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Bhi12G000985 (gene) Wax gourd (B227) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGGAAATAGTGGGAATAAGATTTTCATTGGCCAATGGTCAAGAAATTGTAAGTAGAAGCTTAATCTTCATTGACCTTCAAATTGATGCTTAATATTAGTAACATCACTGATATTAAAGGCCGTTTCACTTTAAAAAGAAAAAAAAAAAAATTACCTTCATTGACCTTCAACATGCTTAATATTACAATTTCTTTGCTCCCCCCACCATAATTGCAACATTCTCAGTCTTTGTAGTTGAAAAAACTACAATTGTTGAATAGGTACCACTTGTTCTTCTTCTATCCTTCTGCTAAACCTTTGCATTGAAGATTGCTTCTTTGCTTATAATAATTTAGCTATTCAATTCATCCCCCAAACCTATAGCCTAACTTTGCATTACCATCCAATTAAGTAGCACTTCTTCAGTTTGTTTAGTCCTTGGTGAGGTTCCATATTTCGCTTTGAGCTTCGTTTTTCTGTATGCCCTTGTATTCTTTAATTATTTCTCAATACAGGCAGTTGTTTCGATAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAGTAGCACCTCTTCAGTTTGACAACTGACTCTGCACTTTACATTTCCATATCCAATGAAGTAGAACTTTCAGTTCTAGTTAATACATGAAGTAGCACTTTACATTTCTCTTCATGTTTTATTTGCTCGACTTGTATTTAGTTGTGTTTTTAGGTGGTATTTCTATTCTTTAAAGATTTATTGGCTGAAATTTTGTTTGTTCTGACCGTTGGGTAGTTAGCCTATAAATAGGCTTGTATTATGTTATTTTGGTAGAACTTCAATAAAACTTCGGCTTCAAGATTTCTCCAAGAATTGGTCTTCACCCATACCCAGATGCCGAAGCATGTTCTACTTCCCCAAGAACCTTTAGTTGTCGGCGGCTTTCAGTAGAGACTTACCTGGGTGAATTAAACGTAAGTGTTGCGGGAATCCATGAGCAGATGGCTGGAATTCAAACCATGATGGCTAGTATGCAGCGAACAATGGAACTTCTAACAAGGGAGATCCTAAGGCTGCCCAATCCCCAAAATATGTTGTGTTATGAGCAGCAAAAAAGACCCATCCCTCATAATATGTTGGGTTATGGCTCAGATCTTCAAGCGAAGATGATTTCCCACAATTTCATCAAAATTATTTTTAAGATATCCACCTAATCCATTATACCAAGATAATCTCTGCCCATCCAAGAACTACACCAAGAACATAGATATTATGGACAAAATGGTTATGACATCTATCAAGATTGGAATTATGGACAATAATATGAAGGAGGATTTGGAGACAAGATTTAGACTATAAGATGAAAATTGACATACATACAATGGCTGTATGAATATCGAGACATTTCTGGATTGGGTGAAAAATGTAGAAAGTTTTTTCAATTACGTGGGAACACTTGAGGATTGCAAGGTAAAATTAGTTTCTTTTAAACTAAGAAGTGGAGTTTTGACGTGGTAGGATCAACTTCAATCAAATTGAAGATTATATGGGAGGAGACCTATATAGAGTTGGCCAAAAGTGTTGAGGCGAATAAAAAGATGTTTCTTGCCTATTAACCATGAACGCTCCTTTATAATCAATTTCAACATTTTAACCACGATTGAAGATGATGAGGCACATAAACAAAAAAGACTGGACTGGCGAGTTCTTGGGGGAGATTTGGTCCATAGCTAGGTCCCAATGCCTCCCTTTGGATGTAGTTACTGAAGAGTTTTGTAATTTTTCTTTGTTTCTTATTCTTGATAGATGGAGCCCTTTCTTGTAGTTATTTTGTTCGACTTCTTTTGTGATGGGCTGCTCTCTCTCTCCCTCGTCCTTTTTGCATTAATAGATGAGTTTACAAAATTTATCTGCGTCACTTGTCATAGAATAGGTATATTAAGTTTCTCAAAAGAAAATTCCTTATGTAGTGCTTTCCCCCCTTCCCTTTTTCATTAGTATCTGCTGTGTCCATTTATTTATTTATTTTTATTTTTGGTAGTGTATTGCAGCTATCAGTGATTGCCCTATTACCCATGCTAGTCAGCTCTCAAATCCATTTCTTGGTCTGCCAATTGAATTTGGAAAATGTGAATCATGTGGTACTTCTGAACCTGGGAAGTGTGAAGGTATTTTTTATTATCTCTACTTATTGATAAGAGATGGTGCTATTCATGAAGACAACTTGACAGATTTTATTTATCTTCCACTTTTCAGGCCATTTTGGATATATTGAATTACCAATTCCCATTTATCATCCCAATCACATAACTGAATTGAAGAAAATGTTAAGTTTGCTGTGTTTGAAGTGCTTAAAAATGAAAAAAACCAAGGTATGTAGAACTTTCTAACATGGATCTGTACATTCGTTTAATTGAAGATTAGTGCGTACATGTCTAAGTTTTGACTTCGTCTTTGTGCAAACTGATGAGCAGACCAGCTAATGTATTTATATGGCATATGAATATAGTTTAGATCATTTGTTTAATTGGTATGGTAAAAACACAAGCAGTTCGAACCTTATATATACCTGTAGTAAAGAATAAAAGTTCTAAAACTGGACATAAAAGCAACAAGTATTCTAATTAGACTAACATACCTCTTGGTATGAAGTTGAAGAGTTCAACAACTATTGTGGGGTTTATGTTGTTCTATGTAACTATTGTTGTTCGTCGCTGTAGAGATCCATTTATTATGGAGCTTAATAAGGGTTCAAATAGCAAACTGCCTCCAAACCCATGGGATACCCTCTTTAAAACCATTTTTTTTTTGAAATTACAAAAATTTGGAAGTGCCTACTGCTTTTATTTCAATTATGGGCCCATCACTTCTCTCTCCATTTTGCTCAATTGGCATTATAATGTGTCGAAGTCTGTGGTTCAAAAATCTCCCCAACCCCTATGGTACTGAAAAAGAATTATGTTGGGTACTTGGCTCCTACCATTTTTCTCTCCATCTCTTATTTTTTTTATCACGTTTCTTAATGATTTTTTTTTATTACAATTATATAATTTTTTTAATTAAAATGTAGAGTTACTTTATCTTTATGAAAGAAATATTCTTTTCATTTATTTTTTTTTTGAAAAGGATCATTTATTTATGGGCTGTTTTCAAATATAGGAAAATGAACCAAAATATTTTCAAATATATCAAAATTTCATTGTCTATGCGACAAACTGCTATCTATATCTATTTGTGTCATGTTAGACACAGATAGTAGTCTATCACGGTATTTGTGATATTTTGCTATTATTTGTAAGTATTTTCAGTAGTTTTGTCATTTAAAATAATTTTCCTTTATATTTAATTCAATTTAGATTAGTTCAAAATATGTATAGTTTTCTTATTTAGCACCAGAAAAGTATATTTATGACACATTACTCATATTAATATTTTTAAAAGATAACATTGAATTTTAAGTCAAGATATTCAAACGTCAAAATATATTTTATTTTCAAATTAACAATATTCAATGTTTCAAAAATAAATTGCATTTTATTTTGATTCTATTAAAATAAAATGAATAATATTCGATGTAAATTAGATATATTAAAAAGGGTNTGCATACATGTTCTCGGGAGAGCACTGTGAGTTGACACCTTCCATTGAAAAATCTAGGCTTTGCTCACGTTCATCTACTTTTATTGTGAATCTATTTTGTCTAAACGACTACAGTTTTCTTTGTAATATTTGTTTAAGACCGTGCTTTGTCAGTTATGTTCCTACTTAATCTCTGATATCATGCTTGTACAATGCATTTTATTTGTAATGTTTTTTTTTGAAAAGGAAACAAGTCTCTTATCTATGAATTTTATTTGTAATGAGATTATAGTTTTAGATTTTTAATCTTAAAATATGATCTTCATTTTGATCTGTAAAATTGAATCTTATCTATGAATCTCTAGAGTTAAAGAGTTGAAGAGTTTATAAATTTATTTGAAAAATAAGTAATGATAAAAAGAAATTAATTAAAAGTAAGTTTAAAAAAAGATTGTCAGTATGAATTTTATTATAATTATAATGATATAAAAAGAAATCAAACATAAACAAACTTATAATTCCAATTTGAATATGGTTGGTACAGTTGTTTCATACAGAATTGGACAAAATATAAACTATCAGATTAAAAAAATGGGAACCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATGTTGAAAAATCAGACTAGCCAAACTCAGCCAAACCCATCCATGCACATATGCATCAGAAATTTAACCAACCAAACCTTGCACTCCAAACATAGACTTCAACGTTCCCATGTTTCTGATTGTAGACAACAAAGCCCATGGTAAATCAGATTTCTAGAATTTCTGATTTGGAAGTAGTGCCCAAACAACCCTCGAGTGTTTAGAGGTTGTGATAACCTACAATTTTATCCTAGTGCGAATATCCTTGTTGCTTTCCCACCGTTCAGTTTGACTTCACTGTACTTCATTAACTGGGTTCCCTTATTTCCTGTTCAACTATGGTGGTATGTTCAAGAATGATCATATATATATATATATATATATATTATTTTGGAAAAGGAAACAGTCTCTTCATTAAGATAAAGCTCAAAATACAAGAGGAATGAACAATCAACTAAACTCAAGGATTAGGAAGAGTGATCATATATTTTTACTGCCAATGAACCACTATTTGATGGGTTTTCTCCTCTGAGTTGTCTGTTCTTTAATAATTTTTGCAGTCTCCTTCCAGAAATAATAATTTTGTCATGCCATGCTTTTATTCTTGAATTTTATGCCTGGACTTTTATTGGATATTTGTTTTCTCTCTTCAGTTTCCTTCGAAGAATATTGGTTTTGCAGAAAGATTGTTATCCGCATGTTGTGAGGTAAAGGCACTATTCTCAATTTTATTTCTCTTATTTTCGAAACAAGAAACAATACCATTCATTAATGTAATGAAAAGAAACAGGAAATGCCGTTCTCAAGATATCTTTATCAGCTTTTGACGTCTTTTCTTGTTTTGGTTCTGTTATATGTGT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Homology
BLAST of Bhi12G000985 vs. TAIR 10
Match: AT2G40030.1 (nuclear RNA polymerase D1B ) HSP 1 Score: 1424.8 bits (3687), Expect = 0.0e+00 Identity = 708/1128 (62.77%), Postives = 873/1128 (77.39%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi12G000985 vs. TAIR 10
Match: AT1G63020.1 (nuclear RNA polymerase D1A ) HSP 1 Score: 307.0 bits (785), Expect = 6.3e-83 Identity = 308/1206 (25.54%), Postives = 514/1206 (42.62%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi12G000985 vs. TAIR 10
Match: AT1G63020.2 (nuclear RNA polymerase D1A ) HSP 1 Score: 307.0 bits (785), Expect = 6.3e-83 Identity = 308/1206 (25.54%), Postives = 514/1206 (42.62%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi12G000985 vs. TAIR 10
Match: AT4G35800.1 (RNA polymerase II large subunit ) HSP 1 Score: 208.0 bits (528), Expect = 4.0e-53 Identity = 217/867 (25.03%), Postives = 367/867 (42.33%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi12G000985 vs. TAIR 10
Match: AT5G60040.1 (nuclear RNA polymerase C1 ) HSP 1 Score: 131.3 bits (329), Expect = 4.7e-30 Identity = 138/555 (24.86%), Postives = 242/555 (43.60%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 49.7 bits (117), Expect = 1.8e-05 Identity = 28/78 (35.90%), Postives = 42/78 (53.85%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi12G000985 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5D869 (DNA-directed RNA polymerase V subunit 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NRPE1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1424.8 bits (3687), Expect = 0.0e+00 Identity = 708/1128 (62.77%), Postives = 873/1128 (77.39%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi12G000985 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LQ02 (DNA-directed RNA polymerase IV subunit 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NRPD1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 307.0 bits (785), Expect = 8.8e-82 Identity = 308/1206 (25.54%), Postives = 514/1206 (42.62%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi12G000985 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P36594 (DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=rpb1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 235.0 bits (598), Expect = 4.3e-60 Identity = 223/843 (26.45%), Postives = 369/843 (43.77%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi12G000985 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P18616 (DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NRPB1 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 208.0 bits (528), Expect = 5.6e-52 Identity = 217/867 (25.03%), Postives = 367/867 (42.33%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi12G000985 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P11414 (DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 OS=Cricetulus griseus OX=10029 GN=POLR2A PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 199.9 bits (507), Expect = 1.5e-49 Identity = 213/865 (24.62%), Postives = 353/865 (40.81%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi12G000985 vs. NCBI nr
Match: XP_038874337.1 (DNA-directed RNA polymerase V subunit 1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2270.0 bits (5881), Expect = 0.0e+00 Identity = 1120/1120 (100.00%), Postives = 1120/1120 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi12G000985 vs. NCBI nr
Match: XP_011655250.1 (DNA-directed RNA polymerase V subunit 1 [Cucumis sativus] >XP_031741011.1 DNA-directed RNA polymerase V subunit 1 [Cucumis sativus] >XP_031741012.1 DNA-directed RNA polymerase V subunit 1 [Cucumis sativus] >XP_031741013.1 DNA-directed RNA polymerase V subunit 1 [Cucumis sativus] >XP_031741014.1 DNA-directed RNA polymerase V subunit 1 [Cucumis sativus] >KGN51090.1 hypothetical protein Csa_009187 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2209.1 bits (5723), Expect = 0.0e+00 Identity = 1082/1119 (96.69%), Postives = 1108/1119 (99.02%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi12G000985 vs. NCBI nr
Match: XP_008465860.1 (PREDICTED: DNA-directed RNA polymerase V subunit 1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2201.0 bits (5702), Expect = 0.0e+00 Identity = 1076/1119 (96.16%), Postives = 1106/1119 (98.84%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi12G000985 vs. NCBI nr
Match: XP_022146394.1 (DNA-directed RNA polymerase V subunit 1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 2156.3 bits (5586), Expect = 0.0e+00 Identity = 1061/1121 (94.65%), Postives = 1087/1121 (96.97%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi12G000985 vs. NCBI nr
Match: XP_022953816.1 (DNA-directed RNA polymerase V subunit 1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 2152.5 bits (5576), Expect = 0.0e+00 Identity = 1052/1120 (93.93%), Postives = 1092/1120 (97.50%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi12G000985 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KN85 (DNA-directed RNA polymerase subunit OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G435050 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2209.1 bits (5723), Expect = 0.0e+00 Identity = 1082/1119 (96.69%), Postives = 1108/1119 (99.02%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi12G000985 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CPU1 (DNA-directed RNA polymerase subunit OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503449 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2201.0 bits (5702), Expect = 0.0e+00 Identity = 1076/1119 (96.16%), Postives = 1106/1119 (98.84%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi12G000985 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CY08 (DNA-directed RNA polymerase subunit OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111015618 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2156.3 bits (5586), Expect = 0.0e+00 Identity = 1061/1121 (94.65%), Postives = 1087/1121 (96.97%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi12G000985 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GP51 (DNA-directed RNA polymerase subunit OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111456230 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2152.5 bits (5576), Expect = 0.0e+00 Identity = 1052/1120 (93.93%), Postives = 1092/1120 (97.50%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi12G000985 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JRG8 (DNA-directed RNA polymerase subunit OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486902 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2148.6 bits (5566), Expect = 0.0e+00 Identity = 1051/1120 (93.84%), Postives = 1090/1120 (97.32%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Wax gourd (B227) v1
Date Performed: 2021-10-22 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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