAAGAATAAAGAATTAGGGTAAAGAAAATCTTAACTACCCATGGACTTTCGTCAAGGCCCAAGCCCACTATTTCTAACACTTGGGCTGGTTTTATCTCCACATGGTCATCTCTTCGGGTCATTGCTGTCAAAGCTTTCATTTCAGAATAATGAAATCACAGGATTTTTAAAGAGAAGTCTAAAGCTTGGATGGAAAGATTCAATATAATTGTATGTTCTGATTACTTGCATACATTTATATTCTGATTACCATAGCCACAAATGGAAGAAAATACAGTCCAAGTCTAAGATCAGCAATATTGCAATCAACAATGTTGCCTTCAATCAATAAACCATAAAAAATTACATTTAATCACTCAAGAAGGCTAAGAGCTTGTCCAAATGAGCTGTGAAAATGTGCAAGTAATGAGTGGAGTAGAAGGGAAAAAATCAATCAAAGACGAGCCAAATAAGGAATGTAGGAAGATTGAGGAAGAGGTTGCGTTGAAAGGGGAAAAAAATAAATGTGACACACATAAATTACGCAACTTGAACCCGATAAGGTGGAACGATCAACTGATAAAATCAAAGAAAAAGACGTTGAAAGCAAAGGAGTGGCAGAAGAAGATACCCATGAGCGTCCCGGTTTGAAAAATTGCAAAAATCGATTGGTGTCGATTGCAAAGAATGTGGAAGATGATATATTTTGAATATTTTTTTTTGGGT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Match: Q13395 (Probable methyltransferase TARBP1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TARBP1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 188.3 bits (477), Expect = 7.5e-46 Identity = 87/149 (58.39%), Postives = 119/149 (79.87%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI03G02240 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q07527 (tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=TRM3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 144.4 bits (363), Expect = 1.2e-32 Identity = 68/165 (41.21%), Postives = 114/165 (69.09%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI03G02240 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O67577 (tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase OS=Aquifex aeolicus (strain VF5) OX=224324 GN=trmH PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 1.6e-11 Identity = 51/158 (32.28%), Postives = 80/158 (50.63%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI03G02240 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q72GI1 (tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase OS=Thermus thermophilus (strain ATCC BAA-163 / DSM 7039 / HB27) OX=262724 GN=trmH PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 64.3 bits (155), Expect = 1.6e-08 Identity = 43/163 (26.38%), Postives = 81/163 (49.69%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI03G02240 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5SM16 (tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase OS=Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) OX=300852 GN=trmH PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 64.3 bits (155), Expect = 1.6e-08 Identity = 43/163 (26.38%), Postives = 81/163 (49.69%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI03G02240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L1E9 (SpoU_methylase domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G017140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3618.9 bits (9383), Expect = 0.0e+00 Identity = 1825/1837 (99.35%), Postives = 1829/1837 (99.56%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI03G02240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BKH8 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC103490840 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490840 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3456.8 bits (8962), Expect = 0.0e+00 Identity = 1741/1830 (95.14%), Postives = 1780/1830 (97.27%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI03G02240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F8L8 (uncharacterized protein LOC111441850 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441850 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3063.1 bits (7940), Expect = 0.0e+00 Identity = 1569/1846 (84.99%), Postives = 1682/1846 (91.12%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI03G02240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KSL3 (uncharacterized protein LOC111498319 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111498319 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3050.4 bits (7907), Expect = 0.0e+00 Identity = 1566/1846 (84.83%), Postives = 1674/1846 (90.68%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI03G02240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DPL7 (uncharacterized protein LOC111022655 isoform X5 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022655 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3000.7 bits (7778), Expect = 0.0e+00 Identity = 1536/1845 (83.25%), Postives = 1655/1845 (89.70%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI03G02240 vs. NCBI nr
Match: XP_011650373.1 (uncharacterized protein LOC101213211 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031738458.1 uncharacterized protein LOC101213211 isoform X2 [Cucumis sativus] >KGN55820.1 hypothetical protein Csa_010845 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 3618.9 bits (9383), Expect = 0.0e+00 Identity = 1825/1837 (99.35%), Postives = 1829/1837 (99.56%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI03G02240 vs. NCBI nr
Match: XP_031738459.1 (uncharacterized protein LOC101213211 isoform X3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 3569.2 bits (9254), Expect = 0.0e+00 Identity = 1806/1837 (98.31%), Postives = 1810/1837 (98.53%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI03G02240 vs. NCBI nr
Match: XP_008448774.2 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC103490840 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 3456.8 bits (8962), Expect = 0.0e+00 Identity = 1741/1830 (95.14%), Postives = 1780/1830 (97.27%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI03G02240 vs. NCBI nr
Match: XP_038906253.1 (uncharacterized protein LOC120092116 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 3301.1 bits (8558), Expect = 0.0e+00 Identity = 1670/1844 (90.56%), Postives = 1738/1844 (94.25%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI03G02240 vs. NCBI nr
Match: XP_038906254.1 (uncharacterized protein LOC120092116 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 3110.9 bits (8064), Expect = 0.0e+00 Identity = 1593/1844 (86.39%), Postives = 1662/1844 (90.13%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI03G02240 vs. TAIR 10
Match: AT4G17610.1 (tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU) family protein ) HSP 1 Score: 1779.2 bits (4607), Expect = 0.0e+00 Identity = 995/1893 (52.56%), Postives = 1289/1893 (68.09%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (PI 183967) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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