Simple sequence repeat (SSR)
>UN11726 GGAATATCTGAGAGTGCTGTAGGCGGCACCGGGTTGTTGTTGTTGCGGTGATGATTCGAACTTGTACGCGAATTGTTCCTTAATCAACGGAGTG GGTGTGGTGGACTTGACTCCGGAAGAGAATTGGCTCTTGGCTGACTGTTGGACGCGTGGTTGTTCGGTAGCGGCTACGGTGTAGTAGTATTGGG GTTGTTGTTGTTGTTGGTACTGTTGCGGTAATGCGTTGTACTGGAATTGGGGTTGGGCGGCTGGTGCCTGGGATTTGAATTGGACAGCAGTGGT GGCAGGGTGACGGG |
Primers for UN11726 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | TTGTTGTTGCGGTGATGATT | 59.972 | 20 | ACCCCAATTCCAGTACAACG | 59.711 | 20 | 205 | 37 | 241 |
2 | TTGTTGTTGCGGTGATGATT | 59.972 | 20 | CCACTGCTGTCCAATTCAAA | 59.691 | 20 | 245 | 37 | 281 |
3 | CGGAAGAGAATTGGCTCTTG | 59.948 | 20 | ACCCCAATTCCAGTACAACG | 59.711 | 20 | 128 | 114 | 241 |