Simple sequence repeat (SSR)
>UN23294 CTGAAAATAGACTCTCGAGCTCATTTATGTCAATTTCTGGAGCCTTGGATTTATCTTCTTGCTTTTGAGTATCAGCCCATAAACTCCCTTGCAG CGCTCTTGTAACCTTGTTCCAGTGCAGAGGCTTCAAAGACGTTTTCTTGGGAGGAATTGAAGAACCCGAACTAACTTTACCTTTTCCACTACCC AAAGAACCAGAAGAACGTAATCGTCCACTGGATGATGTAGGTTGTTGCACCCCATTAGATCCCTTTGTTCCAGGCGGTGGAGGTGGAGGTGGAC CACTGCGACCTGGTGGTGGAGGCGGACCTGGTACACTACCACGGCCTGGTGGTGGAGGTGGTGGTGGACCTGGCCCACCGCTGCGGCCTGGAGG TGGTGGTGGAGGTGGCGCGCCGGCACCACTGCGGCCTGGGGGCGGAGGTGGTGGTGGTGGTCCTGAGGTGGCACTTGCTTTAGTAGGTGGTGGA GGTGGTGGTGGAGGGCCTTTAGATGA |
Primers for UN23294 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | CTGGTACACTACCACGGCCT | 60.051 | 20 | CACCACCTCCACCACCTACT | 59.876 | 20 | 168 | 310 | 477 |
2 | GAGGCGGACCTGGTACACTA | 60.134 | 20 | CACCACCTCCACCACCTACT | 59.876 | 20 | 177 | 301 | 477 |
3 | AGGTTGTTGCACCCCATTAG | 59.853 | 20 | CACCACCTCCACCACCTACT | 59.876 | 20 | 251 | 227 | 477 |